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Biochemistry
体外支持性脂质双层自组织蛋白模式的重组
体外支持性脂质双层自组织蛋白模式的重组
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JoVE Journal Biochemistry
In Vitro Reconstitution of Self-Organizing Protein Patterns on Supported Lipid Bilayers

体外支持性脂质双层自组织蛋白模式的重组

Full Text
12,743 Views
08:10 min
July 28, 2018

DOI: 10.3791/58139-v

Beatrice Ramm*1, Philipp Glock*1, Petra Schwille1

1Department of Cellular and Molecular Biophysics,Max Planck Institute of Biochemistry

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

我们提供了一个协议,在体外自我组织的精神和矿山的研究, 在支持的脂质双层在开放室。此外, 我们还描述了如何将该检测包裹在脂质包覆的 microcompartments 中, 通过反应约束模拟体内条件。

这种方法可以帮助回答有关细胞组织和膜的关键问题,例如,几何线索在此过程中的作用。该技术的主要优点是它允许精确控制影响模式形成的所有方面,例如蛋白质浓度。首先,按照文本协议中的描述生成多层囊泡。

现在,将脂质冻融 7 到 10 个循环,首先在热板上准备一个装有 70 至 99 摄氏度水的烧杯,以及一个盛有液氮的容器。用大镊子将样品瓶放在液氮中,直到氮气停止沸腾。然后将样品瓶转移到热水中,直到溶液完全解冻。

重复这些步骤,直到脂质混合物看起来清晰,具体取决于混合物。接下来,组装脂质挤出机并用 Min 缓冲液预冲洗系统。将脂质混合物挤出 35 到 41 次,穿过 50 纳米孔径的膜。

确保以奇数次结束,以避免从未穿过膜的聚集体。将玻璃盖玻片分布在倒置玻璃培养皿或其他惰性表面上。用玻璃移液管,向每个盖玻片的中心加入七滴浓硫酸。

然后在酸滴的中间加入两滴 50% 的过氧化氢。覆盖反应物并孵育至少 45 分钟。现在,用镊子单独拿起盖玻片,然后用超纯水冲洗掉酸。

将清洗过的盖玻片放入不粘支架或类似的运输装置中。现在用超纯水充分冲洗每个盖玻片,并用加压气体干燥表面。用永久性记号笔标记盖玻片的清洁面。

要组装腔室,首先用锋利的剪刀切掉并丢弃 0.5 毫升反应管的盖子和锥形部分。然后将 UV 胶涂在管的上边缘,并使用移液器吸头将胶水均匀分布。将试管倒置到盖玻片的干净面上。

最后,通过在 360 纳米灯或 LED 下方放置多个腔室 5 到 15 分钟来固化 UV 胶。为了形成支持的脂质双层,将加热块预热至 37 摄氏度,并将两毫升反应管与 Min 或 SLB 缓冲液以每个腔室一根管孵育。将氮气吹入组装和固化的腔室中,以去除在 UV 固化和组装过程中可能沉淀的任何灰尘或其他颗粒。

然后,将腔室放在加热块上。用 130 μL Min 缓冲液稀释 20 μL 等分试样的透明脂质,使工作浓度为 0.53 mg/mL。向每个腔室中加入 75 微升脂质混合物。

现在,将计时器设置为 3 分钟。在孵育期间,囊泡在亲水性玻璃表面爆裂,并融合形成连贯的 SLB。60 秒后,向每个腔室中加入 150 μL Min 缓冲液。

剩余 120 秒后,加入 200 μL Min 或 SLB 缓冲液洗涤每个腔室,小心地上下吹打几次,取出并再加入 200 μL。每个腔室洗涤一次后,继续彻底清洗第一个腔室,直到 2 毫升缓冲液用完。洗涤支撑的脂质双层需要一些经验来完善腔室中的运动程度,并找到正确的洗涤强度。

要从图案化硅晶片生产 PDMS 微结构,首先使用塑料杯称量 10 克 PDMS 基座和 1 克 PDMS 交联剂。使用混合装置对 PDMS 混合物进行混合和脱气。现在,使用移液器吸头将少量 PDMS 直接滴到硅晶片上的结构上。

立即将 1 个盖玻片放在 PDMS 液滴上,然后取干净的移液器吸头的上端,轻轻地将盖玻片压到硅晶片上。PDMS 应在盖玻片和硅晶片之间薄薄地铺展。将带有盖玻片的晶圆放入烘箱中,在 75 摄氏度下固化 PDMS 三到四个小时,或过夜。

接下来,从烤箱中取出晶片,让它冷却至室温。用剃须刀片小心地从硅晶片上取下带有附加 PDMS 的盖玻片。现在,按照前面对玻璃的描述,将塑料腔室连接到 PDMS。

取出带有连接腔室的盖玻片,放入以氧气为工艺气体的等离子清洗器中。用等离子体清洁盖玻片。在这项工作中,使用了 30% 的功率和 0.3 毫巴的氧气压力,持续一分钟。

现在,按照之前在玻璃上的描述,在腔室中准备 SLB。要进行自组织测定,请将腔室中的缓冲液体积调整为 200 微升 Min 缓冲液,减去蛋白质和 ATP 溶液的量。然后加入 MinD,标记为 MinD、MinE,如果需要,加入 MinC,并通过移液轻轻混合组分。

现在,添加 2.5 毫摩尔 ATP 以开始 MinDE 的自组织。在接下来的 10 到 30 分钟内,在荧光显微镜上检查规则的 MinDE 图案形成和正确形成的微观结构。当形成规则的 MinDE 模式时,轻轻上下移液两次以混合组分。

使用 100 微升移液器去除大部分缓冲液,然后使用 10 微升移液器小心去除其余部分。为了延长成像时间,请将一块湿润的海绵塞入腔室内。确保海绵不接触盖玻片的表面。

立即用盖子关闭腔室,以避免微结构中残留的缓冲液干燥。在对微结构进行成像之前,确认 MinDE 自组织在 PDMS 微结构顶部停止,而微腔中的蛋白质正在振荡。在这个具有代表性的视频中,双色成像展示了 MinD 和 MinE 如何自组织成行进表面波,这些波符合支撑脂质双层上的螺旋图案。

在这里,单色成像显示 MinD 和 MinE 在 PDMS 微结构中执行磁极到磁极振荡。振荡建立了一个时间平均的 MinD 浓度梯度,其中隔室磁极的浓度最大,隔室中间的浓度最小。按照此程序,可以执行其他方法,如单颗粒跟踪,以确定膜结合动力学和停留时间。

不要忘记,使用食人鱼溶液可能非常危险,因此在执行此程序时应始终采取预防措施,例如个人防护设备。

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生物化学 问题 137 体外重建 心 矿 支持的脂质双层 模式形成 显微组织 自我机构

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