2016年3月8日
RNA干扰(RNAi)是揭示基因功能的极为重要的工具。然而,在主要的人类疟疾传播媒介冈比亚按蚊(Anopheles gambiae)中,利用RNAi在成虫前阶段靶向基因的能力受到限制。本文描述了一种通过在蛹期发育阶段直接注射实现基因功能下调的RNAi实验方案。
本方法的总体目标是向冈比亚按蚊递送RNA干扰触发因子,以启动在蛹期发育阶段开始的基因敲低。该方法有助于回答媒介生物学领域的关键问题,并揭示在未成年期或成虫早期发育阶段发挥作用的基因。该技术的主要优势在于,它为研究人员提供了开展快速功能基因组学研究的机会,能够在发育阶段(即以往尚未建立RNA干扰注射方案的蛹期)开始基因敲低。
该方法的可视化演示至关重要,因为注射步骤需要极高的精确度,且蛹在这一发育阶段十分脆弱,操作难以掌握。在选定目标基因后,需确定一段200至800个碱基对的区域,该区域应预测无脱靶效应,并通过标准PCR扩增获得两侧带有T7启动子序列的双链RNA合成模板。随后,利用商业化的体外试剂盒合成双链RNA,并纯化产物。
将最终RNA浓度调整至每微升3微克。接着,使用标准的2%琼脂糖凝胶,将0.5微升双链RNA与模板DNA及标准分子量标记物进行比较。电泳完成后,检测双链RNA条带的质量和长度。
不应出现可见的非特异性产物。双链RNA的迁移速度将慢于模板DNA。储存时,将双链RNA分装成 aliquots,并于-20摄氏度保存。
首先配制快绿 FCF 染料。将染料用无 RNase 水稀释至 0.1%(体积分数)。然后,取 1 微升该溶液加入 1.5 毫升微量离心管中。
将装有样品的管子在 65 摄氏度下加热约三小时,以蒸发水分。然后在使用染料固体前,将管子冷却至少 30 分钟。接下来,用硼硅酸盐玻璃管制备拉制玻璃注射针。
将拉针仪的针尖直径设置为10至30微米。对于NARISHIGE拉针仪,将第一加热器设为100,第二加热器设为70。然后将毛细管针固定在夹具中,开始拉制。
现在,准备注射工作站。选择一个可轻松在显微镜下移动的平台。在平台上,首先用胶带固定一张厚滤纸。
然后,在厚滤纸上用胶带固定一张薄滤纸。接着,向染料固体管中分别加入 10 微升待注射的双链 RNA,并重新悬浮染料。将这些管子置于冰上保存。
现在,收集待注射的蛹。用10毫升去离子水填充一个60毫米的培养皿,并使用塑料移液管将约50只浅色蛹转移至培养皿中。仅使用色素较浅的蛹,因为已经到达中等至深色鞣化程度的蛹会出现表皮损伤,且存活率较低。
显微注射的第一步是打开针头。在显微镜下,使用精细镊子折断针头最远端的尖端。然后使用30号针头和注射器将矿物油反向填充至针头中。
填充后,使用显微注射器排出多余油液。将显微注射器设置为抽取69纳升体积。随后,用制备好的注射用RNA从前端填充针头。
测试双链RNA的点样是否存在异常。针尖堵塞和针头固定不牢是导致问题的主要原因。注射装置准备就绪后,选取一至三只蛹,转移至滤纸载物台上。
使用画笔将蛹调整至背侧表皮可接触的位置。通过按压纸张,吸收蛹体表面多余的水分。用湿润的画笔固定蛹体使其保持静止,同时从前往后以约30度角将针头插入腹部与胸部之间的背侧表皮。
然后,向血淋巴中注射一到两脉冲的双链RNA。如果注射成功,可见染料在体内广泛扩散。注射蛹时,关键是要确保针头仅穿刺背侧表皮。
如果针头穿刺穿透了腹侧表皮,则可在蛹体外部观察到染料标记液体的积聚,或染料会转移到滤纸上。出现此类情况时,必须弃用该蛹。如果染料未在血淋巴中扩散分布,则最可能的原因是针尖被堵塞。
轻微移动针尖,判断是否有RNA和染料释放。若无染料释放迹象,则弃去该蛹。随后评估针尖状态,并在新的蛹上进行下一次注射。
成功注射蛹后,使用湿润的画笔将其轻轻从针头上取下,并移入盛有水的培养皿中,使其完成后续发育。将注射后的蛹置于蚊笼或容器内的培养皿中,在正常饲养条件下培养。成虫食物来源可提供浸泡在棉球中的10%(质量/体积)葡萄糖溶液。
成虫羽化后,将其与对照组进行比较。例如,应每天评估双链SRPN2昆虫的假性肿瘤形成情况。为此,将成虫在零下20摄氏度下冷藏两到三分钟,然后转移至2摄氏度的冷板上进行观察。
观察成虫后,将其放回昆虫饲养室的饲养区域。掌握注射技术后,注射过的蛹羽化频率约为70%。在部分注射过的蛹中,出现了从蛹壳部分羽化的现象,导致蚊虫无法存活。注射组与未注射组蚊虫的羽化时间无延迟差异,且注射的影响不因性别而异。
羽化后十天,与未注射对照组相比,注射蚊虫的存活率未见显著变化。丝氨酸蛋白酶抑制剂SRPN2作为阳性对照,双链LacZ作为双链RNA注射的阴性对照。羽化后三天,通过光学显微镜可观察到注射双链SRPN2成虫体内出现假性肿瘤。
注射八天后,假性肿瘤非常明显。在成虫期蚊子中,大多数注射双链SRPN2的个体通过表皮即可观察到黑色素性假性肿瘤,而对照组则未观察到任何假性肿瘤。注射后第五天,与注射双链LacZ的对照组及未注射对照组相比,注射双链SRPN2蚊子体内的SRPN2蛋白水平显著降低。
观看本视频后,您应能够充分掌握如何利用这种新开发的注射方案,将RNA干扰触发物递送至冈比亚按蚊蛹体内。通常,初次接触该方法的研究人员会因蚊蛹不可预测的移动而遇到困难。然而,通过练习正确地定位和稳定蚊蛹,可显著提高注射成功率及注射质量。
掌握该技术后,每只蛹的注射操作约需30秒。随着该技术的建立,我们为媒介生物学领域的研究人员探索和评估冈比亚按蚊(Anopheles gambiae)在未成年期及成虫早期发育阶段的基因功能铺平了道路。在完成该操作后,可进一步采用蛋白质印迹分析(Western blot analysis)或定量PCR等方法,分别检测目标基因在蛋白或转录水平上的敲低程度。
最终,该技术可帮助鉴定对蚊媒寄生虫传播至关重要的基因,这一方法将有助于我们发现新的靶点,并为开发更有效的病媒控制策略提供新的见解。
本文介绍了一种在冈比亚按蚊发育的蛹期递送RNA干扰(RNAi)触发物的方法。该技术旨在促进基因敲低,从而有助于阐明媒介生物学中的基因功能。
该方法通过在冈比亚按蚊的蛹期启动RNAi,实现了对其功能基因组学的研究,而蛹期此前因无法进行基于注射的基因沉默而难以触及。该方法支持媒介生物学中的靶点验证,能够评估在前成虫期和成虫早期表达的基因,这些基因可能影响寄生虫的传播能力和媒介效能。该策略通过黑色素样假性肿瘤形成等表型读数,为疟疾防控策略中新型靶点的筛选提供了一种基于机制的风险降低工具。
该方法通过在临床前疾病模型中实现早期基因功能评估,契合了从靶点假设到先导物识别的发现全过程。