亚纳米级分辨率成像与调幅原子力显微镜在液体
December 20th, 2016
我们提出了以振幅调制（轻敲模式）在液体原子力显微镜实现亚纳米分辨率的图像的方法。该方法被证明在商业原子力显微镜。我们解释的理由背后我们的参数选择，并提出解决的优化策略。
该程序的总体目标是在液体中实现尽可能高的分辨率成像，使用商用 AFM作和振幅调制，也称为轻敲模式。这种方法通过使用高分辨率的最佳参数组合，有助于突破液体中标准 AFM作的极限。该技术的主要优点是它可以与大多数商用 AFM 一起使用，因此它不需要任何专业设备。
这里介绍的方法针对的是已经具备一些 AFM 基础知识，但希望从该技术中获得更多收益的科学家和技术人员。该方法不针对任何特定类型的样品，可广泛应用于物理、生物学、化学、材料和服务科学的样品。一般来说，刚接触这项技术的人会很挣扎，因为它需要一些耐心才能找到给定样本的最佳参数。
在超纯水中对仪器和支撑基质的圆盘进行超声处理。然后是异丙醇，然后是超纯水，每次 10 分钟。当以高分辨率为目标时，任何污染都可能产生有害后果。
始终戴上手套，并确保彻底清洁与样品、悬臂或 AFM 池接触的任何表面或仪器。超声处理后，在氮气流下干燥每台仪器和样品盘。使用钢盘作为云母的载体，对单个吸收的金属离子进行成像。
依次用浸泡在超纯水、异丙醇和超纯水中的单层低绒纸巾擦拭无法通过超声处理清洁的表面，对这些表面进行物理清洁。让表面在空气中干燥长达 30 分钟。接下来，通过充分混合试剂来制备少量环氧树脂胶，并将约 10 微升环氧树脂放在干净的钢制样品盘上。
将云母基板放在环氧树脂上，然后通过对基板施加压力将其固定在钢盘上。根据制造商的规格，让环氧树脂在高温下固化数小时。然后，将一块 2.5 厘米宽的胶带用力压在基材上，使整个面部被覆盖，并顺利剥离顶层。
重复此过程 2 到 3 次，直到云母对眼睛来说是镜面光滑的。将悬臂芯片浸入异丙醇浴中，然后浸入超纯水中，每次浸泡 60 分钟。然后，将尖端暴露在紫外线下长达 5 分钟，以促进形成稳定的水合作用部位。
较长的过度曝光时间可能会损坏尖端或增加其曲率半径。将悬臂插入 AFM 的悬臂支架，然后将 25 微升成像液体移液到悬臂和尖端以预润湿表面。这将减少接近样品时气泡的出现。
将样品盘和基底熔化到样品台上，并向样品中加入一滴成像液。然后将悬臂支架连接到 AFM。将悬臂和样品靠近，以便在悬臂尖端上的液体和样品上的液体之间形成毛细管桥。
使用 AFM 软件将测量激光对准悬臂尖端。接下来，从悬臂的热谱中的主峰找到悬臂的驻留频率。如果校准了悬臂的挠度，则使用简单的谐振子模型拟合驻留峰值，可得到悬臂的弹簧常数。
然后，通过找到悬臂在接近热谱中确定的谐振频率的频率范围内进行外部驱动时的振幅响应来调整悬臂。调整驱动振幅，使自由振荡振幅约为 5 纳米。这通常对应于大多数 AFM 上的 0.2-0.8 伏特。
然后，将振幅设定点调整到自由振幅的 80% 左右。接下来，将 feedback gains 设置得相对较高。确保没有出现不稳定或振铃后，将初始扫描速率设置为大约 1 赫兹，并将扫描大小设置为 10 纳米。
使用 AFM 控制软件启动针尖接近表面。通过稍微改变设定点值来评估尖端是否已到达表面而不开始成像。如果尖端位于表面，则对 ZPA 区扩展的影响应该可以忽略
不计。尖端到达表面后，缩回 ZPA 区域并重新调整悬臂。由于针尖采样的相互作用，谐振频率可能已经转移到较低的值。现在，将设定点更改为新调谐自由振幅的 80% 左右，并接合悬臂，以调幅模式对表面进行 10 x 10 纳米平方的扫描，以验证成像参数是否合适。
检查 trace 和 retrace 配置文件是否叠加。如果没有，请进一步降低设定点，并尝试增加增益。如果图像变得杂色，请降低增益。
如果可能的话，对样品的 1 到 5 平方微米的大区域重复该作。对于软样品或生物样品，这可能会导致吸头污染。将扫描大小减小到适合可视化感兴趣特征的值。
这可以低至 20 x 20 纳米。接下来，减小悬臂的驱动振幅，使反馈回路自动缩回 ZPA 区域，从表面增强尖端。当悬臂远离表面时，调整驱动振幅，使悬臂振幅为 1 到 2 纳米峰到峰。
以小步骤逐渐降低设定点，直到 ZPA 区域再次向表面延伸，并恢复原始图像。将设定点振幅保持在新自由振幅的 75% 和 95% 之间。然后，重新调整增益，因为可以在较低的幅度下使用较高的增益，而不会引入明显的噪声。
优化系统以找到自由幅度、设定点和增益的最佳组合，以实现高分辨率。最佳系统条件取决于样品、液体的润湿特性以及所使用的悬臂。对于亲溶剂界面，使用弹簧常数为每米 0.5 到 2 牛顿的悬臂。
使用这种技术，可以在广泛的样品中获得亚纳米分辨率的图像。此处显示的软样品包括脂质双层、盐酸杆菌的紫色膜、两亲性二分子的自组装单层和牛晶状体膜的水通道蛋白晶体。在每种情况下，都会突出显示感兴趣的特征。
小振荡幅度和高设定点最大限度地减少了探针对样品施加的力，从而允许双层中脂质、天然生物膜中的蛋白质和两亲性分子的脆弱自组装在溶液中成像而不会损坏。较硬的晶体材料，如方解石、钛酸锶、碳化硅和云母表面吸收的单金属离子，都可以使用这种方法进行成像，因为在每种情况下，有效成像的是界面液体，而不是晶体本身。一旦掌握，这项技术几乎每次正确执行时都能在液体中提供分子或原子水平的分辨率。
在尝试此过程时，重要的是要记住这是正在成像的界面液体。这意味着使用柔和成像条件。针尖、样品或液体的污染通常是无法实现高分辨率的主要原因。
如果有任何疑问，最好清洁与液体接触的所有表面，并重复使用成像解决方案。外部噪声也不利于高分辨率。远离通风管道的低振动地板更好。
看完这个视频后，您应该对如何优化成像参数以实现高分辨率 AFM 有很好的了解。当然，对于任何尖端技术，可能需要多次试验才能弄清楚如何对样品进行最佳成像，因此耐心是关键。
概述
本文介绍了一种使用振幅调制原子力显微镜（AFM）在液体中实现亚纳米分辨率成像的方法。该技术适用于各种商用AFM，并强调了优化成像参数以获得高分辨率结果。
关键研究组成部分
科学领域
- 神经科学
- 生物学
- 成像技术
背景
- 原子力显微镜（AFM）是一种在纳米尺度进行成像的强大工具。
- 在液体环境中操作对分辨率提出了独特的挑战。
- 参数优化对于获得高分辨率图像至关重要。
- 这种方法在各种科学学科中广泛适用。
研究目的
- 提高液体中AFM成像的分辨率。
- 提供可用于标准商用AFM的协议。
- 协助研究人员优化其成像技术。
使用的方法
- 准备AFM仪器和样品以最小化污染。
- 校准弹簧片和调整成像参数。
- 使用振幅调制模式进行成像。
- 通过正向和反向轮廓分析评估成像质量。
主要结果
- 成功展示了亚纳米分辨率成像。
- 确定了各种样品类型的最佳参数。
- 建立了一个可靠的液体中AFM操作协议。
- 为研究人员提供指导以获得高质量的成像结果。
结论
- 该方法显著提高了液体中AFM的成像分辨率。
- 它对具有基础AFM知识的研究人员来说是可行的。
- 进一步优化可以导致各学科更好的成像结果。
常见问题
Executive Industry Relevance
Sub-nanometer resolution imaging in liquid using amplitude-modulation AFM enables precise characterization of biomolecular interfaces and soft materials under near-physiological conditions. This capability supports target validation by revealing structural details of membrane proteins, lipid assemblies, and molecular interactions critical for mechanistic de-risking in early discovery. The method’s compatibility with commercial AFM systems enhances accessibility for R&D labs seeking high-confidence, label-free imaging without specialized infrastructure.
Strategic Applications in Biopharma R&D
Early Discovery & Target Validation
- Scientific Value: Enables interrogation of therapeutic hypotheses by resolving molecular-scale features of biomembranes and protein complexes in liquid.
- Operational Value: Supports biological de-risking through direct visualization of target engagement and conformational states without fixation or labeling.
Screening & Assay Development
- Scientific Value: Prepares validated biological systems such as lipid bilayers and membrane proteins for downstream screening by confirming structural integrity in solution.
- Operational Value: Enhances assay standardization and reproducibility through controlled tip-sample interactions and optimized imaging parameters.
Translational & Preclinical Research
- Scientific Value: Facilitates translational biomarker alignment by imaging native biomolecular assemblies under physiologically relevant conditions.
- Operational Value: Enables continuity from discovery to preclinical validation by providing consistent, high-resolution structural data across sample types.
Pipeline & Workflow Integration
The method integrates into early discovery workflows by providing label-free, high-resolution imaging of biomolecular targets in liquid, supporting hypothesis testing and pathway clarification before lead identification.
- Discovery Biology: Supports hypothesis testing and biological de-risking by enabling direct observation of membrane protein dynamics and lipid bilayer integrity in solution.
- Screening: Enhances assay readiness through reproducible imaging of soft samples such as lipid bilayers and self-assembled monolayers under controlled liquid conditions.
- Analytics: Generates quantitative topographical and mechanical readouts via trace-retrace profile superposition and amplitude set-point optimization, enabling condition comparison.
- Translational Research: Connects to preclinical continuity by imaging disease-relevant biomembranes and protein assemblies in near-native states.
- Enterprise Reuse: Establishes a reusable imaging capability across projects due to compatibility with commercial AFM systems and broad sample applicability.
Operational & Enterprise Impact
- Scientific Value: Predictive confidence through sub-nanometer resolution imaging of fragile biomolecular assemblies without perturbing native structure.
- Operational Value: Standardization and reproducibility via optimized cantilever tuning, amplitude set-point control, and gain adjustment protocols.
- Strategic Value: Improved go/no-go decisions by reducing mechanistic ambiguity in target validation through direct structural observation.
- Portfolio Impact: Risk-adjusted prioritization enabled by high-confidence imaging data on target conformation and interaction interfaces.
Implementation Considerations
- Requires expertise in AFM operation, cantilever calibration, and liquid-cell imaging.
- Depends on access to commercial AFM systems with amplitude-modulation capability and vibration isolation.
- Necessitates cross-team standardization of cleaning protocols, sample preparation, and parameter optimization.
- Involves adaptation considerations for varying sample wettability, cantilever spring constant (0.5–2 N/m recommended for solvophilic interfaces), and liquid properties.
- Practical limitations include sensitivity to tip/sample contamination and external noise, which can degrade resolution if not rigorously controlled.
Biopharma FAQs
Chapters in this video
0:05
Title
0:59
Equipment and Substrate Preparation
2:39
Cantilever and Tip Preparation
3:22
Set-up of AFM Cell and Cantilever Calibration
4:27
Approach and Initial Check of the Sample
6:31
High-resolution Imaging
8:09
Results: Sub-nanometer Resolution Imaging of Soft and Stiff Samples
9:18
Conclusion
