2019年4月27日
SUMO 是一种必需且高度保守的小分子泛素样修饰蛋白。本实验方案描述了利用一种耐受应激的重组 SUMO 捕获蛋白(kmUTAG)来可视化多种细胞类型中天然的、未标记的 SUMO 共价结合物及其亚细胞定位。
本方案的意义在于使用一种新型的荧光SUMO捕获蛋白UTAG,用于在多种真核细胞中检测蛋白质修饰物SUMO。该技术的主要优势在于提供了一种无需抗体即可在多种细胞中检测SUMO的简便方案,包括哺乳动物组织培养细胞和线虫性腺。SUMO在癌症和神经退行性疾病中发挥着重要作用,因此迫切需要可靠且高效的工具来检测和功能分析SUMO修饰的蛋白质。
由于SUMO具有高度保守性,因此荧光标记的SUMO捕获蛋白UTAG可用于在多种不同生物体中标记共价连接的SUMO。本视频展示了其在哺乳动物细胞中的应用,此外,全文还描述了其在线虫卵母细胞中的使用。
该技术的可视化演示为染色前细胞处理及SUMO检测提供了关键提示。首先,在六孔组织培养板中,将所选的组织培养细胞接种于22毫米圆形盖玻片上,培养至细胞融合度达到70%至80%。随后用一毫升DPBS短暂洗涤细胞。
为了固定细胞,向每个孔中加入两毫升新鲜的4% PFA和DPBS。在室温下孵育细胞20分钟。在摇动培养板的条件下,用一毫升DPBS洗涤固定后的细胞,每次五分钟,共洗涤三次。
为了透化细胞,将细胞与含1% Triton X-100的DPBS孵育15分钟。再次按前述方法洗涤细胞。将细胞与500微升1摩尔的甘氨酸盐酸溶液(pH 2)孵育10秒。
然后立即加入500微升10X SUMO蛋白酶缓冲液(SPB)以中和pH值。按照之前的方法洗涤细胞后,将盖玻片从孔中取出,并置于湿盒中。仅针对UTAG-FL染色,取1微克UTAG-FL与含有5毫摩尔TCEP的100微升1X SPB缓冲液在离心管中混合。
然后,将混合液用移液器加到盖玻片上的细胞中,在湿盒中室温孵育1小时。洗涤盖玻片时,向每个盖玻片上加入200 µL的DPBS,静置10分钟。重复此洗涤步骤两次。
从最后一次洗涤液中取出盖玻片,将其倒置在预先清洁的显微镜载玻片上,滴加一滴封片介质。将样品在20摄氏度的冰箱中避光保存过夜,然后在显微镜下观察。使用适用于DAPI和Texas Red的相应滤光片组观察细胞。
有关对SUMO和固定线虫性腺进行标记的完整方案,请参见全文。虽然标记哺乳动物细胞相对简单,但标记线虫卵母细胞需要事先接受性腺解剖方面的培训。将KmUTAG-FL与固定的PMT2细胞共同孵育后,显示出明显的细胞核染色。
可见弥散性核染色以及明显的核内焦点。通过与DAPI共染色确认了核定位。与KmUTAG-FL的SUMO捕获活性一致,其核定位模式与SUMO23染色相似。
使用抗SUMO23 8A2抗体进行共染色,证实了KmUTAG-FL与SUMO23信号的共定位。这验证了KmUTAG-FL在哺乳动物细胞中检测SUMO23的有效性。从产生卵母细胞的成年雌雄同体c.
秀丽隐杆线虫的线虫卵母细胞用抗SUMO抗体进行标记。与先前的报道一致,抗SUMO抗体最初定位于减数分裂晚期前期卵母细胞的核质中。随后,随着核膜破裂以及染色体向中期板聚集,抗SUMO抗体重新分布至成对同源染色体的中央环状复合体上。
在平行制备实验中,用 KmUTAG-FL 标记的性腺显示出相似的模式。随着卵母细胞开始并完成核膜破裂过程,KmUTAG-FL 的标记信号从核质逐渐集中到环状复合体上。这些结果验证了 KmUTAG-FL 是研究 c 中减数分裂及 SUMO 相关过程的有效工具。
秀丽隐杆线虫及其他可能的线虫。在进行固定时,关键是要使用新鲜的多聚甲醛,并控制较短的固定时间,以保持SUMO的天然折叠构象,从而使其能够被KmUTAG识别。由于SUMO的三级结构高度保守,因此极有可能利用KmUTAG-FL试剂对更多模式及非模式生物系统中的SUMO变体进行分析。
目前,我们正在利用这种新型的荧光SUMO捕获UTAG蛋白来研究细胞应激过程中SUMO的功能。最后,请注意,所有使用固定剂多聚甲醛的步骤都必须在实验室安全通风橱中进行,且该试剂必须妥善处理。
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本方案描述了一种新型荧光 SUMO 捕获蛋白(kmUTAG)在多种真核细胞中检测 SUMO 共价结合物的应用。该技术可实现无需抗体的 SUMO 可视化,对于理解 SUMO 在癌症和神经退行性疾病中的作用至关重要。
无需抗体即可检测SUMO修饰,能够在与疾病相关的体系中实现可靠的靶点验证,尤其适用于SUMO化修饰影响蛋白质稳定性和功能的肿瘤学和神经退行性疾病研究项目。kmUTAG试剂提供了一种可重组的跨物种工具,可降低检测中的变异性,并通过在活细胞或固定细胞中直接可视化内源性SUMO偶联物,支持机制层面的风险评估。该方法通过消除依赖抗体带来的假象,并在不同模型系统中实现标准化的SUMO通路检测,从而提高早期药物发现中的预测可信度。
该方法适用于早期发现工作流程,在其中SUMO通路调控是一种作用机制,可在先导化合物优化之前,为生化或遗传学层面的SUMO干扰研究提供正交验证。