本研究通过共表达基因探讨了非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）与心肌梗死（MI）之间的关系，鉴定出血小板反应蛋白1（THBS1）可作为生物标志物。免疫浸润分析显示，CD8+ T细胞和中性粒细胞是关键因素，THBS1在NAFLD和MI的诊断中具有潜在应用价值。
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本研究通过共表达基因探讨了非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）与心肌梗死（MI）之间的关系，鉴定出血小板反应蛋白1（THBS1）可作为生物标志物。免疫浸润分析显示，CD8+ T细胞和中性粒细胞是关键因素，THBS1在NAFLD和MI的诊断中具有潜在应用价值。
非酒精性脂肪肝病（NAFLD）和心肌梗死（MI）是两种具有高发病率和高死亡率的主要健康负担。本研究旨在探索共表达基因，以阐明NAFLD与MI之间的关联，并利用生物信息学和机器学习方法识别NAFLD相关MI的潜在关键生物标志物。研究进行了功能富集分析，构建了共蛋白-蛋白相互作用（PPI）网络图，并采用支持向量机-递归特征消除（SVM-RFE）和最小绝对收缩与选择算子（LASSO）技术，鉴定出一个差异表达基因——血小板反应蛋白1（Thrombospondin 1, THBS1）。THBS1在区分NAFLD患者（AUC = 0.981）和MI患者（AUC = 0.900）方面表现出优异性能。免疫浸润分析显示，NAFLD和MI患者的CD8+ T细胞水平显著降低，而中性粒细胞水平升高。CD8+ T细胞和中性粒细胞在区分NAFLD/MI患者与健康对照者方面具有有效性。相关性分析表明，在NAFLD和MI患者中，THBS1与CCR（趋化因子受体）、MHC类别（主要组织相容性复合体类别）、中性粒细胞、旁炎症（parainflammation）及Tfh（滤泡辅助性T细胞）呈正相关，而与CD8+ T细胞、细胞溶解活性及TIL（肿瘤浸润淋巴细胞）呈负相关。THBS1作为一种新型生物标志物，在区分NAFLD/MI患者与健康对照者方面展现出潜力。研究结果提示，CD8+ T细胞和中性粒细胞可作为区分NAFLD/MI患者与健康个体的炎症免疫特征。
非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）是一种重大的公共卫生问题，其患病率为25%-30%1。已有报道指出，NAFLD在糖尿病患者中的患病率较高2。然而，NAFLD在非糖尿病患者中的意义尚不明确。研究表明，NAFLD在动脉粥样硬化的发病机制中发挥着独立作用3,4。此外，一项荟萃分析显示，NAFLD与冠状动脉钙化、内皮功能障碍及动脉粥样硬化密切相关，并已成为独立的心血管危险因素5。NAFLD与心血管疾病之间的关联仍需进一步研究。
心肌梗死（MI）是一种危及全球患者及其家庭健康的灾难性疾病，并带来沉重的经济负担6. 心肌梗死（MI）也是非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）患者死亡的主要原因之一。一项发表于 英国医学杂志 已表明，非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）患者发生心肌梗死的风险是非NAFLD患者的1.17倍7,8一些研究已鉴定出与非酒精性脂肪性肝病相关心肌损伤相关的分子通路，包括炎症、氧化应激和脂质代谢。9
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所使用的数据库、网页链接以及软件/程序包的详细信息列在材料表中。模拟参数见表1。
1. 获取RNA微阵列数据集
2. 差异表达基因的鉴定
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本研究提出的关键发现如下，涵盖了为阐明非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）和心肌梗死（MI）潜在分子机制而开展的多种分析。
差异表达基因的鉴定
在GSE89632数据集中，鉴定出76个上调基因和20个下调基因作为非酒精性脂肪性肝病相关差异表达基因（NAFLD-DEGs）（图2B、D）；而在GSE66360数据集中，鉴定出118个上调基因和8个下调基因作为心肌梗死相关差异表达基因（MI-DEGs）（图2C、E）。随后，通过NAFLD-DEGs与MI-DEGs的交集分析获得共表达差异表达基因（co-DEGs），在co-DEGs中鉴定出13个上调的差异表达基因和1个下调的差异表达基因（图2A）。
鉴定非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）和心肌梗死（MI）各.......
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本研究中描述的方法对非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）和心肌梗死（MI）潜在分子机制的研究具有重要意义。通过鉴定如THBS1等关键生物标志物，所提出的方案为诊断和治疗干预提供了潜在靶点。该方法可拓展至其他涉及多条通路和免疫反应的复杂疾病，有助于发现新的生物标志物和治疗靶点。此外，生物信息学与机器学习技术的整合为个体化医学提供了灵活的框架，可根据个体的分子特征制定个性化的治疗策略。该方法还可适用于临床环境，通过靶向干预提高诊断准确性，改善患者预后。
非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）和心肌梗死（MI）是两种具有高发病率和高死亡率的主要健康负担。NAFLD 的特征是脂质在肝脏中积聚1。越来越多的证据表明，NAFLD 不仅对心脏的结构完整性产生不利影响，还会影响其功能，尤其是在心肌梗死的背景下22,23,24。此外，已有强有力的证据表明 NAFLD 与动脉粥样.......
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本研究由国家自然科学基金（编号 62271511、U21A200949）、南部战区总医院育才基金（2022NZC011）、广州市科技计划项目（2023A03J0170）、国家老年医学临床研究中心（NCRCG-PLAGH-2023006）以及广东省基础与应用基础研究基金（编号 2020A1515010288、2021A1515220101）资助。
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| Cytoscape | Cytoscape Consortium | Version 3.6.1 | 用于可视化蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络 |
| MI 数据集 GSE66360（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/） | NCBI-GEO 数据库 | - | 用于收集RNA微阵列数据集进行分析 |
| R 包 clusterProfiler | Bioconductor | - | 用于 GO、KEGG 和 DO 富集分析 |
| R 包 ggplot2 | CRAN | - | 用于创建维恩图及其他可视化图形 |
| R 包 GSEABase | Bioconductor | - | 与 GSVA 联合用于基因集富集分析 |
| R 包 GSVA | Bioconductor | - | 用于单样本基因集富集分析（ssGSEA） |
| R 包 limma | Bioconductor | - | 用于识别差异表达基因（DEGs） |
| R 包 pheatmap | CRAN | - | 用于生成热图 |
| R 包 venn | CRAN | - | 用于创建维恩图 |
| RNA 微阵列数据集（GSE66360，GSE89632） | NCBI-GEO | - | 公开可用的 RNA 微阵列数据集，用于分析 |
| RStudio | RStudio, PBC | Version 1.4.1717 | R 的集成开发环境 |
| String 数据库 | STRING（www.string-db.org/） | - | 用于构建 PPI 网络的在线工具 |
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