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高分辨率三维成像 EX - VIVO生物样品显微CT
高分辨率三维成像 EX - VIVO生物样品显微CT
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JoVE Journal Bioengineering
High Resolution 3D Imaging of Ex-Vivo Biological Samples by Micro CT

高分辨率三维成像 EX - VIVO生物样品显微CT

Full Text
19,089 Views
08:57 min
June 21, 2011

DOI: 10.3791/2688-v

Amnon Sharir1, Gregory Ramniceanu2, Vlad Brumfeld3

1Department of Molecular Genetics,Weizmann Institute of Science, 2Department of Biological Regulation,Weizmann Institute of Science, 3Department of Chemical Infrastructure,Weizmann Institute of Science

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Summary

非破坏性的量可视化可以实现,只有通过层析成像技术,其中最有效的是X射线微计算机断层扫描(CT)。

Transcript

该程序的总体目标是对矿化和非矿化组织进行 3D X 射线显微断层扫描。这是通过首先提取要检查的样品,然后将样品固定在显微 CT 仪器中并定位来实现的。该程序的第三步是为每个样品设置采集参数并收集图像。

最终,通过 X 射线 CT 获得样品的高分辨率 3D 图像。我们现有方法(如 MRI、超声或电子显微镜)的这种技术的主要优点是它以 1 微米的分辨率提供有关蜱虫体积的信息 D.这种方法可以提供许多生物组织的洞察力。它还可用于电子学、材料科学和考古学。

矿化组织和非矿化组织的制备不同。矿化组织必须密封在紧密配合的容器中,这样样品位置不会改变。在进行高分辨率测量时,容器形状将根据组织的形态而变化。

例如,从 18.5 D 龄胚胎中提取的小鼠股骨可以放入移液器吸头中。首先用类似胶水的环氧树脂密封聚苯乙烯移液器吸头的窄端。然后用工作缓冲液填充尖端。

在这种情况下,PBS 现在将裸露股骨的腿紧紧地放入吸头中,并将移液器吸头放入合适的支架中,并用封口膜片状处死密封另一端,并按照随附手稿中的概述灌注动物。然后提取染色的肺和心脏,并将它们转移到准备好的 50 毫升试管中。将器官放在一张干燥的纸上。

将样品放入最后的测量试管中,试管底部是乙醇湿布。为了营造乙醇饱和的环境,样品应紧密贴合试管内。如果样品松动,请用金属丝拧紧,并将其固定在试管底部附近,就在布的正上方。

接下来,将管子粘上或拧入仪器的支架中,然后继续设置图像。采集参数。首先将样品架放在仪器的旋转台上。

然后使用任意选择的电压和电流值拍摄 X 射线图像。如果图像太暗。首先逐渐增加光子的数量来进行更改。

这是通过逐渐增加电流来实现的。如果在将电流增加到 200 微安后图像没有变得更亮,则通过增加电压来逐渐增加 X 射线光子的能量。如果图像太亮,首先降低电压,然后降低电流,直到图像令人满意。

弯曲还可用于以牺牲分辨率为代价来提高图像亮度。inning 值为 2 将使图像的亮度增加大约四倍,而分辨率只有一半。设置最佳亮度后,优化相机的曝光时间,以在可获得的最佳对比度和合理的实验持续时间之间进行折衷。

通过使用滤光片减少低能光子通量,可以提高图像对比度,尤其是对于高吸收率的样品。现在,在 0.5 x 和 40 x 之间选择工作放大倍率,并调整视野以包含整个样品,同时最大限度地提高分辨率。要提高分辨率,请将 X 射线源放置在更靠近样品的位置。

为了增加视野,请将检测器放置在更靠近样品的位置。对于 3D 成像,样品必须在任何旋转角度下都适合视场,因此旋转轴必须居中。首先将样品旋转到负 20 度。

如果所需的体积已横向移动,请重新定位旋转轴。继续以进一步旋转的方式拍摄图像并继续进行校正,直到样品从负 90 度到正 90 度完全可见,然后继续以负 90 度到 90 度之间的所有角度进行测量。运行成像程序可能需要很长时间,因此请相应地进行计划。

例如,要在外汇放大倍率下以 8 微米的分辨率对最股骨进行成像,需要 1000 张投影图像。这只需要三个小时即可完成。然而,需要 10 小时才能收集到 2, 500 张投影图像,以 0.5 倍放大倍率和 16 微米分辨率观察大鼠肺。

为了将来的图像比较,有必要通过拍摄由人造材料制成的标准模型的图像来校准图像,这些人造材料在相同的实验条件下具有骨状和水状 X 射线吸收。对于样品,在记录所有投影图像后,重建整个体积。要将重建的图像校准为模型的值,请使用 hounds 场或 CT 刻度。

例如,在外汇放大时,虚拟模型中的 waterlike 值设置为零,bone like 值设置为此范围内的 3000。所有其他值都是内插或外插的。现在可以使用任何可以支持 20 GB 文件的软件包(例如免费软件 Image J 或 Fiji)来分析图像。

该体积渲染显示了小鼠在骨矿化开始四天后的股骨,矿化分数计算为 18%,骨矿物质密度可以与处于其他发育阶段的骨骼进行比较。12 周龄雌性裸鼠肺的断层扫描体积渲染被解析为 16 微米。肺染色用于显示直径为 20 微米的血管。

在这个系列切片中,对相同的肺进行了分析。在植入肿瘤细胞后的 4 周内,多个癌结节可显示为纯灰色。在这些肺部中,结节生长到覆盖 17% 的肺体积。

大多数肺部染色发生在肿瘤的外围区域。结节内部也有血管,约占其体积的 3%。一旦掌握,如果作得当,可以在 15 到 20 分钟内完成样品定位。

成像时间包括自动体积重建,通常不需要手术人员在场,具体取决于样本,可能需要长达 50 小时。不要忘记,使用固定剂和染色剂可能非常危险。始终佩戴实验室手套,避免吸入样品中的蒸气。

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