基于 CRISPR 干扰的基因沉默:一种靶向抑制致病性钩端螺旋体基因功能的技术

0 次观看7:27 分钟 • July 8th, 2025

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CRISPR 干扰或 CRISPRi,使用 Cas9 的失活变体 dCas9 进行靶向基因沉默,从而抑制基因功能。

要执行CRISPRi,请使用穿梭载体构建体-一种含有与大肠杆菌钩端螺旋体细菌相对应的复制起点的质粒,促进在这两个物种中的繁殖。

该载体还包含 dCas9 基因特异性序列和单向导 RNA 或 sgRNA,用于识别靶序列。

最初,穿梭载体存在于供体大肠杆菌内部。用宿主钩端螺旋体补充供体大肠杆菌培养物以促进偶联。偶联在生物体之间建立直接的细胞间接触,促进钩端螺旋体对穿梭质粒的摄取。在细胞内,质粒构建体产生 sgRNA 序列并表达 dCas9 蛋白。

sgRNA 包含一个原间隔区,该区域识别其钩端螺旋体 DNA 上的互补靶区,靠近原间隔区相邻基序或 PAM(宿主 DNA 上的短识别序列)。这有助于 dCas9 在基因转录起始位点下游的靶位点与 sgRNA 形成复合物。

来自sgRNA-dCas9复合物的dCas9不具有切割DNA链的催化活性,相反,它充当mRNA形成RNA聚合酶运动的物理屏障,最终抑制基因转录。使用基因沉默的钩端螺旋体进行进一步测试。

为了结合,钩端螺旋体细胞在 HAN 培养基中在 29 或 37 摄氏度下生长。偶联前一天,将供体大肠杆菌细胞在补充有二氨基吡甲酸 - DAP 和大观霉素的 LB 培养基中生长。

接下来,在偶联当天,在LB加DAP中生长饱和大肠杆菌培养物。在生物安全罩内,通过将膜过滤器放在玻璃底座顶部,然后放置 15 mL 玻璃漏斗来组装过滤装置。两件由弹簧夹固定在一起。然后,将玻璃连接到真空泵。将 5 ml 钩端螺旋体培养物添加到漏斗中。

接下来,加入含有目标质粒的大肠杆菌β2163菌株。体积会根据培养物的光密度而变化。我们的目标是 1:1 的细胞比例。转动真空泵。现在,液体将穿过膜,细胞将集中在膜上。

取出过滤器,将其放在 EMJH 板和 DAP 上,细菌面朝上。将板在29摄氏度下孵育24小时。然后,从板中回收过滤器,并将其放入 50 mL 锥形管中。

使用 1 mL 液体 HAN 培养基通过移液从过滤器中回收细胞。通过暗场显微镜可视化回收的细胞。

在这个

阶段,可以看到等效数量的大肠杆菌钩端螺旋体。100 至 200 微升用于将细菌传播到两个含有大观霉素的 HAN 板上。在这个阶段,DAP被省略,大肠杆菌不会生长。板在 37 摄氏度和 3% CO2 下孵育。菌落应在 8 至 10 天之间明显。

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最后更新:1 八月 2026