Research Article

利用迁移学习方法对 SARS-COV-2 的区域特异性急性后遗症进行流行病学研究

DOI:

10.3791/68805

September 30th, 2025

In This Article

Summary

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拟议的工作旨在设计和实施一种新的迁移学习技术,以更好地了解长期健康结果并支持量身定制的流行病学见解。

Abstract

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SARS-CoV-2 急性后遗症 (PASC) 构成了一个极高风险的环境,后果严重,特别是对于中老年人以及患有心血管疾病、癌症、呼吸系统疾病和糖尿病等慢性疾病的人。身体疾病包括严重和持续的身体疼痛、疲劳和身体运动困难。同样,抑郁、情绪波动、绝望感和注意力不集中等情绪障碍也是 PASC 的重要预测因素。个人,主要是中老年人,正面临着越来越多的身体和精神后果,包括频繁住院、病情不稳定,在某些情况下还可能出现意外死亡。及时识别 PASC 对于减轻相关健康问题的严重程度至关重要。本研究推荐了一种潜在转移模型来整合来自不同地区的患者数据,提取对数据的洞察,并提供个性化的医疗保健解决方案。本研究展示了潜在迁移学习模型在改善数据简化、泛化、个性化、洞察力检测、可变性、可扩展性和适应性方面的潜力,以改善公共卫生结果。

Introduction

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2019 年冠状病毒病 (COVID-19) 首次在中国武汉发现。2019年12 月31日,中国向世界卫生组织(WHO)报告了中国湖北省武汉市发现的病因不明的肺部炎症性疾病1。2019年12 月31日至2020年1 月3日,有44人感染了该病毒,并有与批发市场——“华南海产品”有接触史。最初,患者出现发烧、疲劳和干咳。该病毒的爆发发生在 2020年 1 月 30 日,并被世界卫生组织宣布为国际关注的突发公共卫生事件1.截至2020年2月中旬,超过25个国家受到新型冠状病毒的影响,其中中国和其他国家分别有70635例和794例。中国一千七百七十二人死亡(1772年),所有国家死亡三人,正式宣布死亡。2019 12 月 31 日,报告了一批肺炎感染病例,世界卫生组织报告称武汉没有死亡报告。在泰国,2020年 1 月 13 日在曼谷宣布了首例病例,一名 61 岁的中国女性在访问武汉市后于 2020年 1 月 8 日从武汉市返回。她的症状是喉咙痛、咳嗽、发烧、发冷和头痛。该人于 2020年 1 月 8 日在热监测中被检测为 COVID-19 阳性,并于当天被泰国官员送入医院。这个人从疾病中康复了。该病毒的基因测序结构由中国政府共享,使更多国家能够有效地检查和诊断患者2

在美利坚合众国,2020年 1 月 19 日在华盛顿报告了首例病例,一名 35 岁男性于 2020年 1 月 15 日在家庭聚会后从武汉市返回。他从 2020年 1 月 15 日起出现咳嗽和发烧症状,并被建议接受医学检查。他没有与 COVID-19 感染者接触过,但在访问武汉期间,由于中国爆发疫情,他感染了 COVID-19。他于 2020年 1 月 20 日检测出 COVID 呈阳性,并被隔离在一家医疗中心的空中隔离室。入住隔离病房后,脉搏110/min,血压134/87 mmHg,体温37.2 °C,呼吸频率16 bpm,血氧饱和度96%,肺部听诊正常,血氧饱和度正常。定期进行 COVID 监测和调查测试,发现他咳嗽、恶心和呕吐了两天3.入院第二天,他主诉腹部不适,第二天,胸片没有异常证据。然而,在第五天,胸片上看到了明显的肺炎证据,血氧饱和度下降到90%。建议他接受氧疗,并补充氧疗以提高饱和度。第8天,病情好转,出院。在印度,喀拉拉邦于 2020年 1 月 27 日报告了首例病例,一名 20 岁女性因中国爆发 COVID-19 疫情而从武汉市返回。她在 2020 年 1 月 23日至 2020年 1 月 26 日期间没有症状,并从 2020年 1 月 27 日开始出现喉咙痛和轻微咳嗽。她没有与 COVID-19 感染者接触过,但在从武汉到昆明的火车旅行中,她注意到几个人患有呼吸系统问题、感冒和咳嗽。因此,喀拉拉邦政府当局指示她留在一个与世隔绝的地方,并在未来几天内因出现任何 COVID 症状而前往医疗机构。入院后,她正常,脉搏 82/min,血压 130/80 mmHg,体温 98.5 °F,肺听诊正常,血氧饱和度 96%。在患病之日起的 3 天、第 7 天和第 20 天进行了定期的 COVID 监测和调查测试。自发病之日起23天,在第一天和隔天进行口咽拭子检测,从17天开始检测阴性。她通过了所有检查,并于 2020年 2 月 20 日出院4.

在英国,2020 年 1 月 23 ,一名 50 岁女性报告了首例 COVID-19 病例,她访问完武汉后从武汉市返回。最初,她没有症状,并于 2020年 1 月 26 日出现发烧、虚弱、喉咙痛和干咳症状。入院后,呼吸频率18/min,血压120/80 mmHg,体温37.6 °C,血氧饱和度97%,正常。定期进行 COVID 监测和调查测试,患者病情临床稳定。初步检查显示她有轻度淋巴细胞减少和 C 反应蛋白升高。入院 3 天后,她清除了所有症状,从住院的第二天开始,口咽拭子测试显示 COVID 呈阴性。她被隔离了2周,她的鼻子和喉咙拭子测试结果为阴性5

冠状病毒 (CoV) 是在 1960 年代发现的,它们分类如下。Orthornavirae 被称为各种病毒的王国/领域,这些病毒包含由核糖核酸 (RNA) 制成的基因组,并用 RNA 依赖性 RNA 聚合酶 (RdRp) 进行翻译。RdRp 将病毒 RNA 基因组转录为信使 RNA (mRNA) 并复制基因组。Orthornavirae 中的病毒特征包括进化、基因突变、重组和重组6。由RNA组成的基因组分为三种类型,即正链RNA病毒、负链RNA病毒(-ssRNA病毒)和双链RNA病毒(dsRNA病毒)。正链RNA病毒(+ssRNA病毒)是具有正义单链RNA的相关病毒的集合。+ssRNA病毒的基因组可作为信使RNA(mRNA),由宿主细胞的核糖体直接转化为病毒相关蛋白。+ssRNA 病毒与 Pisuviricota、Kitrinoviricota 和 Lenarviricota 等门相关。正链RNA病毒含有多种病原体,如丙型肝病毒、登革热、埃博拉病毒、麻疹、狂犬病、流感、严重急性呼吸系统综合症CoV、中东呼吸综合征冠状病毒CoV和严重急性呼吸系统综合症CoV7。负链 RNA 病毒(-ssRNA 病毒)是具有负义单链 RNA 的相关病毒的集合。-ssRNA 病毒的基因组可以看作是信使 RNA (mRNA),由一种名为 RNA 依赖性 RNA 聚合酶 (RdRp) 的酶产生。-ssRNA 病毒构成 Negarnaviricota 门。负链RNA病毒在门中包含两个主要分支,即单倍病毒和多倍病毒。重要的脊椎动物 ssRNA 病毒是埃博拉病毒、汉塔病毒、流感病毒、拉沙热病毒和狂犬病。双链 RNA 病毒(dsRNA 病毒)是具有双链 RNA 基因组的多系病毒的集合。dsRNA 的基因组通过病毒 RNA 依赖性 RNA 聚合酶 (RdRp) 转录 +ssRNA。+ssRNA病毒的基因组可用作快递RNA(mRNA),并被宿主细胞的核糖体公开转化为病毒相关蛋白。而-ssRNA病毒的基因组可以作为信使RNA(mRNA)并由RNA依赖性RNA聚合酶(RdRp)产生。dsRNA 病毒与 Duplornaviricota 门和 Pisuviricota 门有关。双链RNA病毒包括轮状病毒(影响幼儿)和蓝舌病病毒(影响牛和羊)8

Pisuviricota 被称为 RNA 病毒门,包括所有 + ssRNA 病毒和 dsRNA。其较低分类包含三类,即双核菌门、双核菌门和石菌云菌门。Pisoniviricetes 是一类感染和污染真核生物的 +ssRNA 病毒。其较低分类包含三个亚类,即尼多病毒类、小核糖核酸病毒类和索贝利维拉类。Nidovirales 是一种有包膜的 +ssRNA 目,可感染和污染脊椎动物和无脊椎动物9。它包含病毒的一个亚目,即阿尼多病毒科、角质病毒科、纳尼多病毒科、阿尼多病毒科、美尼多病毒科和托尼多病毒科。 尼多病毒科下有多种科,例如 Abyssoviridae、Coronaviridae、Nanghoshaviridae、Nanhypoviridae、Arteriviridae、Medioniviridae、Cremegaviridae、Mesoniviridae、Euroniviridae、Gresnaviridae、Roniviridae、Tobaniviridae、Mononiviridae 和 Olifoviridae8。冠状病毒科是一类有包膜的 +ssRNA 病毒,可感染哺乳动物、两栖动物和鸟类。其较低的分类包含两个亚科,Letovirinae 和 Orthocoronavirinae。正冠状病毒科的成员被确定为冠状病毒。冠状病毒是冠状病毒科的一个亚科,它与引起哺乳动物和鸟类感染的 RNA 病毒有关。在哺乳动物和鸟类中,这些病毒会引起轻度至重度呼吸道拭子感染,例如上呼吸道拭子感染和下呼吸道拭子感染10。这些病毒会导致人类和一些哺乳动物的 SARS、MERS 和 COVID-19,猪和牛的腹泻、肝炎和脑脊髓炎。冠状病毒是包膜的 +ssRNA,属于 Orthornavirae 王国、Pisuviricota 门、Pisoniviricetes 纲、Nidovirales 亚纲、冠状病毒科和正冠状病毒亚科。冠状病毒分为四个属,即阿尔法冠状病毒、贝塔冠状病毒、伽马冠状病毒和德尔塔冠状病毒11。基于这项研究,形成以下假设。

严重急性呼吸系统综合症冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 刺突突变是高度糖基化的。检查这些刺突突变的生物学后果至关重要。多个突变可以起源于刺突蛋白序列中的同一位置。刺突蛋白序列提供了估计全球检测到的广谱突变的机会,它们如 表 1 所示。所考虑的突变是病毒人际传播的结果。疫苗接种引发了能够强力中和 SARS-CoV-2 的免疫反应12.尽管科学调查发现 SARS-CoV-2 变体的出现掩盖了刺突中的突变,但核心目标仍然是中和宿主抗体。有不断发展的迹象表明,接种疫苗后某些 SARS-CoV-2 变体的中和作用降低。疫苗制造商为疫苗结构的潜在更新制定了各种平台,并通过实验对全球病毒种群的遗传和抗原变异进行了调查,以阐明突变的表型影响13

美国国家生物技术信息中心 (NCBI) 病毒数据库包含来自非洲、亚洲、欧洲、北美、南美和大洋洲的 10333 种人类 SARS-CoV-2 刺突蛋白。上表显示了从不同地理位置检查的刺突蛋白中几种突变的传播情况。上表提供了 Alpha、Beta、Gamma 和 Delta 冠状病毒的详细信息及其属、特征和描述。每个属都按其特征进行描述,例如基本、变体、意义、形状、测量、结构、膜融合、释放、污染和合成14

表1所述,HCoV-229E、HCoV-OC43、HCoV-NL63和HCoV-HKU1等病毒株观察到轻度至中度疾病症状,而SARS-CoV、MERS-CoV和SARS-CoV-2在人类中观察到严重的危重症状。病毒微生物穿过人体并感染宿主细胞。根据冠状病毒的类别,它会感染宿主身体不同部位的细胞。一旦它附着在强壮健康的细胞上,它就会进入其中15.病毒在宿主细胞内定居后,它会变得整洁,它的 DNA 和 RNA 会散发出来并向细胞核传播。它们会以碎片形式移动,这将导致病毒的各种繁殖。这些拷贝将从细胞核中出来组装并接收蛋白质,从而保护它们的 DNA 和 RNA。这些新奇的病毒复制品将清除先前感染和患病的细胞,再次污染其他健康的宿主细胞并繁殖。如果宿主的免疫系统成功抵抗冠状病毒,个体就不会生病;否则,可能会发生不健康的并发症。如果免疫系统无法控制冠状病毒,就会导致发病机制。这样,病毒就会进入人体并感染不同的器官。根据体征或症状的严重程度,个人将休息或寻求医疗救助16.冠状病毒的生命周期和各种毒株如 图 1 所示。

上图详细描述了冠状病毒的生命周期和阶段。共有七个阶段,即(1)附着和接纳,(2)融合和内吞作用,(3)蛋白水解,(4)翻译和切割,(5)复制,(6)胞吐作用,(7)成熟病毒释放。在附着和接纳阶段,冠状病毒微生物被接纳到宿主体内,目的是进行抗宿主侦察和干预策略。为了进入宿主细胞,这些病毒首先附着在细胞表面受体上进行结合,然后进入内体,最终开始融合。后来,冠状病毒与病毒相关鞘和溶酶体鞘融合到宿主细胞中。病毒表面固定的刺突蛋白会干扰这些病毒的进入。内吞作用是一种细胞过程,其中物质被带入宿主细胞17。要采用的材料被一系列细胞鞘包围,然后细胞鞘在宿主细胞内喷出,产生包围摄入物质的囊泡。内吞作用包括胞饮作用和吞噬作用;前者是吸细胞,后者是吸食细胞。蛋白水解是将病毒相关蛋白质逐项分解为次要多肽/氨基酸。结构化 mRNA 转化是一种转录后过程,可控制基因通讯并迅速发散蛋白质丰富。它在细胞生长、细胞进展、突触可塑性、应激反应和生产性病毒发育等大量生物学过程中发挥着重要作用18。病毒翻译过程可分为三个阶段,即激发、延伸和溶解。

病毒复制是通过污染受感染的宿主细胞产生遗传病毒的过程。为了发生病毒繁殖,病毒必须首先进入宿主细胞。通过反复复制其病毒基因组并封装这些拷贝,病毒通过感染新的宿主细胞存活并继续传播19。胞吐作用是含有病毒颗粒的囊泡从受感染细胞中分泌和释放的机制,使新形成的病毒能够进入宿主体内并感染其他健康细胞。SARS-CoV-2 (PASC) 的急性后遗症被认为是一种主要影响肺部的综合征,尽管它可以影响多个器官,导致器官损伤甚至器官衰竭20。此类并发症可能导致死亡或长期健康问题。例如,心脏可能会增加心力衰竭或其他并发症的风险;肺炎后肺部可能长期呼吸困难;大脑可能受到中风、癫痫发作或格林-巴利综合征的影响;肾脏可能会受到损害,从而导致感染性休克。肝损伤可能是由于酶失衡而发生的,而横纹肌溶解症会导致肌肉组织分解,将肌红蛋白释放到血液中,如果肾脏不能快速过滤肌红蛋白,这可能会致命。其他并发症包括形成导致内出血和器官衰竭的异常血栓、链球菌或葡萄球菌等细菌的继发感染、由于凝血反应失调导致的弥散性血管内凝血以及慢性疲劳,通常伴有脑雾、严重疲倦、头晕或思维障碍。基于这些挑战,提出了以下假设:H1:利用迁移学习算法可以通过应用流行病学数据来识别特定区域的 PASC,从而显着提高模型的预测准确性和可转移性。H1a:使用流行病学数据进行微调的深度学习模型比其他模型表现更好。H1b:将特定区域的PASC行列因素与迁移学习模型相结合,提高了分类和聚类的准确性和效率。H1c:这种组合还可以揭示以前未公开或被忽视的区域特定模式。H1d:与其他模型相比,迁移学习可以减少训练时间并加快收敛速度。

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Protocol

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本研究是根据涉及人类数据的研究的伦理准则进行的。本研究中使用的所有患者数据在访问和分析之前都是完全匿名的。没有使用个人身份信息。根据《赫尔辛基宣言》,该研究方案由机构审查委员会 (IRB) 审查和批准。在适用的情况下,数据访问权限是从相关当局或数据存储库获得的。由于这项研究涉及对去识别化数据的二次分析,因此 IRB 放弃了知情同意。所提出的潜在转移模型是一种基于机器学习的半监督学习技术,旨在找到隐藏的模式并将其从源数据集转移到目标数据集,确保其非常适合分析PASC16的流行病学问题。新冠肺炎后疾病通常在不同人群中表现出不同的症状,导致数据不一致和稀疏。拟议的工作通过学习改进的潜在表示来表示数据集中隐藏的健康模式,并将它们表示为新兴数据集,解决了由于不同区域症状不同的问题而导致的数据稀疏问题。为了执行这种转换,这些潜在传输技术使用自动或变分编码器来表示公共潜在空间中的源数据和目标数据。这个公共空间保护了所获得的隐藏模式,因为 COVID 后症状集群在不同地区都保存得很好21。原型可以通过域自适应改进泛化来进一步推进。使用这种方法,该模型可以帮助识别和预测高危集群,并支持偏远地区公共卫生监测。这项工作还通过减少对完全标记数据的依赖来增强学习。因此,由于其针对不同人群的通用方法,所提出的方法成为分析差距的有力工具。

1. 数据来源和收集

本研究使用了公开可用的 Kaggle 数据集(心血管疾病数据集、癌症预测数据集、早期糖尿病患者预测数据集和心理健康预测数据集)。因此,此提交不需要 IRB 批准。

对于涉及图像数据的数据集,使用 Python 和 TensorFlow 和 OpenCV 库进行预处理。预处理步骤包括图像大小调整(例如,224 × 224 像素)、灰度或 RGB 转换、将像素值归一化到 [0, 1] 范围,以及数据增强技术(旋转、翻转、缩放)以增强模型泛化并减少过度拟合。然后将图像数组转换为 NumPy 数组,以进行进一步处理和模型输入。

对于特征选择,递归特征消除 (RFE) 是使用 Scikit-learn 的 RFE 类实现的,通常与逻辑回归或随机森林估计器结合使用。每个数据集选择的特征数量各不相同,但一种常见的配置是根据递归评分将维度降低到前 10-15 个最有影响力的特征。该方法提高了分类精度,同时降低了计算复杂性和模型过度拟合。

这项研究利用了 Kaggle 的四个公开数据集。心血管疾病数据集、乳腺癌预测数据集、早期糖尿病预测数据集和心理健康预测数据集。这些数据集是直接从 Kaggle 下载的,由包含临床和基于调查的属性的结构化表格数据组成。数据预处理是使用 Python 进行的,关键库包括用于数据作的 Pandas、用于数值运算的 NumPy 以及用于数据预处理、特征选择和建模的 Scikit-learn。使用均值或众数策略插补缺失值,通过 One-Hot 或 Label Encoding 分类变量进行编码,并使用 StandardScaler 或 MinMaxScaler 缩放数值特征。对于不平衡的类,应用了 imblearn 包中的 SMOTE(合成少数过采样技术)。递归特征消除(RFE)是使用Scikit-learn的RFE模块和Logistic Regression和Random Forest等估计器实现的,根据ROC-AUC和准确性等模型性能指标,特征数量通常减少到前10-15个最有影响力的特征。

2. 模型架构

这项研究提出了一种称为潜在转移模型的神经网络算法变体,用于训练来自 COVID-19 图像数据库的输入图像。这项工作有效地克服了构建深度神经网络时的梯度消失问题。尽管有各种神经网络变体具有不同的层配置,但这项工作主要侧重于在深度神经网络的训练过程中实现残差学习技术。所提出的潜在转移模型使用了改进的ResNet-50算法,具有7 x 7卷积层框架,以及扁平化和密集的分层网络。这些层用于PASC患者的图像转换和多类分类,按区域提取模式22。这项工作考虑了大小为 256 x 256 x 3 的输入图像,利用高效的超参数、学习行为、优化过程和批量。所提出的潜在转移模型考虑了包含 12,946 张图像的数据集,对患有心血管问题、癌症、慢性呼吸系统疾病、糖尿病和心理健康问题的活跃风险的患者进行分类。数据集详细信息和超参数分别在表2和表3中给出。

为了确保可重复性,所有模型实现、预处理和评估步骤都是在运行 Windows 11 的系统上使用 Jupyter Notebook 中的 Python 在受控环境中进行的,该系统配备了 Intel Core i7(第 11 代)处理器、16GB RAM 和 NVIDIA GeForce RTX 3060 GPU(用于任何加速处理,尽管 GPU 对于这些数据集来说不是必需的)。使用的软件库包括 Pandas 1.5.3、NumPy 1.24、Scikit-learn 1.3.0、用于 SMOTE 的 Imbalanced-learn 0.11.0、用于可视化的 Matplotlib 3.7.1 和 Seaborn 0.12.2。预处理包括通过均值/众数插补 处理 缺失值,使用 One-Hot 或 Label Encoding 对分类变量进行编码,以及使用 StandardScaler 进行特征缩放。模型开发利用逻辑回归、随机森林和支持向量机等分类器,并结合递归特征消除 (RFE) 进行降维。使用 5 倍交叉验证对模型进行评估,并使用准确性、精确度、召回率和 ROC-AUC 分数等指标来衡量性能,确保管道的一致性和可重复性。

3. 预处理和特征工程

为了从这些数据集中检索具有统计意义的特征,使用了一种名为“使用递归特征消除 (RFE) 进行特征选择”的预处理技术和名为“使用多层感知器 (MLP) 的迁移学习”的建模管道。

4. 培训和验证

使用有组织的培训和验证方法来评估所提出的 PASC 症状分析和预测方法。首先,应用分层训练-测试拆分,得到训练数据和测试数据比例为80:20的类标签累积系统。然后对训练数据实施k = 5的k折交叉验证,以评估模型在各种数据分割中的鲁棒性。应用了具有两个隐藏层(64 和 32 个神经元)和 300 次迭代的 MLP 分类器。实施了进一步的特征表示和迁移学习技术。

5. 评估指标

对测试数据计算准确度、F-测量、G-mean、MAPE、灵敏度和特异性,以比较所提模型的性能。结果说明了测试数据的评估指标、准确性、F 测量、G 均值、MAPE、灵敏度和特异性的改进,以将所提出的模型的性能与其他最先进的模型(即 VGG-16 CNN、VGG-19 CNN、DenseNet-121 CNN、InceptionV3 CNN、ResNet-101 CNN、MobileNetV2 CNN 和所提出的潜在传输模型)进行比较。上述数据集包含心血管、癌症、慢性呼吸系统、糖尿病和精神疾病相关数据的训练、验证和测试样本。

所有实验均在 Windows 11 环境中使用 Python 3.10 在配备 Intel Core i7 处理器、16GB RAM 和 NVIDIA RTX 3060 GPU 的系统上进行。使用Pandas、NumPy和Scikit-learn对公开可用的Kaggle数据集进行预处理,以进行缺失值插补、编码、缩放和通过递归特征消除(RFE) 进行 特征选择。使用 5 重交叉验证对 Logistic Regression、Random Forest 和 SVM 等模型进行训练和评估,指标包括准确性、精确度、召回率和 ROC-AUC,以确保可重复性和性能一致性。

上表显示了超参数的详细信息以及使用它们的技术或算法。给出了 Adam 优化器算法的学习率、提前停止技术、批量大小、纪元大小、回调、损失函数和衡量效率的指标。

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Results

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将所提出的模型与现有的传输模型进行了比较,包括VGG-16 CNN、VGG-19 CNN、DenseNet-121 CNN、InceptionV3 CNN、ResNet-101 CNN和MobileNetV2 CNN。比较的参数详细信息和结果分别如 表4表5图2所示。结果表明,使用所提模型相对于其他模型(即VGG-16 CNN、VGG-19 CNN、DenseNet-121 CNN、InceptionV3 CNN、ResNet-101 CNN和MobileNetV2 CNN)的评估指标有所改进。

该研究使用 Python 3.10 实施,关键库包括用于 ResNet-50 的 TensorFlow 2.13、用于 MLP 分类器和 RFE 的 Scikit-learn 1.3.0 以及用于数据处理的 Pandas 1.5.3。该环境是在 Windows 11 系统上的 Jupyter Notebook 中设置的,并启用了 CUDA 11.8 以实现...

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Discussion

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该提案的重点是构建一个潜在的迁移学习模型来处理 PASC 的影响。这种结构会导致严重的身心健康问题,特别是在中老年人以及那些既往患有慢性疾病(如心血管疾病、癌症、呼吸系统疾病和糖尿病)的人中。最终目标是借助潜伏转移模型统一来自不同人群的不同患者数据,以实现 PASC 的个性化护理、早期检测和有效治疗。该技术使用迁移学习来弥合复杂临床数据之间的差距,跨人群转移知识,根据患者场景进行定制,并扩展医学见解。最终目标是通过使用最先进的机器学习减轻长期 COVID(慢性)症状的严重影响来提高诊断准确性,促进及时干预,并为公共卫生做出贡献23

拟议的研究将为复杂的病毒后疾病(如 PASC)生成一种新的潜在学习模型,预计将大大推动科学前沿。提出上述模型是为了解决传统诊断技术的这些挑战以及在异质人群池和地理中整合数据的需求,这对于检测长期 COVID 症状的微妙模式至关重要。该模型可以通过迁移学习扩展到不同的区域(或数据集),这使得它具有高度的可扩展性和鲁棒性。这种灵活性将实现数据...

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Disclosures

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作者声明,本文的发表不存在利益冲突。

Materials

List of materials used in this article
NameCompanyCatalog NumberComments
云计算环境(例如 Google Colab / AWS EC2)谷歌 / 亚马逊不适用用于通过GPU加速训练深度学习模型
流行病学数据集(SARS-CoV-2 急性后遗症,区域特异性)公共卫生数据存储库(例如,WHO、CDC、ICMR、地区医院)不适用迁移学习实验数据集
Jupyter 笔记本Jupyter 项目开源用于编码和文档的交互式环境
克拉斯开源与 TensorFlow 集成用于构建和训练深度学习模型的高级 API
Matplotlib / 西伯恩开源不适用用于图表和流行病学趋势分析的可视化库
数字开源不适用数值计算库
熊猫开源不适用数据作和分析库
预训练的 CNN/Transformer 模型(例如,基于 EfficientNet、BERT 的模型)TensorFlow 中心 / HuggingFace特定于型号用于流行病学预测的迁移学习和微调
Python (v3.8 或以上)Python 软件基础开源用于数据预处理、模型训练和评估的编程语言
Scikit-学习开源不适用用于预处理、评估指标和基线模型的机器学习库
TensorFlow (v2.x)谷歌开源用于迁移学习和模型部署的深度学习框架

References

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