2019年1月21日
我们介绍一种简单的方法,用于快速定量多种细菌中的无机多聚磷酸盐,包括革兰氏阴性菌、革兰氏阳性菌以及分枝杆菌。
无机多聚磷酸盐是细菌应激反应中的关键组分。但以往提取和测定细菌中多聚磷酸盐(polyP)的方法复杂且耗时耗力。本技术的主要优势在于,能够快速、灵敏且低成本地定量多种不同细菌物种中的多聚磷酸盐水平。
该实验步骤将由我实验室的本科生 Arya Pokhrel 演示。首先,在不含半胱氨酸的苹果酸酶诱导培养基中,于 37 摄氏度静置培养罗伊氏乳杆菌过夜。取 1 毫升过夜培养物,置于 1.5 毫升微量离心管中离心,以收集足够量的细胞,获得总计 50 至 100 微克的细胞蛋白。
完全去除细胞沉淀中的上清液,然后加入250 µL GITC裂解缓冲液,通过涡旋振荡重悬细胞。在95 °C下孵育10分钟以裂解细胞。将裂解液储存于-80 °C。
首先,配制含有 0、1、2 和 4 毫克/毫升 BSA 的 BSA 标准品,溶于 GITC 裂解缓冲液中。取 5 微升已解冻并充分混匀的细胞裂解液,以及 5 微升 BSA 标准品,分别加入透明 96 孔板的不同孔中。每孔加入 195 微升 Bradford 试剂,然后在酶标仪中于 595 纳米处测定吸光度。
根据手稿中所述的 BSA 标准曲线,计算每个孔中的蛋白含量。为确定每个样本中的总蛋白量,将所得数值乘以 05。开始多聚磷酸盐提取时,向每个 GITC 裂解的样本中加入 250 微升 95% 乙醇,并涡旋混匀。
将此混合物用移液器转移至置于1.5毫升离心管中的硅胶膜离心柱中。在16,100 g条件下离心30秒。弃去滤过液,加入750微升三(羟甲基)氨基甲烷盐酸盐、氯化钠、EDTA和乙醇的混合液。
在16,100 ×g下离心30秒。弃去流出液,将吸附柱在16,100 ×g下离心2分钟。将吸附柱置于一支干净的1.5毫升微量离心管中。
加入150微升50毫摩尔、pH 8的三羟甲基氨基甲烷盐酸盐(Tris-HCl),在室温下孵育5分钟。通过在8,000 g离心2分钟洗脱聚磷酸盐(polyP)。首先配制标准品,其中含有0、5、50或200微摩尔的磷酸钾,溶于50毫摩尔、pH 8的三羟甲基氨基甲烷盐酸盐(Tris-HCl)中。
将每种磷酸盐标准品各100微升以及提取的polyP样品各100微升分别加入透明96孔板的不同孔中。按每份样品配制主混合液:30微升5X ScPPX反应缓冲液、19微升水和1微升纯化的ScPPX。向96孔板的每个孔中加入50微升该主混合液。
在37摄氏度下孵育15分钟。在检测当天,通过将9.12毫升检测溶液基础液与88毫升1摩尔抗坏血酸混合,配制新鲜的检测工作液,并在使用前使其恢复至室温。向96孔板中的每个样品和标准品孔中加入50微升检测溶液。
为使颜色充分显色,在室温下孵育反应板约两分钟。使用酶标仪在882纳米波长处测定吸光度,并通过与磷酸钾标准曲线比较,计算各样品的磷酸盐浓度。随后将磷酸盐浓度转换为每份细胞裂解液中来源于聚磷酸盐(polyP)的磷酸盐纳米摩尔数,并根据文中所述方法,将细胞内polyP含量归一化至总细胞蛋白量。
在LB培养基中培养的野生型大肠杆菌(E.coli),一种革兰氏阴性细菌,不产生聚磷酸盐(polyP);但在MOPS培养基中培养时,每毫克总蛋白可产生约192纳摩尔的polyP。缺乏聚磷酸激酶的E.coli delta ppk突变株在两种培养基中均不产生polyP。
缺乏外切多聚磷酸酶的Δppx突变株产生的多聚磷酸盐(polyP)量与野生型大致相同。而磷酸盐转运缺陷的ΔphoB突变株产生的polyP量则显著低于野生型。野生型罗伊氏乳杆菌(L.reuteri),一种在MEIC培养基中过夜培养的革兰氏阳性细菌,每毫克总蛋白约积累51纳摩尔的polyP。
缺乏 polyP 激酶的 L.reuteri ppk1 缺失突变株所含 polyP 不足该含量的一半。ppk1 缺失突变株中仍存在 polyP 可能是由于 L.reuteri 含有第二种 polyP 激酶。在 Hartmans-de Bont 培养基中无乙醇条件下培养的耻垢分枝杆菌 SMR5 菌株,每毫克总蛋白积累约 141 纳摩尔的 polyP。
尽管乙醇处理导致了三倍的增加。按照此步骤操作后,可进行丙烯酰胺凝胶电泳以评估聚磷酸链长度的差异。在尝试该步骤时,应避免常见错误。
请注意避免在微量滴定板孔中产生气泡,从离心柱转移样本至微量离心管时,务必小心确保样本转入正确的管中。请勿忘记,使用异硫氰酸胍(GITC)和强酸具有潜在危险性,进行本实验操作时应始终佩戴适当的个人防护装备。
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本文介绍了一种用于快速定量多种细菌中无机多聚磷酸盐的简便方法,涵盖革兰氏阴性菌、革兰氏阳性菌以及分枝杆菌。该技术设计快速、灵敏且成本低廉,克服了传统方法的局限性。
无机多聚磷酸盐的准确定量能够降低细菌毒力和应激反应通路的机制研究风险,支持抗菌药物发现中的靶点验证。该简化方法通过在多种细菌中快速、灵敏且经济地测定多聚磷酸盐,提供可靠的预测依据,有助于早期假设验证和通路解析。该方法通过标准化关键的与毒力相关的生物标志物,促进临床前研究中跨学科协作,增强转化研究的连续性。
该方法适用于从靶点假设验证到先导化合物发现直至临床前验证的整个发现过程,可提供可重复使用的生物标志物读数,用于多聚磷酸盐(polyP)通路调控的评估。