一体化CRISPR基因组编辑:利用CRISPR-Cas9系统在培养细胞中基于同源定向修复的基因敲入方法 关键词:CRISPR-Cas9,基因敲入,同源定向修复,培养细胞,基因组编辑

0 次观看5:12 分钟 • July 8th, 2025

首先,将一体式CRISPR质粒加入试管中存在的免疫细胞中。该质粒包含Cas9基因,以及与宿主基因组中靶序列互补的sgRNA(单导向RNA)编码序列。

加入线性化的供体质粒,该质粒包含位于同源臂(HAs)之间的转基因序列——同源臂是实现同源重组所需的DNA重复序列。进行电穿孔操作,利用电流将质粒混合物导入细胞内。进入细胞后,经加工的sgRNA与表达的Cas9核酸酶结合形成复合物。

sgRNA 与靶位点结合,使 Cas9 核酸酶能够识别被称为原间隔序列邻近基序(protospacer adjacent motif,PAM)的特异性识别序列,并在其附近切割宿主 DNA。这产生一个平末端的双链断裂,细胞机制随后对 DNA 进行切除,生成 3' 突出端。两侧存在同源臂(HA)序列会触发同源定向修复机制,使断裂的 DNA 与 HA 序列连接,形成杂合双链结构——D 环(D-loop)。

DNA 合成持续进行,形成与转基因序列互补的链,直至重新连接到原始 DNA 链。D 环顶端作为模板,合成 DNA 缺失的部分,产生双霍利迪连接(double Holliday junctions)——即四条 DNA 链相互作用的结构。这些连接结构随后得以解析,缺口被修复,从而促进靶基因的插入。

在24孔板的每个孔中加入500微升不含抗生素的完全生长培养基。将该培养板置于加湿的37摄氏度、5%二氧化碳培养箱中预热。打开电穿孔系统。输入适用于JURKAT或RAW细胞的电穿孔参数。

准备用于电穿孔的细胞-DNA混合物。收集25平方厘米培养瓶中的JURKAT细胞培养物,转移至50 mL离心管中。随后在室温下以90 × g 离心8分钟,使细胞沉淀。

对于上清液,用5 mL DPBS重悬细胞以进行洗涤。然后,在与前一步骤相同的条件下,通过离心处理细胞悬液。弃去DPBS,并用2 mL DPBS重悬细胞沉淀。取10 µL细胞悬液,与等体积的0.2%台盼蓝混合。

为估算细胞数量,将样品加入此计数载玻片中。将计数载玻片插入自动细胞计数仪,观察细胞图像,然后获得细胞计数结果。每次基因敲入实验需进行5次电穿孔,每次按200万细胞进行计算。

将所需数量的细胞转移至1.5 mL离心管中,通过离心沉淀细胞。为节省时间,可在离心过程中配制电穿孔混合物。在新的1.5 mL离心管中,加入2.5 µg的CRISPR-Cas9载体、2.4 µg的线性化靶向载体以及重悬缓冲液R,总体积为55 µL。

轻轻涡旋混匀,并短暂离心以充分混合。将电穿孔混合物在室温下放置备用。离心后,吸除DPBS,再额外离心30秒。尽可能彻底去除上清液。加入制备好的电穿孔混合物重悬细胞,轻轻吹打混匀。

电穿孔: 对于细胞电穿孔混合物,使用10微升的核转染吸头配合移液器操作。

重要提示:移液过程中避免产生气泡,否则将导致电穿孔失败。按下“开始”

电穿孔后,将样品转移至含有预热培养基的24孔板的一个孔中。对剩余的4个重复样品执行与上述相同的电穿孔操作。轻轻摇动培养板,以确保细胞均匀分布。将细胞在37°C培养箱中孵育48至72小时,然后进行FACS细胞分选。