2016年2月14日
本文介绍了一种鉴定驱动蛋白-1(Kinesin-1)货物分子的实验方案。驱动蛋白-1重链(KIF5B)的一种无马达功能突变体会在细胞质中形成聚集体,并诱导其货物分子共同聚集。通过荧光显微镜可同时检测到这两类聚集体。该策略同样可用于鉴定其他马达蛋白的货物分子。
本方法的总体目标是利用荧光显微镜鉴定驱动蛋白-1的运输货物。该方法有助于回答分子马达领域中的关键问题,例如驱动蛋白和肌球蛋白所运输的货物有哪些。该技术的主要优势在于,显性负性KIF5B突变体能够帮助我们通过荧光显微镜直观地识别这些货物。
首先,对于在40倍或更低倍数下进行的活细胞或间接荧光成像,每孔加入一毫升完全培养基,其中接种0.2至0.3百万个HeLa细胞于六孔板中。将细胞置于37摄氏度、5%二氧化碳条件下培养。对于放大倍数高于40倍的间接免疫荧光研究,需在生物安全柜中操作以避免污染,使用纯酒精清洗盖玻片,并将其竖直放置于六孔板的孔中,待其自然晾干。
盖玻片干燥后,将其放入孔板的各孔中,每孔加入一毫升完全DMEM培养基,接种0.2至0.3×10⁶个细胞。培养细胞过夜。次日,在生物安全柜内,用0.1毫升转染培养基稀释0.6微克tdTomato标记的野生型或无马达结构域的KIF5B表达质粒,可单独使用,也可与表达候选货物蛋白的质粒共同使用。
在另一个1.6毫升微量离心管中,加入1.8微升转染试剂至0.1毫升转染培养基中。然后在室温下孵育5分钟。接着,将0.1毫升稀释后的转染试剂加入稀释的DNA样品中。
将离心管颠倒混匀内容物,并离心5秒。然后在室温下孵育样品45分钟。在转染复合物形成的孵育期间,使用PBS洗涤细胞三次。
然后向每个孔中加入 0.8 mL 预热的转染培养基,并将培养板放回培养箱。稀释后的转染试剂孵育 45 分钟后,将 0.2 mL 溶液逐滴加入培养板的每孔中。轻轻摇动六孔板 5 秒钟,然后将其放回 37 °C 培养箱中孵育 6 至 8 小时。
然后用完全DMEM替换培养基。在额外培养16小时后进行活细胞成像,将DNA嵌入染料Hoechst 33342加入培养基中,使其终浓度为1 µM,并将细胞在37°C下孵育10分钟。随后,使用40倍物镜观察细胞中荧光蛋白的表达情况。
对经转染试剂孵育的细胞进行间接免疫荧光实验的操作步骤如下:根据文本方案配制好甲醛溶液后,使用室温的磷酸盐缓冲液(PBS),通过轻轻晃动六孔板五秒钟来洗涤细胞。每孔加入一毫升新鲜配制的4%多聚甲醛PBS溶液,在室温下固定30分钟。随后用PBS晃动洗涤细胞一次,并弃去溶液。
接着,向每个孔中加入1毫升含0.1% Triton-X 100的PBS溶液,在室温下孵育30分钟以通透细胞。然后用PBS洗涤细胞四次,每次弃去上清液。加入一抗,室温下振荡孵育4小时。
孵育结束后,用 PBS 轻轻晃动培养板,洗涤细胞四次。然后加入一毫升荧光染料标记的二抗,在室温下避光振荡孵育两小时。用 PBS 将细胞洗涤四次后,加入一毫升 DAPI,在室温下避光孵育十分钟。
若使用盖玻片处理样本,取10微升封片液滴加在载玻片中央,将盖玻片覆盖于封片液上。然后在室温下避光孵育过夜。次日,用指甲油密封盖玻片边缘,并在通风橱中避光孵育过夜。
进行荧光显微镜观察时,使用40倍物镜,并根据需要配备DAPI、CFP、FITC和Cy3的滤光片组。如本实验所示,外源表达的野生型KIF5B在细胞质中均匀分布,而c-MYC主要定位于细胞核内。然而,无马达结构域的KIF5B突变体在细胞质中形成聚集体,并导致c-MYC发生共聚集。
此外,无马达功能的KIF5B也能诱导内源性c-MYC和转录因子p53的聚集,表明c-MYC和p53均为驱动蛋白-1的货物蛋白,且KIF5B可调控这两种内源蛋白的亚细胞定位。该图显示,KIF5B介导的转录因子转运具有特异性,因为表达无马达功能的KIF5B突变体并未影响c-Fos的亚细胞定位,也不会导致其聚集。这些数据表明,本视频所展示的方法能够高特异性地鉴定驱动蛋白-1的货物蛋白。
在进行该实验操作时,需要注意,驱动蛋白最适合用于细胞质体积较大的细胞,以便于观察细胞质中的聚集现象。该技术的发展为分子马达领域的研究人员提供了途径,使其能够构建其他驱动蛋白和肌球蛋白的类似显性负性突变体,从而鉴定它们各自特异的运输货物。观看本视频后,您应能够很好地掌握如何利用分子马达的显性负性突变体,结合荧光显微镜技术,来鉴定其运输货物。
请注意,苯酚、溴化乙锭和多聚甲醛的操作具有极高危险性,在进行本实验时,务必采取预防措施,避免皮肤直接接触这些物质。感谢观看,祝您的实验顺利成功。
本文介绍了一种利用荧光显微镜鉴定驱动蛋白-1(Kinesin-1)货物的实验方案。该方法利用驱动蛋白-1重链(KIF5B)的无马达功能突变体,观察细胞质中货物的聚集现象。
利用荧光显微镜直接鉴定驱动蛋白-1的货物,可通过实现细胞内运输机制的功能性靶点验证,解决早期发现中的关键挑战。该方法提高了通路归属的预测可信度,并支持在发现项目组合中对分子马达靶点进行基于风险的分类筛选。该方法在货物鉴定方面的特异性,为马达蛋白研究的机制性去风险化和转化连续性提供了依据。
这种荧光显微镜方法在早期发现和靶点验证阶段进行整合,当货物特异性在机制上与疾病通路相关时,可支持先导化合物的鉴定和临床前研究。