需要JoVE订阅才能观看此内容。 请登录或开始免费试用

方法文章

用于研究的荧光检测方法 结核分枝杆菌 与免疫受体SLAMF1的相互作用

1.2K 次观看

DOI:

10.3791/67745

2025年2月28日

本文内容

摘要

本研究提供了一种评估结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)与SLAMF1微生物传感器相互作用的实验方案。该实验采用人单核细胞来源的巨噬细胞,通过流式细胞术和荧光显微镜进行检测。所述工具适用于研究病原体与免疫受体之间的相互作用。

摘要

病原体与免疫受体之间直接相互作用的评估通常涉及复杂的技术,或需要使用转基因品系和基因工程细胞。本文介绍一种检测巨噬细胞微生物感应受体SLAMF1与 结核分枝杆菌 进行了描述。开发了两种技术方法,分别采用流式细胞术和荧光显微镜。制备人巨噬细胞的全细胞蛋白提取物,然后与完整细胞共同孵育 M. tuberculosis (WCMtb) 或 M. tuberculosis 抗原(Mtb Ags)在4 °C下孵育过夜,最后通过甲醛/甘氨酸/乙二醇双(琥珀酰亚胺基琥珀酸酯)处理进行交联. 通过流式细胞术检测SLAMF1与WCMtb的相互作用,使用PE标记的特异性抗SLAMF1抗体。荧光显微镜下验证该相互作用的存在:将罗丹明-PE标记的结核分枝杆菌抗原(Mtb Ags)固定于聚-D-赖氨酸包被的载玻片上,随后与单核细胞来源巨噬细胞的总蛋白提取物共同孵育。经交联处理后,使用一抗(抗SLAMF1)和二抗(Alexa Fluor 488标记)对SLAMF1进行可视化检测。这些实验方法提供了一种强有力的生化工具,用于检测病原体与免疫受体之间的相互作用,克服了转基因细胞系及蛋白质基因表达调控实验中的相关技术难题。

引言

结核分枝杆菌, 142年前被发现的结核病致病病原体至今仍是全球性难题,目前至少感染了全球四分之一的人口1通过感染者产生的空气飞沫传播, M. tuberculosis 到达肺部的肺泡巨噬细胞,并可在其中以潜伏状态长期存活2,3不仅局部巨噬细胞反应被激活,近年来还发现外周单核细胞可被招募至呼吸道并分化为肺泡巨噬细胞,从而产生更强烈的抗感染反应 M. tuberculosis 比其胎儿来源的对应物2,4.

巨噬细胞是先天免疫系统中的关键参与者。在吞噬M. tuberculosis 后,巨噬细胞表现出多种杀菌功能,例如分泌促炎性细胞因子、吞噬溶酶体的融合,以及激活其他免疫细胞以清除M. tuberculosis2,3。然而,该病原体复杂的结构特征使其能够产生多种效应分子(如蛋白质和脂类),调控巨噬细胞的代谢与功能,从而影响炎症反应过程3。通过分泌毒力因子或利用宿主因子,M. tuberculosis对巨噬细胞反应进行操控,进而实施多种逃逸策略。一些关键的免疫逃逸机制包括诱导抗炎性细胞因子的产生、抑制吞噬溶酶体的成熟与酸化、改变氧化应激状态、破坏自噬过程,以及在抗原加工和呈递过程中出现缺陷3,5

巨噬细胞与M. tuberculosis之间严格调控的相互作用对于适当免疫反应的形成至关重要。因此,研究这些免疫突触是识别宿主-病原体相互作用所诱导的免疫保护或免疫病理机制的关键,同时也有助于发现潜在的治疗靶点。多种受体介导了M. tuberculosis的识别和/或内化过程,包括TLRs6,7,8、NLRs7,8、补体受体6,8、C型凝集素受体6,8以及清道夫受体6,8。越来越多的数据表明,细胞表面和细胞内的PRRs在感染过程中均发挥重要作用,能够识别被调理素包被和未被调理素包被的M. tuberculosis

Zihad 和 Sifat 等人最近综述了 PRRs 在固有免疫细胞响应 M. tuberculosis 感染中的作用9。特别是,TLR 家族的大多数成员已被证实参与识别 M. tuberculosis 的配体6,7。位于细胞表面的 TLR2 可识别分枝杆菌抗原,如酰化脂蛋白、19-kDa 脂蛋白、LprA 脂蛋白、LprG 脂蛋白、30-kDa 抗原、38-kDa 抗原、MymA、脯氨酸-脯氨酸-谷氨酸(PPE)-57、LAM、LM、PIM、热休克蛋白 60、特征性蛋白 Rv1509 以及分泌蛋白 ESAT-67。膜结合型 TLR4 可与热休克蛋白、38-kDa 抗原、RpfE、Rv0652、Rv0335c、Rv2659c、Rv1738、Rv2627c、Rv2628、GrpE 和 HBHA 相互作用。另一方面,内体 TLRs(TLR3、7、8 和 9)的配体包括 M. tuberculosis 的双链 RNA(dsRNA)、tRNA、单链 RNA(ssRNA)、吞噬体 RNA 以及双链 DNA(dsDNA)。此外,TLR2 在与 TLR1 和 TLR6、TLR4 或 TLR9 协同作用时,在启动免疫应答中发挥重要作用6,7。NOD2 和 NLRP3 是结核病中研究最为清楚的胞质 NLR 家族受体。尽管它们的特异性配体仍在研究中,但已知 NOD2 可被胞壁酰二肽激活,而 NLRP3 可被 ESAT-6 激活7,8。C 型凝集素受体经典地参与 M. tuberculosis 的内吞过程。Dectin-2 可作为 M. tuberculosis 细胞壁 ManLAM 的直接 PRR,而 Dectin-1 的配体至今尚未被发现8。Mincle 和 MCL 均可识别糖脂海藻糖-6,6′-二分枝菌酸(TDM),也称为索状因子7。DCAR 可与分枝杆菌糖脂磷脂酰肌醇甘露糖苷(PIMs)相互作用7。CR3 识别分枝杆菌的 LAM 和 PIM,DC-SIGN 结合 ManLAM,MR 可识别多种 M. tuberculosis 成分,包括 ManLAM、PIM、LM、38-kDa 糖蛋白、19-kDa 抗原以及其他甘露糖基化蛋白,而 DCIR 的配体仍未知。

可溶性CLRs包括SP-A,其可识别ManLam、LM、60-kDa糖蛋白以及糖蛋白Apa;SP-D可与LAM、LM和PILAM相互作用;MBL则特异性识别ManLAM6,7。清道夫受体也属于吞噬性PRRs。SR-A和MARCO以TDM为配体,SR-B1识别ESAT-6,而CD36可结合ManLAM和LM7,8。此外,Dectin-1、Mincle和MARCO还可与TLR2或TLR4协同作用,在识别结核分枝杆菌(M. tuberculosis)的PAMPs后触发信号通路6,7。CD14是一种表面受体,能够内化非调理素包被的细菌,并可识别热休克蛋白Chaperonin 60.1。特别是,CD14可作为共受体与MARCO和TLR2协同发挥作用6。AIM2是一种胞质受体,当结核分枝杆菌(M. tuberculosis)从吞噬体中逃逸后,可感知单链DNA(ssDNA)8。最后,AhR是一种配体激活的转录因子,可结合结核分枝杆菌(M. tuberculosis)产生的色素性毒力因子萘醌类物质phthiocol6

上述描述的许多相互作用仍处于假说阶段,尚未得到严格证实。甚至某些受体的配体仍不明确,这进一步凸显了深入理解结核分枝杆菌(M. tuberculosis)免疫识别领域的重要性。在此背景下,Barbero 等人最近报道了共刺激分子 SLAMF1(信号淋巴细胞激活分子)是一种 M. tuberculosis 的受体10。SLAMF1 不仅作为信号分子,还可作为 M. tuberculosis 的感应器,在结核病中发挥着特别引人关注的作用。SLAMF1 可通过调节多种保护性免疫功能来诱导免疫细胞的活化,例如通过 Erk/CREB 磷酸化促进 T 细胞产生 IFN-γ11,12,13、促进中性粒细胞的自噬14,以及增强巨噬细胞对细菌的清除能力15

多年来,受体-配体相互作用的研究采用了多种技术,包括酶联免疫吸附测定(ELISA)、表面等离子共振(SPR)、等温滴定 calorimetry(ITC)、荧光偏振(FP)、X射线晶体学、核磁共振(NMR)波谱法、微尺度热泳(MST)、共振能量转移(如BRET或FRET)、共聚焦显微镜、电子显微镜、冷冻电子显微镜(Cryo-EM)和原子力显微镜(AFM)。16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28一些方法涉及报告基因、标记的重组蛋白或嵌合分子、基因敲除、基因敲降或过表达模型的使用。此外,计算工具可预测受体-配体相互作用及结合位点,常与生物学方法结合使用,以全面理解这些相互作用。29,30,31此处介绍了两种检测生化相互作用的替代方法,以及一段关于如何对细菌进行荧光标记的说明。一种可用于研究受体-病原体相互作用的实验方案 体外 将介绍SLAMF1的评估,特别是对SLAMF1-M. tuberculosis 通过流式细胞术和荧光显微镜检测结合情况,这两种技术通常可及且常规使用。

访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。

方案

所有涉及人单核细胞来源巨噬细胞的操作均遵循《赫尔辛基宣言》(2013年)进行,并符合UNNOBA伦理委员会(COENOBA)的规定。在样本采集前已获得书面知情同意。男性/女性分组分布为13/6,中位年龄为32岁,四分位距(IQR)为18–75岁。既往存在病理状况、合并症或结核病阳性诊断被列为排除标准。试剂与设备的详细信息列于材料表中。

1. 单核细胞来源的巨噬细胞培养与刺激

  1. 采血
    1. 使用肝素化注射器通过静脉穿刺从健康供者采集60 mL血液。
      注意:血液提取必须由生物化学家或采血技术员进行。
    2. 将针头丢弃至锐器处置容器中,所有接触过供者血液的材料均应丢弃至病理废物容器中。
  2. 单核细胞分离与巨噬细胞制备
    1. 将血液小心转移至50 mL离心管中,并用生理盐水等体积稀释。
    2. 通过密度梯度介质离心分离获取外周血单个核细胞(PBMCs)。
    3. 从白色晕环区域收集外周血单个核细胞(PBMCs)。
    4. 用生理盐水以400 x g离心洗涤两次 g 10分钟,最后在200 x下洗涤一次 g 在20 °C下孵育15分钟以去除血小板。
    5. 在细胞计数板中确定PBMC的数量,并使用CD14磁珠进行CD14阳性磁选。
      注意:磁珠分选过程中,请严格遵循试剂盒生产商的说明书操作。此外,可使用流式细胞术检测所分离单核细胞的纯度。
    6. 将分离的细胞重悬于RPMI 1640培养基中,使用细胞计数板测定单核细胞数量。
    7. 接种 500 µL 的 1 × 106每孔加入1 mL经CD14阳性筛选的单核细胞,置于24孔细胞培养板中,无血清条件下培养以促进贴壁。
    8. 2小时后,用预热的RPMI 1640培养基洗涤,去除未贴壁细胞。
    9. 为了分化巨噬细胞,将贴壁的单核细胞在1 mL完全培养基(含L-谷氨酰胺的RPMI 1640培养基,添加10%胎牛血清(FBS)、100 U/mL青霉素和100 µg/mL链霉素)中继续培养16–18小时(过夜)。
    10. 第二天更换培养基。移除原培养基,用1 mL 1×PBS洗涤,加入1 mL完全培养基。
    11. 用超声处理的 M. tuberculosis (M. tuberculosis 抗原(Ags)孵育24小时。使用10 µL的 M. tuberculosis Ags(10 µL = 1 × 106 细菌)每 1 × 106 单核细胞来源的巨噬细胞
      注意:10 µL的 M. tuberculosis Ags(Mtb Ags)= 1 × 106 细菌,通过OD600定量纳米米 在分光光度计中 以光密度值(O.D.)为1时对应1 × 108 细菌/mL。使用BSL2生物安全柜,以及在含5% CO₂的 atmosphere 中37 °C的培养箱2 所有培养步骤。
  3. SLAMF1 表达的验证
    1. 从单个孔中收集巨噬细胞。将培养板置于冷表面。加入1 mL冷FACS缓冲液(1× PBS + 2% FBS),重复两次,通过上下吹打使细胞脱落。使用流式细胞术专用圆底管收集细胞。
    2. 以 500 x g 离心细胞 g 4 °C 下离心 5 分钟。弃去上清液。
    3. 在4 °C避光条件下,用荧光染料偶联的抗人SLAMF1抗体对细胞染色30分钟。加入1.25 µL抗体后涡旋混匀。
    4. 使用FACS缓冲液洗涤细胞以去除多余的抗体,将细胞沉淀重悬于FACS缓冲液中,然后使用流式细胞仪检测样本。
      注意:1.25 µL 抗 SLAMF1 抗体相当于 0.0625 µg,用于标记 0.5 x 106 巨噬细胞。然而,强烈建议对抗体进行滴定,并设置相应的同型对照或荧光减一(FMO)对照。

2. 总细胞蛋白提取物的制备

  1. 裂解缓冲液的制备
    1. 配制含有 150 mM NaCl、10 mM Tris、5 mM EDTA、1% SDS、1% Triton X-100 和 1% 脱氧胆酸钠的放射免疫沉淀分析(RIPA)缓冲液。
    2. 在 RIPA 缓冲液中添加 1 mM 苯甲基磺酰氟(PMSF)以及蛋白酶抑制剂,如抑肽酶 A(Pepstatin A)和亮抑酶肽(Leupeptin)。
  2. 细胞收集与蛋白提取
    1. 使用 P1000 移液器弃去孔板中的完全 RPMI 培养基,并用预冷的 1× PBS 通过反复吹打收集巨噬细胞。
    2. 将细胞转移至 1.5 mL 微量离心管中。每管收集一个孔的细胞。
    3. 在 4 °C 条件下,以 500 × g 离心 5 分钟,弃去上清液。
    4. 加入 1 mL 预冷的 PBS,重复步骤 2.2.2 和 2.2.3,将细胞收集至同一微量离心管中。
    5. 将细胞沉淀重悬于 100 µL 1× PBS 中,并合并四管细胞。重复步骤 2.2.3。每管最终含有 2 × 106 个巨噬细胞。
    6. 加入 100 µL 添加了抑制剂的 RIPA 缓冲液,冰上孵育 1 小时,每 10 分钟涡旋一次。
    7. 在 14,000 × g 条件下离心 15 分钟。收集上清液,并于 -20 °C 保存直至使用。

3. M. tuberculosis 通过流式细胞术检测SLAMF1相互作用

  1. 蛋白质-细菌交联
    1. 孵育 1 × 106 全灭活 M. tuberculosis 细胞(WCMtb, M. tuberculosis 经γ射线照射灭活)与1×10⁶个细胞的蛋白提取物混合6 在4 °C下,于旋转微量离心管架中孵育巨噬细胞(50 µL)过夜。
      注意:10 µL WCMtb = 1 × 106 细菌,通过 O.D. 600 定量纳米米 在分光光度计中 以光密度值(O.D.)1视为1 × 108 细菌/mL
    2. 次日,加入500 µL用1×PBS稀释的1%甲醛溶液,在室温(RT)下振荡孵育15分钟。
    3. 加入25 µL用水稀释的0.125 M甘氨酸。室温下振荡孵育5分钟。
    4. 用1 mL 1×PBS在14,000 × g条件下洗涤两次 g 5 分钟。每次洗涤步骤之间弃去上清液。
    5. 将沉淀重悬,并在500 µL含2 mM乙烯二醇双(琥珀酰亚胺基琥珀酸酯)(EGS)交联剂的溶液中孵育,该溶液用冰醋酸与水按1:1体积比配制,室温下孵育1小时。
      注意:建议在使用时配制试剂。配制EGS时,需将冰醋酸和水按等比例混合,并加热至70 °C。若溶液温度不足,则EGS无法完全重悬。
  2. SLAMF1 染色
    1. 使用500 µL的1x PBS进行第一次洗涤,1 mL进行第二次洗涤,重复步骤3.1.4。
    2. 在4 °C避光孵育30分钟,向微管中加入抗人SLAMF1抗体(同1.3.3步骤),对蛋白-细菌复合物进行染色,随后涡旋混匀。使用适合1 x 10⁶细胞的抗体用量6 细胞(2.5 µL 或 0.125 µg)
    3. 用FACS缓冲液洗涤细胞以去除多余的抗体,将细胞沉淀重悬于FACS缓冲液中,并在流式细胞仪中检测样本(同步骤1.3.4)。
      注意:进行相应的同型对照或FMO对照。

4. M. tuberculosis  抗原标记

  1. 将罗丹明B用乙醇重悬,配制成5 mg/mL(1000倍浓缩液)的储存液。保存于-20 °C,待用。
  2. 在1.5 mL微量离心管中,每100 µL结核分枝杆菌抗原(M. tuberculosis Ags)加入1 µL罗丹明B。
  3. 室温下持续振荡(涡旋)孵育45分钟。
  4. 用1 mL 1× PBS在24 °C、14,000 × g 条件下洗涤至少3次,每次5分钟,直至上清液透明。沉淀物(Mtb-R Ags)呈淡粉色。
  5. 用100 µL 1× PBS重悬Mtb-R Ags,恢复至初始体积。
    注意:建议在无菌条件下操作。确保染色在实验前立即进行。

5. M. tuberculosis 通过荧光显微镜检测SLAMF1相互作用

  1. 细菌-蛋白交联
    1. 使用圆头手术镊将直径12 mm的圆形盖玻片放入24孔细胞培养板中(每孔1片)。
      注意:用70%乙醇彻底清洗盖玻片。如需要,可进行高压灭菌或在紫外灯下照射30分钟以灭菌。
    2. 在4 °C条件下,用400 µL含10 µg/mL多聚-L-赖氨酸(Poly-D-Lysine)的溶液孵育盖玻片过夜。用铝箔包裹培养板以避光。
    3. 次日,从冰箱中取出培养板,用1 mL去离子水洗涤盖玻片两次。
    4. 让盖玻片自然干燥。
    5. 将20 µL(2 × 106)Mtb-R Ags加入180 µL 1× PBS中稀释。最终体积200 µL足以完全覆盖一片盖玻片。
    6. 在细胞培养箱中,37 °C条件下用Mtb-R Ags孵育盖玻片1小时。
    7. 弃去剩余液体,用1 mL 1× PBS洗涤两次。
      注意:在此步骤中,可通过荧光显微镜使用对应红色通道的滤光片检查Mtb-R是否正确黏附于盖玻片上。
    8. 加入400 µL封闭缓冲液(含10%胎牛血清的1× PBS),在室温下振荡(摇床)孵育30分钟。
    9. 用400 µL封闭缓冲液洗涤两次。
    10. 加入100 µL蛋白提取物与300 µL 1× PBS的混合液,在室温下振荡孵育2小时。
    11. 加入400 µL用1× PBS稀释的1%甲醛溶液,在室温下振荡孵育15分钟。
    12. 加入500 µL用去离子水稀释的0.125 M甘氨酸溶液,在室温下振荡孵育5分钟。
    13. 用1 mL 1× PBS洗涤两次。
    14. 加入400 µL 2 mM EGS溶液,在室温下振荡孵育1小时。
    15. 重复步骤5.1.13
      注意:建议在使用前现配试剂。
  2. SLAMF1染色
    1. 用石蜡膜包裹细胞培养板的盖子。
    2. 在覆盖有石蜡膜的盖子上滴加60 µL预先滴定好的抗SLAMF1一抗(1:75稀释)。
    3. 使用弯头精细手术镊和针小心地从培养板中取出盖玻片。
      注意:为便于取出盖玻片,可将针尖弯曲成约45°角。
    4. 将盖玻片倒置覆盖在含有抗体的液滴上,在室温、避光条件下孵育30分钟。
    5. 抬起盖玻片,用封闭缓冲液洗涤两次。
    6. 将盖玻片倒置覆盖在新的含有二抗(1:200稀释)的液滴上,在室温、避光条件下孵育30分钟。
    7. 重复步骤5.2.5。
    8. 去除多余液体,将盖玻片置于载玻片上的封片液滴中进行封片。
    9. 使用合适的滤光片在荧光显微镜下观察。
      注意:建议在无菌条件下操作。抗体应使用封闭缓冲液稀释。操作盖玻片时需小心,避免产生划痕影响显微镜观察。强烈推荐使用适用于荧光成像的封片液。

访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。

结果

本研究提供了一种用于评估M. tuberculosis与人巨噬细胞中免疫受体SLAMF1相互作用的实验方案(图1)。首先,采集健康供体的外周血,通过密度梯度离心法分离外周血单个核细胞(PBMCs),再利用磁珠阳性分选法分离单核细胞(纯度≥95%,图2A,B)。将分离得到的单核细胞接种于塑料培养板,贴壁2小时以获得单核细胞来源的巨噬细胞,随后进行过夜培养。接着,用超声处理的M. tuberculosis(Mtb Ags)刺激巨噬细胞,以诱导SLAMF1在细胞表面的表达(如先前报道10),并通过流式细胞术确认SLAMF1表面表达水平(图2C)。最后,使用RIPA裂解缓冲液结合涡旋振荡及冰上孵育裂解巨噬细胞,以促进细胞裂解。所获得的总蛋白提取物用于后续的相互作用检测。

在第一组实验操作中,采用流...

访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。

讨论

本研究为研究生物化学相互作用提供了有用的指南 M. tuberculosis 以及在结核病宿主反应中起关键作用的人类巨噬细胞中表达的微生物传感器。所提供的实验方案将有助于解析在病原体入侵过程中发挥作用的分子 M. tuberculosis 进入吞噬细胞。

表征生物分子相互作用(例如病原体与免疫受体之间的相互作用)对于理解免疫保护机制以及结核分枝杆菌(M. tuberculosis)所诱导的免疫逃逸策略至关重要。很多时候,证明受体与其细菌配体之间的直接相互作用十分复杂,可能需要复杂的技术或缺乏通用性的实验系统。Driessen 等人利用M. bovis BCG的突变缺陷菌株,研究了磷脂酰肌醇甘露糖苷在分枝杆菌与DC-SIGN相互作用中的作用32。尽管他们成功研究了这些相互作用,但作者并未发现突变菌株之间存在差异,并指出构建显示结合能力降低的突变细菌将是一项极为艰巨的任务32。其他研究人员开展了出色且繁重的工作,以证明T...

访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。

披露

作者声明无利益冲突。

致谢

本工作由布宜诺斯艾利斯省西北国立大学(资助编号 SIB 0618/2019、SIB 2582/2012,授予 V.P.)、国家科学技术促进局(ANPCyT,资助编号 PICT-2012-2459 和 PICT A 2017-1896,授予 V.P.,以及 PICT-2021-I-INVI-00584,授予 A.B.)、弗洛伦西奥·菲奥里尼基金会以及国家科学技术研究理事会(CONICET,资助编号 PIO 15720150100010CO,授予 V.P.)提供支持。我们感谢 Natalia Menite 和 Gastón Villafañe 提供的技术支持。我们感谢 Paula Barrionuevo 博士和 Luciana Balboa 博士在本研究相关论文发表过程中提供的科学讨论。最后,我们感谢 Estermann 博士在交联实验方案方面的建议,Moroni 讲师在聚赖氨酸操作方面的指导,以及 Moriconi 讲师在示意图绘制方面提供的帮助。

访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。

材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
Alexa Fluor 488 二抗InvitrogenA21121用于荧光显微镜检测
anti-SLAMF1 FITC 抗体 eBioscience11-1509-42用于流式细胞术
anti-SLAMF1 PE 抗体 BioLegend306308用于流式细胞术
anti-SLAMF1 一抗 BioLegend306302用于荧光显微镜检测
Aqua-Poly/MountPolysciences18606-20封片剂
CD14 MicroBeadsMiltenyi Biotec130-097-052用于单核细胞分离
12 mm 盖玻片HDA-用于显微镜下的相互作用检测
EGSThermoFisher Scientific 21565用于交联处理
FACSCanto IIBD Biosciences338960配备 BD FACSDiva 软件的流式细胞仪
胎牛血清 Natocor-灭活并辐照处理,用于巨噬细胞培养
Ficoll-Paque PLUSCytiva17144003用于外周血单个核细胞(PBMCs)分离
Fiji/ImageJ开源软件-用于显微图像分析
FlowJo 7.6.2 Tree Star-用于流式细胞术数据分析
甲醛MerckK47740803613用于交联处理
载玻片Glass Klass-用于显微镜下的相互作用检测
甘氨酸SigmaG8898用于交联处理
Imager.A2Carl Zeiss430005-9901-000配备 Colibri 7 照明模块的荧光显微镜
iMarkBIO-RAD1681130微孔板吸光度读数仪 
L-谷氨酰胺Sigma Aldrich49419用于巨噬细胞培养
M. tuberculosis,H37Rv 菌株,γ-射线辐照全菌细胞 BEI Resources, NIAID, NIHNR-14819用于相互作用检测
M. tuberculosis,H37Rv 菌株,全菌裂解物BEI Resources, NIAID, NIHNR-14822用于巨噬细胞刺激及相互作用检测
Neofuge 13RHeal ForceNeofuge 13R用于蛋白质提取的高速冷冻离心机
青霉素/链霉素Gibco15140122用于巨噬细胞培养
PMSFThermoFisher Scientific36978用于蛋白质分离
多聚-L-赖氨酸Sigma AldrichA-003-M用于盖玻片处理
蛋白酶抑制剂混合物Sigma Aldrich P8340用于蛋白质分离
罗丹明 B Sigma Aldrich 21955用于 M. tuberculosis 染色
RPMI 1640Gibco11875093用于巨噬细胞培养
Sorvall ST 16/16R 离心机ThermoFisher Scientific75004240用于外周血单个核细胞(PBMCs)和单核细胞分离

参考文献

  1. Global Tuberculosis Report 2023. , World Health Organization. Available at: https://www.who.int/tb/publications/global_report/en/ (2023).
  2. Ahmad, F., et al. Macrophage: A cell with many faces and functions in tuberculosis. Front Immunol. 13, 882130(2022).
  3. Bo, H., et al. Mycobacterium tuberculosis-macrophage interaction: Molecular updates. Front Cell Infect Microbiol. 13, 1187205(2023).
  4. Papp, A. C., et al. AmpliSeq transcriptome analysis of human alveolar and monocyte-derived macrophages over time in response to Mycobacterium tuberculosis infection. PLoS One. 13 (5), e0198069(2018).
  5. Zhai, W., Wu, F., Zhang, Y., Fu, Y., Liu, Z. The immune escape mechanisms of Mycobacterium tuberculosis. Int J Mol Sci. 20 (2), 340(2019).
  6. Van Crevel, R., Ottenhoff, T. H. M., Van der Meer, J. W. M. Innate immunity to Mycobacterium tuberculosis. Clin Microbiol Rev. 15 (2), 294-309 (2002).
  7. Mortaz, E., et al. Interaction of pattern recognition receptors with Mycobacterium tuberculosis. J Clin Immunol. 35 (1), 1-10 (2015).
  8. Stamm, C. E., Collins, A. C., Shiloh, M. U. Sensing of Mycobacterium tuberculosis and consequences to both host and bacillus. Immunol Rev. 264 (1), 204-219 (2015).
  9. Zihad, S. M. N. K., et al. Role of pattern recognition receptors in sensing Mycobacterium tuberculosis. Heliyon. 9 (10), e20636(2023).
  10. Barbero, A. M., et al. SLAMF1 signaling induces Mycobacterium tuberculosis uptake leading to endolysosomal maturation in human macrophages. J Leukoc Biol. 109 (8), 257-273 (2021).
  11. Pasquinelli, V., et al. Expression of signaling lymphocytic activation molecule-associated protein interrupts IFN-γ production in human tuberculosis. J Immunol. 172 (2), 1177-1185 (2004).
  12. Pasquinelli, V., et al. Phosphorylation of mitogen-activated protein kinases contributes to interferon-γ production in response to Mycobacterium tuberculosis. J Infect Dis. 207 (2), 340-350 (2012).
  13. Pasquinelli, V., et al. IFN-γ production during active tuberculosis is regulated by mechanisms that involve IL-17, SLAM, and CREB. J Infect Dis. 199 (5), 661-665 (2009).
  14. Pellegrini, J. M., et al. Neutrophil autophagy during human active tuberculosis is modulated by SLAMF1. Autophagy. 17 (2), 423-426 (2021).
  15. Song, T., Dong, C., Xiong, S. Signaling lymphocyte-activation molecule SLAMF1 augments mycobacteria BCG-induced inflammatory response and facilitates bacterial clearance. Int J Med Microbiol. 305 (6), 572-580 (2015).
  16. Eble, J. A. Titration ELISA as a method to determine the dissociation constant of receptor-ligand interaction. J Vis Exp. (132), e57032(2018).
  17. Patching, S. G. Surface plasmon resonance spectroscopy for characterization of membrane protein-ligand interactions and its potential for drug discovery. Biochim Biophys Acta Biomembr. 1838 (1), 43-55 (2014).
  18. Draczkowski, P., Matosiuk, D., Jozwiak, K. Isothermal titration calorimetry in membrane protein research. J Pharm Biomed Anal. 87, 296-304 (2014).
  19. Smith, D. S., Eremin, S. A. Fluorescence polarization immunoassays and related methods for simple, high-throughput screening of small molecules. Anal Bioanal Chem. 391 (5), 1499-1507 (2008).
  20. García-Nafría, J., Tate, C. G. Cryo-electron microscopy: Moving beyond X-ray crystal structures for drug receptors and drug development. Annu Rev Pharmacol Toxicol. 60, 51-71 (2020).
  21. Asami, J., Shimizu, T. Structural and functional understanding of the toll-like receptors. Protein Sci. 30 (4), 761-772 (2021).
  22. Phạm, T. T. T., Rainey, J. K. On-cell nuclear magnetic resonance spectroscopy to probe cell surface interactions. Biochem Cell Biol. 99 (6), 683-692 (2021).
  23. El Deeb, S., et al. Microscale thermophoresis as a powerful growing analytical technique for the investigation of biomolecular interaction and the determination of binding parameters. Methods Appl Fluoresc. 10 (4), 045001(2022).
  24. El Khamlichi, C., et al. Bioluminescence resonance energy transfer as a method to study protein-protein interactions: Application to G protein-coupled receptor biology. Molecules. 24 (3), 505(2019).
  25. Schneider, P., Willen, L., Smulski, C. R. Tools and techniques to study ligand-receptor interactions and receptor activation by TNF superfamily members. Methods Enzymol. 545, 103-125 (2014).
  26. Park, A. M. W., Schirmer, P. S. H. Atomic force microscopy: A multifaceted tool to study membrane proteins and their interactions with ligands. Biochim Biophys Acta Biomembr. 1838 (1), 74-89 (2014).
  27. Zalejski, J., Sun, J., Sharma, A. Unravelling the mystery inside cells by using single-molecule fluorescence imaging. J Imaging. 9 (9), 183(2023).
  28. Zheng, S., Zou, M., Shao, Y., Wu, H., Wang, X. Two-dimensional measurements of receptor-ligand interactions. Front Mol Biosci. 10, 1075587(2023).
  29. Zlotnikov, I. D., Kudryashova, E. V. Computer simulation of the receptor-ligand interactions of mannose receptor CD206 in comparison with the lectin concanavalin A model. Biochemistry (Moscow). 87 (1), 54-69 (2022).
  30. Fu, Y., Zhao, J., Chen, Z. Insights into the molecular mechanisms of protein-ligand interactions by molecular docking and molecular dynamics simulation: A case of oligopeptide binding protein. Comput Math Methods Med. 2018, 7604567(2018).
  31. Farina, B., et al. A novel approach for studying receptor-ligand interactions on living cells' surface by using NUS/T1ρ-NMR methodologies combined with computational techniques: The RGDechi15D-αvβ5 integrin complex. Comput Struct Biotechnol J. 19, 3303-3318 (2021).
  32. Driessen, N. N., et al. Role of phosphatidylinositol mannosides in the interaction between mycobacteria and DC-SIGN. Infect Immun. 77 (10), 4538-4547 (2009).
  33. Bansal, K., et al. Src homology 3-interacting domain of Rv1917c of Mycobacterium tuberculosis induces selective maturation of human dendritic cells by regulating PI3K-MAPK-NF-κB signaling and drives Th2 immune responses. J Biol Chem. 285 (47), 36511-36522 (2010).
  34. Xu, Y., et al. PPE57 induces activation of macrophages and drives Th1-type immune responses through TLR2. J Mol Med. 93 (6), 645-662 (2015).
  35. Olesen, R., et al. DC-SIGN (CD209), pentraxin 3 and vitamin D receptor gene variants associate with pulmonary tuberculosis risk in West Africans. Genes Immun. 8, 456-467 (2007).
  36. Berger, S. B., et al. SLAM is a microbial sensor that regulates bacterial phagosome functions in macrophages. Nat Immunol. 11 (10), 920-927 (2010).
  37. Degos, C., et al. Omp25-dependent engagement of SLAMF1 by Brucella abortus in dendritic cells limits acute inflammation and favours bacterial persistence in vivo. Cell Microbiol. 22 (4), e13156(2020).

访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。

重印与许可

标签

SLAMF1 相互作用流式细胞术荧光显微镜巨噬细胞蛋白提取物病原体免疫受体交联处理单核细胞来源巨噬细胞病原体受体相互作用