2018年2月15日
本文描述了一种进行滴定ELISA的详细实验方案。此外,还提出了一种新颖的算法,用于评估滴定ELISA结果,并获得可溶性配体与微孔板固定化受体结合的解离常数。
本滴定 ELISA 方法的总体目标是利用一种新型算法,以可重复且高效的方式确定两个结合配体之间的亲和常数。该方法不仅有助于解答蛋白质-配体相互作用和受体研究领域中的关键问题,也可应用于药物研究和药理学等生命科学应用领域。该技术的主要优势在于,可通过在 ELISA 板上用配体滴定受体,并结合一种新型评估算法,简便地测定受体-配体相互作用的亲和常数。
开始实验时,将整合素α2 A结构域的储备液用TBS氯化镁缓冲液稀释至终浓度为每毫升5微克。本实验将同时使用野生型和突变型整合素α2 A结构域。取半区微量滴定板的一整行,每孔加入50微升整合素α2 A结构域包被液。
每次滴定至少重复两次。本示例中,每行滴定设置四个重复。用封口膜密封酶标板,并于4°C过夜孵育。
次日,移除包被液,并向每孔中加入 15 微升 TBS 氯化镁缓冲液。移除洗涤液,再向孔中加入新的洗涤液。洗涤步骤将去除未通过物理吸附固定在塑料表面的可溶性受体分子。
下一步是向每个孔中加入50微升含1% BSA的TBS氯化镁缓冲液,以阻断非特异性结合位点。重新密封酶标板,并在室温下孵育1小时。在微孔板孔内用BSA封闭的同时,对配体Rhodocetin进行系列稀释。
本实验中,起始浓度为 243 微摩尔的釉质腐蚀罗得青素,稀释倍数为 2.3。针对本实验中的八条滴定曲线,需在 1% BSA 的 TBS 氯化镁溶液中,于 1 号试管中配制 920 微升最高浓度的罗得青素溶液。将 1% BSA 的 TBS 氯化镁溶液各 520 微升分别加入编号为 2 至 11 的其余十个试管中。
将400微升罗丹明结合蛋白(Rhodocetin)溶液从1号试管转移至2号试管。通过反复吹打混匀两种溶液,然后从此混合液中取出400微升转移至3号试管。继续进行系列稀释,直至11号试管。
为了确保本实验步骤的成功,必须迅速向每个孔中加入溶液,以防止孔壁干燥。在完成一小时的孵育后,移除微孔板各孔中的封闭液。立即向第一列各孔中加入50微升第一支试管中的Rhodocetin溶液,向第二列各孔中加入第二支试管中的溶液,并依次加至第十一列。
向第12列的孔中加入50 µL含1% BSA的TBS氯化镁溶液作为无配体对照。重新密封酶标板,并在室温下孵育1.5小时。为去除未结合的配体分子,移除结合溶液,并向每孔中加入50 µL HBS氯化镁缓冲液。
然后移除 HBS 缓冲液并加入新的 HBS 缓冲液。为了化学固定受体及其结合的配体,向微孔板的每个孔中加入 50 微升含 2.5% 戊二醛的 HBS 氯化镁缓冲液。将微孔板在室温下孵育 10 分钟。
通过移除固定液,并向每孔加入 50 µL TBS 氯化镁缓冲液,以去除并灭活过量的戊二醛。移除洗涤缓冲液,向每孔加入新的洗涤缓冲液。开始本检测时,从微孔板的所有孔中移除洗涤缓冲液,并向每孔加入 50 µL 一抗溶液,该溶液用含 1% BSA 的 TBS 氯化镁缓冲液按 1:2000 比例稀释。
重新密封酶标板,并在室温下孵育。吸去所有孔中的初级抗体溶液,每孔加入 50 µL TBS 氯化镁缓冲液。用 TBS 氯化镁缓冲液洗涤 3 次。
随后,向每个孔中加入 50 µL 二抗溶液,该溶液用含 1% BSA 的 TBS 氯化镁缓冲液按 1:2000 比例稀释。重新密封酶标板,并在室温下静置孵育。移除各孔中的二抗溶液,然后向每个孔中加入 50 µL TBS 氯化镁缓冲液。
洗涤三次。第三次洗涤后,将微孔板轻拍在纱布上,以去除所有残留液体。使用多通道移液器,立即向微孔板的每个孔中加入50 µL碱性磷酸酶检测试剂,尽可能同时启动酶促反应。
将酶标板在室温下孵育,直至最高配体浓度孔中的溶液变为黄色。根据信号强度,孵育时间可能在5分钟至1小时之间变化。使用多通道移液器按照碱性磷酸酶检测试剂的添加顺序,向每个孔中加入50 µL 1.5 M的氢氧化钠溶液,以终止磷酸酶底物的显色反应。
静置平板数分钟,以确保两种溶液充分混合且无划痕。使用酶标仪测定各孔在405纳米处的光密度。通过打开原始数据表格开始数据分析。
从 Excel 文件中复制各列,打开 Graph Pad Prism Five,在主菜单中新建项目文件,在“新建数据与图表”下选择 XY 格式。选择“为 Y 轴每个值输入并绘制单个数据点”的选项,并将数据分别作为 X 和 Y 值粘贴到 Graph Pad Prism 的数据表中。将 405 纳米处的光密度值转置为列格式。
在数据表中,第一列代表作为 X 值加入的配体浓度,右侧各列包含八条滴定曲线的信号值作为 Y 值。由于将绘制半对数图,因此删除最后一行,即配体未添加(浓度为零)对照组的信号值。Graph Pad Prism 将绘制出图形部分所示的曲线图。
对于 X 轴,选择半对数刻度。X 轴显示在 405 纳米处测得的以 OD 值表示的信号值。通过双击任意符号,可将其选中并以简单的形状和颜色标记。
野生型的滴定值用不同深浅的红色圆圈标出,而突变型的滴定信号则用蓝色方块标记。打开分析子程序,在“X Y 分析”中选择“非线性回归”选项,并点击“新建”按钮以创建新方程。将滴定曲线方程输入新打开的模板表格中,并定义适当的约束条件。
通过选择新创建的用户自定义方程来分析数据表中的数值。打开包含计算所得近似值的表格,该表格显示在软件屏幕左侧的结果部分下方。在此代表性的滴定 ELISA 微孔板中,碱性磷酸酶底物转化后呈现的黄色表明,结合的配体量随着添加的 Rhodocetin 浓度降低而减少。
未添加Rhodocetin的孔中缺乏颜色,表明背景信号较低。一种新型算法对405纳米波长下的光度定量原始数据进行处理,以计算信号随添加的Rhodocetin总浓度的变化关系。每种受体形式、类型及突变体的四条滴定曲线高度可重复,几乎完全重叠。
相比之下,两组滴定曲线明显分离。突变型α2A结构域的滴定曲线向更高的Rhodocetin浓度方向偏移,表明Rhodocetin与突变受体的结合亲和力较低。将八条滴定曲线的解离常数进行作图,并按α2A结构域的野生型和突变型分组。
Rhodocetin 与野生型 alpha 2 A 结构域结合的亲和常数为 5.80 ± 0.15 纳摩尔,而 Rhodocetin 与突变受体结合的亲和力显著降低,为 9.68 ± 0.18 纳摩尔。该技术一旦优化用于常规操作,可在六至七小时内完成。在进行此操作时,需注意戊二醛可能影响配体与受体的结合,并可能破坏配体的抗原表位,从而影响抗体的检测。
这必须事先进行测试。如果具备表面等离子共振设备,可采用SPR方法作为替代方案,但SPR是通过评估动力学数据来确定亲和常数。本滴定ELISA方法结合新型评估算法具有广泛适用性,例如可用于比较不同配体的亲和力,分析构效关系,并揭示蛋白质-配体相互作用的分子机制。
观看本视频后,您应能充分理解如何进行滴定 ELISA 以及如何实施这种新颖的评估算法,从而能够轻松、常规地确定任意蛋白质-配体相互作用的亲和常数,甚至可同时处理多个配体。请务必注意,使用戊二醛可能存在危险,因此在执行本方案的固定步骤时,必须始终采取安全措施,例如佩戴手套和护目镜。
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本文介绍了一种详细的滴定ELISA实验方案,用于测定受体-配体相互作用的亲和常数。文中引入了一种新颖的算法,可高效分析实验结果,有助于蛋白质相互作用与药理学领域的研究。
受体-配体解离常数的准确测定对于药物发现中的靶点验证和先导化合物优化至关重要。本研究采用一种经新型非线性回归算法增强的滴定ELISA方法,无需依赖图形估算即可实现可重复的亲和力测量,支持基于数据的决策判断。该方法通过量化不同配体变体与受体突变体之间的结合强度,提高了早期药物发现中的预测可靠性。
该方法适用于从靶点验证到先导化合物发现的研究流程,其中定量的亲和力数据可用于优先级排序和机制层面的风险评估。