2018年6月30日
本文介绍了一种在活细胞细胞器中对单个膜蛋白进行多色定位的实验方案。通过使用自标记蛋白来连接荧光染料,可对同一细胞器不同膜区室中分布的蛋白质实现约18 nm精度的定位。
该技术可以解答调控过程中的关键问题,例如蛋白质动态变化和组织结构在功能适应中所起的作用。该技术的主要优势在于可在活细胞中进行,从而揭示单分子水平上的蛋白质动态行为。尽管该方法最初被用于研究线粒体膜蛋白的时空组织特性,但它也可应用于其他细胞器及其他膜蛋白的研究。
本技术由我实验室的研究生 Timo Appelhans 演示。按照文本方案转染并制备细胞样品和显微镜后,将含有荧光微球的制备样品置于样品架中,夹在聚四氟乙烯环与红色橡胶环之间。启动显微镜、所有硬件组件以及显微成像所需的所有软件。
使用一块新的无绒布,喷上异丙醇后擦拭物镜和盖玻片底部。然后在物镜的镜片上滴加一滴浸油。接着,将装有微珠样品的样品托架放置到显微镜载物台上,使盖玻片底部与浸油接触。
然后使用透射光或激光线对微珠进行聚焦。调节两束激发激光的功率,使两个荧光通道中的信号密度相近。随后寻找具有大量清晰可辨荧光信号的区域。
使用相机控制软件生成荧光通道的合并图像。然后利用图像分光器上的螺丝手动倾斜内部光学图像分光器,以实现两个荧光通道信号的最佳重叠。启动TIRF显微镜控制软件,并选择在实时成像模式下分别显示各个通道。
拍摄一张快照图像,激发所有通道中的荧光。然后使用该图像生成变换矩阵。启动软件分析插件,并将先前记录的荧光微珠双色图像载入软件中。
选择荧光通道的使用方向。当提示校准图像时,点击“是”,并选择先前拍摄的快照。打开单位管理器以定义单位转换系数,然后打开定位管理器。
为了确定点扩散函数(PSF),请按下“PSF半径”按钮。在打开的PSF估算窗口中,定义数值孔径和发射波长最大值,然后点击“估算PSF半径”。
接下来,接受获得的实验点扩散函数(PSF)。定义评估区域、去卷积循环次数以及用于计算的计算机核心数量。然后点击“定位”(Localize)以启动对单个粒子强度分布的拟合,拟合采用二维对称高斯函数。
打开校准管理器。在两个通道的渲染合并图像中,将显示原始信号和定位的中心。选择仿射模式。
然后,通过绘制连接线,手动连接两个通道中源自同一荧光微球的相应局部中心点。连接分布在视场范围内的对应信号。然后按“接受”按钮,并保存变换矩阵。
为了对线粒体膜蛋白进行单分子成像,将样品盖玻片置于橡胶环和聚四氟乙烯环之间固定。然后向腔室中加入0.5至0.8毫升成像缓冲液。清洁物镜镜头和盖玻片底部。
然后在物镜上滴加一滴油后,使用透射光或激光线对细胞进行聚焦。接着调节两束激发激光的功率,使其强度相近,并寻找具有较多荧光信号的区域。在TIRF显微镜控制软件中调整照明角度,设置入射角小于临界角,即采用HILO片层照明模式,以激发特定的兴趣区域。
将TIRF显微镜的照明条件调整为采用HILO照明方式以激发细胞器时,需要快速判断信噪比,并具备TIRF显微镜操作经验以及对细胞形态的了解。设置EM增益,并选择适合实验的曝光时间,以确保每帧采集到足够的光子数。随后调节激光功率,以实现较高的信噪比,因为该比值直接关系到定位精度。
在细胞周边区域寻找具有不重叠、呈长条形的线粒体以及单分子信号的视野。如果在一个或两个通道中均未观察到单个信号,则等待漂白,直至单分子信号出现。若仅需对一个通道进行漂白,在记录另一通道前应关闭其激光,以避免发生漂白。
记录直至信号数量过少而无法合理继续。启动成像处理软件,通过生成至少 1,000 个已记录帧的累积渲染和图像来检查线粒体结构。启动软件分析插件。
为进行定位和追踪的数据处理,请加载原始数据。检查多色图像,并选择两个通道的正确方向。
当提示校准图像时,加载变换矩阵。各通道将被分别显示。通过点击“显示”打开图像容器中的原始数据。
然后在顶部选项卡中打开单元管理器,并定义每个通道的单位转换系数。在顶部选项卡中打开定位管理器,并定义评估框和放气循环次数。单击点扩散函数半径(PSF Radius)以打开PSF估计器。
设置数值孔径和发射波长最大值,以获得理论点扩散函数(PSF)值。按下“接受”。对所有通道重复此操作。
然后按“定位”以启动对两个通道中记录信号的单粒子定位。等待软件完成处理。此时,每个通道的超分辨图像已生成,并显示在软件分析插件的图像容器中。
PINK1 是维持线粒体功能的重要因子。为了确定 PINK1 在功能正常与功能障碍线粒体中相对于 Tom20 的定位,记录了一系列共 1,000 帧的时间序列图像。其中一个通道随时间累积的所有信号叠加图像显示,在正常条件下,PINK1 定位于细胞质、线粒体外膜以及线粒体内部;而在去极化的线粒体中,则主要定位于外膜。
如定位颗粒的叠加图像所示,PINK1 主要分布在极化线粒体内部,而 Tom20 定位于线粒体外膜。在 Tom20 与 PINK1 定位颗粒的合并图像中,这一分布差异更为明显,显示外膜蛋白 Tom20 的分布范围更广。为了验证 PINK1 在线粒体内部的定位,将呼吸链复合物 I 的 30 千道尔顿亚基与光激活型 GFP 融合,并通过荧光光激活定位显微镜进行记录。
累积的三色图像和截面分布显示了复合物一与PINK1的重叠,证实了全长PINK1的导入。这些数据表明,PINK1的不同亚群占据了多个线粒体微区室。一旦掌握,该技术可在20小时内完成,包括数据采集和后续处理,前提是操作正确。
在进行该实验操作时,重要的是要记得检测细胞器的运动情况。通过本方法,可确定蛋白质的相对定位。该技术建立后,为线粒体蛋白质单颗粒示踪领域的研究人员提供了基础,使其能够在Z2细胞以及不同代谢条件和应激状态下观察这些蛋白质的行为。
观看本视频后,您应能充分理解如何利用双柱显微技术对线粒体蛋白进行成像,以揭示其亚细胞器定位及转运过程。
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本文介绍了一种利用自标记蛋白在活细胞细胞器中进行单个膜蛋白多色定位的实验方案。该技术可实现不同膜区室中蛋白质的精确定位,分辨率达到约18 nm。
多色定位显微技术能够对活体哺乳动物细胞中的单个膜蛋白进行精确定位,为研究蛋白质动态行为及细胞器特异性组织结构提供关键信息。该技术通过揭示蛋白质的亚细胞转运模式和功能性微区室化,有助于靶点验证,从而降低早期发现阶段机制性假设的风险。由于该方法适用于活细胞及多种细胞器,因此在生理条件下评估蛋白质行为方面具有更高的转化应用价值。
该方法通过提供亚细胞分辨率的数据,整合到早期发现工作流程中,有助于靶点验证和先导化合物筛选决策,尤其适用于膜相关靶点。