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研究文章

溃疡性结肠炎中药方剂痛泻要方的临床证据与作用机制研究知识图谱:一项文献计量学分析

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DOI:

10.3791/72094

2026年8月11日

本文内容

摘要

这项文献计量学研究梳理了Web of Science核心合集数据库中关于痛泻要方(TXYF)治疗溃疡性结肠炎的英文文献证据,区分了临床研究、机制研究和转化研究三个方向。分析表明,该领域正迅速扩展,主要由中国主导,其中网络药理学、动物模型、肠道菌群及炎症信号通路等方面的研究进展快于标准化临床终点指标的研究。

摘要

为了系统描绘痛泻要方(Tongxie Yaofang, TXYF)治疗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis, UC)的临床证据与机制研究的知识图谱,我们对截至2025年12月31日从Web of Science核心合集(Web of Science Core Collection)检索到的英文文章和综述进行了文献计量学与知识图谱分析。经过筛选后,共纳入133篇文献,分析其发表趋势、合作网络、期刊分布、共被引聚类、关键词共现情况以及临床研究与机制研究的主题结构。采用操作性标准将文献分类为临床证据、机制研究或转化/桥梁研究。该领域自2020年后显著扩展,中国机构占据主导地位,但国际间及跨团队合作仍较有限。机制研究在核因子κB(nuclear factor kappa B, NF-κB)/NOD样受体蛋白3(NOD-like receptor protein 3, NLRP3)、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase, MAPK)/AKT(蛋白激酶B)、肠道微生物群、短链脂肪酸代谢、肠屏障修复、巨噬细胞极化及计算药理学等方面表现出较强的研究活跃度。英文WoSCC语料库中的临床证据相对匮乏,且多依赖于广泛的症状或疾病活动度结局指标,而非标准化的患者报告、内镜、组织病理学及生物标志物终点指标。这些发现提示机制发现与临床评价之间存在转化脱节,支持开展基于机制指导、多中心的临床研究,并预设生物学效应指标。

引言

溃疡性结肠炎(UC)是一种由环境、遗传、微生物、上皮屏障和免疫因素共同作用引起的结肠慢性炎症性疾病1。目前的治疗策略已从单纯的症状缓解转向以目标为导向的治疗模式,强调黏膜愈合、持久缓解以及并发症的预防。尽管5-氨基水杨酸、糖皮质激素、免疫调节剂、生物制剂、小分子抑制剂和靶向白细胞介素的疗法已使许多患者的预后得到改善,但原发性无应答、继发性应答丧失、感染风险、治疗成本及治疗负担仍是临床上重要的挑战2,3,4。这些未被满足的临床需求持续推动着对多组分辅助治疗策略的兴趣,这类方法可能通过协同机制调节炎症反应、屏障损伤、菌群失调和免疫失衡。

痛泻要方(TXYF)是中医经典方剂之一,遵循抑木扶土的治疗原则,常用于治疗与肝郁脾虚证型相关的腹泻和腹痛5。在现代临床实践中,该方已成为治疗溃疡性结肠炎及相关炎症性肠病的常用处方。近年来,对痛泻要方的科学研究已从临床经验验证逐步深入到分子机制分析层面6,7。现代药理学研究表明,该方剂并非仅通过单一抗炎作用发挥疗效,而是通过多途径协同作用实现治疗效果8。在炎症调控方面,研究证实其能显著抑制相关信号通路的过度激活及炎症微粒的产生。在肠黏膜屏障修复方面,该方剂可上调紧密连接蛋白的表达,降低肠道通透性9。此外,肠道菌群平衡的恢复以及肠-脑轴神经内分泌-免疫网络的调节,正逐渐成为阐释痛泻要方治疗机制的新焦点。最新的基础实验表明,该方剂通过调节色氨酸代谢及其受体活性,改善免疫失调状态,为痛泻要方治疗溃疡性结肠炎的科学合理性提供了有力证据10

尽管发表活动日益增多,但证据体系仍呈碎片化状态。目前的研究主要采用单一视角:要么通过小样本随机对照试验关注临床疗效指标,要么开展纯粹的基础实验,探究特定信号通路的干预机制11,12。临床证据与机制研究之间存在显著脱节,二者之间的相互关系缺乏充分整合。此外,针对核心研究团队分布、跨机构合作强度、奠基性文献的基础作用以及研究主题的时间演变模式,尚未开展系统性分析。例如,尽管“网络药理学”“肠道菌群”和“信号通路”等关键词在关键词聚类中出现频率较高,但仍缺乏定量的大数据分析,以阐明这些研究热点如何从传统的症状评估方法演变而来,并确定其未来的发展方向13。在溃疡性结肠炎(UC)相关研究中,TXYF 已通过综述、网络药理学、分子对接、疾病模型、菌群分析、转录组学、巨噬细胞极化实验以及粪便菌群移植验证等多种方法进行了研究2,14,15,16,17,18,19,20。现有证据表明,TXYF 的研究已从经验性的症状导向解释,转向涉及核因子κB(NF-κB)/NOD样受体蛋白3(NLRP3)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)/AKT(蛋白激酶B)、IL-10RA/NF-kB信号通路、上皮屏障保护、微生物重塑及线粒体自噬等假说。临床研究与研究方案通常强调症状缓解、疾病活动度、复发、安全性及中医证候分型,而机制研究则常聚焦于计算靶点预测、炎症信号通路、动物或细胞验证、菌群调节以及上皮屏障修复2,14,15,16,17,18,19,20。然而,这两类研究尚未实现良好整合:机制研究成果很少被前瞻性地纳入临床试验终点,而临床研究也极少包含能够验证临床前研究提出的生物学通路的标准化生物标志物组合。

因此,本研究旨在绘制溃疡性结肠炎(UC)领域中英文 WoSCC 关于痛泻要方(TXYF)的研究图谱,识别关键贡献者与知识结构,并比较临床证据与机制研究的成熟度及转化关联性。研究目的并非声称涵盖所有中国及国际的 TXYF 研究,而是表征被国际索引的英文文献体系,并明确未来研究应在哪些方面加强可重复性、协作性、终点指标标准化以及从机制到临床的研究设计。

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方案

研究设计

本研究采用文献计量学与知识图谱设计,聚焦于TXYF治疗UC的临床证据和机制研究。工作流程如图1所示,包括六个相互关联的阶段:数据库检索、去重、标题/摘要筛选、全文合格性评估、结构化数据提取以及可视化/综合分析。最终分析样本包含133篇英文文章和综述。表1总结了检索策略和纳入标准,材料表列出了文献数据库平台、导出的数据类型、软件工具及可重复性说明。

该设计整合了书目元数据、作者及机构信息、国家/地区、来源期刊、被引参考文献、关键词、摘要以及人工编码的主题属性。这种方法使论文能够描述出版物的增长趋势和合作模式,同时还能考察临床证据与机制研究是作为相互关联的转化研究流在发展,还是作为并行且关联较弱的研究体系在发展。

数据来源与检索策略

数据来源为Web of Science核心合集(WoSCC),因其提供标准化的引文记录、作者关键词、机构隶属关系、国家/地区字段、被引参考文献以及与VOSviewer和CiteSpace兼容的导出格式而被选用。检索涵盖截至2025年12月31日可用的记录。为减少数据库更新带来的不稳定性,所有数据检索与导出均在同一个时间点完成。

在 WoSCC 中执行的精确主题搜索查询为:

TS=(("痛泻要方" 或 "通协药方" 或 "痛泻要方" 或 "痛泻方" 或 "TXYF")与("溃疡性结肠炎" 或 "加州大学"))

检索结果限定为英文文章和综述。会议摘要、社论、通讯、更正、书评以及缺乏足够书目信息的文献记录被排除在外。这些限制旨在保持网络构建所需的元数据一致性;然而,在讨论部分已指出,仅纳入英文文献的WoSCC设计是一个重要的检索局限性,而非证明中文临床研究不存在的证据。

为了确保可重复性,所有符合条件的WoSCC记录均以包含引文的完整记录形式导出。初始检索未添加诸如临床、机制、网络药理学、信号通路、微生物群或试验等限制性描述词。检索完成后,通过标题、摘要以及必要时的全文,对记录进行人工筛选和编码。在可视化之前,地理字段已进行标准化处理:来自中国台湾、香港和澳门的机构隶属记录被视作中国区域记录,用于国家层面的统计,不视为独立的主权国家。

纳入标准与文献筛选

为确保纳入的文献与研究主题具有高度相关性,并提高后续知识图谱分析结果的准确性和可解释性,本研究在正式分析前制定了明确的纳入与排除标准,并采用标准化流程对检索到的文献进行分阶段筛选。整体筛选过程包括四个步骤:文献去重、标题和摘要初筛、全文复筛以及最终纳入判定(详细流程见图1)。经过系统检索和逐级筛选,最终共有133篇文献被纳入本研究的文献计量分析。

关于纳入标准,本研究主要选择符合以下要求的文献:第一,研究主题必须明确涉及痛泻要方与溃疡性结肠炎,即痛泻要方和溃疡性结肠炎均作为核心研究内容,而不仅仅是在背景或讨论部分被提及。第二,文献类型须严格限定为已正式发表的文章或综述,以确保参考文献信息和引文数据的完整性。第三,文献语言须限定为英文,以提高数据来源的一致性,并满足国际文献计量分析的基本要求。第四,文献记录应包含相对完整的元数据信息,包括标题、作者、来源期刊、摘要、关键词及引文详情,以便开展后续的合作者网络分析、关键词共现分析和共引分析。

排除标准主要包括以下几类:第一,重复的文献记录;第二,与痛泻要方或溃疡性结肠炎主题无直接关联的研究,例如仅讨论其他中药方剂,或仅关注广义的炎症性肠病但未明确提及痛泻要方的研究;第三,会议摘要、社论、读者来信、勘误表、书评及其他缺乏完整研究结构的非正式学术文献;第四,文献信息不完整,或无法获取有效摘要及基本引文信息的记录;第五,尽管检索词匹配,但痛泻要方并非研究主要对象,或溃疡性结肠炎并非主要疾病关注点的文献。通过上述标准,本研究旨在最大限度减少非目标文献及信息含量较低的材料对研究结果的干扰。

文献筛选过程采用分层次逐步推进的方法进行。首先,将从数据库导入的所有原始文献记录导入文献管理软件和电子表格中,核对标题、作者、年份和期刊信息,并剔除重复的文献记录。随后,开展题名和摘要的初步筛选,由研究人员根据预先设定的纳入与排除标准,独立审阅每条记录的题名和摘要,初步排除明显不符合主题要求的文献。在此基础上,对保留的文献进行全文复核,评估其研究对象、研究内容及核心主题是否真正围绕"治疗溃疡性结肠炎的止痛方剂"展开,同时核查其是否符合文献类型分类要求以及元数据完整性要求。

在编码前应用了操作性定义。临床证据研究定义为以评估患者水平的疗效、安全性、复发、症状变化、疾病活动度、生活质量、中医证候结局、炎症标志物、内镜结局、组织学结局或其他临床终点为主要目的的研究记录。机制性研究定义为以通过网络药理学、分子对接、分子动力学、靶点预测、动物模型、细胞验证、菌群分析、多组学、炎症信号通路、免疫调控、上皮屏障修复、氧化应激、细胞凋亡、线粒体自噬或相关通路解释TXYF作用机制为主要目的的研究记录。转化性或桥梁性研究定义为将临床评价与机制检测、证据整合、生物标志物映射或实验验证相结合,并能够为临床试验设计提供依据的研究记录。

数据提取与主题分类

在完成文献筛选并最终选定133篇目标文献后,本研究对相关书目信息进行了结构化提取与整理,为后续知识图谱分析建立了数据基础。数据提取主要包括三个部分:文献基本信息、引文信息以及主题属性数据。文献基本信息包括标题、作者、发表年份、来源期刊、国家/地区、机构、文献类型和摘要。引文信息包括被引频次、参考文献、关键词及作者关键词。主题属性信息用于研究内容的分层与比较分析,涵盖研究对象、研究方法、研究模型以及核心主题方向。

除了标准的文献计量学字段外,还提取了主题属性。对于每条记录,作者对主要研究类型、主要模型或方法、主要临床或机制研究重点进行了编码,并判断该研究是否将机制层面的发现与临床终点直接关联。对于含义模糊的记录,根据标题、摘要和方法部分中声明的主要研究目的进行分类,而非依据简短的推测性讨论语句。

临床终点编码被细化为患者报告结局(PROs)和客观终点。患者报告结局包括腹泻、腹痛、排便频率、整体症状改善、生活质量以及中医证候评分。客观终点包括疾病活动指数、炎症标志物、内镜或黏膜愈合指标、组织学结果、复发情况、安全性事件、菌群谱、上皮屏障指标、细胞因子、免疫细胞表型以及通路生物标志物。

若研究的主要目的是阐明机制,则将结合网络药理学预测与动物、细胞、微生物群或分子验证的研究归类为机制性研究。若研究主要关注疗效观察,仅在讨论部分提及可能的机制,则将其归类为临床证据研究。对于明确尝试将临床效应评估与机制探索相结合的方案或证据整合类文献,则归类为转化/桥梁研究。

文献计量分析与可视化

采用电子表格软件、VOSviewer 和 CiteSpace 进行文献计量分析;材料表列出了版本/标识字段,并标注了需根据原始分析日志由作者确认的条目。电子表格软件用于重复项检查、描述性统计、年度发表数量统计、研究类型分类以及源数据表的准备。VOSviewer 用于构建作者合作、机构、国家/地区、期刊以及关键词共现网络。CiteSpace 用于共被引分析、聚类检测、时间线解读和突现关键词检测。

采用共引分析方法识别被TXYF-UC研究反复引用的知识模块。通过阅读代表性文献的标题、摘要及被引参考文献的上下文,对聚类进行人工解读,重点关注UC炎症机制、中药复方干预证据、肠道微生物群与黏膜屏障研究以及计算药理学方法。

关键词预处理包括同义词整合、拼写标准化、大小写归一化、去除无信息量术语以及等效生物学概念的协调统一。随后通过关键词共现和时间序列分析,识别出主要的研究热点和新兴前沿领域,包括炎症信号传导、中医临床证据、菌群-代谢相互作用、计算药理学以及屏障-免疫调控。

临床与机制映射相结合,将主题分类与关键词聚类及编码的终点领域整合起来。该比较分析了六个领域:症状控制、炎症反应、肠道屏障修复、肠道微生物群、免疫调节以及疾病进展。

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结果

文献筛选与总体发表特征

根据既定的检索策略和筛选标准,本研究最终纳入了133篇与痛泻要方在溃疡性结肠炎治疗中应用相关的英文文献,构成后续知识图谱分析的基础样本。总体而言,该领域已从早期零星探索发展为具有一定规模和连续性的研究方向,在文献发表趋势、研究类型及方法学路径上均呈现出明显的阶段性特征。

首先,图2展示了该领域从2003年至2025年的年度发表趋势及累积增长轨迹。结果表明,早期的发表数量相对较低,说明该领域主要处于初始积累阶段。2010年之后,相关出版物数量逐渐增加,表明该领域已形成稳定的研究方向。2020年以后,年度发表量持续上升,累积曲线斜率显著增大,表明近年来发展速度加快。分层柱状结构进一步揭示,临床证据研究始终构成主要基础,而机制研究在中后期阶段逐步扩展。尽管已出现转化研究或桥梁性研究,但其总体占比仍然有限。图2B进一步分析了研究类型的构成:外环显示临床证据研究...

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讨论

本研究提供了关于溃疡性结肠炎(UC)的英文 WoSCC 文献中 TXYF 领域的结构化图谱,表明该领域自2020年以来迅速扩展。所绘制的文献体系以中国为主导,机构分布集中,并日益趋向机制研究。临床证据仍然可见,但相对缺乏标准化;而机制研究已围绕 NF-kB/NLRP3、MAPK/AKT、IL-10RA/NF-kB 信号通路、菌群重塑、上皮屏障保护、巨噬细胞极化、线粒体自噬以及计算药理学等领域变得更加深入2,14,15,16,17,18,19,20,21...

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披露

作者无任何利益冲突需要披露。

致谢

作者衷心感谢东台市人民医院药学部为本项文献计量学工作提供的机构支持和学术环境。作者还感谢在文献检索、数据核对和稿件讨论中提供帮助的同事们。本研究未报告任何特定的外部资金或资助支持。

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
CiteSpaceChaomei Chen, Drexel Universityhttps://citespace.podia.com/共被引分析、聚类分析、时间线可视化和突现关键词检测。
Microsoft ExcelMicrosoft Corporationhttps://www.microsoft.com/en-in/microsoft-365/Excel数据清洗、重复检查、描述性统计、年度发表数量统计、研究类型分类及表格准备。
VOSviewer莱顿大学科学技术研究中心https://www.vosviewer.com/作者、机构、国家、期刊及关键词共现网络的构建与可视化。
Web of Science 核心合集科睿唯安https://clarivate.com/academia-government/scientific-and-academic-research/research-discovery-and-referencing/web-of-science/web-of-science-core-collection/主要的书目数据库,用于检索有关痛泻要方与溃疡性结肠炎的英文期刊文章和综述。

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肠道微生物群肠道屏障巨噬细胞极化计算药理学