2019年1月25日
Dictyostelium discoideum 是研究细胞迁移、内吞作用和发育等复杂细胞过程的常用模式生物。该生物的应用依赖于其遗传操作的可行性。本文介绍了一种转染 Dictyostelium discoideum 细胞的方法,克服了在液体培养基中培养细胞的现有局限性。
本方案的价值在于,它几乎允许对任意黏菌株(dictyostelium discoideum)进行分子遗传学操作,无论该菌株是否能在液体培养基中无菌培养。该技术的另一优势在于快速且简便。在开始混合黏菌之前,先转染细胞以导入游离型质粒。
转染后两天即可通过显微镜观察验证结果。使用盘基网柄菌细胞与细菌悬液进行实验较为特殊,可视化过程将有助于实验人员了解各实验步骤的具体操作方式。
与我共同演示该实验步骤的是我实验室的博士后 Soudabeh Imanikia。首先,根据文本方案,配制含有氯化镁和氯化钙的 1000 毫升索伦森缓冲液工作液。随后,用一单菌落的产气克雷伯菌(K aerogenes)接种一升 LB 培养基。
将细菌在37摄氏度下振荡培养过夜。将菌液分装至两个500毫升离心管中,离心收集菌体。随后用500毫升缓冲液洗涤细菌一次。
将沉淀重悬于20毫升缓冲液中。使用光度计检测样品的光密度,并用缓冲液稀释样品,直至光密度约为100。随后,根据文本方案配制H40电穿孔缓冲液。
在室温下于SM培养基中过夜培养产气克雷伯菌至汇合状态。取400微升细菌悬液加入SM琼脂平板,均匀涂布。然后用无菌接种环挑取黏菌细胞,并在平板的一侧边缘接种并涂布细胞。
将培养板在 22 摄氏度下孵育两天,以确保生长区域足够大,便于转染。向一个 10 厘米经组织培养处理的培养皿中加入 10 毫升 K. aerogenes 菌悬液。然后,使用 10 微升一次性接种环从培养板的生长区域刮取细胞。
将细胞转移至含有预冷H40缓冲液的1.5毫升离心管中,在10000 ×g条件下离心2秒。随后弃去上清液,并将细胞重悬于H40缓冲液中。
接下来,将100微升细胞加入含有1至2微克DNA的离心管中。用移液器吹打混匀,然后将细胞与DNA的混合物转移至预冷的电穿孔比色皿中。DNA用量不得超过2微克。
较高的DNA浓度对细胞具有毒性,会降低转染效率。电穿孔后,立即将细胞转移至预先准备好的10厘米培养皿中,让细胞恢复5小时。为了筛选敲除、敲入或act five敲入的转染细胞,通过在培养皿表面吹打液体使细胞脱离。
然后,根据文本方案配制选择剂的三种稀释液。最后,将150 µL已配制好的稀释液分别加入96孔平底组织培养板的每个孔中。本方案中展示了一种双报告基因染色体外质粒系统。
转染后32小时,大多数细胞均表达两种荧光标记的融合蛋白。同时尝试了act five M cherry基因敲入和NC4实验。将消化产物在琼脂糖凝胶电泳后,获得了两条条带。
4127 bp 的条带包含目的构建体。纯化的 DNA 用于转染 NC4 细胞。通过 PCR 分析了两株 NC4 转染克隆,两者均显示出预期的条带模式。
随后使用Southern印迹法验证PCR结果。NC4在细菌菌苔上的生长速度比Ax2细胞更快。四小时后,能够爬行穿过琼脂糖的NC4细胞数量多于Ax2细胞。
NC4 细胞比 Ax2 细胞移动更快,且对叶酸的趋化反应更强。务必使用新近接种的 SM 平板上的细胞。切勿使用超过四天的细胞,否则效率会下降。
新分离的、非扩展性的白色 HAP 菌株常用于研究盘基网柄菌的聚集或社会行为。我们的方法允许通过这些分离株应用分子遗传学技术。
本文介绍了一种转染Dictyostelium discoideum细胞的实验方案,该方法可在不依赖菌株生长条件的情况下实现遗传操作。该方法高效且简便,能够快速验证实验结果。
本方案实现了对在细菌上生长的野生型嗜黏菌株进行遗传操作,克服了因 Ras 信号通路异常而适应无菌培养菌株的局限性。该方法提供了一种可扩展且快速的靶点验证手段,适用于与疾病相关的模型系统,有助于在早期发现阶段降低机制性风险。该策略将分子遗传学方法拓展至环境分离菌株,增强了表型筛选工作流程中的转化连续性与预测可信度。
该方法适用于从早期发现到先导化合物鉴定的阶段,可提供易于进行遗传操作的模型,用于通路解析和表型筛选。