2009年9月9日
本文描述了一种基于细胞死亡的PTI检测方法,用于Nicotiana benthamiana植物。
您好,我是来自博伊斯·汤普森植物研究所 Greg Martin 实验室的 Suma TI。今天我们将向您展示一种基于细胞死亡的检测方法,用于检测由 PAM 触发的免疫反应(PTI)。我们实验室使用该方法来研究某个基因是否参与了 PTI 过程。
那么,让我们开始吧。在开始实验前约七周,开始种植烟草(Nicotiana ANA),并在实验开始前四到五天进行准备。
PAMP触发的免疫反应或PTI检测。修剪植株,去除所有腋生分枝和花朵。在腋生分枝刚出现时尽快将其去除,以便更好地管理植株。
在准备好植物后,开始培养细菌。本实验采用非致病性细菌,在接种挑战菌株之前诱导植物免疫反应,需同时启动实验中使用的所有细菌的培养。同时,针对每种假单胞菌菌株,使用其冻存的甘油菌种进行复苏。
在含有适当抗生素的 KBM 平板中央涂布少量细菌,并在 30 摄氏度下培养约 18 至 24 小时。对于农杆菌,使用先前准备好的新鲜平板,接种 2 毫升 LB 液体培养基以启动液体培养。在 30 摄氏度下振荡培养过夜,次日继续培养。
向假单胞菌的平板中加入 150 至 200 微升液体 KBM。将细菌均匀涂布于整个平板表面,使用无菌涂布棒。
将培养皿重新放回培养箱中继续培养20至24小时。农杆菌。在含有20微摩尔乙酰丁香酮的约5至10毫升LB培养基中启动二级培养。
在30摄氏度下振荡培养过夜。在准备细菌的同时,于进行PTI实验前一天开始准备用于实验的植物。细菌制备完成后,将植物转移至温度为22至24摄氏度、相对湿度约为35%至40%、并保持恒定光照的环境中。
接下来,使用粗的黑色记号笔在叶片上标记圆形区域。选择充分展开的叶片,避免选择较老、质地坚韧或触摸较厚的叶片。不要标记叶片的下部区域。
圆圈的直径至少为1.5厘米,每片叶子上可标记2至4个圆圈。圆圈之间应保持适当间距,且最好不跨越大的叶脉。开始PTI检测前,先收获用于诱导PTI的细菌。
所使用的假单胞菌应已形成表明生长良好的细菌菌苔。用无菌长木棒从平板上刮下菌体,并重悬于约20至25毫升的10毫摩尔氯化镁溶液中,用于农杆菌离心。
培养以收集细胞,并重悬于约20至25毫升含10毫摩尔氯化镁和10毫摩尔MES(pH 5.6)的溶液中,重复离心,再次重悬于约20至25毫升氯化镁加MES溶液中。此时,诱导用假单胞菌和农杆菌已重新悬浮。
在600纳米波长下测定三种培养物的光密度。通过用氯化镁稀释假单胞菌,以及用MES缓冲液加氯化镁稀释根癌农杆菌,来调整OD值。最终所需的OD值见随附的书面实验方案。
总共25毫升的细菌培养物足以接种约40至50个位点。现在开始实验,使用1毫升无针头注射器将PTI诱导剂注入叶片上预先标记的圆圈区域。记录下植物被侵染的顺序以及诱导后开始侵染的具体时间。
在诱导接种后的数小时进行攻毒接种。收获攻毒接种所需用的细菌菌株,方法同此前所述诱导用假单胞菌菌株的收获方法。再次测定OD值,并根据随附的GR方案调整菌液浓度。
在诱导剂接种后七小时开始进行挑战接种。使用以下诱导剂与挑战剂的组合。选择第一次接种圈边缘上的一点作为第二次接种圈的中心。
按照诱导时的相同顺序对植株进行挑战性侵染。若叶片上有多个侵染位点,需确保各侵染区域不发生重叠。最后,将实验中使用的所有菌液进行系列稀释,并涂布于含有适当抗生素的KBM或LB平板上。
在激发接种后的两天,可以开始评估PTI反应。在诱导接种和挑战接种后的两天,观察因效应子触发的免疫(ETI)导致的细胞死亡现象,这些细胞死亡应出现在用PST DC3000进行挑战的区域。若在渗入重叠区域内部出现细胞死亡,则表明PTI被破坏,应记为阳性表型。在诱导接种和挑战接种后的四到五天,观察因病害导致的细胞死亡现象,这些细胞死亡应出现在用DC3000 hopQ1突变体或PS back高浓度再次挑战的区域。再次观察PTI被破坏的现象,该现象表现为在渗入重叠区域出现由病害引起的细胞死亡。持续观察植株,直至那些PTI功能未受损的植株开始在渗入重叠区域表现出细胞死亡。
在用PFDC组合接种两天后,FLS2基因沉默的植物PTI受损。在重叠区域观察到细胞死亡,表明PTI功能失常。未进行任何基因沉默的对照植物也用PFDC组合接种,并在检测后两天进行观察,结果显示由于正常PTI反应,由挑战引起的细胞死亡出现在重叠区域外部,而不在内部。
我们刚刚向您展示了如何在进行该实验流程时,开展基于细胞死亡的PTI(模式触发免疫)检测。需要注意的是,务必使植物保持在我们推荐的环境条件下。过高的湿度会对植物产生不利影响,并导致检测进程加快。
以上就是全部内容。感谢观看,祝您的实验顺利成功。
本文介绍了一种基于细胞死亡的检测方法,用于分析在本氏烟草(Nicotiana benthamiana)植物中由PAM触发的免疫反应(PTI)。该实验流程包括植物与细菌的准备,随后进行一系列接种操作,以评估PTI反应。
该检测方法通过定量关联PAMP识别与下游防御反应,实现对植物免疫通路的机制性风险评估。通过提供可重复的读出结果,用于筛选调节PTI的化合物,从而支持在农用化学品研发中的靶点验证。该方法可提高在早期筛选中对增强或抑制植物免疫活性分子的预测可靠性。
该检测方法贯穿了从靶点结合(PAMP-PRR 结合)到功能验证(免疫应答输出)以及表型筛选(免疫调节剂化合物库筛选)的完整发现过程。