2018年6月9日
传统的利用基因敲除动物进行的基因功能缺失研究通常成本高昂且耗时。基于电穿孔的CRISPR介导体细胞突变技术是研究基因功能的强大工具。 体内在此,我们报告一种用于分析小脑增殖细胞中基因敲除表型的方法。
本项基于电穿孔的活体基因转移技术的主要目标是利用CRISPR介导的功能缺失分析,评估目的基因在小脑颗粒细胞分化过程中的作用。该方法有助于解答发育神经科学和神经肿瘤学领域中的关键问题,例如鉴定对正常小脑发育及脑肿瘤形成具有重要作用的分子。子宫内电穿孔操作将由彼得·利希特教授实验室的博士后研究员Lena Herbst博士演示,随后的免疫组织化学实验将由Di Haikun博士实验室的博士后研究员冯伟军博士完成。
该方法的主要优势在于,利用CRISPR-Cas9技术,可在小脑细胞中尽可能地实现目标基因的敲除,而无需构建多种基因敲除动物的组合。尽管该方法可用于研究基因在正常小脑发育过程中的功能,也可应用于其他系统,例如其他脑区的发育以及脑肿瘤建模。首先将一根硼硅酸盐玻璃毛细管装入微电极拉制仪中,拉制成细尖端。
用黑色墨水标记毛细管尖端,以便在注射过程中更清晰地观察,并在玻璃上绘制刻度。在体视显微镜下操作,使用直尺和尖头镊子将尖端修剪至约六毫米长,并制成锋利的单面斜面边缘。将1%快绿储备液通过0.22微米滤膜过滤,以去除溶液中的染料颗粒。
将单导向RNA质粒与荧光素酶报告质粒等量混合,使每种质粒的终浓度至少为每毫升一微克。用快绿染料对质粒溶液进行染色,快绿的终浓度为0.5%。使用异氟烷麻醉怀孕的CD-1小鼠后,将小鼠仰卧置于加热垫上,并给予镇痛剂。涂抹眼膏以防止手术期间眼睛干燥。
用胶带固定镜头,用消毒剂对腹部进行消毒。用纱布覆盖小鼠,仅暴露手术区域。在皮肤上做一个约两厘米长的切口后,找到白线,使用钝头组织剪在腹膜上做一个稍小的第二道切口。
用预热的无菌 PBS 润湿打开的腹腔。接着,使用环形镊子小心地将子宫角从腹腔中取出。在两个相邻胚胎的卵黄囊间隙处夹住子宫壁,并轻轻牵拉。
在将胚胎通过切口拉出时,避免对其施加任何压力。子宫角取出后,用准备好的玻璃毛细管吸取约10至15微升的有色质粒溶液。此过程中应避免产生任何气泡。
用环形镊子轻轻夹住胚胎,找到颈部区域。将玻璃毛细管的尖端缓慢刺入后脑背侧,进入第四脑室。注入约一微升的质粒混合液。
确认染色的 DNA 未从脑组织中泄漏,并呈现为菱形结构。在此过程中,最重要的是用质粒溶液充分填充第四脑室的整个区域,以确保 DNA 也能递送至小脑原基的远端部分。同时,务必避免操作过程中引起任何出血。
将带有直径为五毫米电极板的铂金镊子横向置于胚胎头部,负极覆盖耳部,正极置于子宫壁上方的小脑原基处,施加电方波脉冲。当所有胚胎完成电穿孔后,小心地将子宫角放回腹腔内,并用无菌 PBS 填充。让子宫角自然滑入其正常位置。
关闭麻醉,将动物腹部朝下放入新的笼子中恢复。在冷冻切片前,将小脑组织在每脑5毫升的4%PFA PBS溶液中,4摄氏度下固定过夜。第二天,将固定后的小脑组织转移至每脑10毫升的30%蔗糖PBS溶液中,4摄氏度下继续孵育过夜。
次日,待组织沉入管底后,将脑组织从蔗糖溶液中取出,并用一片纤维素滤纸吸去残留的蔗糖溶液。接着,将每个小脑浸入一次性塑料模具中的最佳切割温度包埋剂中,并在干冰上冷冻。使用冷冻切片机将冷冻组织块切成10 µm厚的切片,并将切片保存在-80 °C条件下,直至使用。
准备进行免疫染色时,首先将载玻片在室温下干燥30分钟,然后用PBS洗涤两次,每次10分钟。用液体阻断笔在组织周围画圈,并在室温下用封闭液孵育组织1小时。在封闭液中加入针对目标分子的一抗,于4摄氏度孵育过夜。
用含0.1% Triton的PBS洗涤载玻片,每次10分钟,共洗涤三次。然后加入用封闭液稀释的含DAPI的荧光标记二抗,在室温避光条件下孵育一小时。用PBS-T洗涤载玻片,每次10分钟,共洗涤三次,随后封片,并于4摄氏度保存直至成像。
将表达化脓性链球菌Cas9的HEK293T细胞稳定转染表达并靶向GFP的sgRNA质粒。转染48小时后,使用荧光细胞成像仪监测活细胞中的GFP表达。该图像显示基于GFP表达水平受影响的sgRNA序列。
此图像显示了由于非有效sgRNA序列导致的GFP表达缺失。这些图像展示了在E13.5时期通过表达对照sgRNA的Cre质粒进行电穿孔处理的p7-rosa26-LSL-cas9基因敲入小鼠(带有floxed终止盒以及下游的双顺反子cas9和EGFP序列)的小脑组织中GFP、Ki67和p27的免疫染色结果。该切片经DAPI复染。
注意在外颗粒细胞层中由 Ki67 标记的表达 GFP 的细胞。掌握该手术后,每只小鼠的操作可在 30 分钟内完成。进行该操作时,需牢记要非常小心地处理胚胎,始终使用尖端锋利的毛细管,并将电极置于精确的角度,以确保电脉冲传递至第四脑室的顶壁。
该技术问世后,为医学领域研究人员探索神经系统疾病(包括小鼠小脑中的脑肿瘤)的致病因素铺平了道路。
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本文介绍了一种基于电穿孔的CRISPR介导的体细胞诱变方法,用于分析小脑颗粒细胞中基因的功能。该方法可有效评估基因在正常小脑发育及脑肿瘤形成中的作用。
通过子宫内电穿孔在小脑颗粒细胞中实现CRISPR介导的体细胞诱变,可快速、低成本地在神经发育和神经肿瘤学研究中对疾病相关基因进行功能解析。该方法克服了生殖系模型在时间和资源上的限制,有助于在发现流程中更早地完成靶点验证和机制层面的风险排除。该技术的定量表型分析和嵌合建模能力,为项目组合筛选和转化研究的连续性提供了可预测的置信度。
该方法整合了早期发现与临床前模型开发的接口,架起了基因靶点鉴定与体内功能验证之间的桥梁。