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蛋白质中的多重磷酸化是指在蛋白质的不同位点(特别是丝氨酸和苏氨酸残基)上添加磷酸基团。
为了鉴定蛋白质中的多个磷酸化位点,首先从一个含有用氮-15标记的磷酸化蛋白质的离心管开始,这种标记有助于区分蛋白质中的酰胺氢与其他氢原子。
加入内标核磁共振(NMR)参考化合物,以准确测量相对共振频率。将混合物转移至核磁共振(NMR)管中。将NMR管插入旋转接口,并置于核磁共振波谱仪中。
磷酸基团的存在对磷酸化的丝氨酸和苏氨酸残基产生吸电子效应。因此,与其它酰胺氢相比,磷酸化残基的酰胺氢表现出去屏蔽效应,电子密度较低。
具有不同电子环境的酰胺氢原子在原子核周围经历不同的磁场,从而达到低能态。
施加一个短暂的射频脉冲,使氢原子核基于其电子环境在特定共振频率下被激发至较高能态。
在弛豫过程中,原子核通过释放吸收的能量回到低能态,所释放的能量被检测并产生核磁共振信号。
绘制代表各个酰胺氢的一维核磁共振谱图。
比较磷酸化蛋白与非磷酸化蛋白的谱图。磷酸化蛋白的核磁共振谱中出现额外的共振峰,表明存在多个磷酸化位点。
将4毫克冻干的15N和13C标记的ERK磷酸化Tau溶于400微升NMR缓冲液中。加入5%的重水用于NMR波谱仪的磁场锁场,并加入1毫摩尔的TMSP作为NMR信号的内标。同时,加入10微升40倍浓度的蛋白酶抑制剂混合物储备液。
使用带长针头的电子移液器或巴斯德移液管,将样品转移至5毫升核磁共振(NMR)样品管中。用推杆封闭NMR样品管。通过移动推杆,除去推杆与液体之间夹带的气泡。
将核磁共振(NMR)样品管放入转子中。使用合适的量规调节其在转子中的垂直位置,使样品溶液的大部分位于NMR线圈内部。接着,在磁体控制系统窗口中点击“Lift”,启动NMR仪器的气流。小心地将装有样品管的转子置于磁体孔道顶部的气流中,随后停止气流,使样品管下降并准确就位至磁体内部的探头中。
待样品平衡至 25 摄氏度后,在命令行中输入 'atmm',以对探头进行半自动调谐和匹配,从而优化功率传输。然后,在磁体控制系统窗口中点击 “Lock”,以启动光谱仪的磁场频率锁定功能。
通过在命令行中输入 'topshim gui' 打开匀场窗口,以启动匀场程序,优化样品位置处磁场的均匀性。然后,在匀场窗口中点击 “开始”。检查残余 B 零标准偏差,以确认匀场效果是否达到最佳。
接下来,校准 P1 参数,即质子射频脉冲的持续时间,单位为微秒。该参数用于实现质子自旋磁化的 90 度翻转。通过水分子中质子的一维谱图,以 360 度脉冲为目标进行优化。
通过将 01 参数设置为一维谱中的质子水峰频率,来调整频率偏移。最后,在命令行中输入 'zg',开始采集一维质子谱。