2015年12月21日
我们展示了一种用于分析花生种子中黄曲霉毒素及转基因表达的方法,这些花生种子含有针对真菌Aspergillus flavus中黄曲霉毒素合成基因的RNA干扰信号。此前尚未见有关通过RNAi在植物中控制霉菌毒素的报道。
本研究的总体目标是提供一种可靠、准确、低成本且快速的方法,用于检测转基因花生中RNAi介导的黄曲霉毒素合成基因沉默效果,该方法仅需使用极少量种子即可完成;通常需要数百克种子才能有效定量样品中的黄曲霉毒素。该技术的主要优势在于,仅需不到五粒种子即可对特定处理进行检测,并且比准备种子提前10天进行。建立黄曲霉毒素阳性菌株黄曲霉Aspergillus flavus NR RL 3 3 5 7的培养物于ZAP Pex螺旋培养基中,在25摄氏度条件下培养该菌种。
它将用于种子接种。在制备表达RNAI的转基因植株后(具体步骤详见文字版实验方案),继续收获其种子。首先,使用调至低压的高压水枪通过冲洗去除果皮,或手动刮除果皮。
去除荚果外层后,将荚果放置在成熟度分级板上,根据中果皮的颜色将其归入相应的组别。随后去除空洞部分,并分别处理黄色和棕色的种子。计算实验所需的种子数量,每份花生品系至少需要三个种子片段,即每个花生品系需准备三个完整的子叶半粒。
在无菌烧杯底部铺上一层种子,然后加入适量的75%乙醇,刚好浸没种子,随后将乙醇体积加倍。让种子在溶液中孵育30秒,然后用灭菌的蒸馏水冲洗干净。
接着,用与F乙醇处理相同体积的2%次氯酸钠处理种子,浸泡5分钟。然后用五倍体积的无菌蒸馏水清洗三次。
为了去除次氯酸盐,此步骤中必须彻底洗去所有次氯酸盐溶液。此时种子已完成表面灭菌。接下来,将种子浸入已灭菌的蒸馏水中浸泡两小时以进行水合,随后将水合后的种子置于无菌培养皿中。
此时应将所有材料进行灭菌处理。使用镊子去除种皮,然后分离胚乳。最后用解剖刀取出胚。
胚胎可被丢弃或用于再生新植株。接下来,用解剖刀将子叶切为两半,并将切好的子叶半片浸入无菌蒸馏水中,直至准备进行接种。随后,用无菌纸巾吸去子叶半片上多余的水分,将种子片段分别放入含有种子大小凹槽的1.5%琼脂平板中,并将种子切面朝上放入凹槽内,以完成对子叶半片的接种。
向切面上加入2 µL浓度为每微升10,000个曲霉孢子的悬浮液。注意勿使悬浮液沿种子半片的侧面流下。最后,将培养皿置于30 °C的黑暗培养箱中培养1至4天,直至进行检测。
在一天后、两天后以及三到四天后,轻轻取样,根据需要随机选取接种过的半粒种子。用纸巾擦去多余的孢子和钻屑,将样品放入玻璃螺口小瓶中。将未接种的样品转移至2毫升离心管中,用于RT-PCR分析。
将游离样品置于液氮中,并将冷冻样品储存在冰箱中,直至进行处理。如需进行黄曲霉毒素分析,取接种后的半片子叶放入4毫升玻璃螺口小瓶中。样品在负80摄氏度条件下可稳定保存数月。
当种子处于室温时,加入四倍体积的甲醇提取样品,并将试管在室温下避光静置过夜,不进行振荡。第二天,首先进行超高效液相色谱(UPLC)分析,准备一个1.5毫升的聚丙烯微型柱,配以匹配的烧结滤片,然后加入200毫克氧化铝。
接着,插入另一个烧结片。下一步,将A-U-P-L-C自动进样瓶置于微型柱下方并与之接触,以尽量减少蒸发。现在,将0.5毫升样品的甲醇提取物加入一次性玻璃试管中,切勿使用塑料管。
然后向试管中加入 0.5 毫升乙腈,并用移液器混合溶液。现在将 0.5 毫升混合液加入已制备好的微型柱中,仅依靠重力收集 EIT。收集完 EIT 后,立即在收集管上安装无菌盖,用于 UPLC 分析。
将小瓶放入已用甲醇-水-乙腈三元流动相预平衡的A-U-P-L-C中,然后定量EITs中的黄曲霉毒素含量。更多细节请参见文本方案及UPLC分析部分。
将用于提取的种子样品分别放入玻璃小瓶中。随后将小瓶冷冻干燥过夜,次日早晨测定组织样品的干重,以便将黄曲霉毒素浓度表示为每克样品中含多少纳克。然后从冷冻箱中取出样品,加入三醇,并使用珠磨匀浆机在 3,100 RPM 条件下研磨冷冻组织 40 秒,随后进行 RNA 提取。实验中采用携带来自黄曲霉的五个黄曲霉毒素合成基因小片段的 RNAi 载体转化花生植株。
这些编号对应于从7个PCR阳性株系中克隆并检测的99个再生转化体的布罗德研究所基因组注释编号。与对照株系相比,所有7个株系的黄曲霉毒素积累量均减少了60%至100%。本文展示了其中2个株系的结果。
这两条RN AI品系显示出含有NPT II型选择性标记。根据S-T-N-P-C-R结果,所用阴性对照为经过转化过程的PCR阴性品系,用于检测RNAi品系抵抗黄曲霉毒素的能力。接种物为新收获的、黄曲霉毒素检测呈阳性的kedia,所用菌株为黄曲霉NRRL 3357,在培养长达96小时后,将其接种于去除胚和种皮的半片cotyledon上。
接种的组织采用超高效液相色谱法(UPLC)检测其黄曲霉毒素含量,方法如前所述。这些结果进一步通过液相色谱-质谱法得到确认。总体而言,与对照组相比,RNAi 2 88 72株系的黄曲霉毒素B2减少了94%至100%,黄曲霉毒素B1减少了90%至100%。
而RNAi 2 88 74则显示出对两种黄曲霉毒素的抑制效果达到60%至100%。按照此方法,可利用相同的种子提取物分析植物抗毒素(phytoxin),以更深入地理解种子对真菌侵染的响应机制。该方法还将为开发RNAi技术以控制霉菌毒素提供一种独特的工具。Oxon。
本研究提出了一种用于分析花生种子中黄曲霉毒素及转基因表达的新方法,该花生种子经过基因工程改造,可针对寄生曲霉(Aspergillus flavus)中黄曲霉毒素合成基因进行RNA干扰(RNAi)。该方法能够有效量化黄曲霉毒素,且所需种子数量显著少于传统方法。
该方法通过使用极少的种子即可进行RNAi效果检测,解决了霉菌毒素防控研究中的一个关键瓶颈问题,克服了传统大规模田间试验的局限性。该方法为早期性状开发阶段的转基因性能评估提供了可扩展、可重复的实验流程,直接支持作物保护研发管线中的决策判断。该技术提高了对基于RNAi的黄曲霉毒素防控策略的预测可靠性,这对于全球食品安全和农业生物技术布局具有重要意义。
该方法适用于从发现到临床前研究的连续过程,支持植物生物技术流程中从早期靶点验证到先导化合物鉴定的各个环节。