0 次观看 • 3:25 分钟 • July 8th, 2025
噬菌体的计数方法 通过 定量聚合酶链式反应,qPCR,配制含有 Taq DNA 聚合酶、引物、脱氧核苷三磷酸 — dNTPs — 及荧光报告染料分子的优化缓冲体系 qPCR 反应混合液,转移至 qPCR 板的各孔中。
加入热处理的噬菌体。热处理可使噬菌体DNA从噬菌体颗粒中释放出来。密封培养板,防止混合物蒸发。将培养板放入qPCR系统中,并设置适当的循环条件。
高温加热使双链DNA变性为单链,同时激活Taq DNA聚合酶。退火过程中,序列特异性的引物与互补的噬菌体DNA链结合。延伸阶段,活化的Taq DNA聚合酶在引物的3'端添加dNTPs,沿5'至3'方向延伸正在合成的DNA链。
染料分子插入新合成的双链DNA中,导致荧光强度增加。每经过一个PCR循环,目标DNA的数量增加一倍,荧光强度也随之增强。
确定荧光信号超过背景水平时的循环阈值(Ct)。
Ct 值与起始 DNA 量呈反比关系,每个噬菌体基因组相当于一个噬菌体颗粒,因此可通过噬菌体 DNA 标准曲线实现噬菌体的定量。
扩增后,进行熔解曲线分析,逐步升高反应温度。在特定的熔解温度下,一半的DNA解离为单链,释放染料分子,导致荧光信号突然下降。
独特的熔解温度(为qPCR产物特有)可验证产物的特异性。
为10个浓度未知的噬菌体生物淘选样品和7个标准浓度样品(每个样品设三个重复)配制qPCR预混液,共配制51个样品的预混液,包含255微升qPCR主混合液、51微升引物和102微升水。
将制备好的PCR混合液各8微升分装至96孔qPCR板的51个孔中。随后,向每个孔中加入2微升经热处理的T7噬菌体样品,加样时应将液体加至qPCR预混液液面以下。使用粘性封板膜密封反应板。
用铝箔包裹板以尽量减少荧光漂白,然后在qPCR仪器上运行该板。按照文本方案中所述设置循环条件和熔解曲线参数。
本文详细介绍了一种利用定量聚合酶链式反应(qPCR)对噬菌体进行计数的方法。该过程包括配制qPCR反应体系,加入经热处理的噬菌体,并通过分析产生的荧光信号来定量噬菌体颗粒。
基于定量PCR的噬菌体计数技术可实现对发现阶段工作流程中病毒颗粒的精确、高通量定量。该方法通过提供定量且可重复的结果,支持靶点的可靠验证和检测方法的开发,对早期决策至关重要。将qPCR计数整合到生物制药研发流程中,有助于提高基于噬菌体或调节微生物组的治疗策略的预测可信度及候选产品组合的筛选效率。
基于qPCR的噬菌体计数法适用于从早期发现到先导体鉴定的整个研究流程,可提供用于假设检验和检测准备的定量结果。
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最后更新:22 八月 2026