2018年9月11日
本文介绍了一种利用分光光度法定量测定蓝细菌Synechocystis中藻胆蛋白含量的实验方案。该提取方法也已成功应用于其他蓝细菌和藻类菌株;但由于色素吸收光谱存在差异,需针对每种菌株单独验证分光光度法计算公式的适用性。
本实验方案的总体目标是利用分光光度法对模式蓝细菌集胞藻(Synechocystis)中的藻胆蛋白含量进行定量测定。藻胆蛋白是一类水溶性的色素-蛋白复合物,是原核蓝细菌以及若干类真核藻类中光捕获天线系统的主要组成成分。由于藻胆蛋白是主要的光捕获复合物,因此其含量是决定藻类和蓝细菌光合生产力的关键因素之一。
Synechocystis 是一种模式蓝细菌,在全球数百个实验室中被广泛使用。Synechocystis 含有两种藻胆蛋白,即藻蓝蛋白和别藻蓝蛋白。本方案描述了一种针对该菌株中这两种藻胆蛋白进行定量测定的简单、高效且可靠的方法。
我们比较了多种方法,包括藻胆蛋白的提取和分光光度法定量。由于不同藻株的藻胆蛋白吸收光谱可能存在差异,因此每种藻株均需单独验证定量方法。在开始提取藻胆蛋白时,将一毫升蓝细菌培养物转移至带安全锁的离心管中。
如果决定测定样品的干重,需在取样前称量空离心管的重量。确保培养物未发生沉淀。在室温下以 15,000 G 离心 5 分钟,收集细胞。
小心弃去上清液,注意不要扰动沉淀。将样品放入冷冻机中。
长期保存时,需将样品置于 -80 摄氏度条件下。此步骤对于防止藻胆蛋白降解至关重要。样品冻结后,立即将其放入冷冻干燥机中。
冻干开始后,检查冻干机的温度和压力。温度必须低于60摄氏度,压力应约为1百帕。将样品冻干过夜。
冻干循环结束后,应尽快封闭管子,以防止样品从空气中重新吸收水分。向每个样品管中加入四个2毫升的玻璃珠。用玻璃珠对样品进行15秒的均质处理。
充分匀浆的样品应均匀涂布于安全锁管的整个内表面。细胞匀浆后,向样品中加入1毫升磷酸盐缓冲液,以提取藻胆蛋白。PBS的最适pH约为7.4。
在均质器上将细胞与 PBS 混合 5 秒。这将确保样品充分混匀,以实现高效的藻胆蛋白提取。混合后,样品呈绿色。
为实现最高效的藻胆蛋白提取,将样品置于冰上保持60分钟。提取后,在4°C条件下以15,000 G离心5分钟。离心后,上清液呈深蓝色。
在进行分光光度测定之前,使用 PBS 作为空白对照校准分光光度计。分光光度计校准后,从一个分光光度计比色皿中弃去 PBS,用移液器将含有提取的藻胆蛋白的上清液加入该比色皿以替代弃去的缓冲液。在藻蓝蛋白和别藻蓝蛋白的定量分析中,需在 615、652 和 720 纳米波长下测定含有提取藻胆蛋白的上清液。
如文中所述,文献中已知有多种用于藻胆体定量的方程式。本方案所采用的方程式在藻蓝蛋白和别藻蓝蛋白浓度与色素及点状物之间具有最佳相关性。本方案的关键步骤是细胞均质化与提取,应同时实现高得率和高特异性。
我们测试了多种提取方法,例如通过超声波破碎细胞、使用氧化锆珠均质化或冷冻细胞裂解。本方案中的方法获得了最高的藻胆体得率。由于蛋白质提取物中即使存在少量叶绿素污染,也可能导致藻胆蛋白含量被高估,因此必须避免从细胞中提取任何叶绿素。
我们在粗提物中检测到叶绿素,随后使用超声处理破碎细胞。随着超声处理循环次数的增加,叶绿素浓度也随之升高。经优化,匀浆时间确定为15秒。
均质处理5秒和20秒均得到略低的得率。在PBS缓冲液或水中添加氯化钠或氯化钾,以及使用醋酸钠缓冲液进行提取,均未提高藻胆蛋白的提取效率。藻胆蛋白的提取时间优化为60分钟,因为在120分钟甚至240分钟后,藻胆蛋白浓度未发生显著变化。
确保在615、652和720纳米处的吸光度处于分光光度计的适宜吸光度范围内。本实验方案所用的分光光度计显示的适宜吸光度范围为0.1至3。我们比较了文献中已知的几种分光光度法测定藻胆蛋白含量的计算公式。
Bennett 和 Bogorad 的方程在已知蛋白质浓度的色素标准品中,对藻蓝蛋白和别藻蓝蛋白含量的重建效果最佳。不同方程之间的差异与特定生物中藻胆蛋白消光系数的变异有关。在应用或未应用超声处理的样品中,硫酸链霉素的使用并未导致叶绿素 A 的减少。
作为代表性数据,我们测定了集胞藻(Synechocystis)细胞中藻胆蛋白的含量。随着光照强度增加,藻胆蛋白含量下降。本方案的建立旨在最大限度减少时间与设备需求,所描述的色素分析方法可在任何标准的生命科学实验室中进行。
此外,该实验方案还包括另外两个步骤,如细胞沉淀的冷冻干燥和蛋白质提取。藻胆体定量的总操作时间不超过两小时。
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本方案概述了一种利用分光光度法定量测定集胞藻(Synechocystis)中藻胆蛋白含量的方法。该提取方法适用于多种蓝细菌和藻类菌株,但由于色素吸收特性的差异,需对分光光度法计算公式进行个体化验证。
对集胞藻(Synechocystis)中藻胆蛋白进行定量分光光度法测定,可实现对捕光复合体丰度的标准化评估,有助于光合作用生产力研究中的机制性风险排除。在不同蓝细菌和藻类菌株中实现可靠的定量分析,可支持早期发现和比较代谢通路分析,为合成生物学和代谢工程领域的项目组合决策提供依据。该实验方案具有良好的适应性且所需设备简单,便于致力于光合作用优化的研发团队在企业范围内广泛采用。
该分光光度法实验方案整合了早期发现与检测方法开发的接口,可用于蓝藻和藻类中光捕获蛋白的假设验证及定量基准测试。