建立了一套结合胰蛋白酶消化与差别离心的标准化方案,用于从小鼠骨骼肌中分离、纯化和功能性表征线粒体,并评估其在线粒体移植中的应用。
方法文章
* These authors contributed equally
建立了一套结合胰蛋白酶消化与差别离心的标准化方案,用于从小鼠骨骼肌中分离、纯化和功能性表征线粒体,并评估其在线粒体移植中的应用。
线粒体是调节真核细胞中能量代谢、信号转导和细胞稳态的重要细胞器。线粒体功能障碍促成了多种疾病的发病机制,并促使线粒体移植作为再生治疗策略的发展。线粒体移植的成功应用依赖于高度纯化且功能完整的线粒体的可用性。骨骼肌因其高线粒体含量、代谢活性强且可及性强,是合适的供体来源。本研究建立了一套标准化、可重复的方案,用于从小鼠骨骼肌中分离、纯化和表征功能性线粒体,并评估其在线粒体移植中的应用。该手术分为两个主要阶段。首先,通过糖蛋白酶消化和差别离心,从C57BL/6小鼠的骨骼肌中分离出线粒体。其次,对分离的线粒体进行了鉴定,以评估其纯度、超微结构和功能活性。线粒体纯度通过双辛戊酸(BCA)蛋白定量和西方印迹分析进行评估。超微结构完整性通过透射电子显微镜进行了检测。通过JC-1和线粒体荧光标记,结合高分辨率呼吸系统测量氧气消耗、ATP生成能力和呼吸控制比,评估了功能活性。分离出的线粒体表现出保存的膜电位、完整的超微结构和稳定的呼吸活动,表明适合后续功能研究和线粒体移植应用。
线粒体是腺苷三磷酸(ATP)的主要产区,在细胞凋亡、钙稳态以及活性氧物种(ROS)代谢中起着核心作用。因此,线粒体的功能完整性对于维持细胞稳态和决定细胞命运至关重要 1,2。线粒体功能障碍,包括线粒体DNA(mtDNA)突变和电子传递链(ETC)异常,会导致能量代谢受损、氧化应激和细胞凋亡失调 3,4。这些异常与多种疾病相关,包括遗传性线粒体疾病、神经退行性疾病和心血管疾病5,6。传统的线粒体功能障碍治疗策略,如抗氧化剂和代谢辅因子,通常疗效有限,因为它们只能缓解症状,但无法直接恢复线粒体功能 7,8。因此,线粒体移植已成为再生医学中一种有前景的治疗方法。该策略涉及将完整的外源线粒体输送到受损或功能失调的细胞中,以恢复线粒体活性和细胞能量代谢9,10。以往研究表明,外源性线粒体可以被受体细胞内吞并纳入内源性线粒体网络,从而提升生物能量功能和细胞生存率11,12,13。
骨骼肌因其高线粒体含量、代谢活性和可及性,被认为是线粒体分离的合适供体 14,15,16。线粒体移植需要多个关键步骤,包括线粒体分离、纯化、功能表征以及高效地输送到受体细胞。然而,迄今为止报告的方案中仍存在显著方法学差异,尤其是在涉及组织均质化、酶消化、温度控制和纯化等程序中。这种变异性会影响线粒体的产量、纯度和功能完整性,从而限制实验的可重复性。
为提高方法学的一致性和可重复性,本研究提出了一套标准化方案,利用胰蛋白酶消化和差别离心法从小鼠骨骼肌中分离和表征功能性线粒体。通过双碳酸(BCA)蛋白定量、西方吸迹法、透射电子显微镜、基于荧光的膜电势测定和高分辨率呼吸法,对分离出的线粒体进行了纯度、超微结构完整性和功能活性的评估。此外,评估了受体细胞对分离线粒体的摄取情况,以评估其在线粒体移植应用中的适用性。该方案为获得功能性骨骼肌来源线粒体提供了可重复的工作流程,用于下游实验研究。
所有动物实验均在特定的无病原体(SPF)设施内进行,并经空军医科大学第三附属医院动物伦理与使用委员会批准(批准号:IACUC-2024kq-065)。
雄性C57BL/6小鼠(6-8周龄,18-20克)购自空军医科大学实验动物中心(生产许可证:SCXK(陕西)2024-002)。这些小鼠被安置在个体通风笼(IVC)中,环境为正压且环境清洁,温度为20-26°C,相对湿度为40%-70%,12小时的明暗循环,每小时至少换气15次。提供了消毒饮食、饮用水和环境丰富措施。
协议中使用的试剂、化学品和实验仪器列于 材料表中。
1. 动物献祭与组织采集
2. 组织切碎与均质化
3. 差速离心
4. 线粒体纯化与储存
5. 线粒体和胞质蛋白提取及BCA定量
6. 骨骼肌来源线粒体的纯度评估
7. 骨骼肌来源线粒体的有丝粒蛋白追踪器染色
8. 利用JC-1染色评估线粒体膜电位
9. 通过透射电子显微镜对分离骨骼肌线粒体进行超微结构分析
10. 骨骼肌来源线粒体的细胞摄取
11. 利用高分辨率呼吸测验测量线粒体呼吸功能
线粒体分离和纯化工作流程的示意概述见 图1。所有手术均在4°C下进行,以保持线粒体完整性和功能活性。新鲜分离的骨骼肌组织被剁碎并与胰蛋白酶消化以促进组织解离,然后使用玻璃均质剂在等渗分离缓冲液中均质化。随后进行了差别离心,将线粒体从组织碎片和细胞质污染物中分离。首次离心在1,000×克下去除了核和大颗粒,而随后在12,000×克离心时得到粗糙的线粒体颗粒。额外的洗涤和离心步骤进一步减少了细胞质污染,得出适合下游结构和功能分析的纯化线粒体(见图1)。

图1:线粒体分离与纯化的示意图。 通过控制胰蛋白酶消化和差别离心结合方法分离出高纯度线粒体。所有手术均在4°C下进行,以保持线粒体的结构和功能完整性。新鲜分离的骨骼肌组织经过酶消化、均质化和顺序离心步骤,以获得适合下游功能和结构分析的纯化线粒体。 请点击此处查看该图的放大版本。
通过JC-1染色和荧光线粒体标记评估了分离线粒体的功能活性(见图2)。JC-1染色在基础条件下新分离的线粒体表现出强烈的红色荧光,表明线粒体膜电位得以保存。经过碳酸氰化物m-氯苯薮(CCCP)处理后,红色荧光减少,绿色荧光增强,符合线粒体膜去极化的表现。这些发现证实,分离的线粒体在分离后仍保持膜电位响应性,并保持功能活性。荧光标记进一步表明,线粒体在田野中呈现为离散、均匀分布的斑点结构,没有明显的聚集或染料沉淀。低背景荧光和均匀染色图样表明分离后线粒体完整性和膜电位得以保留。

图2:分离线粒体功能活性的表征。(A) 通过JC-1染色评估线粒体膜电位。纯化后的线粒体被用JC-1染色,并在荧光显微镜下观察。在对照组线粒体中观察到明显的红色荧光聚集体,表明线粒体膜电位得以保留。经过解偶联CCCP处理后,荧光主要转向绿色JC-1单体,表明膜去极化和膜电位坍缩(尺度条=50微米)。 (B) 纯化线粒体的线粒体荧光标记。荧光标记的线粒体呈现为分散的点状结构,缺乏明显聚集,背景荧光极少,表明线粒体完整性得以保存,膜电位稳定(尺度条=100微米)。 (C) JC-1染色后不同组的JC-1荧光强度比值定量分析。数据以SEM平均±表示(n=3)。统计显著性采用无配对t检验(****P < 0.0001)进行分析。 请点击此处查看该图的放大版本。
通过透射电子显微镜检查了分离线粒体的超微结构完整性(见图3)。低倍成像显示纯化线粒体,形态主要呈椭圆形,而高倍成像则显示外膜完整且嵴结构清晰。未观察到明显的肿胀、破裂或结构破坏。定量评估分析了五个随机选取的田间,每个田间约含40-60粒线体。这些观察表明,分离过程有效保存了线粒体超微结构,并生成了适合下游功能研究的线粒体。

图3:通过透射电子显微镜评估分离骨骼肌线粒体的超微结构完整性。 (左)代表性透射电子脑成像,低倍率(4,000×;比例条=2微米),显示纯化后的线粒体形态主要呈椭圆形。 请点击此处查看该图的放大版本。
(正确)高倍率透射电子显微镜成像(40,000×;比例条=200纳米),显示出光滑且连续的外线粒体膜和清晰的嵴结构。黄色箭头表示线粒体外膜保存完好,白色箭头表示线粒体嵴结构良好。未观察到肿胀、破裂或结构破坏的迹象。分析了五个随机选拔的田地,每个田地约有40-60个线粒体。这些发现表明,分离方案保留了线粒体超微结构完整性,并为后续功能性测定提供了可靠的结构基础。
随后通过蛋白质定量和免疫印迹分析评估线粒体产率和纯度(见图4)。胰蛋白酶消化法(TD)与正常提取法(NE)法的比较显示,TD法每mg组织约产出2.3-2.4微克线粒体蛋白,而NE法约为1.7-1.8微克/毫克组织。免疫印迹分析显示线粒体标记物——细胞色素c氧化酶和COX IV在线粒体组分中强烈富集,而在细胞质组分中检测极少。相比之下,细胞质标记β肌动蛋白在线粒体组分中仅表现出微弱信号,表明细胞质污染有限。TD组与NE组的比较表明,胰蛋白酶消化提高了线粒体的产率和纯度。综合来看,这些发现表明该方案生成的线粒体适合进行下游分子和功能分析。

图4:纯化线粒体的产率与纯度比较。(A) 利用胰蛋白酶消化(TD)和正常提取(NE)方法获得的线粒体蛋白产量,单位组织质量比较。TD组约为2.3-2.4 μg/mg,而NE组约为1.7-1.8 μg/mg。数据以SEM平均±表示(n=3)。统计显著性采用未配对t检验(*P < 0.05)进行分析。 (B) 利用TD和NE方法分离线粒体分数中的线粒体和细胞质标记蛋白进行免疫印迹分析。 (C-D) 线粒体标记蛋白细胞色素c氧化酶和COX IV的定量分析。线粒体标记在线粒体组分中高度富集,但在细胞质组分中表达极少。细胞质标记β肌动蛋白在线粒体组分中表现较弱,表明细胞质污染物的高效去除。与NE组相比,TD组的线粒体纯度有所提升。数据以SEM平均±表示(n=3)。统计显著性采用无配对t检验(*P < 0.05;**P < 0.01)进行分析。 请点击此处查看该图的放大版本。
为进一步评估线粒体呼吸功能,采用高分辨率呼吸测验测量氧气消耗(见图5)。使用TD法分离的线粒体显示出约9-10的呼吸控制比(RCR)值,而使用NE法分离的线粒体则显示约8-9的RCR值。由于RCR值大于4通常被视为线粒体呼吸活动保存的指标,这些结果表明,使用两种方法分离的线粒体仍保持功能完整性。TD组观察到较高的RCR值表明线粒体呼吸功能的保存率优于NE组。还使用方程1−(泄漏呼吸率/电子转移呼吸率)评估生化耦合效率,接近1的值表明呼吸耦合更紧密,ATP产生效率更高。两组的偶联效率均接近1,表明线粒体生物能功能在分离后得以保留。

图5:纯化线粒体呼吸功能的检测。(A) 胰蛋白酶消化组(TD)组与正常提取组(NE)组线粒体呼吸控制比(RCR)的比较。两组的RCR值均大于4,表明分离后线粒体呼吸活动保持。TD组的RCR值略高于NE组,显示呼吸功能保存率较佳。数据以SEM平均±表示(n=3)。统计显著性使用未配对t检验(**P < 0.01)进行分析。 (b) 线粒体生化偶联效率与TD基团与NE基团ATP合成能力的比较。两组的联结效率值均接近1,表明呼吸高度耦合且ATP产生高效。数据以SEM平均±表示(n=3)。统计显著性采用未配对t检验(*P < 0.05)进行分析。 请点击此处查看该图的放大版本。
接受细胞对分离线粒体的摄取情况进行了L929细胞的评估(见图6)。细胞与红色荧光染料标记的骨骼肌源线粒体共孵育,并用荧光肌动蛋白探针观察肌动蛋白细胞骨架。共焦点显微镜显示细胞质中分布着斑点状的红色荧光结构,表明L929细胞已吸收外源性线粒体。定量分析显示,线粒体摄取在12、24和48小时时呈时间依赖性增加。然而,24小时至48小时间仅观察到适度增加,表明摄取效率在24小时后接近饱和。此外,受体L929细胞在线粒体摄取后线粒体膜电位增加,显示线粒体功能有所改善。这些发现表明,通过该方案分离的骨骼肌来源线粒体可以在保持功能性活动的同时,被受体细胞有效内吞。

图6:L929细胞对骨骼肌来源线粒体的细胞摄取。(A) L929细胞在不同孵育时间(12小时、24小时和48小时)吸收纯化线粒体。在受体细胞质中检测到线粒体-荧光染料标记的线粒体(红色),而使用染色(绿色)观察肌动蛋白细胞骨架。核染色使用DAPI(蓝色)进行。共焦点显微镜确认L929细胞内化了外源性线粒体(比例条=50微米)。 (B) L929细胞在不同时间点线粒体摄取效率的定量分析。 (C) 在骨骼肌来源线粒体摄取后,对L929细胞线粒体膜电位的JC-1染色分析。 (D) 线粒体摄取后受体L929细胞JC-1聚集体与单体荧光比的定量分析。在活跃骨骼肌来源线粒体内化后,线粒体膜电位显著增加。数据以SEM平均±表示(n=3)。统计显著性采用单向方差分析(*P < 0.05;**P < 0.01;***P < 0.001)。 请点击此处查看该图的放大版本。
线粒体移植是细胞治疗和再生医学中的一种新兴策略,通过传递功能完整的线粒体,恢复能量代谢受损细胞的生理功能。除了调控细胞能量代谢外,该技术还能调节细胞凋亡和氧化应激等关键生物过程,从而为多种疾病提供新的治疗机会 4,17,18,19。然而,线粒体移植的临床转化仍面临诸多挑战,其中包括缺乏标准化、高效且可重复的线粒体分离方案,这仍是一个主要瓶颈。
为解决这一问题,本研究建立了基于差别离心的标准化且可视化的实验方案,以高效分离功能性游离线粒体,从C57BL/6小鼠骨骼肌中分离。通过优化纯化程序,并结合胰蛋白酶的预消化、清洗和纯化步骤,该方法有效改善组织解离,保持线粒体结构完整性,并减少非靶细胞成分的污染。
该方案在线粒体纯度和产率之间实现了有利的平衡。与传统的研磨提取方法相比,现有方法更快、更实用且更具成本效益,适合常规实验室应用和供体线粒体制备。现有的线粒体分离方法各有其局限性。例如,密度梯度离心和免疫亲和纯化可以实现更高的纯度,但耗时且成本高,而纳米探针方法在常规应用方面尚未充分开发20,21。对于骨肌等致密组织,优化的消化前胰蛋白酶步骤(0.25%胰蛋白酶在37°C下10-15分钟)结合温和均质化,比单用传统差动离心更能保持线粒体完整性。
本研究使用商业化差动离心试剂盒,在低温条件下全程遵循标准化流程,实现结构完整线粒体的快速采集。为解决提取过程中可能遇到的问题,如产量低、蛋白质污染和膜异常潜力,提出了多种故障排除策略。
线粒体产量低通常由均质化不足、组织数量不足或离心损失引起。这些问题可以通过确保充分的预消化、进行温和均质化(使用紧密均质剂10-15次)、使用至少100-150毫克新鲜骨骼肌组织、严格控制离心条件(1,000 × 克用于去除杂物,10,000-12,0 ×00 克用于线粒体沉淀)以及使用宽口径移液器头重新悬浮样品来尽量减少这些问题。蛋白质污染主要由残渣不完全清除或脂质干扰引起;因此,建议重复1,000 ×克 离心步骤,加入两次12,000 ×克 洗涤步骤,并仔细去除脂肪组织。线粒体膜电位异常通常与机械损伤或温度波动有关。因此应避免过度均质化,整个过程应在冰上进行,并在60-90分钟内完成,分离缓冲液应补充EGTA和0.5% BSA。通过确保酶促消化、选择合适的均质剂以及进行均质后过滤,可以改善不完全均质化。
尽管现有方案显著提高了线粒体分离的效率和纯度,但仍存在若干局限性。首先,该手术高度依赖组织新鲜度;理想情况下,组织样本应在死后1小时内处理。其次,如果洗涤过程中未充分去除,残留的胰蛋白酶可能会降解线粒体表面蛋白,包括转运酶相关蛋白,从而影响后续细胞的吸收效率。第三,线粒体储存时间有限,长期储存在4°C或低温保存会显著降低线粒体活性。
在转化层面,还面临额外挑战,包括提升 体内 递送效率、理解线粒体整合的长期机制,以及澄清移植线粒体与宿主基因组之间的潜在相互作用。随着线粒体分离和纯化技术的持续进步,预计未来方法创新将加速线粒体移植治疗的临床转化。
作者声明不存在利益冲突。
该工作得到了中国国家自然科学基金会(拨款号82301046)和陕西卫生科学研究创新团队(复杂面部损伤综合治疗拨款号2024TD-07)的支持。
| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 抗细胞色素C抗体 | Abcam | EPR1327 | 线粒体特性 |
| 抗褪色安装介质 | PlantChemMed | PC-90016 | 减少荧光染料的光漂白 |
| BCA蛋白测定试剂盒 | 中汇和彩生物技术有限公司 | PQ003 | 蛋白浓度测定 |
| β-肌动蛋白抗体 | Cell Signaling technology | 3700s | β-肌动蛋白抗体用于检测分离的线粒体纯度 |
| BSA | Sigma | A6003 | 在分离过程中,它结合游离脂肪酸以保护线粒体活性。 |
| 离心机 | Eppendorf | 5418R | 4 ℃ 离心 |
| CCCP | Solarbio | C6700 | 解偶联线粒体氧化磷酸化并诱导最大质子泄漏 |
| 共聚焦激光扫描显微镜 | Olympus Corporation | FV4000 | 免疫荧光染色观察 |
| COX IV多克隆抗体 | Proteintech | 11242-1-AP | 线粒体特性 |
| DAPI | Plant Chem Medicine | PC-90004 | 用于核染色 |
| D-甘露醇 | Solarbio | IM00402 | 保持渗透平衡并防止分离过程中线粒体肿胀 |
| EGTA | Sigma | E4378 | 通常用于线粒体分离缓冲液中,通过特异性结合 Ca2+ 来保护线粒体功能 |
| 胎牛血清 | Every Green | 11011-08611 | L929 细胞培养 |
| 镊子 | RWD生命科学有限公司 | F11003-11 | 用于抓握、持有和提升组织 |
| 玻璃研磨器 | Beyotime | FGH005 | 用于组织研磨和线粒体分离 |
| 甲醛 | LEAGENE | DF0151 | 它通过交联蛋白迅速固定和稳定细胞超微结构,防止自溶以保存细胞器的自然形态。 |
| HEPES | Thermo Fisher | J67485 | 提供稳定的 pH 环境。 |
| 培养箱 | Thermo Fisher | 51032874 | L929 细胞培养 |
| JC-1 | Solarbio | M8650 | 检测纯化线粒体膜电位的变化。 |
| L929 细胞系 | Procell | CL-0137 | 用于线粒体内吞检测 |
| 铅醋酸 | Sigma | 15326 | 用于染色超薄切片以观察精细亚细胞结构。 |
| MEM Alpha 基础(1x) | Gibco | 6125510 | L929 细胞培养 |
| 甲醇 | 富裕化工(中国) | 67-56-1 | 作为转移缓冲液的组成部分,用于去除 SDS 并促进蛋白质从凝胶转移到固相膜。 |
| 微板读取仪 | Thermo Fisher | Varioskan LUX | 测量 JC-1 染色线粒体的吸光度 |
| 线粒体膜电位检测试剂盒 | Solarbio | M8650 | 骨骼肌线粒体膜电位检测 |
| 线粒体分离缓冲液 | Solarbio | SM0020 | 基于差速离心的提取试剂盒 |
| 线粒体储存缓冲液 | Solarbio | SM0020 | 用于线粒体保存 |
| 线粒体荧光探针 Red CMXRos | Yeasen 生物技术 | 40741ES50 | 线粒体特性 |
| MOPS | MedChemExpress | HY-D0859 | 作为溶液制备中的缓冲液 |
| Multi-rAb HRP-山羊抗小鼠重组二抗(H+L) | Proteintech | RGAM001 | RGAM001 在蛋白质印迹中靶向小鼠 IgG (H+L) |
| Multi-rAb HRP-山羊抗兔重组二抗(H+L) | Proteintech | RGAR001 | RGAR001 靶向兔 IgG (H+L) 在 ELISA 和蛋白质印迹中 |
| 无脂干奶粉 | NCM 生物科技 | WB6503 | 主要用作阻断剂,通过占据膜上非特异性结合位点来减少背景信号。 |
| O2k-Fluo呼吸仪 | Oroboros Instruments | O2K | 确定线粒体呼吸功能和氧代谢。 |
| 四氧化锇 | Sigma | 75633 | 或后固定以保存脂质并增强 TEM 样品中的膜对比度。 |
| PBS(1x) | Plant Chem Medicine | PC-00003 | 清洁肌肉组织 |
| 青霉素-链霉素 | Procell | PB180120 | L929 细胞培养 |
| Phalloidin-488 | Beyotime | C1035 | 标记细胞骨架 F-肌动蛋白以进行荧光显微镜成像 |
| 聚偏氟乙烯(PVDF)膜 | Millipore (Merck) | IPVH00010 | 蛋白质印迹 |
| PowerPac Basic | BIO-RAD | 164-5050 | 用于 SDS-PAGE 电泳分离蛋白质 |
| 预铸梯度聚丙烯酰胺凝胶(4-12%) | ACE Bioscience | ET12412LGel | 用于 SDS-PAGE 分离线粒体和细胞总蛋白 |
| 蛋白酶抑制剂 | 陕西中汇和彩生物医药技术有限公司 | PL032 | 抑制内源性和外源性蛋白酶的活性,防止样品处理过程中目标蛋白的降解。 |
| RIPA 裂解缓冲液 | 中汇和彩生物技术有限公司 | PL001-2A | 用于动物和细胞组织的 |
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