本方案描述了一种在多只小鼠社交互动过程中同步记录视频和音频数据的方法。该方法利用麦克风阵列和声源定位技术,将超声波发声(USVs)分配给个体小鼠,从而实现对不同动物在不同社交情境下的发声行为进行定量分析。
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本方案描述了一种在多只小鼠社交互动过程中同步记录视频和音频数据的方法。该方法利用麦克风阵列和声源定位技术,将超声波发声(USVs)分配给个体小鼠,从而实现对不同动物在不同社交情境下的发声行为进行定量分析。
小鼠(Mus musculus)在社交互动过程中通过超声波发声(USVs)进行交流。然而,由于小鼠的超声波发声缺乏明显的视觉提示,且发声频率超出人类听觉范围,因此在群体中识别具体发声个体仍具挑战性。本实验方案描述了一种在多只动物社交互动期间同步记录视频与超声音频数据的方法,从而实现行为与发声活动的同步采集。文中介绍了一个计算分析流程,该流程整合了多动物追踪、发声检测、声源定位以及 将发声信号分配至各个个体的技术。此外,还详细说明了用于评估该流程各阶段性能的验证方法,包括追踪准确性、发声信号提取效果、定位精度以及发声归属置信度。将该方案应用于一个包含四只动物的示范数据集,可实现对个体发声的精确追踪、空间上精准的声源估计,并获得发声输出量及声学特征的定量测量结果。综上所述,这些 方法为将发声交流与个体行为关联提供了 一个稳健的分析框架,并支持对自由互动小鼠中性别差异、个体间变异性和社交交流特征的 下游分析。
动物界中的社会交流是行为动态的基本组成部分,有助于生存和繁殖等过程1,2。在哺乳动物中,小鼠通过超声波发声(USVs)进行声学交流,其频率范围为35至110 kHz3。USVs具有复杂的特征,能够根据不同的行为情境传递特定信息4。雌性小鼠对雄性小鼠的USVs表现出偏好5,6,而雄性和雌性小鼠在求偶行为中也会进行声音互动7,这表明USVs发挥着关键的社会信号功能。由于特定的USV特征与小鼠不同的行为状态密切相关8,准确地将发声分配给个体对于理解社会互动至关重要。
尽管已投入大量努力来阐明超声波发声(USVs)的功能及其与社会行为的关系8,但该领域一直面临一个挑战,即在群体互动过程中难以将USVs准确归因于个体小鼠。这一困难主要源于USV产生时缺乏可见的口部运动4,以及USVs的频率范围超出人耳听觉能力3。因此,以往关于USVs与社会行为关系的研究仅局限于简化的实验范式或受控环境,这些条件限制了可观察的群体行为范围9,从而只能部分揭示自由互动动物中发声行为的动态过程。
为了深入理解听觉通讯与社会行为之间的关系,有必要捕捉小鼠的全部行为谱,并将群体中个体发出的发声进行归因。确定发声个体的身份对于明确不同个体间性别和情境依赖的发声范围8、检验特定发声特征如何驱动同种动物行为的因果假设10,11,12,以及在适用情况下 将发声输出与同步记录的脑信号(如电生理信号)进行关联分析至关重要13。传统观点认为仅雄性小鼠会发声;然而,声源定位技术揭示雌性小鼠在群体环境中7或与雄性配对时14也会产生超声发声(USVs)。若无法确定是哪只动物发出了超声发声,则在自由互动的群体中将发声特征与个体行为及社会行为结果相联系的研究仍受到限制。因此,使用一种能够在维持自然互动动态的同时将发声归因于个体动物的定位系统至关重要。
本文所述的麦克风阵列声源定位系统此前已有发表7,15,可估算发声时发声源在实验区域内的空间位置,并同步追踪所有在场动物的位置,从而实现将发声信号归属至发声个体。通过基于概率的度量方法,整合声源估计结果与动物位置追踪数据,以支持将超声发声(USVs)分配给特定个体动物。发声归属处理可将以往模糊的群体发声记录转化为带有明确个体标签的动物发声数据7,15 ,进而实现将发声类型和时序与行为及后续同种个体行为进行关联的定量分析。本研究的目的是提供一套详细的操作流程,用于实施 该方法,该方法此前已被量化并验证15。以下方案详细说明了该系统的搭建、校准与实施步骤,包括麦克风阵列几何结构、音视频同步、自动声音检测与概率性声源估计、多动物位置追踪,以及用于将超声发声(USVs)归因于发声动物的 归属流程 7,15。
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所有涉及动物的实验方案均经特拉华大学动物护理与使用委员会批准(方案编号:1275),并依照美国国立卫生研究院指南进行。所用试剂和设备列于材料表中。
1. 构建声源定位装置
2. 社交行为记录的准备工作
3. 社会互动记录
4. 视频预处理
5. 多动物追踪
6. 声学分割
7. 声源定位
8. 结果验证
9. 数据分析
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本文展示的结果来自为期2天的记录,旨在说明Warren等人15最初发表的实验方案的输出效果。这些数据并不用于支持统计推断或得出普遍性结论。
USVs 的提取与归属
使用麦克风阵列定位系统,在个体和群体社交互动过程中记录了 USVs。在每次社交互动过程中,同时记录两只雄性与两只雌性小鼠。总共在 2 天内进行了记录,所记录动物的身份信息见表 2。在社交过程中,共提取到 2,783 个 USVs,其中 2,773 个被成功定位(99.6%),1,636 个被归属至个体小鼠(58.8%)。其余 1,137 个已定位信号未达到归属标准,被标记为未归属。在单独记录过程中,共提取到 512 个 USVs,其中 508 个被定位(99.2%),475 个被归属至记录的小鼠(93.0%)。其余 32 个已定位信号被标记为未归属。对于所有单独记录过程,我们为每次发声生成了(一个或三个)随机位置的虚拟小鼠。虚拟小鼠的位置使归属概率低于 95% 的阈值,因此该发声被标记为未归属(详见...
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在群体互动期间,将超声波发声(USVs)可靠地归因于个体小鼠,一直是小鼠发声交流研究中的主要技术局限。尽管小鼠被广泛用于社会交流研究,但无法将发声行为准确分配给特定个体,限制了在接近自然的社会环境中对发声行为的定量分析。因此,一种能够在社会互动期间实现个体特异性发声追踪的方法,对于研究自由互动小鼠的发声产生至关重要。
本文介绍了一种系统化且经过验证的实验方案,可用于在自由社交互动过程中追踪个体动物、提取超声波发声(USVs)并准确将发声信号分配给特定小鼠。该方法结合基于视频的追踪技术与发声信号的提取、定位和分配,实现了行为数据与声学数据在时间上的精确对齐。所生成的数据集支持对发声时间、声学结构以及个体动物特异性发声输出进行定量分析,同时强调流程中每个阶段的验证与质量控制。
该方案中的多个步骤需要密切监控,因为在这些阶段引入的错误可能会影响后续分析。在视频预处理(步骤4)期间,若动物与背景环境之间的对比度不足,可能导致追踪错误,尤其是在动物彼此靠近时。在处理前调整视频亮度或对比度(步骤4.2)可显著减少因光照不均或动物重叠引起的...
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作者无任何利益冲突需要披露。
感谢特拉华大学生命与科学研究设施的工作人员在动物护理方面提供的帮助,感谢Jim Farmer和Jamie Quesenberry在实验室设备建造方面的协助,以及特拉华大学高性能计算小组在维护计算集群方面的支持。感谢Andre Yichong Ma在数据收集方面的协助。本研究由美国国立卫生研究院(NIH)资助,资助编号为R01MH122752和T32GM142603。
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