2013年7月13日
本文描述了将一种原型电压门控钾通道完全重建到脂质膜中的操作步骤。重建后的通道适用于生化分析、电生理记录、配体筛选以及电子晶体学研究。这些方法可能普遍适用于其他膜蛋白的结构与功能研究。
本实验的总体目标是详细描述研究脂质对膜蛋白功能和结构影响的技术。首先通过表达和纯化电压门控钾离子通道来实现这一目标,第二步是进行离子通道的重建。
接下来,通过脂质双层膜中的离子通道进行电生理记录,以研究离子通道的功能。最后一步是膜中离子通道的结晶,用于结构解析。最终,通过生化分析、电生理方法以及电子晶体学研究,来探究脂质对离子通道电压感应器运动的影响。
初学者通常会因蛋白质重构和生物记录中的诸多技术细节而遇到困难。希望本视频能帮助您顺利完成整个实验流程并取得成功。整个实验过程将由我实验室的 Dr. Hui Jim 进行示范。
在进行脂质制备之前,准备一支14毫升的一次性玻璃试管、一支带螺口盖的玻璃管,以及一支含有氯仿的250微升玻璃注射器。然后将10毫升氯仿转移至试管中。为制备POPE和POPG脂质体,将3.75毫克溶于氯仿中的POPE和1.25毫克溶于氯仿中的POPG转移至带螺口盖的玻璃管中。
当无可见氯仿残留时,在持续的氩气流下干燥脂质。随后在室温真空条件下进一步干燥一小时。接着,向干燥的脂质中加入440 µL低盐缓冲液或水,涡旋混匀。
用于水合脂质的试管。脂质悬液应呈现乳白色且浑浊。随后,将脂质悬液置于冰浴中进行超声处理,直至囊泡溶液变为半透明。
然后向混合物中加入50微升3摩尔的氯化钾和10微升0.5摩尔的DM,使最终脂质悬浮液中含有300毫摩尔氯化钾和10毫摩尔DM,将溶液在室温下于旋转仪中孵育2小时,以促进脂质-去垢剂混合胶束的形成。孵育结束后,由于去垢剂诱导小单层脂质体(ELLA囊泡)融合,悬浮液应略微变浑浊。当蛋白浓度浓缩至超过2毫克/毫升时,加入上述组分——脂质-去垢剂混合物,定容至最终体积1毫升。
然后将蛋白质-脂质-去垢剂混合物置于玻璃管中,在旋转仪上再孵育两小时。KVAP 与去垢剂溶解的 DTaP 或 DOGS 混合制备的过程,类似于 P-O-P-E-P-O-P-G 囊泡的脂质制备。然而,将水合脂质超声处理成小单层囊泡所需时间比 P-O-P-E-P-O-P-G 脂质更长,DOGS 囊泡可能会缓慢相互融合,形成微小油滴,从而完全溶解 Dote 或 DOGS。
将超声处理后的囊泡与10毫摩尔的DM和40毫摩尔的beta og混合。脂质-去垢剂混合物在室温下孵育过夜,混合物应较为澄清,无任何微小颗粒或液滴。接下来,将KVAP蛋白与去垢剂溶解的DTaP或DOGS混合,蛋白与脂质的比例应小于或等于1:10。
将蛋白质-去垢剂-脂质混合物在室温下孵育2至3小时,并持续进行圆周旋转。为证明去除临界胶束浓度(CMC)相对较高的去垢剂(如DM和Beta-OG)的过程较为缓慢,首先为每1毫升混合物准备2升透析缓冲液。
然后剪取一段合适长度的透析管,用去离子水冲洗,检查并确保透析管无泄漏。接着,将蛋白质-脂质-去污剂混合物装入透析管中。用夹子夹紧透析管两端,使夹子下方与液面之间的空间尽可能小。
将装有样品的透析管置于透析缓冲液中,并放在搅拌板上,使透析管在溶液中缓慢旋转。每八小时更换一次透析缓冲液。接下来,通过称量0.5克干态聚苯乙烯珠,为去除低临界胶束浓度(CMC)的去垢剂做准备。
然后将它们放入一个50毫升的Corning离心管中,加入20毫升甲醇,在超声水浴中处理5分钟以去除夹带的气泡,并在5,000 rpm下离心5分钟。随后,彻底倾去甲醇,并用乙醇和Milli-Q水重复洗涤步骤。将洗涤后的珠子保存在4°C的20%乙醇中,并在使用前更换为无去垢剂的缓冲液。估算待处理的蛋白质-脂质-去垢剂混合物中的去垢剂含量,并计算去除去垢剂所需的珠子用量。
称取湿润的珠子(不含过量水分),并直接加入蛋白混合物中,静置至少15至20分钟,以确保珠子充分发挥作用。为去除1毫升溶液中的8.7毫克DDM,共需87毫克的聚苯乙烯珠(例如Bio-Beads SM-2),将其均分为五等份。将蛋白-脂质-去污剂混合物与每一份珠子在室温下以持续翻转的方式孵育20至30分钟。
离心沉淀珠子,然后将上清液转移至下一组珠子中,重复此步骤直至完成。在此步骤中,首先使用氯仿清洗玻璃试管、带聚四氟乙烯表面螺旋盖的棕色小瓶以及一套玻璃注射器。然后在氩气气流下干燥棕色小瓶。
接下来,将0.75毫克POPE和0.25毫克POPG溶于氯仿中,转移至燃烧瓶内,并用氩气蒸发氯仿。随后,向瓶中加入0.2毫升戊烷以溶解干燥的脂质,然后彻底干燥以去除残留的氯仿。接着,向瓶中加入50微升癸烷以溶解干燥的脂质。
现在,将脂质涂抹在双层杯圆柱表面的圆形孔洞上,注意不要让任何脂质溶液进入孔内。等待一到两分钟,使溶剂完全蒸发,以便对脂质双层中的KVAP通道进行电学记录。将杯子插入记录室,插入盐桥,并将电极连接到记录杯的两侧。
将半胱氨酸溶液加入电极孔中,将CYS和跨膜溶液分别加入池室的外杯和内杯中。然后调节杯两侧之间的电位偏移,使其小于两毫伏,接着在杯盖的小孔上涂抹脂质。等待膜逐渐变薄并达到相对稳定状态。
一旦膜变得稳定,将P2移液器吸头的细端置于孔上方,注入0.5至1微升含有囊泡的通道液。囊泡会穿过孔洞,沉降到杯底。
为了在双层膜中测试 KVAP 通道,从 -80 毫伏的保持电位施加一个 80 毫伏的短暂脉冲。由于通道具有快速失活和激活后缓慢恢复的特性,在两次脉冲之间需给予较长的间隔时间,对于 PEPG 膜中的通道而言,该间隔约为 120 秒。一旦观察到电流幅度良好,通过向离子浓度较低的一侧添加额外的离子盐,平衡膜两侧溶液中的离子浓度。
这是一张负染二维晶体的图像,处于晶体优化的中期阶段。由于糖的存在有时会导致晶体相互堆积,因此使用6% pH 6.4的钼酸铵溶液并添加0.5%甘油三醛进行染色。此处的黑色方框标示了一个区域,该区域可产生具有衍射斑点的衍射图样。
此处显示的约 20 埃的冷冻电镜图像是来自一个与之前所示样品相似的二维晶体。该样品与 3% TLOs 混合后,通过直接浸入法冷冻,并在冷冻电镜下以 50,000 倍放大倍数成像。显然,晶体排列中存在局部缺陷。
这是另一张进一步优化后的晶体的冷冻电镜图像。样品包埋于0.75%单宁酸和10%树精中,在50,000 ×倍率下拍摄。紧密排列中的直线表明,在此类晶体中通道排列有序,而两个黑色箭头标记了方形矢量。
观看本视频后,希望您能够充分了解如何正确处理脂质和蛋白质,本视频将有助于您更高效地研究膜上脂质与蛋白质的相互作用。
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本文描述了将一种原型电压门控钾通道完全重建到脂质膜中的操作步骤。重建后的通道适用于多种生化分析、电生理记录、配体筛选以及电子晶体学研究。
将电压门控性钾离子通道重构至明确组成的脂质膜中,可系统性地解析对离子通道功能至关重要的脂质-蛋白质相互作用机制。该方法通过构建简化的实验体系,用于探究脂质组成如何影响通道的构象状态及电压感应结构域的运动,从而支持靶点验证。该技术通过关联脂质微环境与功能输出,在早期药物发现阶段提高了预测的可靠性,为真核离子通道的药理学筛选和先导化合物的发现提供指导。
重组工作流程整合了表达、纯化、脂质掺入以及功能/结构检测,以支持发现阶段的假设验证和先导化合物优化。