需要JoVE订阅才能观看此内容。 请登录或开始免费试用

研究文章

PAK5 通过转录组谱分析揭示其促进食管鳞状细胞癌进展

349 次观看

⸱

DOI:

10.3791/69085

⸱

2025年12月16日

本文内容

摘要

本研究提出了一种评估食管鳞状细胞癌(ESCC)中PAK5功能的方法,表明PAK5的过表达可预测不良预后,并通过PAK5-GAREM1信号轴促进肿瘤进展。

摘要

食管鳞状细胞癌(ESCC)是全球癌症相关死亡的主要原因之一,尤其在亚洲地区更为突出。由于缺乏早期症状,大多数患者在确诊时已处于晚期,导致治疗效果受限,预后较差。深入理解 ESCC 的发病机制,并鉴定其生物标志物或治疗靶点,对于改善患者预后至关重要。P21 激活蛋白激酶 5(PAK5)属于丝裂原活化蛋白激酶家族成员,已被发现通过调控细胞周期、迁移和侵袭在多种恶性肿瘤中发挥作用。然而,其在 ESCC 中的作用尚不明确。本研究采用免疫组织化学方法检测了 ESCC 组织及配对正常组织中 PAK5 的表达水平,并通过 Kaplan-Meier 生存分析评估 PAK5 与患者预后的关系。构建了 PAK5 过表达和敲低的 ESCC 细胞模型,开展了一系列功能实验,包括 CCK-8、克隆形成和 Transwell 实验。此外,通过 mRNA 测序分析,鉴定 PAK5 调控的下游靶基因及信号通路。结果显示,与正常组织相比,ESCC 组织中 PAK5 表达显著升高,且与不良预后相关。功能实验表明,PAK5 可促进 ESCC 细胞的增殖、克隆形成、迁移和侵袭能力,而转录组学分析揭示 GAREM1 是其关键的下游效应分子。上述结果表明,PAK5 参与了 ESCC 的进展过程,可能作为潜在的预后生物标志物和治疗靶点。

引言

在全球范围内,食管癌是致死率最高的恶性肿瘤之一。在中国,食管鳞状细胞癌(ESCC)是最主要的组织学亚型。尽管治疗手段已取得一定进展,但ESCC患者的预后仍然极差,5年生存率仅为10%至25%1。这主要归因于早期诊断困难以及有效的分子靶向治疗手段有限2。与其他靶向治疗已显示出显著前景的实体瘤不同,ESCC中的此类治疗仍处于起步阶段,受限于可操作的分子靶点稀缺。

PAK5 是一种 II 组 PAK,可整合细胞骨架动态与促存活信号通路,并已在多种恶性肿瘤中被发现与化疗耐药相关3,4,5,6,7,8,9,10,11。鉴于 MAPK 信号通路在食管鳞状细胞癌(ESCC)生物学行为及治疗反应中的重....

访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。

方案

所有实验程序均经海南医科大学第二附属医院伦理委员会批准(批准号:LW2022602),并根据《赫尔辛基宣言》的要求获取每位参与者的知情同意。本研究中使用的试剂和设备列于材料表中。

1. 患者及组织样本采集

共纳入40例经病理确诊的食管鳞状细胞癌患者,所有患者术前肝肾功能均正常。手术切除后立即采集肿瘤组织(T组)和相邻的正常组织(N组;距肿瘤边缘≥2 cm)。组织在室温下用含4%多聚甲醛(PFA)的磷酸盐缓冲液固定7天,随后进行石蜡包埋。

2. 免疫组织化学染色

将石蜡包埋的组织切成5 µm厚切片,并在60 °C下烘烤1小时。切片使用二甲苯替代物脱蜡,经梯度乙醇复水,随后在10 mM柠檬酸钠缓冲液(pH 6.0)中于95–98 °C进行抗原修复20分钟。内源性过氧化物酶活性用3%过氧化氢孵育10分钟灭活,然后在室温下用5%正常血清封闭30分钟。切片在4 °C下与抗PAK5一抗(1:100稀释,参见材料表)孵育过夜(12–16小时)。PBS洗涤后,切片在室温下与辣根过氧化物酶标记的二抗孵育30分钟,用DAB显色至出现颜色(1–5分钟,显微镜下监控以避免过度染色),随后用苏木精复染30–60....

访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。

结果

PAK5 在食管鳞状细胞癌中高表达,且与不良预后相关
图1 展示了从PAK5的临床验证到功能及转录组学分析的整体工作流程,该流程鉴定出GAREM1是其下游靶点。为验证PAK5通过调控MAPK通路促进食管鳞状细胞癌(ESCC)进展的假设 通过 GAREM1,检测了PAK5在食管鳞状细胞癌(ESCC)组织中的表达模式及其与临床预后的关联。首先,利用来自基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus, GEO)的基因表达数据集GSE269447,筛选食管鳞状细胞癌组织与正常组织之间显著差异表达的基因(DEGs)19随后,生成了热图和火山图(图2A,B)。通过热图直观展示表达差异最大的前 25 个基因(图2A)。在此热图中,蓝色表示显著下调,红色表示显著上调。火山图(.......

访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。

讨论

本研究通过结合临床样本、功能实验和转录组学分析,深入探讨了PAK5在食管鳞状细胞癌(ESCC)进展中的作用。这些发现拓宽了对PAK5在ESCC中作用机制的认识,凸显了其作为预后标志物和治疗靶点的潜力。

食管鳞状细胞癌组织中PAK5的显著过表达及其与患者较差生存率的相关性,与其他癌症中的研究结果一致,即PAK5与肿瘤进展和不良预后相关。10,11通过鉴定PAK5作为食管鳞状细胞癌(ESCC)进展的调控因子,本研究增进了对激酶介导的肿瘤发生机制的广泛理解,并为食管癌中MAPK通路的调控提供了新的见解。值得注意的是,PAK5并非唯一参与ESCC发病机制的PAK家族成员——先前的研究已揭示其他PAK亚型在该疾病中的促癌作用。例如,作为I组PAK家族成员的PAK1在ESCC组织中显著上调,其高表达与肿瘤进展期及淋巴结转移相关;在机制上,PAK1通过激活ERK/MAPK信号通路促进ESCC细胞增殖和侵袭,该信号通路与本研究中涉及PAK5的信号级联存在重叠。

访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。

披露

作者声明,他们不存在可能影响本文所报告工作的竞争性财务利益或个人关系。

致谢

本工作得到了中国海南省自然科学基金(项目编号:822QN474)的支持。

....

访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。

材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
Annexin V-FITC 凋亡检测试剂盒Beyotime BiotechnologyC1062S凋亡检测染色试剂盒
抗 PAK5 抗体Abcamab110069免疫组化一抗,稀释比例 1:100
自动化电泳系统Agilent2100 BioanalyzerRNA 完整性评估
cDNA 合成试剂盒Invitrogen1896649逆转录试剂盒
结晶紫溶液Sigma-AldrichC3886克隆和侵袭实验染色剂
DMEM 培养基Gibco (Thermo Fisher)11965092细胞培养基
胎牛血清(FBS)Gibco (Thermo Fisher)16000044细胞培养添加剂
流式细胞仪BD BiosciencesFACSCanto II细胞分析仪器
GraphPad PrismGraphPad Software版本 8统计分析与绘图软件
H&E 染色试剂盒SolarbioG1120苏木精-伊红染色液
HRP 标记的抗大鼠 IgG 抗体Abcamab150165免疫组化二抗
Illumina NovaSeq 测序仪IlluminaNovaSeq 6000高通量测序平台
KYSE-150 细胞系RIKEN 细胞库RCB2057人食管鳞状细胞癌细胞系
Lipofectamine 3000ThermoFisherL3000008转染试剂
酶标仪Bio-Tek InstrumentsELx808吸光度测定仪器
DynabeadTM Oligo(dT)25sThermo Fisher Scientific61005用于 mRNA 纯化
青霉素-链霉素Gibco (Thermo Fisher)15140122细胞培养用抗生素
碘化丙啶(PI)Sigma-AldrichP4864DNA 染色剂
RPMI-1640 培养基Gibco (Thermo Fisher)11875093细胞培养基
分光光度计Thermo FisherNanoDrop ND-1000RNA 浓度与纯度测定
SPSS 软件IBM版本 23统计分析软件
Transwell 小室Corning3422细胞侵袭实验用小室

参考文献

  1. Chen, W., et al. Cancer statistics in China, 2015. CA Cancer J Clin. 66 (2), 115-132 (2016).
  2. Pennathur, A., Gibson, M. K., Jobe, B. A., Luketich, J. D. Oesophageal carcinoma. Lancet. 381 (9864), 400-412 (2013).
  3. Zhang, D. G., et al.

访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。

重印与许可

标签

PAK5表达预后生物标志物治疗靶点细胞增殖细胞迁移免疫组织化学Kaplan-Meier分析mRNA测序