RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
zh_CN
Menu
Menu
Menu
Menu
DOI: 10.3791/57847-v
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
此协议描述如何准备果蝇幼虫进行基于 GC-MS 的 metabolomic 分析。
这种方法可以回答代谢领域的关键问题,例如癌代谢物 L2-羟基戊二酸是如何在健康细胞中合成的。该技术的主要优点是它允许用户以灵敏且可重现的方式直接测量 100 多种代谢物。通常,刚接触这种方法的人会很挣扎,因为该方案需要高效的样品处理,并且对水蒸气极为敏感。
要开始该方案,将 1 毫升冰冷的 0.9% 氯化钠加入含有先前制备的幼虫的 1.5 毫升试管中。盖上盖子,垂直翻转试管以彻底清洗幼虫,然后将试管放在冰上 30 秒。幼虫会沉到管底,但酵母会保持悬浮状态。
一旦所有幼虫都形成松散的颗粒,使用 1 毫升移液器去除氯化钠溶液。将样品在 4 摄氏度下以 2, 000 g 离心 1 分钟。使用 200 微升移液器去除所有残留溶液,并立即将样品冷冻在液氮中。
使用耐乙醇标记物标记 2 mL 螺口盖微珠管的侧面。接下来,使用能够准确测量 0.01 毫克的分析天平对标记的珠管的质量进行去皮。使用长镊子从液氮杜瓦瓶中取出 1.5 mL 样品管。
戴上丁腈手套,抓住冷冻管,将其倒置,然后用力敲打管盖,使冷冻沉淀脱落。立即将沉淀物倒入预先去皮的 2 毫升螺旋盖珠管中。必须快速处理样品,以确保内源性代谢途径不会被重新激活。
快速测量幼虫颗粒和珠管的总质量。立即将样品管放入液氮中。将样品管放入负 20 摄氏度的台式冷却器中。
向每管中加入 0.8 毫升预冷的 90% 甲醇,每毫升含 2 微克琥珀酸-D4 酸。将样品放回负 20 摄氏度的台式冷却器中。将 0.8 毫升预冷的 90% 甲醇(每毫升含 2 μg 硫辛酸-D4 酸)加入空珠管中,设置阴性对照。
然后,使用位于 4 摄氏度温度控制室中的珠磨机均质器,以每秒 6.45 米的速度将样品均质化 30 秒。将均质化的样品放回负 20 摄氏度的台式冷却器中,并将冷却器转移到负 20 摄氏度的冰箱中至少一小时。孵育后,将试管在 20, 000 g 下在 4 摄氏度下离心 5 分钟,以去除所得沉淀物。
将 600 μL 上清液转移到新的 1.5 mL微量离心管中,不要干扰沉淀。打开所有样品管,并将它们放入真空离心机中。在室温下干燥样品,直到去除所有溶剂。
如果干燥的样品储存在零下 80 摄氏度,请将未开封的样品管放入真空离心机中并干燥 30 分钟。在无水吡啶中制备 40 毫克/毫升的盐酸甲氧基拉敏 (MOX) 溶液。将 MOX 和吡啶储存在干燥器中。
接下来,使用热风枪干燥 1 毫升玻璃注射器约 5 秒钟。将注射器的针头插入无水吡啶瓶中。取出 1 毫升吡啶,加入含有 40 毫克 MOX 的微量离心管中。
协议的这一部分对水极为敏感。所有试剂在使用前必须储存在干燥器中。此外,用户必须确保样品与大气水蒸气的暴露程度最低。
然后,用氩气冲洗无水吡啶瓶。密封瓶子,然后将其放回干燥器。将试管在 35 摄氏度的热混合器中以 600 rpm 的速度孵育 10 分钟,将 MOX 溶解在吡啶中。
接下来,向干燥的样品中加入 40 微升 40 毫克/毫升的无水吡啶溶液中的 MOX。涡旋样品 10 秒钟,然后短暂离心。然后,在热混合器中孵育样品。
以20, 000 g 或最大速度离心样品 5 分钟以去除颗粒物质。将 25 μL 上清液转移到带有 250 μL 去活玻璃微量内插管的自动进样器样品瓶中。加入 40 微升含有 1% TMCS 的 MSTFA。
在自动进样器样品瓶上盖上盖子,然后使用压接工具密封样品瓶。将样品在 37 摄氏度下孵育 1 小时,并以 250 rpm 的速度振荡。最后,在进样前,使用机器人自动进样器将 3 微升先前制备的脂肪酸甲酯标准品 (FAMES) 溶液添加到自动进样器样品瓶中。
与对照幼虫相比,乳酸脱氢酶突变幼虫的气相色谱-质谱法显示乳酸、丙酮酸和 L2-羟基戊二酸的显着变化。使用该方案生成的 GC-MS 谱图显示出许多可见特征和明显的海藻糖峰,海藻糖通常代表幼虫样品中的最大峰。主成分分析或 PCA 清楚地表明,敲除组和野生型组彼此分开,并且两组中都没有异常值。
在尝试此程序时,请务必记住在匀浆之前保持样品冷冻,并在整个过程中保持所有试剂干燥。
View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos
Related Videos
09:22
Related Videos
19.7K Views
12:49
Related Videos
22.4K Views
08:22
Related Videos
9.9K Views
09:16
Related Videos
8.4K Views
09:18
Related Videos
6.2K Views
07:06
Related Videos
9.9K Views
08:33
Related Videos
12.8K Views
09:00
Related Videos
3.7K Views
07:18
Related Videos
1.2K Views
10:43
Related Videos
11K Views