本研究展示了一个灵活且标准化的秀 丽隐杆 线虫孵化测定平台,集成了多种实验格式。该方法提升了可重复性、可扩展性和可及性,使药物效应和开发过程能够稳健评估,同时在成本效益高且易于适应研究和教育环境。
方法文章
本研究展示了一个灵活且标准化的秀 丽隐杆 线虫孵化测定平台,集成了多种实验格式。该方法提升了可重复性、可扩展性和可及性,使药物效应和开发过程能够稳健评估,同时在成本效益高且易于适应研究和教育环境。
卵孵化测定(EHA)被广泛用于评估化学化合物对线虫早期发育阶段的影响,尤其是在抗虫学研究中。然而,现有方法论在格式、复杂性和可重复性方面差异较大,且常被呈现为固定方案,而非可适应的实验框架。本研究通过整合并直接比较三种实验配置,建立了一个简单、易用且灵活的秀 丽隐杆线虫 卵孵化实验平台:(i)在微离心管中受控培养后在琼脂板上播种,(ii)在含药物琼脂板上直接暴露,以及(iii)多孔液体测定。用了两种代表性化合物来说明该检测:一种抑制卵孵化,另一种无明显效果。每种配置在实验控制、吞吐量和可及性方面都有明显优势。基于微离心管的方法能够精确控制药物暴露,并支持定量药理学分析。琼脂基测定法提供了一种简化且低成本的替代方案,适合持续暴露和教育环境。多孔格式实现了可扩展、标准化的筛选,符合现代药物发现流程。通过直接比较这些格式,我们展示了方法学选择如何影响测定的重复性、药物暴露动态和生物学解释,特别是在阶段特异因素中,如蛋壳的保护作用和分子靶点表达的发育变异。总体而言,这项工作确立了秀 丽隐杆线虫 孵化测验作为一个多功能且可扩展的平台,适用于抗虫筛查、毒理学评估、发育研究和教学实验室等多种应用,从而促进该方法的更广泛和合理应用。
卵孵化测定(EHA)长期以来已被确立为线虫学中评估杀卵活性和化合物早期发育效应的基石方法。这些测定最初为寄生线虫开发,能够量化在受控体外条件下胚胎或幼虫孵化的抑制,提供稳健且生物学相关的终点,如孵化率或浓度-反应分析(如EC50或IC50)1,2,3,4,5,6,7。
经典的基于卵的方法在寄生线虫如扭曲的海蒙库斯和三强菌(Trichostrongylus colubriformis)中被广泛用于评估合成药物和天然产物的疗效,以及监测抗驱虫抗性1,2,6,8,9,10.这些方法涵盖了多种读数,从直接评估卵子的存活率和孵化,到粪便培养后幼虫发育的评估。它们在将药物暴露与寄生虫生殖产出和传播潜力联系起来方面发挥了核心作用。然而,这些方法通常需要从感染宿主中进行复杂的样本制备、延长的孵育期和专业基础设施,这可能限制其可及性、可扩展性和实验室间的重复性。
将秀丽隐杆线虫作为模式生物的使用,已成为克服寄生线虫若干局限性的有力策略。其短生命周期、遗传易处理、易于培养以及与寄生物种共享的关键分子靶点的保护性,使其特别适合药理学、毒理学和发育学研究。重要的是,秀丽隐杆线虫的胚胎发生速度快且高度可重复,使卵子的存活率和孵化测试能够作为定量且可靠的早期发育过程及其被异种生物干扰的读数(11,12,13,14,15,16,17)。
此外,经过充分描述的突变株的存在,使得对药物作用和耐药机制有了新的见解。以往研究表明,对生物活性化合物的抗药性可以以阶段依赖的方式出现,胚胎和幼虫阶段的敏感性差异。例如,谷氨酸能信号的改变与幼虫的耐药表型有关,而卵孵化则未受影响 14,18,19,20。这凸显了药物敏感性的阶段特异性,并表明胚胎阶段可能涉及不同的靶点或与晚期发育阶段的可及性差异。
除了寄生虫学之外,秀丽隐杆线虫的卵子存活性检测在毒理学和早期药物发现中也日益重要。这些检测方法不仅用于评估驱虫活性,还用于评估发育毒性和药物诱导的胚胎缺陷,其结果可与更高毒性的生物体特征相关(15,16)。同时,卵壳的存在带来了重要的生物学约束,因为它作为包围胚胎的保护性和选择性渗透屏障21,22。因此,尽管在发育后期阶段14、19、23、24表现出活性,某些生物活性分子可能未能到达胚胎。因此,胚胎的获取可能取决于每种化合物的物理化学性质,包括分子大小和极性。这可能导致孵化实验中观察到的活性与后期发育阶段的活性差异。这一区分强调了明确定义实验背景和被测量生物学终点的重要性。
在方法学上,秀丽隐杆线虫的孵化测定采用了多种实验形式,包括同步卵液培养、直接暴露于含药物琼脂板以及适用于中高通量筛选的多孔测定法,编号为11,13,14,16,19,23,24。
液体基和微板格式已被广泛应用于药理学筛选研究,因为它们提供了均匀的暴露条件,便于精确控制药物浓度,并允许对浓度-反应关系进行定量分析。与此同时,针对寄生线虫的类似多孔策略也被广泛开发,从传统的96孔板测定到采用384孔格式的超高通量平台4,5。这些方法共同强调了不同线虫种类卵孵化检测的多样性和可扩展性,以及它们对从小规模机制研究到大规模化合物筛选等多样化实验环境的适应性。
每种格式在实验控制、可重复性、通量和可及性方面各有优势和局限性。液体测定法提供均匀的暴露条件,非常适合定量药理分析,而琼脂法则允许在开发过程中持续暴露,但会引入与药物扩散和生物利用度相关的变异性。多孔格式则促进并行化并减少试剂消耗,符合现代筛选策略。
尽管广泛应用,孵蛋测试常被介绍为固定方案,而非灵活的方法论框架。格式之间的直接比较很少,针对从机制研究到高通量筛选或教学环境等具体应用选择最合适配置的指导仍然有限。
本研究提出一个简单、易用且可适应的秀 丽隐杆线虫卵孵化实验平台,整合并比较三种实验配置:(i)在微离心管中受控孵育后在琼脂板上播种,(ii)直接暴露于含药物琼脂板,以及(iii)多孔液体测定。
通过系统评估这些配置,我们旨在建立一个实用框架,突出实验控制、简易性和可扩展性之间的权衡。这一综合视角将传统寄生虫学方法与现代基于模型的筛选方法相结合,将孵化卵子检测定位为一个灵活的平台,可适应多种研究环境,包括驱虫发现、毒理学评估、发育生物学和教育应用。
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1. 秀丽隐杆线虫 的菌株与文化
2. 测试化合物和对照的制备
3. 同步采集秀 丽隐杆线虫 卵
注:秀丽隐杆线虫卵的分离过程在以往研究中有大量描述,29,32。本文总结了主要步骤,并结合了小幅修改,以优化清洁、无杂质的卵子回收,以便进行孵化检测。
4. 孵蛋测定格式
5. 评估与计数
6. 图像采集与文档
7. 数据分析
8. 使用转肉桂醛和醋酸酯进行卵孵化检测的应用
注:本研究并非聚焦于特定化合物,而是通过代表性药物说明每种实验形式如何在可比条件下实施、控制和解释。转肉桂醛(TCA)之所以被选为示范化合物,是因为它此前已被鉴定并能在上述三种检测配置中持续产生强健且可重复的卵孵化抑制作用。重要的是,纳入TCA的目的是展示协议的实施和代表性的集中-反应行为,而非建立不同格式之间的相对效力或性能比较。
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TCA在所有实验格式中均明显抑制了卵孵化,如 图1所示。为每种检测配置提供了代表性的浓度-响应曲线:微离心管(图1A)、琼脂平板直接暴露(图1B)和多孔板(图1C)。
估计IC₅₀值为微离心管中0.19 ± 0.0262 mM,琼脂板为0.1758± 0.0463 mM,多孔板为0.2267 ± 0.0093 mM。这些数值作为每种检测格式中浓度-反应关系的代表性示例。虽然观察到细微差异,但所有数值均处于相对狭窄的范围内,表明实验配置之间的整体一致性。重要的是,化合物特异性反应可能随物理化学性质和检测条件而异;因此,这些数值不应被解释为跨格式效力的普遍预测。
对照条件(水和DMSO组)在所有实验格式间孵化率无显著差异(
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本研究提供了一个简单且可适应的秀 丽隐杆线虫孵化实验平台,围绕三种互补的实验形式构建,分别在控制、暴露动态和可扩展性上有所不同。我们的结果支持这样一种观点:孵蛋实验应被视为一种灵活的方法论框架,能够适应特定实验目标。
基于微离心管的结构为药物暴露提供了高度受控的环境,允许精确定义孵育时间、化合物浓度和清洗步骤。这种配置特别适合定量药理分析和机理学研究,因为它能够区分暴露阶段与后续显影阶段。使用该格式获得的IC50 值(0.19 mM)反映了这些受控条件,即化合物暴露有时间限制,随后通过清洗步骤降低孵化前残留药物浓度。该设计最大限度地减少了长期暴露带来的混杂效应,并便于后续应用,如将幼虫转移到细菌种子培养板上,以便进一步评估运动、生长或发育进展。类似的分离暴露和恢复阶段的方法此前已在秀 丽隐杆线虫 的药理学测定19、23、...
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作者声明与本文内容无利益冲突。
这项工作得到了南方国立大学(PGI 24/B366至GH)的支持。我们感谢WormBase(https://wormbase.org)。株由美国国立卫生研究院研究基础设施项目办公室(P40 OD010440)资助的 线虫 病隐患遗传学中心(CGC)提供。
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 细菌学琼脂 | Britania | B0101406 | 应新鲜制备(1.7 克于 100 毫升 H2O 中) |
| 漂白液 | N/A | N/A | 1.2 % (v/v) NaOH 和 0.5 M NaOH |
| 离心机 | ThermoScientific. | Sorvall ST16R. | |
| 离心机 | BiofugePICO to eppendorf 试管 | Heraeus 75003235 | |
| 数码相机 | ToupCam | TP605100A | 工业数码相机。可调焦距 USB 2.0 |
| DMSO | BioBasic | RAS#7-68-5 | 分子量:78.13 |
| 芳樟醇醋酸酯 | SIGMA | CAS 编号:115-95-7 | 应新鲜制备 |
| 溶菌肉汤(LB)培养基 | N/A | N/A | 10 克肉蛋白胨,5 克酵母提取物,10 克 NaCl 加至 1 升蒸馏水 |
| M9 缓冲液 | N/A | N/A | 3 克 KH2PO4,6 克 Na2HPO4,5 克 NaCl,0.25 克 MgSO4 加至 1 升蒸馏水 |
| 迷你旋转器 | BioSan | Bio RS-24 | |
| 线虫生长培养基(NGM) | N/A | N/A | 3 克 NaCl,17 克琼脂,2.5 克 Bacto-Peptone 加至 1 升蒸馏水。通过高压灭菌进行灭菌。补充 1 毫升胆固醇(5 毫克/毫升), 1 毫升 CaCl2(1 M),25 毫升钾磷酸盐缓冲液(1 M,pH 6.0)和 1 毫升 MgSO4(1 M) |
| 培养皿(3 - 5 毫米) | ThermoScientific. Nunclon DeltaSurface | 153066 | |
| 培养皿(90 毫米 x 15 毫米) | ExtraGene | 1026160305 | 仅供实验室使用,聚苯乙烯。 |
| 移液器 | Fisherbrand | N/A | |
| SigmaPlot 12.0 | Systat Software | N/A | 版本 12.0 |
| 立体显微镜 | ARCANO | ZTX-T 1:4 LED | 三眼立体显微镜(10x–40x 总放大倍数;LED 入射和透射光源) |
| 蔗糖 | Laboratorio Cicarelli | Art 841 | 60 % (v/v) 蔗糖 |
| 96 孔组织培养板 | Biofil | TCP 012096 | 聚苯乙烯,低蒸发盖。 |
| ToupView | ToupTek Photonics | N/A | |
| 反式肉桂醛(TCA) | Santa Cruz Biotechnology | J1712 | 应新鲜制备 |
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