2015年5月3日
此稿件描述了SUMO化修饰和着丝粒蛋白,Ndc10和Ndc80的泛素化的检测,在芽殖酵母 。
该程序的总体目标是检测出芽酵母动力学核心蛋白 NDC 10 和 NDC 80 的模拟和泛素化。这是通过首先收获表达嘶嘶声标记的 SMT 3 和 MT 标记的 NDC 10 或 NDC 80 的酵母细胞,并从这些细胞中制备蛋白质提取物来实现的。第二步是纯化 hiss 标记的 SMT 三种偶联物,用于检测求和,或免疫沉淀 mik tagg 动力学核心蛋白,用于检测泛素化。
随后,通过 western blot 分析检测总和或泛素化。最终,NDC 10 和 NDC 80 的阶梯模式的存在证实了这些蛋白质是模拟和泛素化的。所描述的蛋白质纯化方法允许检测出芽酵母骶骨中 connico 蛋白 ND C 10 和 NDC 80 的模拟和泛素化。
我的 cci.该技术的主要优点是我们创建的菌株具有两个表位攻击,一个在测试蛋白质上,另一个允许检测模拟。使用这些标签可降低背景,因为使用多克隆血清时经常观察到的交叉反应性。
该程序的演示将由我实验室的研究员 Canero Uni 完成。将从先前制备的酵母细胞沉淀中提取感兴趣的蛋白质,并在零下 20 摄氏度下储存。复苏,将细胞悬浮在 0.5 毫升冰冷缓冲液中。
如果提取物用于使用镍丁腈、三乙酸或镍 NTA 超流珠的沉降测定,请使用 Guine 缓冲液。如果提取物用于免疫沉淀,请使用缓冲液 A。始终将试管放在冰上。
将细胞悬液转移至 2 mL。将 2 个盖拧到每根试管上。添加的玻璃珠体积等于细胞悬液珠的体积。
在室温下,在迷你微珠打浆器中将细胞打浆 2 分钟,然后将试管置于冰上 2 至 3 分钟。重复珠子敲打和糖霜 3 次。在 4 摄氏度下高速涡旋 30 至 60 分钟。
通过在显微镜下观察检查细胞,以确保细胞被裂解。裂解的细胞将显示为黑暗的幽灵,并且没有边界或定义的形状。最好至少 80% 的细胞应该躺着。
接下来,使用图钉在管子底部刺穿一个孔。松散地盖上螺帽,然后将试管放入 15 mL 锥形管中。以 1000 倍 G 离心 1 分钟。
要收集裂解物,请将裂解物转移到微量离心管中,在 4 摄氏度下以 15, 000 倍 G 离心 30 分钟,以收集提取的蛋白质。使用蛋白质检测试剂盒测量提取的蛋白质的浓度后,将所有提取物归一化,使每种提取物含有相同量的蛋白质。用适当的缓冲液将总体积调至 1 mL。
从 50 OD 600 个细胞中获得大约 5 毫克的总蛋白。将 50 微升提取的蛋白质保存为全细胞提取物。剩余的 950 微升蛋白质提取物稍后将用于 MT 标记蛋白的蛋白质纯化或免疫沉淀。
将 50 微升 2 x laly 样品缓冲液添加到 50 微升全细胞提取物中。将样品在 100 摄氏度的加热块中孵育 3 到 5 分钟,然后通过 western blot 进行分析。通过制备纯化所需的镍 NTA 超流珠子来开始此过程。
获得低速离心 1 分钟所需的微珠量。去除上清液并用 PBS 洗涤珠子。加入 1 毫升 PBS,将试管顶部倒置,直到珠子重悬。
通过低速离心收集珠子并去除上清液。以这种方式清洗珠子总共五次。将珠子悬浮在一毫升几级缓冲液中,并将它们分装到与要处理的样品相对应的试管数量中。
通过低速离心收集珠子,并去除每个样品的上清液。加入 950 微升全细胞提取物。提前制备 100 μL 的珠子。
在 4 摄氏度的摇床上孵育至少 4 小时或过夜。在 4 摄氏度下以 800 至 1500 倍 G 离心 1 分钟。节省 50 微升的上清液。
向该上清液中加入 50 微升 2 x laly 样品缓冲液,并在 100 摄氏度下在加热块中孵育 3 至 5 分钟。每个样品 10 微升稍后将通过 Western blot 进行分析。在室温下,在摇床上用 1 毫升 Guine 缓冲液洗涤镍 NTA 超流微珠一次,持续 5 至 10 分钟。
接下来,用 1 毫升破碎缓冲液洗涤珠子 5 次,最后一次用断裂缓冲液洗涤后,将珠子重悬于 90 微升 2 x laly 样品缓冲液中。加入 10 微升一磨牙碘,以帮助将 his 标记的蛋白与镍 NT 解离。A 珠子在 100 摄氏度的加热块中孵育 3 到 5 分钟。然后涡旋,然后以 13, 000 倍 G 离心 30 秒。
将上清液转移到新试管中。要开始此程序,请通过低速离心获得必要量的抗 cmic aero 亲和凝胶抗体。去除上清液,用缓冲液 A 洗涤树脂加入 1 毫升缓冲液 A,并倒置至上,直到树脂重悬。
通过低速离心收集树脂并去除上清液。总共洗涤五次。将树脂悬浮在 1 毫升缓冲液 A 中,并分装到与待处理样品相对应的试管数量中。
通过低速离心收集树脂并去除上清液。将 950 μL 全细胞提取物添加到 25 μL 树脂中,第二天在 4 摄氏度的摇床上孵育过夜。在 4 摄氏度下以 800 至 1500 倍 G 离心 1 分钟。
节省 50 微升的上清液。向该上清液中加入 50 微升 2 x lam ly 样品缓冲液,并在 100 摄氏度下在加热块中孵育 3 至 5 分钟。用缓冲液洗涤树脂,加入 1 毫升缓冲液,上下倒置,直到树脂重悬。
通过低速离心收集树脂,并从最终洗涤中取出上清液后去除上清液。将树脂重悬于 100 μL sume 样品缓冲液中,在 100 摄氏度下在加热块中孵育 3 到 5 分钟。然后涡旋,然后以 13, 000 倍 G 离心 30 秒。
将上清液转移到新试管中。最后,加载从该协议收集的所有样品。在 SDS 页面中,用于 Western blot 分析的凝胶,表达多聚组胺标志标记的 SMT 3 或 HF SMT 3 和 MT 标记的 NDC 80 和 NDC 10 的酵母菌株用于检测动力学蛋白的模拟。
使用镍珠对 HF SMT 三种底物进行亲和纯化,并用 Anti-Flag 抗体进行检测。用抗 mic 抗体探测时,在 HF SMT 三种底物中检测到总和护城沟 NDC 80。在没有 HF SMT three 的对照菌株中不存在修饰蛋白表明 HF SMT three 与其靶蛋白之间相互作用的特异性。
此外,在 NOCO desole 处理的细胞中,NDC 80 和 NDC 10 的总和降低,以检测 NDC 80 和 NDC 10 的泛素化。Mick 标记的 ND C 80 或 ND C 10 被免疫沉淀,用抗 mic 和抗泛素抗体进行蛋白质印迹分析,全细胞提取物和上清液分析证实 NDC 80 M 和 NDC 10 M 免疫沉淀样品的表达用抗 MIC 探测显示多个高分子量条带,表明 NDC 80 和 NDC 10 包含翻译后修饰。用抗泛素探测的免疫沉淀样品的阶梯模式显示 ND C 80 和 ND C 10 是泛素化的。
用蛋白酶体抑制剂 MG 1 32 处理增强了 NDC 80 和 NDC 10 的阶梯模式。进一步确认这些代表多泛素化 看完这个视频后,你应该对可以检测交配和接种蝙蝠 NN 的蛋白质纯化技术有很好的了解。
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本文描述了在出芽酵母酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)中动粒蛋白Ndc10和Ndc80的SUMO化和泛素化修饰的检测。该研究概述了一种纯化这些蛋白的方法,并通过蛋白质印迹分析确认其翻译后修饰。
该蛋白质纯化技术能够检测着丝粒蛋白上的SUMO化和泛素化修饰,为研究关键细胞分裂因子的翻译后调控提供了可靠方法。通过双重表位标签降低背景信号,该方法可在必须确认翻译后修饰依赖性功能的靶点验证工作流程中支持机制性风险排除。该技术通过蛋白质印迹提供定量的梯状条带读数,有助于在早期发现阶段建立预测性信心。
该方法通过提供经翻译后修饰确认的蛋白质状态,适用于从早期发现到先导物鉴定阶段,以用于后续的功能或相互作用分析。