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焦磷酸激酶催化二磷酸或焦磷酸从核苷酸前体(如三磷酸腺苷 ATP)转移到底物(如鸟苷二磷酸 GDP)。这形成了鸟苷四磷酸盐 - 一种重要的信号分子。
为了确定焦磷酸激酶活性,在补充有氯化镁的合适缓冲液中制备包含GDP和放射性标记ATP的反应混合物。将所需量的焦磷酸激酶加入反应混合物中并孵育。
随着时间的推移
,在镁离子存在的情况下,焦磷激酶开始将放射性标记的焦磷酸部分从 ATP 转移到 GDP,产生放射性鸟苷四磷酸盐。
现在,取薄层色谱或TLC,板上预涂有聚乙烯胺-纤维素 - 一种基于阳离子聚合物的固定相。在不同时间点将反应混合物分析物的等分试样点在TLC板基座附近,以停止反应并评估进展。
将板浸入含有磷酸二氢钾(一种流动相溶剂)的玻璃室中。随着溶剂前沿向上移动,带负电的分析物开始迁移,这取决于它们与带正电的固定相的亲和力。
不同磷酸化分析物的负电荷和重量的差异决定了它们在TLC板上的相对迁移,使它们能够固定为不同的条带。
当溶剂前端达到所需距离时,取下板并风干。测量放射性信号强度,对应于放射性标记的ATP耗竭和鸟苷四磷酸盐积累,以分析焦磷酸激酶活性。
在
进行反应之前,通过在去离子水中洗涤PEI-纤维素薄层色谱板来制备它们。将板放入装有双蒸馏水的玻璃室中,深度约为 0.5 厘米。让水迁移到板的顶部后,将板从玻璃室中取出,放在台架上晾干过夜。
用软铅笔在距一侧边缘 2 厘米处标记干板,以指示样品将应用于 TLC 的位置。对于 2 微升样品,应用样品的间隔不少于 1 厘米。计划实验时,始终在每个板上留一个点未使用,作为样品定量的空白通道。
要进行酶活性测定,请使用γ-32P-ATP制备单个反应,如文本方案中所述。在其他组分混合后加入 RSH,因为将 RSH 添加到含核苷酸的混合物中会启动酶活性测定。
为了控制ATP水解免受核酸酶活性的污染,组装一个不含蛋白质的10微升反应,并平行孵育。在t = 0时和实验结束时点2微升样品,以确保ATP在没有蛋白质的情况下不会被水解。
添加RSH后,立即取出2微升,并将其点在标记的PEI-纤维素板上,作为t = 0分钟样品。
在
37摄氏度下孵育反应,在所需时间点取出2微升等分试样。收集所有等分试样后,通过用 1.5 摩尔磷酸二氢钾填充色谱室至 0.5 厘米深度来进行薄层色谱。将板的底部边缘浸入溶剂中,让溶剂在大约 90 分钟内迁移到板的顶部。
从
色谱罐中取出板,并将其放在台式晾衣架上风干过夜。板干燥后,用塑料薄膜包裹板,避免放射性物质转移到成像盒上,并通过放射自显影进行分析。
将
含有分离反应的PEI-纤维素板暴露在室温下磷光热像仪盒中四个小时。曝光后,在荧光成像仪上对盒进行成像。
使用带有图形用户界面的成像软件,首先选择"绘制矩形"来绘制感兴趣区域或 ROI。然后,使用鼠标在整个泳道周围绘制矩形 ROI,以及该泳道中包含的 ATP 和鸟苷四磷酸点。
使用"选择、复制和粘贴"命令在其他通道内绘制相同的 ROI,以确保 ROI 在每个通道的相同区域内测量信号。包括未使用通道的投资回报率,以用作空白。
使用"分析 |工具 |投资回报率管理器 |添加"命令,选择在PEI-纤维素板上绘制的所有ROI。现在,使用"分析 |设置测量值 |Measure"命令来量化每个 ROI 中的信号强度,并将测量结果导出为电子表格。在电子表格中,从实验信号中减去空白 ROI 值。