本方案提供了一个系统性框架,通过杀菌活性建模和组合相互作用测定,评估植物化学物质如何增强传统杀菌剂的杀菌效果,旨在鉴定可提高微生物控制效果并减少杀菌剂总体使用量的协同作用混合物。
方法文章
本方案提供了一个系统性框架,通过杀菌活性建模和组合相互作用测定,评估植物化学物质如何增强传统杀菌剂的杀菌效果,旨在鉴定可提高微生物控制效果并减少杀菌剂总体使用量的协同作用混合物。
开发创新且高效的策略以增强传统生物杀灭剂的抗菌活性,是改进医疗消毒领域微生物控制的有前景的方法。在此背景下,我们描述了一种详细的实验方案,用于评估植物来源的植物化学物质对合成生物杀灭剂的增效作用。由于这些植物源产品具有结构多样性、生物活性以及通常较低的毒性,因而成为理想的生物杀灭剂佐剂候选物。本文所述的工作流程可用于测定单一组分(生物杀灭剂和植物化学物质)及其双联或三联组合的最小杀菌浓度(MBCs),并系统生成剂量-反应曲线和时间-反应曲线。所得数据可进行高级数学建模分析,包括计算部分杀菌浓度指数(FBCI),并利用软件Combenefit评估各测试组分之间的相互作用,判断其为协同、相加或拮抗效应。由此,可识别出具有潜力的天然产物作为生物杀灭剂增强剂,优化抗菌效果,并设计更可持续且更安全的消毒策略,从而降低对合成生物杀灭剂所需浓度的依赖。这不仅提升了微生物控制效果,也最大限度地减少了因过度使用生物杀灭剂所带来的环境与公共健康风险。
医疗相关感染(HAIs)是全球最严重且令人担忧的公共卫生挑战之一1令人担忧的是,它们与多重耐药微生物(MDR)的传播以及细菌生物负荷在医院环境表面的持续存在密切相关,这通常是由于消毒措施不当或无效所致。2,3此外,患者、医护人员与医疗设备之间的交叉污染进一步加剧了这一问题。4,5例如,在欧洲,据估计每天约有80,000名住院患者至少感染一种医院获得性感染(HAI),每年因此导致额外约1,600万住院日2新冠疫情使这一问题更加复杂,由于抗菌剂/消毒剂的大量使用以及住院人数增加,导致耐多药细菌感染病例激增6,7耐药菌的出现,包括产超广谱β-内酰胺酶(ESBL)的细菌 大肠杆菌 和耐甲氧西林的 金黄色葡萄球菌 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)已在全球范围内造成日益加重的健康和经济负担。事实上,这些菌株凸显了开发创新性感染预防与控制解决方案的紧迫性。1,8,9.
基于这一背景,杀菌剂已成为控制耐药细菌及其感染传播的关键工具,被广泛用于医院环境表面的消毒、医疗器械的灭菌、水系统的处理以及预防医疗设备的污染10,11。与抗生素作用于特定的微生物靶点不同12,杀菌剂可同时破坏多种细胞结构,包括细胞膜、酶、核糖体RNA以及代谢通路13,14,15。这种广谱作用机制最初被认为可降低耐药性的发生风险。然而,现有证据表明,微生物能够适应杀菌剂的暴露,从而产生耐受性、持续存活,甚至对抗生素产生交叉耐药性10,16。例如,Pseudomonas aeruginosa 暴露于苯扎氯铵后,通过外排泵的过表达,筛选出对环丙沙星和新生霉素耐药的变异株17。类似地,三氯生已被证实可激活Stenotrophomonas maltophilia中的外排泵,而氯己定的暴露则与S. aureus中抗生素耐药性的增加相关18。
此外,季铵盐类化合物(QACs)、氯己定、二脒类、吖啶类以及三氯生已被认为可能是导致多种抗生素耐药性产生和持续存在的原因19,20。已知如qacA/B和smr等耐药基因可赋予细菌对QACs的耐受性,且已有临床失败案例报道,包括因导管储存于受污染的QAC溶液中而引发的菌血症,以及碘伏制剂本身存在的微生物污染问题16,17,21。这些发现凸显了优化生物杀菌剂使用的紧迫性,需通过机制研究和合理的消毒策略加以支持。
生物膜是由多糖、蛋白质和核酸组成的胞外基质中嵌入的高细胞密度且结构有序的细菌群落,对感染控制构成了额外且重大的障碍22,23。它们对抗生素和杀菌剂表现出显著的耐受性,导致患者体内感染持续存在。此外,生物膜还常与医疗器械、手术器械及医院环境表面的持续污染相关24。尽管其具有重要的临床意义,但直到近几十年,生物膜才被确认为慢性感染和抗菌药物耐药性的主要因素。其顽强的生存能力使得即使使用强效消毒剂也往往无法彻底清除,残留的持留细胞仍可重新引发感染20,25,26。因此,寻找有效的抗生物膜策略对于控制医院获得性感染(HAIs)以及减轻多重耐药病原体带来的公共卫生和经济负担至关重要27,28。
作为一种有前景的解决方案,植物化学物(phytochemicals)——即由植物产生并从中提取的次生代谢产物——代表了一类尚未被充分开发的新型抗菌和抗生物膜剂资源29。然而,目前尚无植物化学物被用作抗生素,因其抗菌活性与传统抗生素相比相对较弱。通常根据敏感性试验将植物化学物归类为抗菌剂,其最低抑菌浓度(MIC)范围为100至1000 µg/mL,该数值远高于传统抗生素30,31。重要的是,植物化学物单独使用或作为传统杀菌剂的增效剂时,已显示出抗生物膜活性。例如,槲皮素(quercetin)可抑制藻酸盐的生成,从而在生物膜形成过程中减少黏附32,33,34。大黄素(emodin)通过降低生物膜形成相关关键基因的表达,抑制了铜绿假单胞菌(P. aeruginosa)、大肠杆菌(E. coli)和金黄色葡萄球菌(S. aureus)的生物膜发育35。将植物化学物与传统上常用但日益失效的杀菌剂联用,作为耐药性调节剂,是一种有望提高抗菌效果的策略36。此类协同作用可干扰微生物的耐药机制,降低实现有效消毒所需的杀菌剂最低有效浓度37。该方法可优化杀菌性能,减轻耐药性发展的选择压力,并减少因过度使用杀菌剂所带来的生态与毒理学影响15,20。植物化学物具有结构多样性38,39,40、来源广泛38,39,41、成本低廉38,39,42,且通常对人类和环境的毒性低于合成杀菌剂38,39。它们是天然产物,通常来源于可再生的植物资源,在某些情况下,据报道其环境持久性较低,毒性特征也优于某些合成杀菌剂43,44,45。尽管其成本、可获得性和毒性特征因化合物及提取工艺而异,但多种植物化学物与某些传统杀菌剂相比,已表现出更有利的安全性和环境特性46,47。
本方案旨在评估植物化学物质单独使用或与传统生物杀菌剂联用时在医疗消毒中的潜在应用价值。简而言之,该方案在广泛的浓度范围内评估生物杀菌剂与植物化学物质之间的相互作用。首先在0.1–500 mg/L浓度范围内测试生物杀菌剂,在50–10,000 mg/L浓度范围内测试植物化学物质,以确定最小杀菌浓度(MBC)(表1)。对于双组分联合使用,选择亚杀菌浓度如下:苯扎氯铵(BAC)为0.1、0.5和0.75 mg/L;过氧乙酸(PAA)为0.1、0.3和0.5 mg/L;水杨酸(SAL)为50、100和250 mg/L;丁香酚(EUG)为100、250和750 mg/L(表1)。三组分联合使用则采用BAC(0.75 mg/L)或PAA(0.5 mg/L),分别与SAL(100或250 mg/L)和EUG(250或750 mg/L)组合(表1)。进行1–90分钟的时间-反应实验,随后评估24小时细菌再生长情况。抗菌相互作用通过分数杀菌浓度指数(FBCI)进行量化,并使用Combenefit软件进行分析;同时,采用Chick-Watson模型和Weibull模型拟合消毒动力学,以表征浓度依赖性及灭活动力学特征。
其创新之处在于对植物化学物与杀菌剂之间稳定的双重及三重相互作用进行合理设计,在减少传统杀菌剂使用量的同时,优化了消毒活性,并最大限度地降低了毒性和环境影响。此外,还采用了数学方法,如计算FBCI 和协同效应评估,以量化植物化学物与杀菌剂在微生物控制中的相互作用。FBCI可在特定浓度组合下对相互作用(协同、拮抗或无关)提供分类解释,而Combenefit则能够基于响应面法,在更广泛的浓度范围内对相互作用模式进行更全面的评估。这使得浓度依赖性的相互作用效应得以可视化和量化,而这些效应可能无法通过单点指数捕捉到48,49。此外,消毒动力学采用Chick-Watson模型(用于剂量-响应)和Weibull模型(用于时间-响应)进行建模50。这些模型提供了微生物灭活的动力学描述,给出表征消毒速率和存活曲线行为的定量参数50。它们有助于判断杀灭过程是否符合对数线性或非线性动力学,并对处理效应提供更具机制性的解释,从而超越了FBCI的描述性局限51,52。
本方案可系统性地鉴定具有前景的植物化学物-杀菌剂组合,并开发出一种高效且可持续的医疗保健消毒策略。与仅提供静态终点测量结果的传统最小抑菌浓度(MIC)或棋盘法实验不同,本方案整合了动态杀菌建模和相互作用分析,以全面捕捉增效作用的强度和动力学特征。传统棋盘法实验虽能基于MIC终点提供有关抑制性相互作用的重要信息,但其局限在于仅依赖生长测量且仅得出单一的相互作用指数。本文所述方案在此基础上实现了进一步发展:不仅量化杀菌活性而非抑菌效果,还通过评估处理后的再生长情况以判断抗菌作用的持续性,同时涵盖双组分及三组分杀菌剂-植物化学物(或多种植物化学物)组合的评价,采用Chick-Watson和Weibull模型对消毒动力学进行建模,并利用Combenefit软件进行浓度-反应曲面分析。这一多维度策略使得对杀菌剂-植物化学物增效作用的评估更加稳健且具备预测能力。
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注意:所提出的方法学改编自欧洲标准 EN 127653。
1. 培养物制备
2. 分子溶液的配制与对照
3. 细菌接触杀菌剂或植物化学物质
4. 中和、连续稀释与涂布
5. 双联和三联组合评估
6. 细菌再生长评估
7. 联合用药结果的解读——部分杀菌浓度指数(FBCI)
8. 时间响应实验的操作步骤
9. 使用 Combenefit 软件分析组合数据
10. 将 Chick-Watson 模型和 Weibull 模型应用于剂量-反应和时间-反应数据
11. 生物学重复
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本研究评估了所测试的四种化合物——BAC、PAA、SAL 和 EUG——的杀菌活性 E. coli CECT 434 和 S. aureus CECT 976。如图所示 图1 和 图2BAC、PAA、SAL 和 EUG 对可培养性表现出明显的浓度依赖性效应。 表2 展示了受试分子在暴露后以及暴露后24小时(再生长能力评估)的最小杀菌浓度(MBC)值。对于BAC,在3 mg/L浓度下未观察到菌落形成单位(CFU)(约减少6 log CFU/mL),两种情况下均如此 E. coli 和 S. aureusPAA 在 1 mg/L 时对两种细菌均实现了完全灭活。在植物化学物质中,SAL 在 500 mg/L 时对细菌表现出完全的杀菌活性 E. coli 和 S. aureus,而EUG分别需要1000 mg/L和1700 mg/L才能达到类似效果(
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本研究中所述的实验方案提供了一个综合框架,用于评估两种常用生物杀灭剂——BAC 和 PAA——以及两种具有潜力的植物化学物质——EUG 和 SAL——单独使用及联合使用(双联和三联组合)对 E. coli 和 S. aureus 的杀菌活性。该方案中的多个步骤对于确保实验的可重复性以及对抗微生物相互作用的准确解读尤为关键,包括细菌接种物的标准化、生物杀灭剂和植物化学物质溶液的精确配制与操作、作用时间与温度的严格控制,以及准确的菌落形成单位(CFU)计数,以用于后续的动力学建模和协同作用分析。该框架结合了传统的杀菌实验、再生长评估、组合测试和动力学建模,能够对即时和长期的抗菌效应进行系统且定量的表征。然而,为确保本方案的正确和高效使用,需考虑若干方面。首先,细菌接种物的标准化以及受试分子溶液的仔细配制对可重复性至关重要。BAC 易于非特异性吸附到聚合物实验器具和微塑料表面,因此用于定量实验的溶液应使用玻璃或低吸附性容器操作,并验证避免在聚丙烯或聚乙烯塑料中发生损失73,74。PAA 是一种强氧...
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作者声明,他们在撰写本文时不存在任何竞争性经济利益或利益冲突,且无任何事项需要披露。
本工作由以下项目资助:InnovAntiBiofilm 项目(编号 101157363),由欧洲委员会(Horizon-Widera 2023-Acess-02/Horizon-CSA)资助;MultAntiBiofilm 项目(编号 COMPETE2030-FEDER00852000;编号 17121)和 HCAI_Disinfect 项目(编号 COMPETE2030-FEDER-00752300;编号 16360),通过竞争力因素运营计划(COMPETE)以及科学技术基金会(FCT)的国家资金资助;LEPABE 项目(UID/00511/2025,https://doi.org/10.54499/UID/00511/2025)和 UID/PRR/00511/2025(https://doi.org/10.54499/UID/PRR/00511/2025),以及 ALiCE 项目(LA/P/0045/2020,https://doi.org/10.54499/LA/P/0045/2020),由 FCT/MCTES(PIDDAC;葡萄牙里斯本)通过国家资金资助。Mariana Sousa 的博士奖学金(2023.00337.BD;https://doi.org/10.54499/2023.00337.BD)由 FCT 提供。
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 苯扎氯铵 | Merck, Spain | 8.14363.0100 | 杀菌剂 |
| Centrifuged Mega Star 600R | VWR, USA | VWR Mega Star 600R | - |
| Combenefit - 版本 2.021 | 英国剑桥癌症研究所,剑桥,英国 | - | 用于协同作用评估的软件 |
| 比色皿 | VWR, Germany | VWRI634-0678 | 用于光密度调节的 1.5 mL 比色皿 |
| 蒸馏水 | - | - | 用于培养基制备 |
| 二甲基亚砜 (DMSO) | VWR, France | 23500.322 | 有机溶剂 |
| 一次性接种环 | VWR, Italy | VWRI612-9357 | 10 μL 接种环 |
| Eppendorf 管 | VWR, China | VWRI525-1164 | 1.5 mL Eppendorf 安全锁扣管 |
| Escherichia coli | 西班牙标准菌种保藏中心 (CECT) | 434 | 本研究中使用的参考菌株 |
| 乙醇 | VWR, France | 83813.36 | 用于工作台面、材料及手部的消毒 |
| 丁香酚 99% | Sigma-Aldrich, USA | 163333 | 植物化学成分 |
| Falcon 管 | VWR, USA | VWRI525-1085 | 15 mL Falcon 管 |
| Falcon 管 | VWR, Belgium | VWRI525-1109 | 50 mL Falcon 管 |
| GraphPad Prism 9.0 for Windows 11 | La Jolla, California, USA | - | 用于数学与统计分析的软件 |
| 卵磷脂 | Alfa Aesar, Germany | Q04A010 | - |
| L-组氨酸 | Merck, USA | 1.04351.0025 | - |
| 轨道摇床培养箱 | VWR, USA | VWR 5000I Incubating shaker 230V | - |
| 过氧乙酸 15% | AppliChem, Germany | 143495-1211 | 杀菌剂 |
| 培养皿 | VWR, Italy | VWRI391-0582 | - |
| 移液器 1 - 10 mL | VWR, USA | - | |
| 移液器 100 - 1000 μL | VWR, USA | - | |
| 移液器吸头 100 - 1000 μL | Frilabo, Portugal | 1-202-50-0 | - |
| 移液器 20 - 200 μL | VWR, USA | - | |
| 移液器吸头 1 - 10 mL | VWR, Belgium | vwri613-7094 | - |
| 移液器吸头 2 - 200 μL | VWR, Mexico | vwri613-6418 | - |
| 平板计数琼脂 | VWR, Belgium | 84608-0500 | 用于微生物的分离与培养 |
| 聚山梨酯 80 | VWR, USA | 20E2756726 | - |
| 氯化钾 - KCl | VWR, Belgium | 11D110008 | - |
| 磷酸二氢钾 - KH2PO4 | VWR, Germany | 26931.263 | - |
| 水杨酸 | Sigma-Aldrich, USA | 84210-500G | 植物化学成分 |
| 皂苷 | VWR, Germany | 21A124103 | - |
| 氯化钠 - NaCl | VWR, Belgium | 27788.297 | - |
| 磷酸氢二钠 - Na2HPO4 | VWR, Belgium | 28026.26 | - |
| 硫代硫酸钠 - Na2S2O3 | VWR, USA | 18D2056589 | - |
| 分光光度计 | VWR, USA | UV-1600PC Spectrophotometer | 用于光密度调节 |
| Staphylococcus aureus | 西班牙标准菌种保藏中心 (CECT) | 976 | 本研究中使用的参考菌株 |
| 胰蛋白胨大豆肉汤 | Merck, Germany | 1.05459.0500 | 用于微生物的分离与培养 |
| 超纯水 | - | - | 用于样品制备 |
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