2016年2月19日
本文描述了在整只斑马鱼胚胎中对磷酸化表位进行免疫染色的技术,并进一步在小至初级纤毛的细胞结构中进行双色荧光共聚焦定位。这些固定和成像技术可用于确定特定蛋白质出现或激活的位置及其动力学特征。
本实验的总体目标是在斑马鱼胚胎中进行蛋白质的免疫定位,特别是那些被激活的蛋白质。该方法有助于回答发育生物学和细胞生物学领域中的关键问题,例如磷酸化蛋白质在整个胚胎中的定位与激活情况。该技术的主要优势在于,可通过免疫染色被钙离子激活的蛋白质,从而在整个胚胎水平上定位钙依赖性信号通路。
根据文本方案获得野生型或转基因胚胎后,向养殖用水中的胚胎加入0.003% PTU以抑制色素形成,并孵育至所需发育阶段。当胚胎达到正确阶段时,向培养皿中加入MESAB以麻醉鱼类。待鱼类完全麻醉后,尽可能移除养殖用水,然后加入新鲜的4% PFA和PBS,在室温下孵育三至四小时。
孵育后,去除PFA,加入100%甲醇进行替换。然后将胚胎置于-20°C条件下保存至少48小时。进行免疫染色时,将每种实验条件下不少于10个胚胎放入已标记的1.5毫升微量离心管中。
当胚胎沉降至管底后,移除并弃去甲醇,使用PBTx中浓度递减的乙醇进行逐步洗涤,以重新水化胚胎。移去最后一次PBTx洗涤液,加入0.5毫升含10%正常山羊血清(NGS)的PBTx溶液。然后在室温下轻轻振荡孵育至少一小时。
接下来,移除溶液,加入 0.2 至 0.5 毫升鼠抗乙酰化微管蛋白单克隆抗体(1:5 稀释液)、10% NGS 和 PBTx。将胚胎在室温下轻轻振荡孵育过夜。次日早晨,移除并弃去抗体溶液,用 0.5 毫升含 10% NGS 的 PBTx 溶液轻轻振荡洗涤三次,每次五分钟。
调暗室内灯光,在每份样品中加入500微升含10% NGS和PBTx的荧光标记二抗工作液(1:500稀释),于室温避光孵育,轻柔振荡四小时。孵育结束后,将胚胎洗涤三次。
进行共免疫染色时,加入1:20稀释的抗磷酸化CaMKII抗体。在避光条件下轻轻振荡孵育过夜。次日早晨,用2% NGS和PBTx洗涤胚胎三次后,加入1:5稀释的红色568荧光标记的山羊抗兔IgG抗体以及10% NGS和PBTx。
在室温避光条件下孵育四小时后,用PBTx或含50%甘油的PBS缓冲液洗涤胚胎三次,具体选择取决于成像方法。为进行成像,取一至五个胚胎置于载玻片上,于胚胎两侧各放置四个叠起的1号盖玻片碎片,以形成观察腔室。
盖上盖玻片。使用100倍油镜和透射光将单个胚胎调至焦点。关闭光源。
打开共聚焦显微镜并启动相应的激光器,启用远程对焦功能。启动共聚焦成像程序,在采集工具栏中选择合适的物镜。然后在XY基础工具栏中,点击1024按钮以设置图像尺寸。
在激光器和检测器栏中,单击红色的 488 和绿色的 568 框以打开每个通道的激光检测器,并将针孔设置为中等。然后,在增益栏中,调节每个通道的增益以实现可视化。接下来,在采集设置栏中,单击实时按钮以开始采集图像。
在视图设置栏中,取消勾选“强制整数缩放”框,以在实时窗口中居中显示。在采集设置栏的 Z 选项卡下,逐层扫描图像。选择要纳入图像的层数后,移动至 Z 平面中心的某个位置。
在 Z 选项卡下,单击红色的小参考框。这将使射频消融仪(RFA)在选定的中心点处归零。在标有步进尺寸的框中,选择切片层的厚度。
请注意文件大小框,并尽量将文件限制在1吉字节以内。要找到图像的最顶端,点击“顶部”旁边的圆圈,并逐层移动Z轴层面。然后点击“底部”旁边的圆圈,计算机会将图像返回至中心层面。
然后,在采集设置框中,再次点击“live”以停止激光采集。在此面板中,点击标记为“average”和“Z stack”的红色方框,这些方框将变为绿色。
在采集设置框中,点击“单次”以采集整组图像。在系统对两个通道及整个Z轴层叠进行扫描时,实时监控其进度。保存时,点击体积窗口,选择“另存为”,并为文件命名。
要对文件进行体渲染,在Z轴堆栈仍处于打开状态时,选择数据下拉菜单并点击体渲染。将渲染后的文件保存为.tif格式。该图显示了斑马鱼库普弗氏泡(Kuppfer's vesicle,简称KV)中P-CaMKII和乙酰化微管蛋白的免疫染色结果,其中乙酰化微管蛋白是纤毛的标准标记物。初级纤毛通过摆动产生环形液体流动,从而引起KV腔内纤毛细胞中钙离子水平升高,并在此处观察到CaMKII在特定位置被激活。
这些图像显示了受精后24至72小时(HPF)期间,P-CaMKII在围绕肾周管特定区域的纤毛细胞顶面的分布情况。在发育第1天,用PFA和甲醇固定的斑马鱼胚胎耳囊能够保持其结构完整性,并可在动纤毛的基部及其全长上检测到CaMKII染色信号。在72 HPF时,内耳组织使用Alexa 488标记的鬼笔环肽和Alexa 568标记的抗乙酰化微管蛋白抗体进行复染。
PFA-甲醇固定法可同时保存F-actin和微管蛋白。该30 HPF鱼体表达一种膜定位的GFP,若采用甲醇固定则会导致GFP信号丢失。与PFA联合甲醇固定相比,单独使用PFA固定导致P-CaMKII信号减弱。
然而,在此发育阶段,信号已足够强,无需甲醇即可检测。一旦掌握,若操作得当,该技术可在两天内完成。进行此实验时,务必注意使用新鲜的胚胎和新鲜的游离剂。
观看本视频后,您应能充分掌握如何在斑马鱼胚胎中定位磷酸化蛋白。
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本文介绍了在整只斑马鱼胚胎中进行磷酸化表位免疫染色以及双色荧光共聚焦定位的技术。这些方法可用于确定特定蛋白质在细胞结构(如初级纤毛)中的定位与动力学特征。
对整只斑马鱼胚胎进行磷酸化表位免疫染色,可直接可视化纤毛器官中信号动态,有助于验证发育通路中的靶点。该方法通过将翻译后修饰与脊椎动物模型中的表型结果关联,提供机制层面的风险降低。通过定位活化蛋白(如磷酸化CaMKII)在Kupffer’s Vesicle、肾脏和内耳等结构中的分布,该技术增强了早期发现阶段的预测可信度。
该方法通过提供脊椎动物组织中空间分辨的激活数据,适用于从靶点假设验证到先导化合物鉴定的整个发现过程。