本方案描述了将一种可产生吲哚的减毒Brucella melitensis菌株通过静脉注射给予NOD/ShiLtJ小鼠,随后进行纵向糖尿病监测、胰腺组织学分析,以及可选的高重空间蛋白质组学和单细胞RNA测序,以评估胰岛免疫重编程情况。
方法文章
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本方案描述了将一种可产生吲哚的减毒Brucella melitensis菌株通过静脉注射给予NOD/ShiLtJ小鼠,随后进行纵向糖尿病监测、胰腺组织学分析,以及可选的高重空间蛋白质组学和单细胞RNA测序,以评估胰岛免疫重编程情况。
1型糖尿病(T1D)由自身免疫介导的胰腺β细胞破坏所致,目前的治疗方法无法恢复持久的免疫耐受。通过代谢工程改造、可产生免疫调节代谢物的细菌代表了一种有前景的单剂量治疗策略。本文提供了一项全面的实验方案,通过单次静脉注射产吲哚的减毒Brucella melitensis菌株BmΔvjbR::tnaA,评估其对糖尿病前期雌性NOD/ShiLtJ小鼠自身免疫性糖尿病发病的影响。
该方案首先从冻存的甘油菌种中复苏 BmΔvjbR::tnaA,将其接种于选择性培养基中培养至对数中期,并根据光密度计算菌落形成单位。选用雌性 NOD 小鼠, <5周龄小鼠在无麻醉状态下被固定,并通过侧尾静脉注射磷酸盐缓冲液中特定剂量的细菌,同时置于加热垫上维持体温。在实验期间,于禁食2小时后每周监测2次血糖水平,持续70至105天;若连续两次检测血糖值≥250 mg/dL,则定义为糖尿病。实验终点时,取胰腺组织在中性缓冲福尔马林中固定72小时,经石蜡包埋后切片,进行苏木精-伊红染色、胰岛素免疫组织化学染色及胰岛总面积定量分析。福尔马林固定石蜡包埋切片用于空间蛋白质组学分析,采用包含25种标记物的抗体 panel,以可视化调控性和效应性免疫细胞群体。最后,新鲜胰腺组织进行单细胞分离、3′文库构建、测序及基于Seurat的生物信息学分析,以描绘免疫细胞与基质细胞群体中的转录变化。
该整合方案可实现可重复的单剂量细菌治疗递送,并对胰岛免疫重塑进行多模态表征,为在自身免疫模型中测试代谢物工程化微生物以及在单细胞分辨率下解析组织特异性免疫机制提供了研究框架。
1型糖尿病(T1D)是一种慢性自身免疫性疾病,其特征是免疫介导的胰岛素生成性胰腺β细胞破坏,导致终身依赖胰岛素以及血管并发症风险增加1。NOD/ShiLtJ小鼠重现了人类自身免疫性糖尿病的关键特征,包括自发性胰岛炎及进展为明显糖尿病的过程,被广泛用作机制研究和治疗研究的临床前模型1,2,3。目前的T1D治疗方法——包括免疫抑制药物、单克隆抗体和过继性调节性T细胞(Treg)疗法——可暂时延缓疾病进展,但往往无法持久恢复免疫耐受或持续保护β细胞质量1,2,4,5,6,7,8,9,10,11。
调节性T细胞(Tregs)及其他调节性细胞群体是新兴1型糖尿病(T1D)疗法的主要靶点,包括自体多克隆Treg输注、工程化抗原特异性Treg以及基于IL-2的治疗方案1,2,4,5,6,7,8,9,10,11。然而,胰岛局部的促炎性微环境可能削弱这些疗法的效果,凸显了对组织驻留免疫网络进行局部重编程的必要性2,7。微生物来源的色氨酸代谢物,特别是吲哚及其相关化合物,可通过促进调节性T细胞分化、诱导抗炎型巨噬细胞极化以及抑制Th17反应,调节固有免疫和适应性免疫12,13。因此,活体微生物疗法和代谢工程化细菌代表了一种有前景的策略,可原位递送免疫调节性代谢物并重塑组织免疫状态12,13,14,15,16,17,18。
我们先前开发了一种代谢工程改造的Brucella melitensis菌株BmΔvjbR::tnaA,该菌株可组成型产生吲哚,并通过扩增调节性T细胞(Tregs)和重塑炎症微环境来控制自身免疫性关节炎14,15,16。诸如BmΔvjbR等减毒的Brucella菌株已被广泛表征为疫苗平台,且可经遗传修饰以携带免疫调节有效载荷14,15,16。
本文介绍了一种在NOD/ShiLtJ模型中评估单次静脉注射BmΔvjbR::tnaA的详细方案,包括细菌制备、标准化的静脉给药、糖尿病监测,以及通过组织学、高重空间蛋白质组学和单细胞RNA测序对胰腺组织进行多模态分析。该工作流程为测试经代谢物工程改造的微生物作为器官特异性自身免疫疾病的单剂量免疫疗法提供了实用框架。前期剂量-反应分析表明,减毒菌株在剂量高达1 × 1010 CFU时具有良好的安全性和耐受性。
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所有动物实验均严格遵循伦理准则,并经德克萨斯农工大学机构动物护理与使用委员会(IACUC)批准。&M 大学(方案编号:2021-0123)
1. BmΔvjbR::tnaA 的制备与表征
2. NOD/ShiLtJ 小鼠的获取、饲养与准备
3. 经尾侧静脉进行静脉注射
4. 血糖监测与糖尿病定义
5. 胰腺的收获、固定与处理
6. 组织学评估与胰岛面积定量
7. 多种下游分析
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尽管本文所述的广义方案现已优化为单剂量预防方案,但此处展示这些初步结果仅用于说明通过该工作流程可获得的预期组织学和血糖读数。
健康胰腺与 1 型糖尿病胰腺的整体疾病背景及对比通过示意图展示于 图1A自身免疫对β细胞的破坏及随之而来的胰岛素生成能力丧失,如本示意图所示,反映了人类及NOD小鼠中1型糖尿病(T1D)公认的发病机制1B。根据总结的实验方案,纳入雌性NOD/ShiLtJ小鼠进行研究。 图2A.
所示的代表性概念验证数据 图3 (葡萄糖轨迹和总胰岛面积)来自一项初步小规模队列研究,该研究采用两次给药方案(第0天和第21天)。本研究中的纵向血糖测量结果显示,与对照组(给予载体)相比,接受BmΔvjbR::tnaA治疗的小鼠血糖水平更稳定,高血糖的发生时间也更延迟图3A)。组织学和形态计量...
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本文所展示的代表性结果存在一个关键局限性,即用于说明分析终点的数据(图3)来源于采用两剂接种方案的早期小规模预试验队列。由于该方案现已优化为单剂预防性给药方案,因此需要开展更大规模的后续研究,采用本文所述的优化后单剂方案,以确立正式的统计学有效性。
本 JoVE 方案描述了在 NOD/ShiLtJ 小鼠中静脉单次注射产吲哚减毒 Brucella melitensis 菌株的操作流程,结合标准化的监测与组织学评估,证明该工作流程可用于捕捉 1 型糖尿病中的初步疗效信号。在本研究展示的初步队列中,与对照组相比,BmΔvjbR::tnaA 延缓了糖尿病的发病,并保护了胰岛结构,这通过纵向血糖监测以及总胰岛面积增加且胰岛素染色保持完整得以证实(图 3A–C)6。这些发现与先前研究结果一致,表明对细菌进行代谢工程改造以及微生物来源的色氨酸代谢物能够抑制炎症反应并促进调节性免疫...
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作者无竞争性财务利益。
本工作获得了美国国立卫生研究院基金R01CA273002和R21AI167793(资助J.S.和P.d.F.)以及NIH机构国家研究服务奖(T32,资助K.D.)的支持。我们感谢德克萨斯A&M大学健康科学中心提供机构支持。感谢Yava Jones-Hall博士进行盲法组织病理学评估,感谢Song实验室提供预实验和动物技术支持,感谢德克萨斯农工大学&M 基因组科学研究所 & 社会(TIGSS)分子基因组学工作区提供的单细胞RNA测序文库构建与测序服务、TIGSS生物信息学核心团队提供的数据分析与解读支持,以及Akoya Biosciences提供的空间蛋白质组学服务。我们感谢德克萨斯A&M 基因组科学研究所 & 社会(TIGSS)生物信息学核心(TBC)提供的协助。
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 10% 中性缓冲福尔马林(NBF) | VWR | 10790-714 | |
| 10x Genomics Chromium Controller | 德克萨斯A&M大学TIGSS分子基因组学工作区&M大学 | ||
| 70% 乙醇 | VWR | 89125-164 | |
| 用于FFPE的粘附性显微镜载玻片 | Leica Biosystems | 3800084E | |
| Akoya 小鼠 FFPE 抗体面板(约 25 个标志物) | Akoya Biosciences | [面板 ID/自定义面板] | |
| 使用DNA HS试剂盒的Bioanalyzer或TapeStation | 德克萨斯A&M大学TIGSS分子基因组学工作区&安捷伦 | ||
| BmΔvjbR::tnaA 细菌菌株 | 实验室库存(Song/de Figueiredo 实验室) | ||
| Cell Ranger 分析流程 | 10x Genomics | v7.1 | |
| 氯霉素 | 研究产品国际公司 | 56-75-7 | |
| Chromium Next GEM 单细胞 3' 试剂盒 | 10x Genomics 通过 TIGSS 核心平台 | ||
| 产气荚膜梭菌胶原酶 | 默克生命科学 | C7657-100MG | |
| DAPI 核染色 | Akoya Biosciences | [服务提供] | |
| FFPE包埋,H&E 染色、胰岛素免疫组化染色及切片扫描 | VMBS组织学实验室,德克萨斯农工大学&M 大学 | https://vetmed.tamu.edu/vmbs-histology-lab/ | |
| 葡萄糖检测试纸 | EKF Diagnostics / Fisher Scientific | 22-022-649 | |
| 葡萄糖检测试纸(替代) | Ascensia Diabetes Care | CONTOUR NEXT 试纸条 | |
| 甘油(散装,500 mL) | Millipore Sigma | G7893-500ML | |
| 甘油(无菌,100 mL) | Sigma Aldrich(G Biosciences) | G5516-100ml | |
| GraphPad Prism(或 R 中的 survival 软件包) | GraphPad Software / R | v10.2 | |
| 手持式血糖仪 | Ascensia Diabetes Care | 康拓 NEXT EZ | |
| Illumina NextSeq 2000 测序仪 | TIGSS分子基因组学工作区,德克萨斯A&M 大学 | ||
| 胰岛素注射器,29–30 G(U-100) | VWR | 10002-702 | |
| 糖尿病检测用采血针 | Becton, Dickinson and Company (BD) | 366594 | |
| Liberase TL 研究级 | 默克生命科学 | 5401020001 | |
| 低温加热垫 | 开展科学 | RWD-69025 | |
| Miltenyi 细胞核/细胞分离试剂盒 | TIGSS 分子基因组学工作区,德克萨斯农工大学&美天旎生物技术 | ||
| 小鼠加热垫(替代方案) | Kent Scientific | RightTemp | |
| 小鼠固定器 | Braintree Scientific | TV-RED 150-STD | |
| NOD/ShiLtJ 小鼠(雌性,5 周龄) | 杰克逊实验室 | 品系 #001976 | |
| P2 XLEAP 100循环流动池试剂盒 | Illumina 通过 TIGSS 核心平台 | ||
| PhenoCycler 数据采集与质控服务 | Akoya Biosciences | ||
| PhenoCycler 试剂与成像工作流程 | Akoya Biosciences | [服务提供] | |
| PhenoCycler-Fusion 系统 | Akoya Biosciences | ||
| 磷酸盐缓冲液(PBS),1× | 赛默飞世尔科技 | 10010023 | |
| Protector RNase抑制剂 | Millipore Sigma | 3335402001 | |
| Qubit 荧光仪与双链DNA高灵敏度检测试剂盒 | TIGSS 分子基因组学工作区,德克萨斯农工大学&安普&梅(Amp&M)/赛默飞世尔科技(Thermo Fisher) | ||
| QuPath | 开源 | v0.4.3 | |
| R 软件 | R 项目 | v4.0+ | |
| Seurat(R 软件包) | Satija 实验室 / CRAN | v4.3 | |
| StarDist | 开源 | v0.8.3 | |
| 胰蛋白胨大豆琼脂(TSA) | VWR | CA90002-706 |
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申请许可以重复使用本 JoVE 文章的文本或图表
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