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方法文章

探究固本平喘颗粒治疗支气管哮喘的作用机制

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DOI:

10.3791/70564

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2026年7月14日

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本文内容

摘要

本方案通过网络药理学、分子对接和体内验证,研究固本平喘颗粒在支气管哮喘中的作用机制。

摘要

本研究采用网络药理学、分子对接及实验验证方法,探讨固本平喘颗粒治疗支气管哮喘的作用机制。通过TCMSP、HERB和SymMap数据库筛选固本平喘颗粒的活性成分及其对应靶点;从GeneCards、OMIM、TTD、DrugBank和PharmGKB数据库获取支气管哮喘相关靶点。识别交集靶点,并构建成分-靶点及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。采用错误发现率(FDR)校正法进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。随后进行分子对接,以评估成分与靶点之间的结合亲和力,并开展实验验证 体内 验证。共鉴定出121种活性成分和234个药物相关靶点,得到155个交集靶点。核心靶点包括 TP53, AKT1, TNF,以及 IL6 KEGG 分析显示 PI3K–Akt 信号通路显著富集,被选为实验验证的目标。分子对接结果表明核心成分与靶点之间具有较强的结合亲和力 AKT1 在卵清蛋白诱导的哮喘大鼠中,固本平喘颗粒降低了血清 IL-4 和 IL-10 水平,升高 FoxP3 在肺组织中的表达,并上调 PI3K 和 AKT mRNA 水平。这些发现表明,固本平喘颗粒通过调控 PI3K–Akt 信号通路,调控炎症性细胞因子,增强调节性T细胞功能。

引言

支气管哮喘是一种异质性的慢性呼吸系统疾病,其特征是气道炎症、气道高反应性、黏液过度分泌以及气道重塑1。哮喘的发病机制涉及免疫细胞活化、炎症介质以及多种信号通路之间的复杂相互作用。临床上,哮喘表现为反复发作的喘息、呼吸困难、胸闷和咳嗽。气道炎症是疾病发生和发展的核心机制,其特点包括促炎性细胞因子(如 IL-6, IL-4, IL-17 和 TNF-α)分泌增加,嗜酸性粒细胞和中性粒细胞等炎症细胞浸润,以及气道平滑肌增生、基底膜增厚和黏液腺增生等结构改变2˒3。这些病理过程最终导致气道阻塞和通气功能受损。

哮喘的病理生理学受多种相互作用的信号通路调控,而非单一机制。其中,PI3K–Akt 信号通路通过调控 FoxP3 的表达,在调节免疫平衡特别是Treg/Th17轴中发挥关键作用。该通路还与 IL-17 和 TNF 信号通路相互作用,增强炎症反应和气道重塑,从而导致疾病的异质性和治疗抵抗3,4。流行病学数据显示,全球哮喘患病率持续上升,全球患者超过3.58亿,中国成人患者约4570万5,6。目前的治疗策略主要依赖吸入性β₂-受体激动剂和糖皮质激素;然而,这些疗法仅针对有限的病理机制,可能在部分患者中引起不良反应和糖皮质激素抵抗。PI3K–Akt等通路的失调与治疗反应降低相关,凸显了多靶点治疗策略的必要性7,4。

中医将哮喘归类为“哮证”,认为其与肺、脾、肾功能失调有关,并受外邪诱发。由于中药方剂具有多成分、多靶点的特点,已被广泛应用于哮喘的治疗8,9。与单一靶点的药物不同,中药通过协同调节多条生物通路发挥治疗作用,更契合哮喘复杂的病理生理机制10。网络药理学提供了一种系统层面的研究方法,可用于分析药物成分、作用靶点与疾病通路之间的相互作用,有助于识别关键的生物活性成分及其分子机制11。分子对接技术则可进一步评估小分子与靶标蛋白之间的结合亲和力,从而补充和完善上述研究方法。

固本平喘颗粒是一种由八种草药成分组成的中药复方制剂,包括麻黄(Ephedra sinica,麻黄草)、补骨脂果实(Psoralea corylifolia)、苦杏仁(Prunus armeniaca 种子)、太子参根(Pseudostellaria heterophylla)、紫苏子果实(Perilla frutescens)、枇杷叶(Eriobotrya japonica 叶)、百合鳞茎(Lilium brownii)以及淫羊藿(Epimedium brevicornum)。该方剂传统上用于补益正气、化痰止咳、平喘。既往临床研究已证实其在支气管哮喘治疗中具有显著疗效,相较于常规治疗具有更高的应答率12。

为了阐明其潜在的作用机制,采用了一种整合网络药理学、分子对接和体内实验验证的综合方法。利用网络药理学鉴定与支气管哮喘相关的活性成分及潜在靶点;通过分子对接评估关键化合物与靶蛋白之间的相互作用;随后在动物模型中开展实验验证,以评估其对关键信号通路(特别是PI3K–Akt通路)的调控作用。该策略旨在揭示固本平喘颗粒多靶点治疗效应的作用机制,并为其在支气管哮喘治疗中的应用提供科学依据。

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方案

所有动物实验均经辽宁中医药大学动物伦理委员会批准(批准号:21000042023058),并依照机构实验动物使用指南进行。本实验方案所用的研究工具列于材料表中。

1. 数据库与软件

  1. 访问以下数据库和软件:TCMSP、HERB、SymMap、PubChem、STRING、GeneCards、OMIM、TTD、DrugBank、PharmGKB、DAVID、UniProt 和 Cytoscape(版本 3.9.1)。

2. 组分靶点的获取

  1. 从 TCMSP 数据库13中获取麻黄、杏仁、太子参、紫苏子、枇杷叶、百合属植物及淫羊藿的化学成分。从 HERB 和 SymMap 数据库中获取补骨脂的化合物。
  2. 采用口服生物利用度(OB ≥ 30%)和类药性(DL ≥ 0.18)筛选活性化合物14,15。
  3. 利用 TCMSP 预测靶基因。通过 UniProt 数据库选择智人(Homo sapiens)对所有靶点进行标准化。剔除重复及无效靶点,包括非人类条目、未注释的蛋白质以及已废弃的标识符。

3. 支气管哮喘靶点的获取

  1. 使用关键词“支气管哮喘”在 GeneCards、OMIM、TTD、DrugBank 和 PharmGKB 中进行检索。将 GeneCards 相关性评分设置为 >4。合并所有检索到的靶点并去除重复项。

4. 交集靶点的鉴定

  1. 将药物靶点和疾病靶点导入在线Venn分析工具。识别重叠的靶点,并记录总数以供后续分析。

5. 组分-靶点网络的构建

  1. 将交集靶点导入 Cytoscape 3.9.1,构建成分-靶点网络。根据度值调整节点的大小和颜色。

6. 蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络的构建

  1. 将交集靶点上传至 STRING 数据库。选择 Homo sapiens,并将置信度评分设置为 ≥0.900。导出网络并将其导入 Cytoscape。
  2. 计算拓扑参数(度中心性、介数中心性和接近中心性)。使用中位数阈值并结合度 >20 来鉴定核心靶点。

7. GO 与 KEGG 富集分析

  1. 将重叠的靶标上传至 DAVID 数据库,或使用 R 软件包 clusterProfiler 进行分析。
  2. 对生物过程、细胞组分和分子功能类别进行基因本体(Gene Ontology, GO)富集分析。
  3. 进行 KEGG 通路富集分析。采用错误发现率(false discovery rate, FDR)校正,并将显著性阈值设定为 FDR < 0.05。
  4. 使用柱状图或气泡图可视化最显著富集的条目。

8. 分子对接

  1. 从 PubChem 下载核心化合物的二维结构。使用 ChemOffice 生成三维结构,并保存为 mol2 文件。
  2. 从 RCSB PDB 数据库下载蛋白质结构。使用 PyMOL 去除水分子和配体。
  3. 使用 AutoDock Vina 进行分子对接。定义网格盒参数并运行对接模拟。
  4. 记录结合能(kcal/mol)和关键相互作用残基。利用分子建模、可视化和模拟平台展示对接结果。

9. 实验验证

  1. 动物
    1. 获取48只雄性Sprague–Dawley大鼠(9周龄,220–240 g)。在标准条件下,将动物饲养于20–25 °C、相对湿度55%–60%的环境中。
  2. 药物与试剂
    1. 制备由麻黄、补骨脂、杏仁、太子参、紫苏子、枇杷叶、百合和淫羊藿组成的固本平喘颗粒。
    2. 按照材料表中的列表准备地塞米松、卵清蛋白(OVA)、氢氧化铝、ELISA试剂盒、RNA提取试剂盒和抗体。
  3. 仪器
    1. 准备标准实验室设备,包括酶标仪、电泳系统、石蜡切片机和成像系统。
  4. 动物分组与处理
    1. 将大鼠随机分为六组(n = 8):空白对照组、模型组、地塞米松组(0.3 mg/kg)、低剂量中药组、中剂量中药组和高剂量中药组。
    2. 在第1、7、14天,对模型组、中药低剂量组、中药中剂量组、中药高剂量组及地塞米松组大鼠分别腹腔注射1 mL 10% OVA + 10% Al(OH)₃,进行致敏处理。
    3. 向空白对照组大鼠于第1、7、14天分别腹腔注射0.9%生理盐水1 mL。
    4. 从第15天到第21天,每天进行一次20分钟的雾化吸入刺激。对模型组、低剂量中药组、中剂量中药组、高剂量中药组及地塞米松组大鼠给予5%卵清蛋白(OVA)雾化吸入。
    5. 从第15天至第21天,对空白对照组大鼠进行0.9%生理盐水雾化吸入给药。
    6. 根据分配的治疗组,从第22天至第36天每日通过口服灌胃给予治疗。
    7. 每天监测动物体重和一般状况。实验时间线总结如下: 表1.
  5. 组织病理学
    1. 收集肺组织。固定、包埋并切片样本。进行苏木精-伊红染色。
    2. 采用马松染色法评估胶原沉积。
  6. RT-PCR分析
    1. 从肺组织中提取总RNA。
    2. 在超低温条件下匀浆冷冻肺组织。称重样品后,迅速转移至含有液氮的预冷研钵中,研磨成粉末。
    3. 将粉末样品转移至离心管中。每50–100 mg组织加入1 mL TransZol UP和0.2 mL RNA提取试剂。室温下振荡试管5分钟。
    4. 将样品在1000 × g下离心 × g 2–8 °C 下孵育 15 分钟。将无色水相转移至新的离心管中。
    5. 加入1 mL TransZol UP至0.5 mL异丙醇中,室温孵育10分钟。
    6. 以 1000 × g 离心样品 g 10分钟。加入1 mL 75%乙醇,再离心5分钟。
    7. 弃去上清液,将沉淀物在室温下晾干5分钟。用50–100 µL RNA溶液溶解沉淀物,然后孵育10分钟。
    8. 将样品于 −70 °C 保存以实现长期储存。
    9. 合成cDNA并进行定量PCR以检测PI3K和AKT的表达水平。
  7. 酶联免疫吸附测定
    1. 在 4 °C 下解冻血清样本。测量 IL-4 和 IL-10 使用ELISA试剂盒,按照制造商说明书检测水平。
  8. 免疫组织化学
    1. 用4%多聚甲醛固定肺组织,经石蜡包埋、切片、脱蜡和水化处理。
    2. 进行抗原修复、封闭和抗体孵育。按照FoxP3免疫组化试剂盒说明书使用DAB染色液进行染色,阳性表达呈棕黄色或棕褐色。
    3. 在显微镜下观察并拍照,使用Image J软件对FoxP3表达进行定量统计分析。
  9. 统计分析
    1. 使用Shapiro–Wilk检验测试数据正态性,使用Levene检验测试方差齐性。
    2. 使用单向方差分析(one-way ANOVA)或适当的非参数检验进行数据分析。数据以均值 ± 标准差表示。
    3. 定义 p < 0.05 作为具有统计学意义的阈值。★★p < 0.01 和 ★p < 0.05 与 对照组;◆◆p < 0.01 和 ◆p < 0.05 与模型组相比;##p < 0.01 和 #p < 0.05 对地塞米松组。

表1:实验时间表。 致敏、激发和处理程序的时间安排。请点击此处下载该表格。

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结果

活性成分筛选
共从TCMSP数据库中筛选出121个具有靶标活性的活性成分,其中包括来自 麻黄属 Herb,7 来自 补骨脂,19 来自杏仁,8 来自 假繁缕 迷迭香根,16 来自紫苏籽,18 来自枇杷叶,7 来自 百合属,以及23个来自 淫羊藿 (表2)。共鉴定出16种常见成分,包括木犀草素、槲皮素、β-谷甾醇、山奈酚、豆甾醇和(+)-儿茶素。经标准化后共获得234个药物相关靶点。此外,共鉴定出1,059个哮喘相关靶点,其中药物与疾病共有155个交集靶点图1).

表2:固本平喘颗粒的活性成分。 筛选化合物及其相关的药代动力学参数列表。请点击此处下载该表格。

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讨论

支气管哮喘是呼吸科常见疾病16。它是一种由过敏原和气道高反应性引起的阻塞性气道疾病17。该病临床发病率高,易复发,难以治愈,显著影响患者的健康和生活质量。2025年全球哮喘防治倡议(GINA)报告指出,吸入性糖皮质激素治疗哮喘有效18;然而,长期使用可能导致依从性差。部分患者在减量或停药后出现复发,还可能发生下丘脑-垂体-肾上腺轴抑制,导致部分糖皮质激素反应性降低19。

近年来,中医在哮喘治疗方面受到广泛关注。在中医理论中,哮喘属于“哮证”范畴,其发病机制涉及风邪亢盛、体质虚弱、气机逆乱及痰浊阻滞等方面。其中,风邪亢盛对应诱发哮喘急性发作的过敏原或呼吸道感染等外在因素;而痰浊阻滞则被视为内在病因20。哮喘之痰多为伏痰,发作时咳痰较少21。痰浊久伏于肺络,可引发气道痉挛,导致咳嗽和喘息。支气管哮喘的发...

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披露

作者声明无利益冲突。

致谢

作者感谢所有同事的协助。本工作得到辽宁省教育厅一般项目“基于基因表达谱与代谢组学探讨固本平喘颗粒对支气管哮喘气道炎症及免疫调节作用机制的研究”、辽宁省“兴辽人才计划”医学专家项目以及辽宁省中医药优秀人才(临床类)项目的资助。

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
 qPCR试剂盒NovogeneNQ-001, 2×1mL检测目的基因mRNA的相对表达水平
氢氧化铝 Al(OH)3上海佑博生物科技有限公司YB-AL001, 500g免疫佐剂,用于增强抗原的免疫应答
BCA蛋白浓度检测试剂盒孚德生物科技有限公司FD2001, 每盒100片总蛋白定量,用于标准化上样量
化学发光成像系统 Tanon5200MultiWB条带成像、凝胶及印迹图像的采集与分析
彩色预染蛋白Marker 百奥莱博科技有限公司BL005, 10-180kDa, 500μL电泳实验中蛋白质分子量参照标准
增强型RNA提取试剂盒全式金生物ET111-01v2, 每盒50个从组织和细胞中提取并纯化总RNA
酶联免疫吸附测定仪美国Biotek公司Epoch/BioTek样本中细胞因子及蛋白质含量的定量检测
FOXP3一抗碧云天生物科技有限公司AG5002, 50ul/支特异性结合FOXP3蛋白,用于免疫检测
凝胶快速制备试剂盒 上海雅美PG212, 30套快速制备电泳用分离胶和浓缩胶
Masson染色试剂盒 索莱宝生物科技有限公司G1340, 100片组织胶原纤维特异性染色及纤维化观察
OVA北京博奥拓达科技有限公司OVA-10g, ≥98%建立过敏动物模型的经典过敏原
一抗稀释液 碧云天生物科技有限公司P0256-100ml稀释一抗,维持抗体活性并减少非特异性结合
大鼠IL-10 ELISA试剂盒Andy BioE-30649, 96T大鼠抗炎因子IL-10的定量检测
大鼠IL-4 ELISA试剂盒Andy BioE-30623, 96T大鼠Th2型炎症因子IL-4的定量检测
逆转录试剂盒 宝日医生物技术有限公司 E047-01A将RNA逆转录为cDNA,用于后续基因分析
饱和油红O染色试剂盒索莱宝生物科技有限公司G1261, 50mL×2瓶组织脂滴的特异性染色与检测
上样抗兔二抗Proteintech生物有限公司SA00001-2, 1mL结合兔源一抗,用于WB显色反应
TBST缓冲液武汉赛维尔生物科技有限公司G2150, 1L/瓶Western blot中膜的洗涤及抗体稀释用缓冲液
转印电泳系统上海金灿石精密机械有限公司PowerPac Basic用于蛋白质电泳及Western blot转膜
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