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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
该协议详细介绍了一种使用手动溶酶体膜片钳系统直接测量细胞内囊泡上离子通道活性的方法。我们说明了涉及扩大内溶酶体和手动分离这些囊泡的方法。这种方法确保研究人员可以准确地复制和应用该程序。
内溶酶体离子通道对于内溶酶体离子和 pH 稳态、膜电位调节和囊泡运输至关重要。然而,通过电生理学方式访问细胞内小囊泡内的这些通道一直是一个挑战。溶酶体内溶酶体膜片钳技术的发展有助于克服这一障碍,允许直接测量内溶酶体膜中的离子通道活性。
与现有的平面膜片钳技术相比,内溶酶体膜片钳可以同时记录多个细胞,并可轻松与其他测量方法结合使用。手动作具有可视化目标囊泡的优势。它还解决了溶酶体膜一侧 Ca2+ 不可或缺的存在限制,增加了实验设计的灵活性。利用内溶酶体膜片钳技术可以直接测量和分析内溶酶体内的离子通道活性。
鉴于异常的内溶酶体离子通道功能与神经退行性疾病和代谢紊乱等疾病之间的密切联系,研究和调节这些通道可能会揭示新的药物靶点。通过恢复细胞内离子平衡,我们可以缓解或治愈相关疾病。因此,这项技术对于发现新的药物靶点和开发相关药物至关重要。
离子通道在许多生理过程中起着至关重要的作用。虽然表面离子通道受到了极大的关注,但细胞内通道的重要性,尤其是内溶酶体内的通道,正逐渐得到认可。内溶酶体系统由专门用于基本细胞功能的多功能膜结合细胞器组成,包括回收内体 (RE)、早期内体 (EE)、晚期内体 (LE)、溶酶体 (LY) 以及具有内溶酶体和其他区室特征的杂交细胞器,例如吞噬体和自噬体。
EE,也称为分选内体 (SE),是从质膜 (PM) 内化的材料的早期目的地之一。EE 是负责将货物分类为各种内吞途径的关键隔室,例如到 LE/LY 进行降解的成熟途径、返回 PM 的快速回收途径以及涉及回收隔室或外周 RE 的缓慢回收途径。源自内体的多泡体 (MVB) 是被限制膜包围的球形隔室,该限制膜可以充满腔内囊泡 (ILV)1。为了维持这些细胞器的正常功能,它们需要膜离子通道来调节囊泡 pH 值、渗透压和信号转导。然而,测量这些渠道的活动并不简单。
对于位于质膜上的离子通道,1970 年代开发的膜片钳技术长期以来一直是金标准方法2。然而,在小细胞内囊泡内通过电生理途径进入通道仍然是一个挑战。将测量质膜上离子通道的金标准应用于细胞内细胞器上的离子通道面临三个主要挑战。首先,内溶酶体的大小通常非常小(直径小于 1 μm),这使得它们难以在显微镜下观察和分离,并且小于典型玻璃微量移液器的开口直径,使实验无法作。其次,直接从靶细胞中分离内溶酶体,同时保持细胞器完整性需要特殊技能。第三,由于细胞内细胞器中没有细胞骨架,在贴片移液管内的溶酶体膜上形成密封,然后将其破裂以实现全溶酶体构型可能具有挑战性,因为它会损害细胞器的结构完整性 3。
已经开发了几种方法来克服这些问题,包括脂质双层记录、修饰溶酶体靶向序列和基于实体的膜电生理学(SSM 或 SSME)技术。脂质双层记录方法涉及用纯化的离子通道重建合成磷脂膜,从而能够在受控条件下对膜蛋白功能进行详细的电生理研究 4,5。修饰离子通道上的溶酶体靶向序列涉及将溶酶体离子通道重定向到质膜,以便使用常规膜片钳方法进行测量6。基于实体的膜电生理学(SSM 或 SSME)技术,也称为溶酶体平面膜片钳方法,在微结构平面硼硅酸盐芯片中使用具有小孔径(直径 <1 μm)的固体基质平面玻璃芯片。这些小孔径玻璃芯片允许使用压力吸引控制系统 (Nanion) 分析小的、甚至天然的内溶酶体。然而,在前两种方法中,离子通道并不处于其自然生理环境中。记录在质膜上表达或重构为脂质双层的溶酶体通道的尝试在很大程度上产生了不确定和矛盾的结果。
尽管平面膜片钳技术有效地解决了人为干扰问题,并提供了高通量测量的优势,但所使用的解决方案也受到这种方法的限制。本文介绍的溶酶体膜片钳技术可以同时记录多个细胞,并可轻松与其他测量方法结合使用。手动作提供了可视化目标囊泡的优势。它还克服了内溶酶体膜一侧溶液中 Ca2+ 不可避免的限制,增加了实验设计的自由度3。最近,内溶酶体膜片钳技术在药物开发研究中发挥了关键作用。例如,在神经退行性疾病中,该技术有助于识别靶向与阿尔茨海默病和帕金森病相关的内溶酶体离子通道的新药 7,8。研究人员还可以使用这项技术来探索溶酶体内体离子通道在肿瘤细胞中的作用9,从而控制肿瘤的生长和增殖。在代谢疾病方面,内溶酶体膜片钳研究揭示了调节内溶酶体离子通道的化合物,为糖尿病和肥胖症提供了新的治疗方法。内溶酶体膜片钳技术有助于了解内溶酶体功能障碍和寻找潜在疗法6,显着增强我们对内溶酶体离子通道功能的理解,并促进新药物靶点的发现。
1. 仪器设置
2. 样品制备
3. 细胞器分离
4. Gigaseal 形成
5. 电流测量
下面描述了在溶酶体膜片钳实验中观察到的当前形状。如果当前形状与预期不符,则可能是由于接触不良或泄漏。如果参比电极未与浴液完全接触或移液器电极即将断裂,则可能会出现接触不良。如果腔室和盖玻片之间存在间隙,允许液体流到物镜或载物台上,则可能会发生泄漏;移液器溶液过多或过少也可能导致此类异常。
针头插入溶液/针头接触细胞表面/ZAP
在溶酶体连接模式(gigaseal 形成)建立期间,电流响应迅速降低。密封电阻可以通过将指令电压除以少量剩余电流来确定(图 7)。
斜坡/泄漏
重复施加 -100 mV 至 +100 mV 的连续输入电压可以记录随着时间的推移通过内溶酶体膜的电流(图 8)。使用标准溶液时,细胞器内部和外部的离子组成不同。如果通道表现出选择性,则由于流入和流出的离子的磁导率不同,电流-电压曲线的交点不会为零。这个交点称为通道的反向电位,可以使用以下公式10 计算:

其中 dv:二价离子;mV: 一价离子;i: 内部;o: 外部;P: 离子 S 的膜渗透性,以 m·s−1 为单位;V: 跨膜电位,单位为 Volts;F: 法拉第常数,等于 96,485 C·mol−1 或 J·V-1·摩尔-1;R: 气体常数,等于 8.314 J·K−1·摩尔−1;T:绝对温度,以开尔文为单位 (= °C + 273.15)。
内溶酶体中可能存在与泄漏电导和特异性离子通道相关的无源电流成分。漏电流的特征是线性电流 (I)-电压 (V) 关系,交点位于原点。从未转染的 HEK293 细胞中分离的内溶酶体的泄漏电流在 100 mV 时小于 50 pA;潜在的离子通道可能是钾/钠电导通道和氯离子通道。
在电压激活离子通道的情况下,可以通过在刺激电压门控溶酶体电流之前或之后记录一系列缩放的电压脉冲来减去测量电流中的泄漏电流分量。也可以离线减去泄漏。这些缩放脉冲的幅度通常是实验脉冲幅度的四分之一或五分之一,这一过程称为 P/4 或 P/5 泄漏减法11。由于漏电流的大小非常小,因此通常不使用 P/4 或 P/5 减法。
电压钳
在输入电压中反复应用逐步跳变可以记录电压变化时通过内溶酶体膜的电流。这有助于确定通道是否为电压门控离子通道12。除了电压钳,电流钳也是可行的。可以使用电压钳位模式12 中的可用配置来记录单通道活动。内溶酶体离子通道的通常密度较低,可能会阻碍获得包含单个通道的贴片的过程。厚壁移液器玻璃是生产具有小移液器吸头和低电容电极的最佳材料。用 Sylgard 或蜡涂覆玻璃可以降低移液器电容。

图 1:内溶酶体膜片钳步骤概述。 使用手动溶酶体膜片钳系统评估细胞内囊泡中离子通道活性的方案可以用流程图概述,其中包含以下关键步骤:(1) 溶液制备:组装所有必需的化学溶液。(2) 细胞制备:培养细胞并为内溶酶体提取做好准备。(3) 移液器制造:创建并抛光膜片钳移液器,以确保精确处理。(4) 内溶酶体分离:手动将内溶酶体与培养的细胞分离。(5) 囊泡修补:将移液管连接到单个内溶酶体囊泡上。(6) 信号采集:捕获和放大来自囊泡的电信号。(7) 信号数字化:将模拟信号转换为数字形式进行分析。(8) 数据收集与分析:收集数据并对其进行解释,以研究离子通道功能。 请单击此处查看此图的较大版本。

图 2:电生理硬件的设置。 在双电极测量过程中,测量电极接触目标膜,而参比电极置于浴液中。两者之间的电位差被放大器放大,由数字化仪数字化,然后由计算机捕获。 请单击此处查看此图的较大版本。

图 3:用于内溶酶体膜片钳分析的药理学工具。 示意图显示了膜片钳不同药物的活性范围。渥曼青霉素和拉特鲁克菌素 B 的组合对早期内体具有高度特异性,不包括回收内体。YM201636 选择性地扩增晚期内体/溶酶体。液泡蛋白增大早期内体,回收内体,以及晚期内体/溶酶体13。 请单击此处查看此图的较大版本。

图 4:扩增的细胞器的分离。 从细胞中手动分离目标囊泡过程的示意图。步骤如下:(1) 盖玻片制备:将含有目标囊泡的靶细胞置于盖玻片上。(2) 切开质膜:使用分离移液管切开靶细胞的质膜。(3) 分离移液管:分离移液管的位置以瞄准囊泡。(4) 将目标囊泡挤压到细胞外:使用分离移液管小心地将目标囊泡挤压到细胞外。 请单击此处查看此图的较大版本。

图 5:斑片移液管和囊泡之间用于 gigaseal 形成的推荐相对位置。 施加正压后,用贴剂移液管从上方接近细胞器。将尖端放置在距细胞器顶部约三分之一的位置,然后缓慢(模式 3-6)降低补片移液管,直到正压导致细胞器膜移动。在显微镜下,细胞器必须滚动或从尖端推开。此时,释放正压并等待 gigaseal 形成。 请单击此处查看此图的较大版本。

图 6:配置类型。 根据移液器和细胞器之间的接触方法,有四种不同的测量模式:细胞器或囊泡附着、整个囊泡、由内而外和由外而外。 请单击此处查看此图的较大版本。

图 7:用于计算移液器电阻、密封电阻、串联电阻和电池电容的电流。 将记录移液器放置在 浴液中,矩形电压脉冲(持续时间 5 ms,5 mV)产生几乎矩形的电流响应。移液器的电阻可以通过将施加的电压除以测得的电流来确定。由于 gigaseal 是在 溶酶体连接模式下形成的,因此电流响应迅速减弱。密封电阻可以通过将电压除以剩余的非常小的电流来计算。当施加 ZAP 脉冲时,膜迅速破裂,导致电容电流增加,标志着向 全内溶酶体构型的转变。对于球形内溶酶体,产生的电流服从时间的单个指数函数。串联电阻是通过将电容电流幅度除以指令电压来确定的,内溶酶体的电容是通过将电容电流的时间常数除以串联电阻12 来计算的。 请单击此处查看此图的较大版本。

图 8:斜坡记录期间观察到的电流(例如 TPC2)。 这是一个电流-电压 (I-V) 关系图,X 轴表示 -100 至 +100 mV 的电压范围,Y 轴表示在不同电压下产生的电流。该图以 TPC2 通道的测量值为例。黑线表示施加 ZAP 脉冲后直接获得的结果,红线表示激动剂 TPC2-A1N 激活 TPC2 通道时产生的电流,绿线表示泄漏电流,这可能是由于密封不完整造成的。成功的测量不仅可以通过捕获通道的形状来识别,还可以通过没有泄漏电流来识别。如果存在泄漏电流,电流和 X 轴的交点将为 0,形成一条直线(膜内外离子不同)。 请单击此处查看此图的较大版本。
| 溶酶体内体贴剂移液器 | 全细胞贴剂移液器 | |||||||
| 周期 | 热 | 拉 | 维尔 | 时间 | 热 | 拉 | 维尔 | 时间 |
| 1 | 由 ramp 协议 +10 确定的值 | 空白 | 30 | 150 | 由 ramp 协议 +10 确定的值 | 空白 | 40 | 150 |
| 2 | 30 | 150 | 40 | 150 | ||||
| 3 | 30 | 150 | 40 | 150 | ||||
| 4 | 30 | 150 | 40 | 150 | ||||
| 5 | 由 ramp 协议 +25 确定的值 | 18 | 150 | - | - | |||
| 6 | 由 ramp 协议 +20 确定的值 | 15 | 150 | - | - |
表 1:贴片移液器拉动方案。 首先,使用 ramp 函数找到合适的 HEAT 温度,然后按照表格调整六个拉动周期。
| 非特异性内溶酶体 (Vacuolin-1) / 特异性 LE/LY (YM201636) | 巨 噬 细胞 | 1 微米 / 0.4 微米 | 1-2 小时 / 1-3 小时 |
| COS-1、HEK293、Hela、成纤维细胞等 | 1 微米 / 0.4 微米 | 过夜 / 过夜 | |
| 心肌细胞、骨骼肌细胞 | 5 微米 | 24-48 小时 |
表 2:使用药物药物扩增不同细胞类型中溶酶体所需的浓度和治疗持续时间。 不同的细胞类型在药物治疗下的扩增效率表现出显着差异。通常,具有更活跃的内溶酶体系统的细胞需要更短的处理时间。然而,最佳处理时间和浓度仍需通过实验确定13。
作者没有竞争性的经济利益或其他利益冲突。
该协议详细介绍了一种使用手动溶酶体膜片钳系统直接测量细胞内囊泡上离子通道活性的方法。我们说明了涉及扩大内溶酶体和手动分离这些囊泡的方法。这种方法确保研究人员可以准确地复制和应用该程序。
台湾国家科学技术委员会 (MOST 110-2320-B-002-022)、国立台湾大学 (NTU-112L7818) 和台湾国立卫生研究院 (NHRI-EX112-11119SC)。
| 硼硅酸盐玻璃 | 萨特仪 | BF150-75-10 | 外径:1.5 mm,内径 0.75 mm 10 cm 长,带灯丝 |
| Digidata 1140A | Axon Instruments | ||
| 倒置显微镜 IX73 | 奥林巴斯 | ||
| P-97 型微量移液器拉拔器 | 萨特仪器 | ||
| MPC-200 | 萨特仪器 | ||
| MultiClamp 700B | Axon Instruments | ||
| 机 | |||
| 快速释放腔室 | Warner 仪器 | 641943 | QR-40LP,用于 25 mm 盖玻片 |