本研究提供了一种评估结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)与SLAMF1微生物传感器相互作用的实验方案。该实验采用人单核细胞来源的巨噬细胞,通过流式细胞术和荧光显微镜进行检测。所述工具适用于研究病原体与免疫受体之间的相互作用。
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本研究提供了一种评估结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)与SLAMF1微生物传感器相互作用的实验方案。该实验采用人单核细胞来源的巨噬细胞,通过流式细胞术和荧光显微镜进行检测。所述工具适用于研究病原体与免疫受体之间的相互作用。
病原体与免疫受体之间直接相互作用的评估通常涉及复杂的技术,或需要使用转基因品系和基因工程细胞。本文介绍一种检测巨噬细胞微生物感应受体SLAMF1与 结核分枝杆菌 进行了描述。开发了两种技术方法,分别采用流式细胞术和荧光显微镜。制备人巨噬细胞的全细胞蛋白提取物,然后与完整细胞共同孵育 M. tuberculosis (WCMtb) 或 M. tuberculosis 抗原(Mtb Ags)在4 °C下孵育过夜,最后通过甲醛/甘氨酸/乙二醇双(琥珀酰亚胺基琥珀酸酯)处理进行交联. 通过流式细胞术检测SLAMF1与WCMtb的相互作用,使用PE标记的特异性抗SLAMF1抗体。荧光显微镜下验证该相互作用的存在:将罗丹明-PE标记的结核分枝杆菌抗原(Mtb Ags)固定于聚-D-赖氨酸包被的载玻片上,随后与单核细胞来源巨噬细胞的总蛋白提取物共同孵育。经交联处理后,使用一抗(抗SLAMF1)和二抗(Alexa Fluor 488标记)对SLAMF1进行可视化检测。这些实验方法提供了一种强有力的生化工具,用于检测病原体与免疫受体之间的相互作用,克服了转基因细胞系及蛋白质基因表达调控实验中的相关技术难题。
结核分枝杆菌, 142年前被发现的结核病致病病原体至今仍是全球性难题,目前至少感染了全球四分之一的人口1通过感染者产生的空气飞沫传播, M. tuberculosis 到达肺部的肺泡巨噬细胞,并可在其中以潜伏状态长期存活2,3不仅局部巨噬细胞反应被激活,近年来还发现外周单核细胞可被招募至呼吸道并分化为肺泡巨噬细胞,从而产生更强烈的抗感染反应 M. tuberculosis 比其胎儿来源的对应物2,4.
巨噬细胞是先天免疫系统中的关键参与者。在吞噬M. tuberculosis 后,巨噬细胞表现出多种杀菌功能,例如分泌促炎性细胞因子、吞噬溶酶体的融合,以及激活其他免疫细胞以清除M. tuberculosis2,3。然而,该病原体复杂的结构特征使其能够产生多种效应分子(如蛋白质和脂类),调控巨噬细胞的代谢与功能,从而影响炎症反应过程3。通过分泌毒力因子或利用宿主因子,M. tuberculosis对巨噬细胞反应进行操控,进而实施多种逃逸策略。一些关键的免疫逃逸机制包括诱导抗炎性细胞因子的产生、抑制吞噬溶酶体的成熟与酸化、改变氧化应激状态、破坏自噬过程,以及在抗原加工和呈递过程中出现缺陷3,5。
巨噬细胞与M. tuberculosis之间严格调控的相互作用对于适当免疫反应的形成至关重要。因此,研究这些免疫突触是识别宿主-病原体相互作用所诱导的免疫保护或免疫病理机制的关键,同时也有助于发现潜在的治疗靶点。多种受体介导了M. tuberculosis的识别和/或内化过程,包括TLRs6,7,8、NLRs7,8、补体受体6,8、C型凝集素受体6,8以及清道夫受体6,8。越来越多的数据表明,细胞表面和细胞内的PRRs在感染过程中均发挥重要作用,能够识别被调理素包被和未被调理素包被的M. tuberculosis。
Zihad 和 Sifat 等人最近综述了 PRRs 在固有免疫细胞响应 M. tuberculosis 感染中的作用9。特别是,TLR 家族的大多数成员已被证实参与识别 M. tuberculosis 的配体6,7。位于细胞表面的 TLR2 可识别分枝杆菌抗原,如酰化脂蛋白、19-kDa 脂蛋白、LprA 脂蛋白、LprG 脂蛋白、30-kDa 抗原、38-kDa 抗原、MymA、脯氨酸-脯氨酸-谷氨酸(PPE)-57、LAM、LM、PIM、热休克蛋白 60、特征性蛋白 Rv1509 以及分泌蛋白 ESAT-67。膜结合型 TLR4 可与热休克蛋白、38-kDa 抗原、RpfE、Rv0652、Rv0335c、Rv2659c、Rv1738、Rv2627c、Rv2628、GrpE 和 HBHA 相互作用。另一方面,内体 TLRs(TLR3、7、8 和 9)的配体包括 M. tuberculosis 的双链 RNA(dsRNA)、tRNA、单链 RNA(ssRNA)、吞噬体 RNA 以及双链 DNA(dsDNA)。此外,TLR2 在与 TLR1 和 TLR6、TLR4 或 TLR9 协同作用时,在启动免疫应答中发挥重要作用6,7。NOD2 和 NLRP3 是结核病中研究最为清楚的胞质 NLR 家族受体。尽管它们的特异性配体仍在研究中,但已知 NOD2 可被胞壁酰二肽激活,而 NLRP3 可被 ESAT-6 激活7,8。C 型凝集素受体经典地参与 M. tuberculosis 的内吞过程。Dectin-2 可作为 M. tuberculosis 细胞壁 ManLAM 的直接 PRR,而 Dectin-1 的配体至今尚未被发现8。Mincle 和 MCL 均可识别糖脂海藻糖-6,6′-二分枝菌酸(TDM),也称为索状因子7。DCAR 可与分枝杆菌糖脂磷脂酰肌醇甘露糖苷(PIMs)相互作用7。CR3 识别分枝杆菌的 LAM 和 PIM,DC-SIGN 结合 ManLAM,MR 可识别多种 M. tuberculosis 成分,包括 ManLAM、PIM、LM、38-kDa 糖蛋白、19-kDa 抗原以及其他甘露糖基化蛋白,而 DCIR 的配体仍未知。
可溶性CLRs包括SP-A,其可识别ManLam、LM、60-kDa糖蛋白以及糖蛋白Apa;SP-D可与LAM、LM和PILAM相互作用;MBL则特异性识别ManLAM6,7。清道夫受体也属于吞噬性PRRs。SR-A和MARCO以TDM为配体,SR-B1识别ESAT-6,而CD36可结合ManLAM和LM7,8。此外,Dectin-1、Mincle和MARCO还可与TLR2或TLR4协同作用,在识别结核分枝杆菌(M. tuberculosis)的PAMPs后触发信号通路6,7。CD14是一种表面受体,能够内化非调理素包被的细菌,并可识别热休克蛋白Chaperonin 60.1。特别是,CD14可作为共受体与MARCO和TLR2协同发挥作用6。AIM2是一种胞质受体,当结核分枝杆菌(M. tuberculosis)从吞噬体中逃逸后,可感知单链DNA(ssDNA)8。最后,AhR是一种配体激活的转录因子,可结合结核分枝杆菌(M. tuberculosis)产生的色素性毒力因子萘醌类物质phthiocol6。
上述描述的许多相互作用仍处于假说阶段,尚未得到严格证实。甚至某些受体的配体仍不明确,这进一步凸显了深入理解结核分枝杆菌(M. tuberculosis)免疫识别领域的重要性。在此背景下,Barbero 等人最近报道了共刺激分子 SLAMF1(信号淋巴细胞激活分子)是一种 M. tuberculosis 的受体10。SLAMF1 不仅作为信号分子,还可作为 M. tuberculosis 的感应器,在结核病中发挥着特别引人关注的作用。SLAMF1 可通过调节多种保护性免疫功能来诱导免疫细胞的活化,例如通过 Erk/CREB 磷酸化促进 T 细胞产生 IFN-γ11,12,13、促进中性粒细胞的自噬14,以及增强巨噬细胞对细菌的清除能力15。
多年来,受体-配体相互作用的研究采用了多种技术,包括酶联免疫吸附测定(ELISA)、表面等离子共振(SPR)、等温滴定 calorimetry(ITC)、荧光偏振(FP)、X射线晶体学、核磁共振(NMR)波谱法、微尺度热泳(MST)、共振能量转移(如BRET或FRET)、共聚焦显微镜、电子显微镜、冷冻电子显微镜(Cryo-EM)和原子力显微镜(AFM)。16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28一些方法涉及报告基因、标记的重组蛋白或嵌合分子、基因敲除、基因敲降或过表达模型的使用。此外,计算工具可预测受体-配体相互作用及结合位点,常与生物学方法结合使用,以全面理解这些相互作用。29,30,31此处介绍了两种检测生化相互作用的替代方法,以及一段关于如何对细菌进行荧光标记的说明。一种可用于研究受体-病原体相互作用的实验方案 体外 将介绍SLAMF1的评估,特别是对SLAMF1-M. tuberculosis 通过流式细胞术和荧光显微镜检测结合情况,这两种技术通常可及且常规使用。
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所有涉及人单核细胞来源巨噬细胞的操作均遵循《赫尔辛基宣言》(2013年)进行,并符合UNNOBA伦理委员会(COENOBA)的规定。在样本采集前已获得书面知情同意。男性/女性分组分布为13/6,中位年龄为32岁,四分位距(IQR)为18–75岁。既往存在病理状况、合并症或结核病阳性诊断被列为排除标准。试剂与设备的详细信息列于材料表中。
1. 单核细胞来源的巨噬细胞培养与刺激
2. 总细胞蛋白提取物的制备
3. M. tuberculosis 通过流式细胞术检测SLAMF1相互作用
4. M. tuberculosis 抗原标记
5. M. tuberculosis 通过荧光显微镜检测SLAMF1相互作用
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本研究提供了一种用于评估M. tuberculosis与人巨噬细胞中免疫受体SLAMF1相互作用的实验方案(图1)。首先,采集健康供体的外周血,通过密度梯度离心法分离外周血单个核细胞(PBMCs),再利用磁珠阳性分选法分离单核细胞(纯度≥95%,图2A,B)。将分离得到的单核细胞接种于塑料培养板,贴壁2小时以获得单核细胞来源的巨噬细胞,随后进行过夜培养。接着,用超声处理的M. tuberculosis(Mtb Ags)刺激巨噬细胞,以诱导SLAMF1在细胞表面的表达(如先前报道10),并通过流式细胞术确认SLAMF1表面表达水平(图2C)。最后,使用RIPA裂解缓冲液结合涡旋振荡及冰上孵育裂解巨噬细胞,以促进细胞裂解。所获得的总蛋白提取物用于后续的相互作用检测。
在第一组实验操作中,采用流...
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本研究为研究生物化学相互作用提供了有用的指南 M. tuberculosis 以及在结核病宿主反应中起关键作用的人类巨噬细胞中表达的微生物传感器。所提供的实验方案将有助于解析在病原体入侵过程中发挥作用的分子 M. tuberculosis 进入吞噬细胞。
表征生物分子相互作用(例如病原体与免疫受体之间的相互作用)对于理解免疫保护机制以及结核分枝杆菌(M. tuberculosis)所诱导的免疫逃逸策略至关重要。很多时候,证明受体与其细菌配体之间的直接相互作用十分复杂,可能需要复杂的技术或缺乏通用性的实验系统。Driessen 等人利用M. bovis BCG的突变缺陷菌株,研究了磷脂酰肌醇甘露糖苷在分枝杆菌与DC-SIGN相互作用中的作用32。尽管他们成功研究了这些相互作用,但作者并未发现突变菌株之间存在差异,并指出构建显示结合能力降低的突变细菌将是一项极为艰巨的任务32。其他研究人员开展了出色且繁重的工作,以证明T...
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作者声明无利益冲突。
本工作由布宜诺斯艾利斯省西北国立大学(资助编号 SIB 0618/2019、SIB 2582/2012,授予 V.P.)、国家科学技术促进局(ANPCyT,资助编号 PICT-2012-2459 和 PICT A 2017-1896,授予 V.P.,以及 PICT-2021-I-INVI-00584,授予 A.B.)、弗洛伦西奥·菲奥里尼基金会以及国家科学技术研究理事会(CONICET,资助编号 PIO 15720150100010CO,授予 V.P.)提供支持。我们感谢 Natalia Menite 和 Gastón Villafañe 提供的技术支持。我们感谢 Paula Barrionuevo 博士和 Luciana Balboa 博士在本研究相关论文发表过程中提供的科学讨论。最后,我们感谢 Estermann 博士在交联实验方案方面的建议,Moroni 讲师在聚赖氨酸操作方面的指导,以及 Moriconi 讲师在示意图绘制方面提供的帮助。
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| Alexa Fluor 488 二抗 | Invitrogen | A21121 | 用于荧光显微镜检测 |
| anti-SLAMF1 FITC 抗体 | eBioscience | 11-1509-42 | 用于流式细胞术 |
| anti-SLAMF1 PE 抗体 | BioLegend | 306308 | 用于流式细胞术 |
| anti-SLAMF1 一抗 | BioLegend | 306302 | 用于荧光显微镜检测 |
| Aqua-Poly/Mount | Polysciences | 18606-20 | 封片剂 |
| CD14 MicroBeads | Miltenyi Biotec | 130-097-052 | 用于单核细胞分离 |
| 12 mm 盖玻片 | HDA | - | 用于显微镜下的相互作用检测 |
| EGS | ThermoFisher Scientific | 21565 | 用于交联处理 |
| FACSCanto II | BD Biosciences | 338960 | 配备 BD FACSDiva 软件的流式细胞仪 |
| 胎牛血清 | Natocor | - | 灭活并辐照处理,用于巨噬细胞培养 |
| Ficoll-Paque PLUS | Cytiva | 17144003 | 用于外周血单个核细胞(PBMCs)分离 |
| Fiji/ImageJ | 开源软件 | - | 用于显微图像分析 |
| FlowJo 7.6.2 | Tree Star | - | 用于流式细胞术数据分析 |
| 甲醛 | Merck | K47740803613 | 用于交联处理 |
| 载玻片 | Glass Klass | - | 用于显微镜下的相互作用检测 |
| 甘氨酸 | Sigma | G8898 | 用于交联处理 |
| Imager.A2 | Carl Zeiss | 430005-9901-000 | 配备 Colibri 7 照明模块的荧光显微镜 |
| iMark | BIO-RAD | 1681130 | 微孔板吸光度读数仪 |
| L-谷氨酰胺 | Sigma Aldrich | 49419 | 用于巨噬细胞培养 |
| M. tuberculosis,H37Rv 菌株,γ-射线辐照全菌细胞 | BEI Resources, NIAID, NIH | NR-14819 | 用于相互作用检测 |
| M. tuberculosis,H37Rv 菌株,全菌裂解物 | BEI Resources, NIAID, NIH | NR-14822 | 用于巨噬细胞刺激及相互作用检测 |
| Neofuge 13R | Heal Force | Neofuge 13R | 用于蛋白质提取的高速冷冻离心机 |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | 15140122 | 用于巨噬细胞培养 |
| PMSF | ThermoFisher Scientific | 36978 | 用于蛋白质分离 |
| 多聚-L-赖氨酸 | Sigma Aldrich | A-003-M | 用于盖玻片处理 |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma Aldrich | P8340 | 用于蛋白质分离 |
| 罗丹明 B | Sigma Aldrich | 21955 | 用于 M. tuberculosis 染色 |
| RPMI 1640 | Gibco | 11875093 | 用于巨噬细胞培养 |
| Sorvall ST 16/16R 离心机 | ThermoFisher Scientific | 75004240 | 用于外周血单个核细胞(PBMCs)和单核细胞分离 |
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