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方法文章

通过流式细胞术检测细胞焦亡

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DOI:

10.3791/66912

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2024年5月31日

本文内容

摘要

本文介绍了通过使用针对鸡GSDME的N端片段(chGSDME-NT)和碘化丙啶(PI)的抗体进行双重染色后,利用流式细胞术鉴定发生焦亡的细胞。

摘要

焦亡是一种由炎性介导的程序性细胞死亡,主要由Gasdermin(GSDM)家族蛋白经切割后产生的N端片段在细胞膜上形成孔道所驱动。通过Western Blot检测膜结合型GSDM-NT是评估焦亡最常用的方法。然而,该方法难以区分发生焦亡的细胞与其他形式的细胞死亡。在本研究中,采用传染性法氏囊病毒(IBDV)感染的DF-1细胞作为模型,利用针对鸡GSDME N端片段(chGSDME-NT)的特异性抗体结合碘化丙啶(PI)染色,通过流式细胞术定量分析发生焦亡的细胞比例。使用Alexa Fluor 647标记的抗chGSDME-NT抗体,可通过流式细胞术清晰检测到chGSDME-NT阳性的细胞。此外,IBDV感染细胞中chGSDME-NT/PI双阳性细胞的比例(约33%)显著高于模拟感染对照组(P < 0.001)。这些结果表明,通过流式细胞术检测膜结合型chGSDME-NT是鉴定细胞死亡过程中焦亡细胞的有效方法。

引言

焦亡是一种炎症性的程序性细胞死亡,主要依赖于哺乳动物中Gasdermin(GSDM)D在细胞膜上形成孔道1,2,3。由于鸡缺乏GSDMD基因4,5,鸡体内焦亡的机制仍不清楚。Gasdermin家族包含一系列保守蛋白,如GSDMA、GSDMB、GSDMC、GSDMD、GSDME和DFNB593,6。已有研究报道,来自硬骨鱼类和鸭子的GSDME可被caspase-1/3/7或caspase-3/7切割,从而诱导焦亡性细胞死亡7,8。然而,GSDME介导的焦亡在鸡抵抗病原体感染的宿主反应中的作用仍有待阐明。

传染性法氏囊病(IBD)是由传染性法氏囊病病毒(IBDV)引起的一种急性、高度传染性且具有免疫抑制性的家禽疾病9传染性法氏囊病病毒(IBDV)是一种无包膜的双链RNA病毒,基因组分为两个片段,属于双RNA病毒科(Birnaviridae)禽双RNA病毒属(Avibirnavirus)。10先前其他研究团队及本实验室的研究表明,传染性法氏囊病病毒(IBDV)感染可诱导宿主细胞发生细胞死亡 通过 不同的通路11,12,13,14先前的研究结果表明,传染性法氏囊病病毒(IBDV)感染会引发乳酸脱氢酶(LDH)的释放,后者是溶细胞性细胞死亡的标志物6,15,表明IBDV感染可诱导宿主细胞发生裂解性细胞死亡。此外,数据还显示,IBDV感染的细胞表现出细胞焦亡的形态学特征,包括细胞肿胀、细胞膜表面形成大的泡状突起以及碘化丙啶(PI)染色阳性,提示IBDV感染可诱导细胞发生焦亡。

鉴于GSDM蛋白经切割后产生的N端片段(GSDM-NT)在焦亡细胞膜上形成孔道是焦亡的标志性特征,理论上可通过特异性抗体检测细胞膜上的GSDM-NT,利用流式细胞术来检测焦亡细胞。在禽类焦亡细胞中,鸡Gasdermin E蛋白的N端片段(chGSDME-NT)可在细胞膜上形成孔道,使碘化丙啶(PI)进入细胞并与DNA结合。因此,可通过流式细胞术检测焦亡细胞的比例,从而将焦亡与其他形式的细胞死亡(如凋亡和坏死)区分开来。然而,目前尚未见报道利用流式细胞术检测焦亡细胞的方法。本研究中,将DF-1细胞感染传染性法氏囊病毒(IBDV)后,采用针对chGSDME-NT片段(膜结合形式)的单克隆抗体(McAb)并结合PI染色,通过流式细胞术检测焦亡细胞。出乎意料的是,流式细胞术能够有效检测到焦亡细胞,且可对焦亡细胞的比例进行定量分析。这些发现为焦亡的判定提供了一种强大而有效的方法。

本文介绍了一种利用抗chGSDME-NT 单克隆抗体和PI染色,通过流式细胞术检测IBDV感染细胞中细胞焦亡的方法。该方法还可拓展至其他病原体感染的细胞,适用于检测发生焦亡的各种细胞类型,并将其与其他形式的细胞死亡区分开来。

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方案

本研究中所用试剂和设备的详细信息见材料表。

1. 样品细胞的制备

  1. 在六孔板中培养DF-1(永生化鸡胚成纤维细胞)细胞(每孔5 × 105个细胞),使用添加10%胎牛血清(FBS)的杜氏改良伊格尔培养基(DMEM),于38 °C、5% CO2培养箱中培养。
  2. 当细胞融合度达到80%时,弃去含血清的细胞培养基,用磷酸盐缓冲液(PBS)洗涤细胞三次,然后每孔加入2 mL无血清细胞培养基。
  3. 向每孔加入IBDV病毒液(含计算好的MOI),设置模拟感染对照组,加入与病毒液体积相等的DMEM培养基。
  4. 病毒吸附1小时后,弃去培养基,用PBS洗涤细胞三次,每孔加入2 mL添加2% FBS的DMEM,继续培养24小时。
  5. IBDV感染后24小时,进行胰蛋白酶处理(每孔500 µL,1分钟),随后用含10% FBS的DMEM(每孔2 mL)中和。之后收集细胞,制备单细胞悬液用于流式细胞术分析。
  6. 在2–8 °C条件下,以400 × g离心5分钟,用移液器弃去上清液。
  7. 用PBS重悬细胞沉淀,并轻轻涡旋振荡管子3秒。
  8. 按照步骤1.6所述条件(400 × g,2–8 °C,离心5分钟)再次离心细胞。
  9. 重复步骤1.7和1.8所述的细胞洗涤操作。
  10. 在显微镜下使用血细胞计数板进行细胞计数。然后将细胞重悬于适量的流式细胞术染色缓冲液中(使最终细胞浓度为1 × 107个细胞/mL),并轻轻涡旋混匀悬液。

2. 流式细胞术的细胞染色

  1. 将步骤1.10中获得的单细胞悬液各100 µL加入5 mL圆底聚苯乙烯管(12 mm × 75 mm)中。为抗-chGSDME-NT/CT 抗体染色准备模拟感染和IBDV感染的细胞,并以正常小鼠IgG作为同型对照。同时,使用IBDV感染的细胞制备空白对照管和单染管。
  2. 分别向IBDV感染管和模拟对照管中加入1 µg Alexa Fluor 647标记的抗-chGSDME-NT 单克隆抗体、抗-chGSDME-CT 单克隆抗体或正常小鼠IgG(作为同型对照)。随后,轻轻涡旋振荡管子3秒。
  3. 将染色后的细胞在2–8 °C或冰上避光孵育30分钟。每10分钟轻轻涡旋振荡一次。
  4. 用1 mL流式细胞术染色缓冲液重悬细胞,于2–8 °C以400 × g 离心5分钟进行洗涤。用移液器弃去上清液。
  5. 重复步骤2.4所述的细胞洗涤操作。
  6. 将细胞沉淀重悬于100 µL流式细胞术染色缓冲液中。
  7. 用10 µg/mL的碘化丙啶(PI)对IBDV感染组、模拟感染组以及PI单染管的细胞在室温下染色10分钟,随后加入400 µL流式细胞术染色缓冲液,用于流式细胞术检测。

3. 进行流式细胞术检测

  1. 启动流式细胞仪以初始化仪器并打开软件。
  2. 首先运行空白对照管,随后运行单染管,以调整流式细胞仪的电压和补偿参数。使用在 635 nm 处发射的 FL3 和 FL4 荧光通道,分别检测 PI 和 Alexa Fluor 647 荧光染料。
  3. 完成所有参数设置后,依次运行所有样品。

4. 流式细胞术数据分析

  1. 在FL4通道直方图中分析每个样本的Alexa Fluor 647染色情况。
  2. 为评估每个样本中双阳性细胞的比例,使用FL3/FL4的四象限点图。
  3. 根据同型对照IgG/PI双染样本设定阳性阈值,确保双阳性细胞比例低于1%。该方法有助于测量所有样本中双阳性细胞的比例。

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结果

chGSDME-NT 在IBDV感染的DF-1细胞膜上可 readily 通过流式细胞术检测到
细胞焦亡最重要的特征之一是GSDM介导的细胞膜孔道形成NT 由Gasdermin切割产生的片段。因此,理论上可通过流式细胞术检测焦亡细胞 通过 检测GSDM-NT 使用特异性抗体检测细胞膜上的变化。因此,用传染性法氏囊病毒(IBDV)感染DF-1细胞,并通过流式细胞术检测焦亡细胞,所用抗体为Alexa Fluor 647标记的抗chGSDME抗体。NT McAb 和 PI 染色。有相当数量的 chGSDME-NT 感染IBDV后通过流式细胞术检测到阳性细胞(图1)。相比之下,模拟感染的对照组或使用同型对照IgG染色的细胞中,Alexa Fluor 647阳性细胞极少。这些结果表明,膜结合型chGSDME可被有效且特异性地检测到NT 通过流式细胞术。值得注意的是,裂解后的chGSDME的C端片段(...

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讨论

本文介绍了一种利用流式细胞术检测焦亡的有效方法,该方法通过对感染细胞进行Alexa Fluor 647标记的抗chGSDME-NT 单克隆抗体与PI的双重染色实现。该方法还可应用于多种细胞类型,以区分焦亡与其他类型的细胞死亡,如凋亡和坏死。

焦亡,一种炎症性程序性细胞死亡,主要依赖于哺乳动物中由GSDMD介导的细胞膜孔道形成1,2,3,传统上通过LDH释放等方法进行评估6,15,形态特征16,以及 GSDM- 的检测NT/GSDM-计算机断层扫描 片段 通过 Western Blot 或 IFA 检测17...

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披露

作者无任何利益冲突需要披露。

致谢

感谢刘珏博士的大力协助。本研究得到了中国国家重点研发计划(编号:2022YFD1800300)、国家自然科学基金(编号:32130105)以及现代农业产业技术体系专项资金(编号:CARS-40)的资助。

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
5 mL 圆底聚苯乙烯管(12 × 75 毫米Corning Falcon352052
6孔细胞培养板康宁3516
Alexa Fluor 647 抗体标记试剂盒赛默飞世尔科技A20186
抗chGSDME-CT单克隆抗体中国中山 SAE 生物医学技术公司EU0228
抗chGSDME-NT单克隆抗体中国中山SAE生物医学技术有限公司EU0227
CellQuest 软件BD 生物科学
CO2 培养箱赛默飞世尔科技3100
冷冻离心机Eppendorf5810R
杜尔贝科改良伊格尔培养基(DMEM) Gibco(隶属于 Life Technologies)C11995500BT
胎牛血清(FBS)Sigma-AldrichF0193-500ML
流式细胞仪BD 生物科学FACSCalibur
流式细胞术染色缓冲液赛默飞世尔科技00-4222-26
血细胞计数板邱井生化试剂 &安普&仪器公司(中国上海)YX-JSB52
IBDV Lx 毒株IBDV Lx 毒株由位于中国北京的北京市农林科学院刘珏博士惠赠
倒置显微镜重庆光电仪器公司XDS-1B
正常小鼠 IgGSanta Cruz Biotechnologysc-2025
磷酸盐缓冲液(PBS)M&和C  基因技术CC017
碘化丙啶(PI)Sigma-AldrichP4170
0.25% 胰蛋白酶-EDTAM&与  基因技术CC008
涡旋振荡器MIULABMIX-28+

参考文献

  1. He, W. T., et al. Gasdermin D is an executor of pyroptosis and is required for interleukin-1β secretion. Cell Res. 25 (12), 1285-1298 (2015).
  2. Kayagaki, N., et al. Caspase-11 cleaves Gasdermin D for non-canonical inflammasome signalling. Nature. 526 (7575), 666-671 (2015).
  3. Shi, J., et al. Cleavage of GSDMD by inflammatory caspases determines pyroptotic cell death. Nature. 526 (7575), 660-665 (2015).
  4. Angosto-Bazarra, D., et al. Evolutionary analyses of the Dasdermin family suggest conserved roles in infection response despite loss of pore-forming functionality. BMC Biol. 20 (1), 9(2022).
  5. De Schutter, E., et al. Punching holes in cellular membranes: Biology and evolution of gasdermins. Trends Cell Biol. 31 (6), 500-513 (2021).
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  7. Jiang, S., Gu, H., Zhao, Y., Sun, L. Teleost gasdermin E is cleaved by caspase 1, 3, and 7 and induces pyroptosis. J Immunol. 203 (5), 1369-1382 (2019).
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细胞焦亡检测Gasdermin E程序性细胞死亡质膜孔道碘化丙啶染色蛋白质印迹传染性法氏囊病病毒DF-1细胞抗体染色