2018年3月20日
本文介绍一种简单的方法,可快速制备数百个线虫生长培养基琼脂96孔培养板,每孔中秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)数量一致。这些培养体系适用于整只生物体的表型筛选。本文重点介绍利用这些培养体系筛选具有促长寿作用的化学物质。
该技术的总体目标是通过高通量检测方法,测试不同化合物对模式生物秀丽隐杆线虫(C.elegans)的影响。该方法有助于回答化学、生物学和衰老研究领域中的关键问题,例如特定的化学结构是否能够延长秀丽隐杆线虫的寿命?该技术的主要优势在于,能够以高效且快速的方式对大量化合物进行筛选。
为大量培养线虫以制备大规模培养皿,在超净工作台中,首先将30毫升60摄氏度的线虫生长培养基琼脂倒入10厘米的培养皿中,过夜凝固。次日早晨,向每块培养皿中加入2毫升浓缩的大肠杆菌(E.coli),倾斜并旋转培养皿,使细菌完全覆盖整个培养皿表面。当大规模培养皿干燥后,将其置于4摄氏度保存,最多可保存两周。
为制备用于筛选的高通量检测培养板,使用自动八通道分液器将 0.15 毫升熔融的线虫生长培养基琼脂加入 96 孔板的每孔中。让琼脂过夜凝固,随后将高通量检测板在 4 摄氏度下保存,最长可保存两周。
为建立秀丽隐杆线虫(C. elegans)培养物,使用线虫挑取工具和解剖显微镜将20个卵转移至每块大量培养板上,并将培养板在20°C条件下孵育六天。第七天时,使用解剖显微镜观察确认子宫内是否存在卵。为收集 gravid 成虫,使用玻璃移液管向每块培养板加入2至3毫升S Basal溶液,并用手轻轻旋转每块培养板使溶液混匀。
使用玻璃移液管将线虫转移至15毫升离心管中,通过离心沉淀线虫。将线虫重悬于10毫升次氯酸盐溶液中,快速上下振荡试管5秒。随后,在室温下孵育5分钟,每2.5分钟振荡一次。
孵育结束后,再次离心线虫。沉淀物应呈黄褐色。弃去上清液,加入10毫升新鲜次氯酸盐溶液,再次剧烈振荡试管。
将线虫再孵育一到三分钟,期间偶尔振荡。当仅剩下卵时,离心试管并吸除上清液。沉淀物应为白色,无褐色着色。
采用无菌操作技术,在无菌超净工作台中打开试管,向每份沉淀中加入 14 毫升 S 基础溶液。用 14 毫升 S 基础溶液将沉淀洗涤三次。经过三次离心洗涤后,将虫卵重悬于 2 至 3 毫升新鲜的 S 基础溶液中。
为制备L1期幼虫阶段的秀丽隐杆线虫(C. elegans),将上清液转移至每根试管对应的无菌玻璃培养皿中,并用2至3毫升S Basal溶液冲洗试管中残留的卵进入各培养皿。向每个培养皿中加入5毫升S Basal溶液以减少拥挤,将培养皿置于20摄氏度、20 rpm条件下在摇床上振荡16至24小时,以促进孵化。由于缺乏食物,所有孵化出的幼虫将在第一幼虫期(L1)发生发育停滞。
使用血清学移液管将L1幼虫转移至15毫升离心管中进行离心。通过反复离心和吸弃上清液,将所有孵化出的L1幼虫收集起来后,用10毫升无菌S Basal溶液重悬幼虫沉淀。然后,取10微升转移至未接种的培养板,计数板上存在的幼虫数量。
重复此步骤10次,以获得溶液中L1的平均密度。使用无菌刻度移液管,测定含有L1的溶液的总体积。接着,利用L1溶液的体积和溶液中L1的密度,计算溶液中L1的总数量。
将线虫接种至96孔高通量检测板时,先在无菌的圆形培养基瓶中用适度缓慢旋转的搅拌子将L1期幼虫悬浮液稀释至每微升含一个L1幼虫,并使检测板恢复至室温。随后,在超净工作台内,向每孔加入5微升浓缩的大肠杆菌(E.coli),再向每孔加入10微升L1悬浮液,使每孔平均含有10条线虫。接种完成后,盖上板盖,于25°C培养两天,使幼虫发育为成虫。
孵育结束后,将冷冻保存的化合物文库板恢复至室温。使用微量板振荡器,在加样前立即以60 rpm轻轻振荡解冻后的文库板1分钟。利用自动化的96孔液体处理设备,从文库板中向检测板转移0.75 µL化合物。
当所有孔均处理完毕后,在超净台中将化合物从板表面风干4至8小时,并在板干燥后立即取出。用透明封膜密封干燥后的板,并盖上盖子。然后在1000 G条件下离心45秒,并将其倒置存放于25摄氏度环境中。
为了检测秀丽隐杆线虫(C. elegans)对目标化合物的反应,可使用阴性对照平板记录总存活率,直至95%的对照组动物死亡,此时可对所有测试平板进行评分。例如,在本研究中,从包含179种化合物的复筛文库中观察到57个阳性结果,表明所测试的复筛化学品总体中有32%呈阳性。对阴性对照孔和测试孔的平均存活百分比进行分组分析表明,测试孔的表现优于对照孔。
也可以进行小规模筛选,如本代表性测试实验所示,其中使用了50微摩尔和100微摩尔浓度的待测化合物。当经阴性对照处理的动物死亡率超过99%时,对这些小规模筛选测试板重新评分的结果表明,阳性对照孔的表现远优于阴性对照孔和测试孔,而测试孔的表现略优于阴性对照孔。在本实验中,由于许多测试孔相对于对照处理显示出毒性迹象,这一简单解释受到了干扰。
一旦掌握,若操作得当,该技术可在两到四周内完成。进行此操作时,重要的是保持检测板的完整性,确保其在使用前处于洁净无瑕的状态。采用该技术后,可进一步回答其他问题,例如,这些化合物中哪一种可诱导线粒体自噬?
对于线粒体自噬检测,应使用线粒体自噬报告基因片段。观看本视频后,您将清楚了解如何利用秀丽隐杆线虫(C. elegans)作为模式生物进行高通量化学筛选。
本文介绍了一种在96孔板中培养秀丽隐杆线虫高密度培养物的实验方案,可用于对多种化学物质的促长寿效应进行表型筛选。该方法能够在高通量模式下高效地测试大量化合物。
在线虫(C. elegans)中进行高通量表型筛选,能够快速鉴定出调控复杂衰老相关表型的化学小分子,从而支持以长寿为目标的发现项目中的早期靶点验证和机制层面的风险评估。该方法提供定量的生存率读数,可提高筛选命中化合物选择及项目组合筛选的预测可靠性。通过标准化线虫密度和检测条件,该方法增强了不同筛选实验间的结果可重复性,并促进了生物学、化学与转化研究团队之间的协同合作。
该方法适用于从靶点假设验证到先导化合物鉴定的整个发现过程,能够在临床前模型中进行机制性后续研究之前,实现表型筛选。