2010年1月14日
Visualization of in vivo RNA transport is accomplished by microinjection of fluorescently labeled RNA transcripts into Xenopus oocytes, followed by confocal microscopy.
在此过程中,荧光标记的 RNA。将转录本注射到 XUS Cytes 中并监测其定位。首先,用荧光核苷酸标记 RNA。
在体外转录反应中,然后将 RNA 加载到显微注射装置中。将卵母细胞放在注射皿上并小心地进行显微注射。最后,培养卵母细胞以允许在共聚焦显微镜上成像之前进行 RNA 定位。
大家好,我是来自布朗大学分子生物学、细胞生物学和生物化学系 Kimberly Mallory 博士实验室的 James Gagnan。今天,我们将向您展示一种在 Xap 卵母细胞中可视化亚细胞 RNA 定位的程序。我们在实验室中使用该程序来研究早期脊椎动物发育过程中 RNA 定位所需的 RNA 结构和蛋白质因子。
那么让我们开始吧。要开始此过程,请转录 mRNA,其放射性和荧光标记均如随附的书面方案中所述。添加 DS 以降解模板 DNA,然后通过添加 EDTA 终止反应。
通过 G 50 色谱柱旋转去除未掺入的核苷酸和其他小分子。然后通过乙醇沉淀浓缩 RNA,洗涤并重悬。通过闪烁计数确定浓度后,将 RNA 稀释至 50 纳摩尔,并在零下 80 摄氏度下储存在 5 微升等分试样中。
准备进行显微注射时,将标记 RNA 的 Eloqua 在 70 摄氏度下变性 5 分钟。然后在室温下在微量离心机中以最大速度旋转 10 分钟,以去除颗粒并保持在冰上。接下来,将 xap 后卵巢的细胞修剪块分离成一个 50 毫升的锥形两个,每毫升含有 25 毫升 3 毫克。
胶原酶溶于 pH 值为 7.4 的 0.1 摩尔磷酸钾缓冲液中。由于批次间的变化,请在 18 摄氏度下轻轻摇晃。胶原酶治疗时间可能会有所不同,应通过目视检查仔细监测。
为确保落叶继续摇晃 15 分钟或直到卵母细胞与卵巢明显分离,让卵母细胞沉降到锥形管的底部。取出溶液并替换为 MBSH 缓冲液。重复此作,再洗涤两次,总共洗涤 3 次。
接下来,在标准光学显微镜下手动分选第三至第四阶段的 CYTES 和 MBSH 缓冲液。第三阶段的细胞是完全不透明的,但为白色。而第四阶段的细胞略大并带有色素斑点。
略微透明的细胞太年轻,完全着色或表现出极化色素分布的细胞太老。最后,使用 3.5 英寸的毛细管拉动和斜切准备用于显微注射的针头,以制作外径约为 0.05 毫米的针头。现在 mRNA 卵母细胞和针头已准备就绪,请继续进行显微注射。
首先用 desy 水校准针头,每次注射提供 2 纳米。前面。使用气控微量注射器装入针头,并在校准后使用千分尺校准液滴大小,将要注射的 RNA 前置装入针头。接下来,将分选的卵母细胞放在注射皿上在 MBSH 缓冲液中,培养皿包含一层黑色泡沫橡胶。
白色细胞在黑色背景下非常突出。然后小心地向每个卵母细胞注射 2 升 50 纳摩尔的 RNA。确保每个卵母细胞只注射一次,并在注射完成后定期检查针头是否堵塞。
排出剩余的 RNA,用 desy 水冲洗针头,然后加载下一个 RNA 进行注射。注射后,将注射的细胞转移到无菌 24 孔板的孔中,最多 1000 孔。CYTES 可以按孔培养。
去除缓冲液,用每孔 400 μL 的细胞培养基替换。然后将培养板放入带有湿纸巾的塑料容器中,以在培养过程中保持潮湿环境,在 18 摄氏度下孵育卵母细胞,所需孵育期后 8 至 48 小时不等。注射的卵母细胞孵育后,可以准备卵母细胞进行显微镜检查。
分拣出所有死亡的卵母细胞,并将存活的卵母细胞放入玻璃瓶中。常规观察大于 90% 的卵母细胞的存活率。用 M-E-M-F-A 固定剂更换缓冲液,并摇动细胞 20 分钟。
固定期完成后,在固定期间保护卵母细胞免受阳光照射。通过去除固定剂并用等体积的 MBSH 缓冲液替换来洗涤卵母细胞。再次重复此洗涤,总共洗涤两次。
接下来,将卵母细胞洗涤到无水甲醇中。首先,取出一半的体积并用甲醇替换。再重复两次。
洗涤后,除去所有溶液并用甲醇替换。再重复一次甲醇洗涤。固定和脱水的卵母细胞可以储存在零下 20 摄氏度,直到准备好成像。
成像前,将 Marie 的透明介质添加到玻璃底 WPI 荧光皿中以覆盖成像表面。小心地将卵母细胞从甲醇转移到荧光皿中,尽量减少甲醇转移的体积,在倒置共聚焦显微镜上对卵母细胞进行成像,蔡司 LSM 5 10 和 aica TCSs P 均给出良好的结果。现在,我们将展示一些亚细胞 RNA 定位的代表性图像,显微注射后立即在细胞核中可以看到荧光 RNA,在荧光标记的对照培养 8 小时后。
可以看到 RNA 均匀分布在卵母细胞的细胞质中。然而,在亚细胞定位到卵母细胞的植物极的过程中,可以看到含有募集运输机制的序列的荧光标记的 RNA。我们刚刚向您展示了如何将荧光标记的 RNA 显微注射到 zap 细胞中,并通过共聚焦显微镜观察 RNA 定位。
执行此程序时,请务必使用 deci 处理的溶液,以避免 RNA 污染培养物、含有抗生素的 OCM 中的细胞,并尽可能保护细胞免受阳光照射以避免光漂白。就是这样。感谢您的观看,祝您的实验好运。
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本文介绍了利用荧光标记的RNA转录本注射到非洲爪蟾卵母细胞中,以可视化活体RNA运输的过程。通过共聚焦显微镜监测RNA的定位。
在Xenopus卵母细胞中可视化RNA的定位,可直接研究RNA转运机制,支持细胞极性和发育生物学领域的早期发现与靶点验证。这种基于成像的方法为顺式和反式作用元件的功能研究提供预测性依据,有助于在临床前模型开发中做出风险调整决策。该方法产生的定量且可重复的结果,有助于对RNA靶向治疗策略进行项目筛选和机制层面的风险评估。
该成像技术通过在模式系统中实现假设验证、机制确认以及RNA定位的定量分析,融入了从发现到临床前研究的连续过程。