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对于基于荧光各向异性的蛋白质-蛋白质相互作用检测,需从带有C端四半胱氨酸基序的重组靶蛋白开始,并将其置于合适的各向异性缓冲液中。
加入含荧光染料的探针——与目标蛋白结合 通过 四半胱氨酸基序。用各向异性缓冲液透析,去除未结合的染料。将混合物转移至石英比色皿中。测定吸光度,确定目标蛋白成功标记的百分比。
在荧光比色皿中,将荧光标记的靶蛋白与未标记的蛋白混合。使用荧光分光光度计测量荧光各向异性。
由于目标蛋白质在缓冲液中自由悬浮,其上连接的荧光团会因布朗运动围绕自身轴随机旋转。当使用适当波长的垂直偏振光激发时,荧光团会发射出垂直和水平方向偏振的光。通过测量垂直与水平偏振发射荧光强度的比值——即各向异性——来获取信号信息。
当未标记的蛋白质与荧光标记的靶标结合时,蛋白复合物的分子尺寸增大,从而降低其旋转运动。结果,发射光的偏振程度增加,在垂直平面的发射光强于水平平面,导致各向异性升高。
加入浓度逐渐增加的未标记蛋白,并重复进行各向异性测量。
各向异性随未标记蛋白的增加呈非线性上升,表明未标记蛋白结合在荧光标记靶蛋白上的多个非相同结合位点。
将3纳摩尔的SBDS-FlAsH蛋白与3纳摩尔的Lumio Green染料在5微升各向异性缓冲液中混合。在4摄氏度下反应8小时。8小时后,将样品在各向异性缓冲液中透析过夜,以去除游离染料。使用石英比色皿,在分光光度计中测定280纳米和508纳米处的吸光度。然后,按照文本方案中所述,利用朗伯-比尔定律定量标记蛋白的百分比。
在测量各向异性值之前,应仔细进行蛋白质-配体滴定的每一步操作,确保将全部样品加入溶液中并混匀。
在荧光比色皿中,加入 200 微升 30 纳摩尔的 SBDS-FlAsH 溶液置于各向异性缓冲液中,然后逐次滴加 2 微升 30 微摩尔的 EFL1。充分混匀后,静置反应 3 分钟,再测定其各向异性和荧光值。重复此过程,直至总共加入 40 微升 EFL1。最后一步,按照文本方案中所述,将数据拟合至预设的结合模型。