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方法文章

快速诊断 结核分枝杆菌 基于实时荧光PCR的感染与耐药性检测

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DOI:

10.3791/68445

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2025年7月15日

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* These authors contributed equally

本文内容

摘要

本文介绍了一种利用实时荧光定量PCR(qPCR)技术检测Mycobacterium tuberculosis及其药物耐药性的实验方案。

摘要

结核病(TB)是一个重大的健康问题,对脆弱人群的影响尤为严重。耐药结核病的出现和传播对全球公共卫生构成了严重威胁。传统的结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)诊断方法,如涂片显微镜检查和培养,存在显著局限性,常导致临床治疗延误。为应对这一挑战,已开发出一种基于实时荧光PCR的高效诊断方案。该方法可从检测样本中提取高质量的MTB核酸,并在关键耐药位点识别其耐药状态。与传统方法相比,该技术将检测时间显著缩短至数小时内,使患者在初次就诊后即可迅速确定感染及耐药情况。检测灵敏度超过85%,特异性达到95%。这种非侵入性技术不仅最大限度减少了患者的不适,而且由于其成本低、效率高,有助于在基层医疗机构实现准确诊断。总体而言,该方法代表了结核病诊断领域的重要进步。

引言

结核病(TB)是由Mycobacterium tuberculosis(MTB)引起的一种慢性传染病,是全球十大死因之一1。耐药结核病(DR-TB)对结核病防控工作构成了重大挑战。中国疾病预防控制中心(中国CDC)发布的《无结核社区创建行动方案(2022—2027年)》强调,应对所有细菌学确诊的肺结核患者进行早期耐药筛查2。该方案提倡采用新型分子诊断技术,以提升耐药结核病的检出能力,缩短诊断周期,最大限度发现耐药结核病病例,确保规范化的治疗与管理,并落实必要的感染控制措施3。此外,《关于进一步加强耐药结核病防治工作的通知》(2023年第4号)要求在全国范围内推广先进诊断技术,督促对所有细菌学确诊的结核病患者及时开展耐药筛查,实现耐药筛查全覆盖,提高诊断的规范化水平,并增强医疗服务可及性4。

耐药结核病(DR-TB)指对至少一种抗结核药物产生耐药性的结核病病例。目前的分类包括利福平耐药(RR)、单药耐药、多药耐药、耐多药(MDR)、前广泛耐药(pre-XDR)和广泛耐药(XDR)结核病。一项关于耐药结核病流行病学的全球荟萃分析揭示了令人担忧的耐药率:耐多药结核病(MDR-TB)为11.6%,异烟肼耐药为15.7%,利福平耐药为9.4%,单药耐药为11.8%。这些数据凸显了....

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方案

本研究已获得新疆生产建设兵团第五师医院伦理委员会批准,伦理批号为LLWYH2025001,不存在伦理冲突。所用试剂和设备详见材料表。

1. 样品采集

  1. 使用世界卫生组织(WHO)推荐的国际标准化带螺旋盖的痰液采集瓶,或密封塑料盒和蜡纸盒来收集痰液样本。
  2. 在痰液容器上标注患者姓名、编号(初诊患者的门诊序号或复诊患者的登记号)、检查项目以及容器顺序编号1、2、3(1 = 当日即时痰,2 = 夜间痰,3 = 次日晨痰)。对于无痰患者,可通过雾化诱导痰液采集法收集样本。
    注意:工作人员应评估所采集痰液样本的质量。样本量一般应维持在 3–5 mL。合格样本包括干酪样痰、褐色带血痰、含少量新鲜血液的痰或黏液痰。不合格样本(如唾液)应在进一步指导后重新送检。

2. 痰液预处理

  1. 根据所采集痰液的体积,向痰液容器中加入其体积1至2倍的4% NaOH溶液。振荡并混合内容物2分钟。
  2. 将容器置于生物安全柜中,室温下静置15分钟,在此期间多次振荡以确保痰液完全液化。
    注意:NaOH具有腐蚀性,操作时需小心。若痰液未完全液化,可延长振荡时间。此步骤在整个实验过程中尤为重要。

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结果

本研究采用实时荧光PCR结合熔解曲线分析,对17例结核病患者的痰液样本进行了检测。此外,另有30例患者接受了 利福平 耐药性检测,其中20例进行了耐药性测试 异烟肼 和 乙胺丁醇实时荧光PCR方法对目标物的阳性检出率达到88.2% 结核分枝杆菌 复合物。

利福平的耐药率为13.3%,异烟肼为15.0%,提示部分患者可能存在耐药情况。大量样本未检出耐药性(利福平为26.7%,异烟肼为20.0%),可能与细菌载量较低或检测方法的敏感性问题有关。 乙胺丁醇 耐药性检出率相对较低,为5.0%,但有45.0%的样本未检出,显示出该方法在检测乙胺丁醇耐药性方面存在局限性。建议将此方法与其他方法(如基因测序)联合使用,以提高检测准确性。

检测.......

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讨论

在全球范围内,结核分枝杆菌复合群(Mycobacterium tuberculosis complex, MTBC)耐药菌株的出现已显著增加了结核病(TB)患者治疗的复杂性。特别是耐多药(MDR)和广泛耐药(XDR)结核病,对结核病的防控构成了严峻挑战12。快速检测耐药性对于制定合理的治疗方案、防止治疗失败以及遏制耐药菌株的进一步传播至关重要13,14。基于核酸扩增技术(NAAT)的检测方法(如实时荧光PCR)因其良好的稳定性及较短的检测周期,已在结核病诊断中得到广泛应用15。然而,要被认可为一种经过验证的用于结核病诊断的NAAT方法,该检测技术必须具备高可靠性、高灵敏度、高特异性和良好的可及性16。大多数基于PCR的结核病检测方法以IS6110为靶标,用于肺部及肺外样本中结核分枝杆菌(MTB)的鉴定。据报道,与培养法相比,基于IS6110序列的PCR检测在不同.......

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披露

作者声明无利益冲突。

致谢

本研究由兵团结核病项目专项资助。

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
高速离心机
裂解缓冲液厦门智山生物科技有限公司24110701
结核分枝杆菌乙胺丁醇耐药突变检测试剂盒厦门智山生物科技有限公司24030801
结核分枝杆菌异烟肼耐药突变检测试剂盒厦门智山生物科技有限公司24011101
结核分枝杆菌利福平耐药突变检测试剂盒厦门智山生物科技有限公司24031001
SLAN-96P 实时荧光定量 PCR 系统上海宏石医疗科技有限公司SLAN-96P
痰液处理液厦门智山生物科技有限公司24110701
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参考文献

  1. Salari, N., et al. Global prevalence of drug-resistant tuberculosis: A systematic review and meta-analysis. Infect Dis Poverty. 12 (1), 57(2023).
  2. Cai, X., Xu, X., He, G., Jiang, X., Wu, L. Drug r....

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