2013年12月22日
植物腺体是特化的结构,负责生物合成和分泌多种参与生物环境相互作用的化合物。为了便于研究其分子和生化特性,已建立一种机械显微分离技术,用于分离单个具有代谢活性的腺体,此处以食虫植物Nepenthes为例。
本方法的目的是从新鲜植物组织中获取单一且纯净的腺体,用于分子分析。首先从猪笼草植物上采集一个捕虫笼,随后立即将组织固定在冰上的微型取样平台上,以保持组织的新鲜状态。
在微量取样过程中,以精确方式分离腺体,并将其转移至PCR管中,随后对采集的材料进行定量PCR分析。最终,利用机械式微量取样技术,从猪笼草植物中获取单一且纯净的腺体,从而快速、微创地为后续分子分析提供特定组织。食虫植物在植物界中属于特化类群,因其能够消化动物蛋白。
我们对这一过程在分子层面的作用机制仍知之甚少。一个研究该问题的良好模型是天才阑尾的图像融合,因为它具有结构分明的器官和产生腺体的图像,这些腺体参与消化过程。在阑尾中。
这些腺体位于底部图片的内部。为了进行分子分析,有必要直接从新鲜组织中分离出这些宽而扁平的结构,其直径约为 100 至 200 微米。更为困难的是,这些腺体被一个保护性的罩状结构所覆盖。
由于该结构类似于车棚,需要在取样过程中进行三维观察,同时还需要一种能够以精细方式在三维空间中移动的工具。我们发现,现有的显微解剖技术并不适用于解决我们的问题。例如,激光因植物组织含水量过高而失败。
因此,我们决定采用一种名为aika的新型机械显微解剖技术,用于分离三维结构中的组织部分甚至单个细胞。该技术包含一台体视或立体显微镜,其中集成有三维显微操作器,其结构设计可轻松触及非常扁平或非常高耸的物体。显微镜可连同作为支柱的装置一同移动,以对样品进行操作。在植物样本上,我们经常使用微毛细管。
然而,对于阑尾玻璃样本,我们发现由PTO驱动的微型镊子在我们的操作中更为有效。针对阑尾样本,平台已进行了改进。稍小的VXY载物台用于支撑一个盛有冰的容器,该容器足够大,可同时容纳组织样本及其支架,以及将要放置腺体的位置。
冰能确保组织内的梯度过程被极大减缓,从而有可能识别出组织的原始分子状态。以下操作步骤源自图像的下部区域:切下一枚约一至二平方厘米的组织片,随后将其展平。
然后使用双面胶带将组织固定在载玻片上。该组织样本用无RNA酶的水覆盖,并在取样过程中保持湿润。随后将样本放置妥当,使腺体及其保护罩朝向操作者一侧。
需要调整样品与工具之间的角度,使腺体平放。使用万能台时,可在两个轴向上调节倾斜度,并可在显微镜下轻松校正。金属台可使样品在显微镜下保持低温。
腺体界限清晰。荧光有助于轻松识别腺体及其保护罩的轮廓。通过FSE滤光片观察样品以分离腺体。
进行RNA提取时,需使用紫外滤光片。显微镊子的精确定位对于腺体分离至关重要。建议在低速模式下操作工具。
使用显微镊子,通过操纵杆将镊臂置于腺体边缘,轻柔闭合显微镊。随后将腺体从周围组织中抬起。在精确分离后,可观察到完整的腺体腔,其下方为血管组织。
随后将分离的腺体转移至PCR管中,并放入已准备好的缓冲液内。为验证该方法,检测了分泌到液体中的原子腿蛋白短型(TAP)的基因表达,该基因可直接从腺体中扩增,无需预先提取基因组DNA,只需将PCR反应混合物加入分离的组织中即可。
该系列实验涉及经不同处理的猪笼草植株的腺体,以及来自其周围表皮组织的样品。每次实验均提取总RNA。所获得的mRNA通过逆转录转化为相应的cDNA,并用于后续的PCR反应。
为了扩增目的基因序列,采用实时PCR比较了猪笼草属(nepenthes)腺体和表皮组织中TLP的表达水平。结果显示,在猪笼草属的allotta和miis两个物种中,与表皮组织相比,分泌腺中的TLP转录水平更高,这通过表皮组织与腺体组织比值小于一得以可视化。为检测猎物接触是否可诱导基因表达,比较了捕获猎物后TLP的转录水平以及未经处理的图片与喂食黑腹果蝇(drosophila melanogaster)后的图片。
表皮组织在此处表现出较高的TLP表达。比较了猪笼草miis的腺体和表皮组织中TLP转录水平及其处理后的图片。两种组织中TLP表达的上调表明,捕虫笼液蛋白的产生确实可由猎物诱导。
PCR 结果表明,进食能有效改变两种组织类型中 TLP 的表达,并可改变腺体与表皮之间表达水平的比例。我们建立了一种高效的方法,用于从阑尾 FA 组织中收集清洁样本,并分离出足量的 mRNA 以开展基因表达实验。借助这一新方法,不仅能够研究阑尾腺体的转录组学,还能够进一步开展代谢组学以及蛋白质组学研究。
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本文介绍了一种机械微分离技术,用于从食虫植物猪笼草(Nepenthes)中分离单个具有代谢活性的腺体。该方法可对这些负责多种化合物生物合成与分泌的特化结构进行详细的分子和生化分析。
分离具有代谢活性的植物腺体可实现对特化分泌组织的直接分子分析,有助于天然产物发现中的靶点验证。该方法为研究蛋白质分泌和营养吸收机制提供了与疾病相关的系统,从而为从植物来源中筛选先导化合物提供机制层面的风险降低。通过为下游组学应用提供可重复获取的功能性腺体组织,该技术增强了早期发现阶段的预测可靠性。
该方法通过为组学支持的靶点研究提供可靠的上游步骤,将组织制备与先导化合物筛选级联中的分子分析相衔接,从而契合早期发现的工作流程。