2015年11月13日
本手稿描述了一种新技术,该技术能够在荧光标记的纳米颗粒被内吞后,直接在活细胞内检测其细胞内基因表达。该方法无需对细胞进行操作,且不受目标基因或物种的限制。
本实验的总体目标是通过应用基因特异性的荧光纳米颗粒,直接在活细胞内分析基因表达。该目标的实现首先需要确定目标基因中的合适靶序列;第二步是制备带有特异性捕获链和报告链的纳米颗粒。
接下来,将纳米颗粒直接加入活细胞的培养基中。最后一步是在37摄氏度、5% CO2的湿润环境中孵育细胞与纳米颗粒过夜。最终,利用荧光显微镜观察活的目标细胞中基因特异性的荧光信号,同时通过流式细胞术分析定量荧光阳性细胞的数量。
与现有的免疫组织化学、分子信标或PCR分析等方法相比,该技术的主要优势在于无需对细胞培养物进行任何操作,即可在活细胞中直观地观察基因表达。接下来由我们实验室的生物学家、博士生玛蒂娜·特蕾莎(Martina Teresa)演示实验操作步骤,流式细胞术部分由林内特·亨克尔(Lynette Henkel)完成。在确定靶序列后,从商业来源订购冻干的金纳米颗粒。
这些颗粒由一个中心金颗粒组成,该金颗粒通过共价键连接一条捕获链,而捕获链又与一条报告链结合。当目标 mRNA 与捕获链结合后,报告链及其连接的荧光团被释放到溶液中,从而使 Fluor four 发出荧光。在重建之前。
纳米颗粒应避光保存于纸板箱中,置于4°C环境下。为重组金纳米颗粒,加入20微升双蒸水,最终浓度为100纳摩尔。重组后的纳米颗粒可在避光条件下室温保存至少一年。
在使用当天,将金纳米颗粒的储备液用PBS稀释成20倍工作液,从细胞培养箱中取出含有HEK 293细胞的24孔板,吸除培养基,每孔加入237.5 µL新鲜培养基,再向各孔中加入12.5 µL纳米颗粒工作液,轻轻摇动培养板以确保纳米颗粒均匀分布。将细胞置于37°C、5% CO₂的湿润环境中过夜培养。第二天。
使用标准荧光显微镜分析细胞培养物中基因特异性位点三的荧光,以准备进行流式细胞术。用 PBS 洗涤一次显示位点三诱导荧光的 HEK 293 细胞,加入 1 毫升 0.05% 胰蛋白酶 EDTA,在 37 摄氏度和 5% CO2 条件下孵育细胞 3 分钟。孵育结束后,加入 0.5 毫升 CO 培养基,上下吹打混匀。
然后将细胞转移至15毫升离心管中,加入3毫升培养基,以300 × g离心5分钟。接着弃去上清液,将细胞重悬于200微升预冷的FACS缓冲液中。将细胞转移至1.5毫升离心管中,置于冰上避光保存,直至分析。
进行传真分析之前,需将细胞通过30微米滤器,以防止细胞聚集。然后向细胞中加入碘化丙啶,终浓度为每毫升2微克,孵育至少2分钟,将细胞混匀后转移至流式细胞仪,并将样品管加载到仪器中。用于检测SI3阳性细胞。
使用未经处理的对照细胞,在前向散射(FSC)面积与侧向散射(SSC)面积的散点图上设置层级门控,以及在FSC高度与FSC宽度、SSE高度与SSE宽度的子集中进行门控,以排除细胞碎片和未充分散射的细胞。根据碘化丙啶染色结果,通过展示PE通道与PE Texas Red通道排除死细胞,然后在第三检测位点对PE阳性细胞进行最终分选门控。检测GA脱氢酶。
在 HEK 293 细胞中检测了一个组成型表达的看家基因,以验证实验的可行性。阴性对照纳米颗粒(随机序列)显示极少或几乎无荧光,而永久性荧光阳性摄取组则显示明显荧光。对照组在过夜孵育后显示出强烈的信号。
这些纳米颗粒被证实可特异性检测多能干细胞标志物,即在人和猪的诱导性多能干细胞(IPCs)中,纳米颗粒与GDF3基因表达呈镜像关系。重要的是,这些标志物仅在IPCs中被检测到,而在作为IPS细胞培养过程中饲养层的成纤维细胞中则未检测到。通过流式细胞术进行的视觉和定量分析被用于评估GA DH纳米颗粒(分级版本)在0至1000浓度梯度下的标记效率。
使用HEK 293细胞进行了皮摩尔浓度实验,结果显示荧光强度随浓度增加而明显增强。随后在小鼠胚胎干细胞中进行定量分析,结果显示在加入400皮摩尔浓度的GADH纳米颗粒后,约有40%的细胞呈CY3阳性。多能性标志物也获得了类似的结果。
掌握纳米颗粒和GDF-3技术后,若操作得当,该技术可在16小时内完成。观看本视频后,您应能够充分理解如何利用基因特异性纳米颗粒,通过荧光显微镜直接在活细胞内检测细胞内基因表达。
本手稿描述了一种利用荧光标记的纳米颗粒在活细胞中检测细胞内基因表达的新技术。该方法无需对细胞进行操作即可实现直接观察,因此适用于多种目标基因和物种。
该方法能够在无需固定或处理的情况下,直接可视化活细胞内的基因表达,从而支持在发现工作流程中进行早期靶点验证和机制去风险化。通过荧光显微镜和流式细胞术提供实时、定量的读数,增强了在小鼠、人类和猪模型中评估基因功能的预测可信度。该方法减少了对终点检测和重复培养的依赖,提高了筛选和先导化合物鉴定阶段的效率。
该技术适用于从靶点验证到先导化合物鉴定的整个发现流程,可提供活细胞基因表达数据,为早期决策提供依据。