基因组修饰筛选:在果蝇中识别CRISPR生成突变体的方法

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- 当注射的胚胎发育成 G0 成虫时,将所有单独的果蝇杂交到合适的平衡种群中,以扩大潜在的 F1 CRISPR 编辑系,并能够追踪基因组修饰的遗传。然后,将随机选择的 F1 单雄性与合适的平衡雌性杂交,以便在 F1 雄性突变呈阳性时能够恢复后代。杂交后,将 F1 雄性转移到试管中进行筛选。

要提取基因组 DNA,请用含有提取缓冲液的移液器吸头挤压果蝇。组织分解后,喷出液体。提取缓冲液含有蛋白酶 K,蛋白酶 K 是一种消化样品中蛋白质的酶,可通过高温灭活。

现在 DNA 是可访问的,请继续进行 PCR 筛选。例如,使用旨在扩增包含新序列的区域的引物。只有在修饰存在的情况下,第二个引物才会结合,并且 PCR 产物才会被扩增。在这个例子中,我们将看到果蝇被繁殖并通过 PCR 筛选,以插入反式激活序列来替换无分支基因的第一个外显子。

- 当先前注射了向导 RNA 表达质粒和替代供体的 nos-Cas9 胚胎发育成成体时,从适合目标等位基因的品系将 G0 杂交果蝇单独与平衡果蝇交叉。在二氧化碳垫上麻醉来自每个 G0 杂交的 F1 后代,并在立体显微镜下随机挑选 10 至 20 只雄性。从适合目标等位基因的线中将每个选定的雄性个体与平衡雌性个体杂交。

当 F2 幼虫孵化时,从每个杂交中挑选 F1 父亲。用含有 50 μL 挤压缓冲液的移液器吸头将每只苍蝇挤压 10 至 15 秒,而不分配缓冲液,从而提取基因组 DNA。然后,将剩余的缓冲液分配到试管中并充分混合。

在 37 摄氏度下孵育 20 至 30 分钟。孵育后,将试管置于 95 摄氏度的加热块中 1 至 2 分钟,以灭活蛋白酶 K。以 10,000 倍 g 离心 5 分钟后,将制备物储存在 4 摄氏度下,以便进一步进行 PCR 分析。

使用正向 1 和反向引物 1 进行基于PCR的三步法筛选,以筛选是否存在插入或替换。使用正向 2 和反向 2 引物进行 PCR,以验证来自三个主要区域的插入或替换。使用引物 M13F 和反向 3 进行 PCR 以检查末端 HDR。

- 保留已确认的结束 HDR 的飞线,并建立 F2 代的平衡库存。外交叉平衡器再次飞行以去除其他染色体上的任何意外突变。

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Last updated: 25 July 2026