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方法文章

EasyFiji：用于Fiji中用户友好型荧光图像处理的图形界面

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DOI：

10.3791/69441

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2026年2月20日

 , 
1Center for Bioimage Informatics, St. Jude Children's Research Hospital, 2Cell and Tissue Imaging Center, St. Jude Children's Research Hospital

本文内容

摘要

EasyFiji 是 Fiji（ImageJ）的一个图形用户界面插件，为生命科学家常用的一系列荧光图像可视化与处理工具提供了精选整合。

摘要

Fiji（Fiji Is Just ImageJ）是一个功能强大且可扩展的开源图像处理软件包，被生物图像分析领域广泛使用。然而，对于非计算背景的生命科学家而言，手动操作Fiji的众多功能需要学习并 navigating 一个层次复杂的菜单系统。此外，某些命令的默认行为在荧光图像的显示与处理方面并不理想。为了提高生命科学家处理荧光显微图像的效率，我们开发了EasyFiji——一个为Fiji定制的图形用户界面（GUI）插件。每个EasyFiji命令均通过带有工具提示的按钮和滑块执行，并始终针对荧光图像所需的各个荧光通道独立运行。对像素强度进行修改的命令还支持单击撤销，以实现更交互式的图像处理，并可自动记录和保存为文本格式用于存档。图像信息面板可显示对图像解读至关重要的参数设置。插件还提供了新的图像渲染和漂白校正功能。该插件可免费在GitHub上获取，并作为Fiji的更新站点提供。本实验方案详细说明了使用EasyFiji界面进行荧光显微图像可视化与处理的具体步骤。

引言

Fiji（Fiji Is Just ImageJ）是一个广泛应用于生物图像分析领域的功能强大且可扩展的开源图像处理软件包1,2Fiji 拥有大量通用算法代码库，以及宏语言和插件接口，计算分析人员可便捷地利用这些功能，为几乎任何图像处理或分析问题提供解决方案。然而，对于缺乏计算经验的生命科学用户而言，Fiji 的 >1,100 个命令分布在层级复杂的下拉菜单系统中，可能令人难以有效导航和使用。为简化 Fiji 的手动操作，已提出多种方法。Fiji 的搜索栏可作为菜单导航的替代方案，能够访问详尽的帮助文档，但前提是用户必须知道所需算法的名称。Fiji 的工具栏按钮可自定义，以快速访问用户定义的命令，但该过程需要编写宏代码，并预先判断哪些命令最为常用。ActionBar 插件提供了一个独立的图形用户界面（GUI）窗口，其中包含可自定义和可组织的按钮阵列，但同样需要编程和经验才能有效配置按钮。3这些方案均无法满足缺乏图像处理经验的生命科学研究人员的需求。

除了用户界面问题之外，许多使用荧光显微镜图像的生命科学研究人员还需要针对不同通道进行特定的显示和处理操作。然而，一些常用的 Fiji 命令默认情况下并不具备通道识别能力。例如，用户可能希望以同等显著的方式将伪彩着色的不同通道合并显示，或特别突出显示各通道间强度相似的区域，或在显示荧光信号的同时保留形态学信号的灰度对比度。在这些应用场景中，Fiji 的 RGB 复合图像渲染技术会在感知层面上掩盖所需的信息。在处理多通道图像时，Fiji 自带的图像滤波器（即 Process | Filters）要么仅处理当前激活的二维位平面，要么处理图像窗口中的所有位平面（即由 ImageStack 类定义的“图像栈”）。第一种行为无法针对某一通道在 z 维度或 t 维度上进行跨层面处理，而第二种行为几乎总是不恰当的，因为每个通道都具有独特的染色模式和信噪比，因此必须使用针对特定通道的处理参数。Fiji 自带的漂白校正命令（Image | Adjust | Bleach Correction）在应用于多通道荧光图像时也会产生错误结果，原因在于这些命令在整个图像栈上进行校正，而通道数据在图像栈中是交错排列的，正确的做法应是在每个通道内部独立地沿 z 维度或 t 维度进行校正。

为解决生命科学家在处理荧光显微镜图像时面临的挑战，我们开发了 EasyFiji，这是一个为 Fiji 定制并提供引导的图形用户界面插件。EasyFiji 是一组经过精心组织的主题式命令集合，支持针对不同通道的图像渲染与处理。该插件包含四个分栏面板：显示、处理、保存 和 图像信息，每个面板均设有与主题相关的按钮和滑块，并配有工具提示以辅助执行命令。其他便捷功能包括：用于交互式处理的撤销功能、可自动将修改像素的操作步骤与图像一同保存的简易纯文本操作记录器，以及以格式化方式展示对图像解读至关重要的采集参数设置。EasyFiji 还提供了新的图像渲染和漂白校正工具。需要注意的是，EasyFiji 不支持定量图像分析或批量处理功能，因为这些操作应仅在专业生物图像分析人员的指导下进行。尽管 EasyFiji 在设计上力求简洁，但所有原生的 Fiji 命令仍可通过 Fiji 原生菜单系统随时访问。我们认为，EasyFiji 针对特定用户群体的设计4 将有助于提升生命科学家对 Fiji 的使用率。本文将介绍 EasyFiji 的设计理念、实现方式及其在荧光显微镜图像中的应用。该插件可通过 Fiji 更新站点轻松安装（https://imagej.github.io/list-of-update-sites/ 和 https://imagej.net/plugins/EasyFiji_plugin），开源代码也可通过 GitHub 下载；插件及其源代码均可免费获取（https://github.com/stjude/EasyFiji）。 

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方案

本方案介绍了如何安装和使用 EasyFiji。

1. 安装 EasyFiji 的步骤…

  1. 下载适用于操作系统的最新版本 Fiji（>1.54g），并将其安装到用户具有读写权限的文件夹中（有关 Fiji 下载网站的链接，请参见材料表）。
  2. 启动 Fiji，然后在菜单栏中导航至帮助 | 更新…。
  3. 在更新器窗口中，点击管理更新站点。从列表中选择EasyFiji，然后点击应用并关闭。EasyFiji 将自动安装，并且未来 EasyFiji 发布新版本时，Fiji 将自动更新。
  4. 重新启动 Fiji，然后从 Fiji 插件菜单中选择 EasyFiji。
    注意：EasyFiji 与许多旧版本的 Fiji 完全兼容，且主要兼容 ImageJ。详细的兼容性和依赖性信息可在 EasyFiji GitHub wiki 页面（https://github.com/stjude/EasyFiji）和 EasyFiji ImageJ.net wiki 页面（https://imagej.net/plugins/EasyFiji_plugin#quick-start）上找到（有关这些资源的链接，请参见材料表）。反馈可通过 GitHub 页面或 Image.sc 论坛上的 EasyFiji 专题帖（https://forum.image.sc/t/announcing-easyfiji-a-user-friendly-gui-plugin-for-fiji/117617）提交。 

2. 使用 EasyFiji 显示面板

注意：如图1A所示，显示面板支持使用色卡按钮对荧光通道进行伪彩着色、直观的对比度调节控件，以及用于感知校准的多通道图像渲染的新选项。该面板还包含Fiji原生的3D/4D图像投影和重新切片命令。表1记录了EasyFiji命令与Fiji原生命令之间的对应关系。

  1. 设置通道的颜色或可见性显示 面板， 通道颜色 部分。
    1. 使用图像窗口的通道滑块选择所需的通道。
    2. 按压 a 色卡按钮 分配新的颜色查找表（LUT）。
    3. 按压 黑色色样按钮 关闭一个通道的显示。
    4. 按压 全部Chs按钮 同时显示所有通道。
    5. 按压 EachCh 按钮 通过滚动图像窗口中的通道滑块，依次显示每个通道。
  2. 在图像内部或图像之间设置通道对比度显示 面板， 通道对比 部分）。
    1. 要更改通道的显示范围（对比度），请使用图像窗口底部的通道滑块选择相应通道。
    2. 移动显示器 增益滑块 用于指定图像像素强度（右侧显示的值），使其在屏幕上显示为最亮的值。
      注意：我们使用“显示增益”这一术语来描述此操作，因为它会使通道线性变亮，类似于在图像采集过程中改变检测器增益的效果。
    3. 按下显示屏 增益复位按钮 将通道的最大可能像素强度（由其位深度决定）显示为屏幕上的最亮值。
    4. 移动显示屏 偏移滑块 用于指定图像像素强度（右侧显示的值）在屏幕上显示为最暗值。
      注意：我们使用“显示偏移”（display offset）这一术语来描述此操作，因为它设置了图像的黑电平，类似于在图像采集过程中设置探测器偏移的效果。
    5. 按下显示屏 偏移重置按钮 将图像像素强度的零值设置为屏幕上最暗的值。
    6. 按压 AutoCh 按钮 自动调整显示增益和偏移。
    7. 按压 自动全部按钮 自动调整所有通道的显示增益和偏移。
    8. 按压 扩增按钮 将显示增益和偏移设置从当前活动图像复制到所有其他已打开的、且具有相同通道数的图像中。
  3. 创建一个多通道显示（显示 面板， 频道观看量 部分。
    1. 要将两个荧光通道合并渲染为彩色图像，请使用 FF-前缀 按钮（荧光与荧光）。要将荧光通道和形态学灰度通道共同渲染为彩色图像，请使用 FG-前缀 按钮（荧光与灰度图像渲染图像将在新的图像窗口中生成。
      注意：在创建任何通道视图之前，首先调整每个通道的显示增益和偏移，使目标信号覆盖显示器的动态范围（第 2.2 节），然后应用这些增益和偏移 应用增益和偏移按钮 在 处理 选项卡（第 3.2.3 节）。如果未调整并应用增益和偏移，渲染效果将不理想。
    2. 按压 FFColoc 按钮 通过两个荧光通道生成彩色图像，其中当两通道信号强度相似（在25%范围内）时，以黄色像素突出显示。
      注意：通道间强度差异较大的像素将被渲染为 灰度. 黄色 像素提示基于相关性的共定位5 当每个通道中感兴趣信号跨越显示器的动态范围时。
      警告：FFColoc 渲染仅用于数据探索或示意图解，不可替代在专家协助下进行的共定位严格量化分析。
    3. 按压 FFMerge 按钮 通过两个荧光通道生成颜色渲染，使每个通道中的信号具有相等的可感知性。
      注意：每个像素的亮度根据信号强度较高的通道设定，而色相则由各通道间强度比值决定（遵循 Taylor 等人所述的概念）。6）。另请参见讨论部分。
    4. 按压 FGMerge 按钮 从荧光通道和灰度通道生成彩色图像，其中保留荧光通道的颜色，同时保留灰度通道的对比度。
      注意：灰度通道通常为非荧光模式，包含形态学信息，如微分干涉差（DIC）、相差或电子显微镜图像。
    5. 按压 蒙太奇按钮 将通道拆分为单独的图像，自动在屏幕上平铺排列，并同步显示。
    6. 按压 SyncWins 按钮 用于同步显示同类型的多幅图像。
  4. 创建三维 z- 或 t-序列的二维视图（显示 面板， 堆叠视图 部分）。
    注意：每个渲染图像均在新的图像窗口中显示。
    1. 按压 MIP 按钮 生成最大强度投影。
      注意：所得二维图像中每个位置的强度对应于沿三维方向上最强烈像素的强度rd 三维图像中的维度。该步骤可能会增强噪声，因此对图像栈进行平滑处理可能有助于改善效果（参见 处理 在创建最大强度投影（MIP）之前
    2. 按压 SIP 按钮 生成信号强度总和投影。
      注意：所得二维图像中每个位置的强度对应于沿三维方向各强度的总和rd 三维图像中的维度。该步骤可保留总强度，从而获得比任意单层切片噪声更小的图像。
    3. 按压 Ortho按钮 创建一个正交切片查看器，用于交互式地渲染三维图像堆栈的三个正交平面（例如，xy、xz、yz），这些平面在当前光标位置相交。
    4. 按压 基莫按钮 生成一条线扫描图像（kymograph）。
      注意：kymograph 是一种二维图像，其中垂直（y-）轴对应于图像堆栈的第三维（通常为时间 t-），水平（x-）轴则对应于用户在输入堆栈上所绘制线条上的位置。当 3rd 维度为时间时，可使用明场运动图（kymograph）来展示或量化运动。
      ​此按钮依赖于 KymographBuilder 插件7 Fiji 自带该功能，但如果使用 ImageJ，则需单独下载。
  5. 设置杂项选项显示 面板
    1. 按压 复制按钮 在 Fiji 中复制当前活动的图像窗口。一个新的图像窗口将会出现。
      注意：使用 Fiji 在图像上绘制一个矩形兴趣区域（ROI） 矩形感兴趣区域 工具，以及 复制按钮 将裁剪至 ROI 边界。指定通道、z 轴和/或 t 轴范围，以调整复制图像的维度。
    2. 按压 ToClip 按钮 复制活动图像 如当前屏幕上所示 到系统剪贴板。要将图像粘贴到其他应用程序中（用于准备幻灯片或编辑图片），请激活目标应用程序并选择粘贴（Windows 上按 Ctrl+V，Mac 上按 Cmd+V）。
    3. 按压 |--um--| 按钮 在图像上以叠加形式显示比例尺。切换 |--um--| 按钮 移除比例尺。

3. 使用 EasyFiji 处理面板

注意：如图1B所示，流程 面板中的通道特征部分提供了基于滑块的图像处理命令，并配有工具提示，可用于增强图像显示效果。撤销上一步按钮支持交互式处理。可使用修改尺寸按钮调整图像尺寸。操作表用于以纯文本形式记录改变图像像素强度值的处理命令。该日志可随后与图像一同自动保存，并使用相同的标题（参见保存 面板）。

  1. 改变图像的空间特征（过程 面板， 修改通道特征 部分。
    注意：所有命令仅适用于活动通道，结果将自动显示在原始图像窗口中，不会创建新的图像窗口。
    1. 移动 平滑滑块 应用高斯模糊，从而降低正态分布的像素间变异（~散粒噪声和读出噪声）。
      1. 对于约奈奎斯特采样图像（70-150 nm xy 像素尺寸），建议起始滑块值设置在 1.0 至 2.0 之间。
      2. 对于给定的像素尺寸，当图像的信噪比（SNR）降低时，应增加滑块的数值。
      3. 在给定信噪比（SNR）的情况下，随着像素尺寸减小，应增大滑块值。
      4. 对于图像堆栈，应进行三维平滑处理，其中z轴半径自动设置为xy平面半径的三分之一，适用于奈奎斯特采样数据。
        注意：滑块数值对应高斯核的标准差，以像素为单位测量。
    2. 移动 降噪滑块 应用中值滤波器，以去除极端异常值（相机热点像素或光电倍增管热电子发射）。
      注意：滑块数值对应方框滤波器核的半径（单位：像素）。0.5 至 1.0 之间的数值是合适的起始范围。
    3. 移动 锐化滑块 应用二维非锐化掩模，以减少模糊或 haze（如失焦光引起的模糊），但锐化也会增强噪声。
      注意：滑块值对应高斯核的标准差（单位为像素），用于定义模糊程度的尺度。对于约奈奎斯特采样图像（xy像素尺寸为70-150 nm），滑块值在2.0至4.0之间是一个良好的起点。权重参数固定为0.6。
  2. 调整图像像素强度（过程 面板， 调整通道强度 部分
    注意：所有命令仅适用于活动通道，结果将自动显示在图像窗口中，不会创建新的图像窗口。
    1. 移动 背景减除滑块 应用“滚珠”算法以去除背景（即空间上逐渐变化的强度差异）。
      注意：滑块数值表示滚动球的半径（单位为像素），因此数值越大，减去的背景越少。该数值取决于图像内容，但通常应至少为待保留特征尺寸（以像素计）的2倍以上。数值在10到20之间通常是较好的起始范围。
    2. 移动 伽马滑块 为增强弱信号与强信号混合时的可视化效果，例如在强调精细结构与较大结构共存时所需的情况。
      注意：归一化后，每个像素的值将根据滑块设定的指数值进行幂运算。该指数值取决于图像内容，但通常在0.6至0.8之间的值是一个良好的起始范围。
      警告：应用了伽马校正的图像不能用于强度定量分析。
    3. 按压 应用增益和偏移：ToCh 按钮 或 全部发送按钮 将图像显示范围（由“显示”面板中的显示增益和偏移滑块指定）映射到图像位深度所提供的全部强度范围内。
      注意：此过程也称为应用查找表（LUTs）。在创建通道视图之前，必须以这种方式应用显示增益（Gain）和偏移（Offset）。 显示 面板
    4. 使用 强度校正按钮 用于校正三维图像在 z 轴或 t 轴方向上由光漂白、像差或光散射等因素引起的伪影性强度变化。
      注意：该操作仅应用于活动通道。局部校正和全局校正可依次应用于同一数据集。有关底层方法的进一步说明，请参见结果部分。
    5. 按压 全局按钮 用于校正沿整个 z 轴或 t 轴维度发生的渐进式信号强度衰减，同时保留大多数由生物学因素引起的强度变化。有两种选项：
      1. 按压 全局L按钮 校正初始切片可能存在伪影的z轴堆叠图像 深色或黑色，且从第一帧到最后一帧的总强度损失较轻微（<50%）。该算法将强度损失建模为线性趋势，然后对每个切片应用校正因子，使拟合直线的斜率变为零。
      2. 按压 全局P按钮 用于校正时间序列，其中前几帧最亮，且从第一帧到最后一帧的总强度损失显著（50%–95%）。该算法将强度损失建模为一个 2nd 使用多项式趋势拟合并对每个切片应用校正因子，使得拟合曲线被转换为一条斜率为零的直线。
    6. 按压 局部按钮 用于校正局部的、突然的信号强度变化，同时保留渐进的变化。
      注意：此类变化可能由较大z轴堆栈中少数层面的漂白或激发光功率波动（闪烁）引起。该算法将具有生物学意义的强度变化建模为四阶多项式，然后应用校正因子，以确保每帧的中位强度等于拟合曲线的值。
    7. 按压 均衡按钮 使每帧的中位信号强度相等，类似于 Fiji 的“simple ratio”漂白校正方法。
      注意：当所有其他方法均无法实现可视化时，Equalize 可能有助于可视化，但它会消除中位强度中具有生物学意义的变异，因此不能与强度定量分析结合使用。
  3. 改变图像的维度（过程 面板， 修改尺寸 部分）。
    注意：这些命令适用于图像窗口中的所有通道，且无法通过使用 撤销 按钮
    1. 按压 旋转按钮 旋转图像，例如用于将胚胎或组织的解剖轴与页面或屏幕对齐。
    2. 按压 裁剪按钮 减小图像的xy维度。寻找 矩形感兴趣区域 自动选择工具，并根据提示在图像上绘制用于裁剪的感兴趣区域（ROI）。
    3. 按压 子集按钮 从输入图像的非xy维度的子集中创建一个新的图像堆栈。
      注意：此步骤用于去除通道和/或截断 z 轴或 t 轴上的切片。
  4. 记录应用于图像的处理命令（处理面板，记录操作部分）。
    注意：动作记录器（Action Recorder）的用途是自动将操作以纯文本形式记录下来，然后保存应用了这些操作的图像（这些操作会改变像素强度值）。该日志功能旨在为用户提供便利，使其无需手动记录或解读Fiji宏记录器的条目。不会改变像素强度值的命令不会被记录。
    1. 按压 录制按钮 开始命令录制。
      注意：当记录仪正在录制时，按钮表面显示为“ON”。已执行的命令及其相关参数将出现在动作表中。被“撤销”的命令将从表中移除。
    2. 按压 Clr 按钮 以清除操作表。
    3. 按压 保存按钮 将操作表另存为文本文件。如果已记录对多幅图像应用的操作，则在保存文本文件时，操作将根据图像标题进行分组。
      注意：或者，使用以下方法保存图像 保存 面板（见下文第4节）。检查 保存操作 框以及对图像应用的所有操作将自动保存为文本文件，文件名和路径与图像相同。

4. 使用 EasyFiji 保存面板

注意：如图1C所示，保存面板旨在帮助非专业用户为其预期用途选择正确的图像文件格式。当勾选保存操作复选框时，所有应用于图像的处理操作（如操作表中所列）将随图像一同自动保存，使用相同的文件名和路径，但扩展名为*.txt。如果同时打开了多个图像并进行了并行处理，则所有图像上执行的操作都会显示在操作表中。然而，仅保存应用于当前正在保存图像的操作。生成的文本文件会出现在文件系统中，但不会在Fiji中自动打开。如有需要，可通过将文件图标拖动到Fiji工具栏上来在Fiji中打开这些文本文件。

  1. 保存图像（保存 面板，保存方法 部分）。
    1. 点击 原始数据按钮，将图像保存为 *.tif 文件，以保留精确的像素值、通道结构以及部分元数据。当需要对图像进行进一步定量或分析时，请使用此选项。
    2. 点击 用于展示保存按钮，以当前显示状态将图像保存为采用 jpeg 压缩格式的文件，适用于电子邮件发送或幻灯片演示。
      警告：此选项绝不应用于制作图表或定量分析。
    3. 移动 质量级别滑块 以设置 jpeg 压缩水平。
      注意：数值越大，表示像素强度和图像特征的保留越完整（文件大小也越大），但并非所有特征都能完全保留。
    4. 点击 用于图表保存按钮，将当前显示的图像以 png 格式保存，该格式兼容其他图形软件（例如 Photoshop、Illustrator、Publisher 或 GIMP）。图像将按屏幕上显示的状态保存，但通道信息和元数据不会被保留。
      警告：此选项绝不应用于定量分析。
    5. 点击 保存为视频按钮，将图像堆栈保存为 mov 格式的视频文件，按顺序播放各切片（z 或 t 序列）。
      注意：在基于 Windows 的操作系统上播放 mov 文件需要安装开源的 VLC 媒体播放器。

5. 使用 EasyFiji 图像信息面板

注意：如图1D所示，图像信息面板显示了厂商特定的纯文本采集参数，这些参数对于图像解读至关重要。目前支持的共聚焦图像格式类型请见表2。

  1. 按下 通道信息 按钮以加载 采集 设置。
  2. 在 通道信息 部分查看通道特定的采集设置，包括 % 激光功率、激光波长、发射带通滤光片、增益 和 针孔大小。
  3. 在 系统配置 部分查看全图像范围的设置，包括 系统名称、物镜、扫描模式、停留时间 和 体素大小。

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结果

多通道荧光图像的伪彩渲染可用于展示信号之间的空间关系或强度关系；然而，Fiji 原生仅提供一种 RGB 叠加渲染技术，该方法在感知层面上本质上会混淆颜色与亮度信息。为说明这一问题，图2 使用了 N-Myc 与 RNA 聚合酶 II（RNAPolII）的双通道图像。图2A 中，各通道以灰度单独显示，因此不存在任何（可能造成干扰的）色彩信息。图2B 中，通道以 Fiji RGB 叠加渲染方式共同显示，使用了所有可能的原色和/或间色组合。如图所示，不同颜色的渲染在感知层面上传达了截然不同的信息（下文将对此进行量化）。因此，Fiji RGB 叠加渲染所呈现的信息在感知上任意依赖于各通道所分配的颜色。科学图像的渲染应被合理设计，以有效传达特定信息。

生命科学家可能希望采用多通道渲染来评估两个信号之间的整体（空间和强度）关系，其中每个信号在视觉上都具有同等的可感知性，而不受所用颜色的影响。EasyFiji 的

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讨论

Fiji 是一款开源的图像处理与分析软件，在图像分析人员中广受欢迎。然而，其复杂的菜单界面以及在荧光图像显示与处理方面有时不够直观的操作方式，为非计算背景的生命科学家带来了挑战。EasyFiji 为生命科学家提供了一组经过精心设计、按主题组织并配有工具提示的按钮和滑块，这些控件在处理荧光图像时始终表现出针对特定通道的规范化行为。所有处理命令均可撤销，支持交互式操作，并可自动记录且以纯文本形式随图像保存，便于存档。对于尼康和蔡司点扫描共聚焦显微镜，系统会显示图像解读所需的关键采集参数。作为 Fiji 的插件，EasyFiji 在保持简洁的同时并不限制功能，用户始终可通过 Fiji 原生菜单系统访问全部 Fiji 命令。除简化后的用户界面外，EasyFiji 还提供多种专门设计的多通道渲染技术，以及用于稳健漂白（衰减）校正的新方法。EasyFiji 有意不提供定量分析功能或批量处理功能，因为定量图像分析应仅在生物图像分析专家的协助下进行。

尽管生命科学家可能因多种原因将多个荧光通道合并为一幅彩色图像，但原生的 Fiji 主要提供一种多通道 RGB 叠加渲染技术。在此技术中，每个像素的显...

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披露

作者声明不存在任何竞争性财务利益或其他利益冲突。

致谢

感谢圣犹达细胞与组织成像中心以及生物图像信息学中心成员对本文手稿提出的宝贵意见。生物学图像由以下人员慷慨提供：图2：Melissa Marzahn 和 Tanja Mittag；图3：Peng Wei 和 James Morgan；图4A：Aaron Pitre；图4B：Aaron Pitre 和 Woo Jung Cho；图5A：Helen Chen 和 Heather Mefford；图5B：Sauradeep Sinha 和 Giedre Krenciute。

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
EasyFiji GitHub 网站开源https://github.com/stjude/EasyFiji
EasyFiji Image.sc 论坛开源https://forum.image.sc/t/宣布推出EasyFiji：一款面向Fiji的用户友好型图形界面插件/117617
EasyFiji ImageJ.net 网站开源https://imagej.net/plugins/EasyFiji_plugin#快速入门
FIJI 软件开源https://imagej.net/software/fiji/downloads
VLC 媒体播放器开源https://www.videolan.org/vlc/

参考文献

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