2016年10月19日
非洲锥虫培养 体外 以较低速率发生抗原变异,导致群体由表达一种主导型变异表面糖蛋白(VSG)的寄生虫和少量“转换”变异体组成。本方案描述了一种快速检测和定量这些群体的方法。
本方法的总体目标是从整个种群中分离出表达特定变异表面糖蛋白(VSG)的锥虫,并鉴定出那些已从起始优势VSG转换为其他任何VSG的寄生虫。该方法有助于解答锥虫生物学中的关键问题,例如:哪些因素或事件会影响寄生虫种群中VSG的转换。该技术的主要优势在于,它比以往发表的方法更快,并且能够简便地对发生转换与未发生转换的细胞进行定量分析。
当实验室最初开始研究抗原变异时,第一个问题是如何检测稀有的变异细胞。这类问题实际上在多年前的免疫学研究中已经得到解决,即通过磁激活细胞分选技术来富集不具有特定性状的细胞。将这种非选择性方法应用于抗原变异研究,似乎是一个极具前景的思路。
首先,将 List 427 株血液锥虫培养至每毫升 0.5 至 100,000 个的密度。取 50 × 10⁶ 个细胞分装至 15 毫升离心管中,随后离心。保留 1 × 10⁶ 个细胞进行培养,用于后续作为阳性和阴性抗体对照。
用移液器吸除大部分上清液,管中残留约 750 µL。将细胞转移至 1.5 mL 离心管中。最后,在 4 °C 条件下以 2800 ×g 离心 4 分钟。
然后用移液器吸除所有上清液。将细胞重悬于150微升培养基中,并加入适当稀释倍数的初级抗变异表面糖蛋白抗体或抗VSG抗体。接着,在4摄氏度下涡旋振荡细胞10分钟。
用800至1000微升冷的培养基洗涤细胞。在4摄氏度下以5200 × g离心4分钟。吸除上清液后,用1毫升培养基重悬细胞并再次离心。
吸去上清液,将沉淀重悬于 100 µL 培养基中。加入 110 µL 针对一抗类型的合适磁珠激活细胞分选微珠。用移液器反复吹打混匀,然后涡旋振荡。
细胞涡旋的同时,设置磁性激活分离柱。在分离柱下方放置一个15毫升离心管,用于收集预冲洗培养基。加入2毫升培养基以预冲洗分离柱。
接下来,从涡旋振荡器上取下样品,加入 800 至 1000 微升冷的培养基。离心样品,然后弃去上清液以去除未结合的抗体。用一毫升培养基重悬细胞沉淀,并再次离心。
此次吸走上清液时,需在离心管中留下 100 微升。用力振荡离心管,直至沉淀完全重悬。加入 1 毫升培养基,上下吹打以充分重悬细胞。
取下用于收集预处理缓冲液的15毫米离心管,更换为新的15毫升离心管,用于收集含有转化后寄生虫的流穿液。将细胞悬液加入已预处理的层析柱中。用柱下放置的15毫升离心管收集流穿液,通常每1毫升培养基加锥虫悬液需要6至7分钟完成流穿。
接下来,用一毫升培养基将柱子洗涤两次,并将流出液收集到同一离心管中。将总体积约为三毫升的流出液均分至两个1.5毫升微量离心管中。然后将离心管置于冰上。
向柱中加入三毫升培养基,并将柱子插入一个15毫升离心管中。此步骤可获得表达起始显性VSG的细胞。取300微升此洗脱液并置于冰上保存,其余部分可弃去。
为建立阳性对照,从起始细胞培养物中取约 100,000 个细胞,用移液器转移至 1.5 毫升微量离心管中。同样操作制备阴性对照。对流穿样品和阳性对照样品进行离心。
然后移除并弃去上清液。将阳性对照细胞重悬于100 µL含适当稀释度的荧光标记抗VSG一抗的培养基中。接着,将一份流穿组分的沉淀重悬于100 µL含适当稀释度的荧光标记抗VSG一抗的培养基中。
用该悬液重悬第二个流穿管中的沉淀,得到一个混合管。用移液器反复吹打充分混匀。涡旋振荡细胞,然后加入 800 至 1000 微升冷培养基。
将样品在 4 摄氏度、5200 ×g 条件下离心 4 分钟,然后弃去上清液以去除未结合的抗体。用 1 毫升培养基洗涤细胞,随后再次离心细胞。阳性对照、阴性对照以及先前置于冰上保存的洗脱细胞。
弃去上清液。随后,向样品中加入148.5 µL培养基。接着,加入25 µL绝对计数微球,再加入1.5 µL碘化丙啶染色液。
用175微升培养基重悬阳性对照和阴性对照沉淀。现在可将样品上样至流式细胞仪进行检测。这些流式细胞术图显示了在诱导产生双链DNA断裂的锥虫群体与未诱导细胞群体中细胞分选的结果。
左侧图显示前向散射与侧向散射,可用于区分样本中添加的活细胞、死细胞以及微球。随后可根据散射特性设置门控,以确定这些细胞群体。右侧图仅显示根据左侧图所设散射门控被分类为活细胞的细胞。
在此情况下,起始的优势VSG为VSG two。对碘化丙啶染色呈阳性的细胞为死细胞,这些细胞出现在图中Q one和Q two区域。
对优势VSG染色呈阳性而对PI染色呈阴性的细胞位于第三象限(Q3),属于污染细胞。最后,位于第四象限(Q4)的细胞为活细胞,其对优势VSG染色呈阴性,被视为发生VSG转换的细胞。该图显示了在有或无诱导断裂条件下,锥虫群体中计算得到的观察到的VSG转换频率。
体外随机转换的水平相对较低。尽管诱导断裂会导致显著更多的细胞转换为非优势VSG。一旦掌握,该技术可在约三小时内完成。
在进行该实验操作时,全程保持样品低温并充分重悬沉淀物(尤其是在柱上分离前)至关重要。完成该步骤后,可采用其他方法如RNA测序来进一步探究更多问题,例如在转换群体中表达的是哪些VSG。该方法通常用于检测VSG转换,也可用于分离和定量表达任何目标表面蛋白的寄生虫。
查看完整文字稿并访问数千部科学视频
本方案概述了一种快速分离表达特定变异表面糖蛋白(VSGs)的非洲锥虫并鉴定群体中发生VSG转换的变异株的方法。该技术可提高对稀有转换事件的检测能力,有助于研究这些寄生虫的抗原变异机制。
检测病原体群体中的稀有抗原变异体对于理解免疫逃逸机制并指导治疗策略至关重要。该方法可实现对锥虫群体中变异表面糖蛋白转换子的快速定量,支持抗寄生虫药物发现中的靶点去风险化。该方案为监测与临床前靶点验证相关的表型转换提供了可扩展、可重复的工作流程。
该方法通过提供靶点调节和耐药性出现的表型读出,契合从靶点验证到先导化合物优化的发现连续过程。