2013年7月25日
在本实验方案中,我们描述了两种在蜜蜂中同时抑制两个基因(双基因敲低)的策略。随后,我们介绍了如何利用吻伸反应(PER)实验来研究双基因敲低对蜜蜂味觉感知的影响。
本视频实验方案演示了一种新颖的技术,可同时在成年蜜蜂中敲低两个基因,随后进行喙伸展反应(proboscis extension response,PER)实验,以检测双基因敲低对蜜蜂味觉感知的影响。该方法首先合成针对三种蛋白基因的双链RNA,这些蛋白分别为:vitellogenin、ultraspiracle 和绿色荧光蛋白(green fluorescence protein)。
由于编码GFP的基因不存在于蜜蜂基因组中,因此GFP双链RNA可作为阴性对照。第二步是采用四种处理策略将双链RNA注射到蜜蜂体内:单独注射GFP双链RNA;同时注射vg和usp双链RNA的混合物;第一天注射vg双链RNA,第二天注射usp双链RNA;或第一天注射usp双链RNA,第二天注射vg双链RNA。注射后,用不同颜色标记的彩点标记蜜蜂以对应相应的处理方式,然后将其放回蜂巢。
六天后,通过实时 PCR 验证处理组蜜蜂中 VG 和 USP 基因的敲低效果,并通过 PER 实验测定 VG 与 USP 双重敲低对味觉感知的影响。最终结果显示,双重敲低蜜蜂的 VG 和 USP 基因表达显著降低,同时对蔗糖的味觉感知显著增强。我们的干扰技术是一种可用于揭示基因功能的强大工具。
它通常用于靶向单个基因。然而,基因是复杂调控网络的一部分。要更好地理解任何生物过程,一种方法是研究基因如何与基因网络相互作用。
为此,我们必须同时操控多个基因。迄今为止,我们只能一次干扰昆虫中的单个基因;而在此首次展示如何在蜜蜂中同时敲低两个基因,而非一个。唾液分泌反射(SCUs extension reflex)或称为PER,是一种用于测量蜜蜂味觉感知的非常有用的技术,而味觉感知是蜜蜂社会行为的一种行为学预测指标。
例如,具有较强味觉感知能力的蜜蜂在行为上成熟较快,较早开始外出觅食,并倾向于采集花粉。开始本实验前,需使用免费软件Primer.Three设计靶向目标基因的双链RNA引物。在本实验中,选定进行敲低的两个基因为卵黄原蛋白基因(vitellogenin,VG)和超螺旋受体(ultraspiracle,USP)。
除了VG和USP引物设计外,还设计了靶向编码绿色荧光蛋白(green fluorescence protein,GFP)的对照基因的双链RNA引物,该基因不存在于蜜蜂基因组中。随后,使用Promega公司的Rib Max T7 RNA体外转录系统,完成VG、USP和GFP的双链RNA合成。
采用标准方法纯化双链RNA后,将每份双链RNA沉淀溶解于无核酸酶的水中,以确保基因下调效果;双链RNA浓度应约为9至10微克每微升。为准备蜜蜂进行注射,将新羽化的蜜蜂置于4摄氏度冰箱中冷却1至2分钟。待蜜蜂被固定后,用昆虫针将3至4只蜜蜂并排固定在装有固体石蜡的培养皿中,昆虫针交叉穿过蜜蜂的腹部与胸部之间。
将蜜蜂再次放入4°C冰箱中冷却约一到两分钟。确保蜜蜂完全不动。蜜蜂应呈现松弛状态,而非蜷缩或扭曲。
完全固定非常重要,因为任何移动都可能扩大伤口并增加死亡率。蜜蜂若出现卷曲或扭曲,表明其冷藏时间过长,不应使用,因其死亡率较高。在 Hamilton 微量注射器上安装一次性 30 号针头。
用注射器吸取3 µL双链RNA,确保注射器内无气泡。若采用单次注射策略,注射器中应装入两种基因双链RNA的混合物;若采用两天注射策略,则注射器中装入两种双链RNA中的一种。
将针头插入腹部侧面。为避免损伤内脏器官,应缓慢推动注射器活塞,使双链RNA逐渐被吸收。由于双链RNA黏度较高,完全从注射器中推出需要两到三秒钟。
完全推下活塞后,将针头留在伤口中4到5秒。注射后观察蜜蜂3到5秒。如果伤口有血淋巴液滴渗出,则丢弃该蜜蜂,并用不同颜色标记接受不同处理的蜜蜂的胸部。
此时,如果采用单次注射策略,将蜜蜂置于提供蜂蜜的容器中观察一小时,然后将其放回蜂群中。然而,如果采用两天注射策略且仅注射了第一种双链RNA,则将蜜蜂放入圆柱形网笼中,并在侧壁提供蜂蜜。将蜜蜂在34°C、80%湿度的培养箱中过夜培养,次日继续后续操作。
使用与第一次相同的双链RNA,按照相同的程序对同一批蜜蜂进行注射。将蜜蜂置于提供蜂蜜的容器中,在室温下恢复1小时,然后将其引入蜂群。注射后第六天,从蜂群中采集经处理的蜜蜂,打开蜂箱时不得使用喷烟器。
不使用烟雾,因为它可能影响蜜蜂的味觉感知,而本实验步骤中将对蜜蜂的味觉进行测试。使用柔软的镊子将蜜蜂收集到金属网状圆筒笼中,每个笼内放置不超过三只蜜蜂,以备安装蜜蜂进行PER实验。
将蜜蜂置于 4 摄氏度环境中冷却,直至其完全无法活动。将每只蜜蜂垂直固定于专为 PER 实验设计的塑料管中。用胶带固定,使蜜蜂腹部位于管内,头部露出管外。
将试管放置在带有两排小塑料柱的架子上。其中一排标有数字,以便为固定的蜜蜂分配编号。将装有处理后蜜蜂的架子放入34摄氏度、80%湿度的培养箱中孵育两小时。
配制一系列蔗糖水溶液。将溶液装入带有15至20号针头的注射器中,用于PER检测。
将蜜蜂分组进行测试。首先用一滴0%的溶液(即水)触碰每只蜜蜂的触角,随后依次用0.1%、0.3%、1%、3%、10%和30%的蔗糖溶液进行测试。每次测试不同溶液之间需至少间隔两分钟。
使用一种浓度的蔗糖测试20只蜜蜂通常需要大约两分钟。因此,每组蜜蜂的数量应始终超过20只。如果一只蜜蜂完全伸出了其喙,即计为一次实时的正向反应。
PCR分析证实,单次注射和连续两天注射两种策略均显著降低了蜜蜂体内Fiji和USP基因的转录水平。在这些图中,双链RNA注射后第6天,RQ表示目标基因转录本的相对定量水平,柱状图上方不同的字母表示处理组之间的显著差异。事后分析显示,与先注射USP再注射VG的两天注射方案相比,使用双链RNA混合物进行单次注射以及先注射VG再注射USP的两天注射方案对USP转录本的抑制效果显著更强。
这表明卵黄原蛋白(VG)可能是VG与保幼激素调控环路中的一个主要调控因子。处理组蜜蜂的GUA反应评分(GRS)是根据此处所示的 proboscis extension response(PER)实验结果计算得出的。注射了VG与USP双链RNA混合物的蜜蜂,其GRS显著高于GFP对照组蜜蜂,表明双基因沉默蜜蜂对蔗糖更为敏感。
柱状图上方不同的字母表示处理组之间存在显著差异。此处展示的是通过同时抑制 VG 和 USP 基因所揭示的卵黄原蛋白、超气管蛋白和保幼激素之间的可能调控网络。与单独抑制 USP 基因不引起保幼激素水平变化不同,同时抑制 VG 和 USP 基因比单独抑制 VG 基因导致保幼激素水平更显著升高。
这表明,Vg不仅抑制保幼激素的合成,还抑制保幼激素对USP基因敲低所产生的反馈反应。在双重敲低实验中,保幼激素合成的显著增加源于VG敲低导致VI基因对保幼激素合成的抑制作用减弱,以及USP敲低引起保幼激素信号转导降低所触发的代偿性反应。有关该调控网络的更详细讨论见配套的实验方案文本。
通过采用双基因敲低方法,我们揭示了重要基因 ultras、spherical 以及保幼激素之间详细的相互关系,而仅抑制单一基因则无法发现这一关系。现在,研究人员可利用该技术探索调控网络中基因之间的相互作用。Proboscis Response(PR)是用于测量蜜蜂味觉感知的标准方法,但该方法对操作过程极为敏感,因此在保持实验环境和动物操作的一致性时必须格外谨慎。
此外,如果实验需要在数天内完成,则应尽量保持较短的时间线,并密切关注天气和环境条件,确保其不发生变化。
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本方案描述了在蜜蜂中进行双基因敲低的技术,以及随后利用喙伸展反应(PER)实验评估味觉感知的方法。
该方案通过在调控网络内同时敲低两个相互作用的基因,实现靶点验证过程中的机制性风险降低,揭示单基因方法所遗漏的功能依赖关系。通过将遗传扰动与基于PER的定量味觉感知测量相结合,该方法可有效预测基因网络与代谢及神经靶向通路相关行为表型之间的关联,提供更高的预测可信度。该策略通过阐明通路间的相互依赖关系,提升在复杂生物系统中靶点筛选的精确性,从而支持早期发现生物学研究。
该方法通过双基因扰动实现假设驱动的靶点验证,并结合定量行为表型分析以评估功能影响,从而在先导化合物筛选阶段之前整合到早期发现工作流程中。