定量聚合酶链式反应法检测噬菌体数量

0 次观看3:25 分钟 • July 8th, 2025

噬菌体的计数方法 通过 定量聚合酶链式反应,qPCR,配制含有 Taq DNA 聚合酶、引物、脱氧核苷三磷酸 — dNTPs — 及荧光报告染料分子的优化缓冲体系 qPCR 反应混合液,转移至 qPCR 板的各孔中。

加入热处理的噬菌体。热处理可使噬菌体DNA从噬菌体颗粒中释放出来。密封培养板,防止混合物蒸发。将培养板放入qPCR系统中,并设置适当的循环条件。

高温加热使双链DNA变性为单链,同时激活Taq DNA聚合酶。退火过程中,序列特异性的引物与互补的噬菌体DNA链结合。延伸阶段,活化的Taq DNA聚合酶在引物的3'端添加dNTPs,沿5'至3'方向延伸正在合成的DNA链。

染料分子插入新合成的双链DNA中,导致荧光强度增加。每经过一个PCR循环,目标DNA的数量增加一倍,荧光强度也随之增强。

确定荧光信号超过背景水平时的循环阈值(Ct)。

Ct 值与起始 DNA 量呈反比关系,每个噬菌体基因组相当于一个噬菌体颗粒,因此可通过噬菌体 DNA 标准曲线实现噬菌体的定量。

扩增后,进行熔解曲线分析,逐步升高反应温度。在特定的熔解温度下,一半的DNA解离为单链,释放染料分子,导致荧光信号突然下降。

独特的熔解温度(为qPCR产物特有)可验证产物的特异性。

为10个浓度未知的噬菌体生物淘选样品和7个标准浓度样品(每个样品设三个重复)配制qPCR预混液,共配制51个样品的预混液,包含255微升qPCR主混合液、51微升引物和102微升水。

将制备好的PCR混合液各8微升分装至96孔qPCR板的51个孔中。随后,向每个孔中加入2微升经热处理的T7噬菌体样品,加样时应将液体加至qPCR预混液液面以下。使用粘性封板膜密封反应板。

用铝箔包裹板以尽量减少荧光漂白,然后在qPCR仪器上运行该板。按照文本方案中所述设置循环条件和熔解曲线参数。

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最后更新:22 八月 2026