2019年10月12日
利用维也纳从头算模拟软件包(Vienna Ab initio Simulation Package)进行的计算可用于确定纳米材料的本征电子特性,并预测潜在的水分解光催化剂。
本方案通过第一性原理计算,报道了一种具有II型能带排列的光催化剂的计算筛选,以卡莱尔软线大规模表达的、封装在纳米管内的氮化硼亚硝酸纳米带为例,并列举了其他示例。步骤一:优化原子结构。
通过 vast、INCAR、POSCAR、POTCAR 和 KPOINTS 准备结构弛豫计算的输入文件。文件 INCAR 中包含定义计算的特定参数。文件 INCAR 中用蓝色框标出的行表示,当所有原子均被弛豫,直至每个原子上的受力小于 0.028 每原子时的情况。
文件POSCAR包含原子几何结构信息。该文件中的初始晶格参数可从理论计算或实验参考文献中选择,如橙色框所示。
KPOINTS 定义了一个K点网格,而POSCAR仍是生成用于POSCAR的氮化硼纳米带初始结构的势文件。首先从Materials Project网站下载氮化硼方块单胞的POSCAR文件。他们使用V2SXF将POSCAR转换为SXF格式的文件。
SXF 文件可能是正确的表达式。将 V2SXF POSCAR 输入至双带系统中。然后输出 POSCAR SXFGZ 选项卡中的 gunzi POSCAR 以及 delta SXF-GZ。
并输出 POSCAR SXF 文件。我们将使用 xcrysden 构建氮化硼的超胞。输入命令 xcrysden-sxf POSCAR.Xsf。
选择菜单,修改所绘制的病灶数量,并在 X 和 Y 方向上扩展样式。选择菜单中的“文件”,保存 XSF 结构以导出超晶胞结构。
输入 xmakemol -f supercell 以使用 xmakemol 打开超胞。选择菜单并将其设为可见。点击 toggle 以延迟范围内的原子,并制备具有指定宽度和手性的纳米带。
氮化硼纳米管可以通过纳米管建模工具构建,在 Windows 系统中打开纳米管建模工具 EXC。选择菜单,选择类型为 B-N,并指定手性。
选择菜单中的“文件”→“保存XYZ表格”以导出此结构。在开始创建计算任务之前,使用VMD Southwire检查原子结构。在内部VMD系统中输入VMD。
在打开的 VMD 主窗口中,选择菜单中的“文件”(File)→“分子”(Molecule),然后在浏览窗口中找到 POSCAR 文件。通过选择类型为 MAGE 并加载 POSCAR 文件来载入该文件。
在图形表示绘制方法窗口中,以不同样式显示结构。例如,选择CPK样式,每个原子由一个球体表示,每条化学键由一个柱状物表示。
输入 qsub job.pbs 以将作业提交至计算机。该文件属于可移植批处理系统脚本。
这是一个名为 job.pbs 的脚本示例。作业完成后,如果比率需要精确停止,则结构能量最小化会出现在输出文件末尾。收敛结果为 pend。
生成的POSCAR将作为后续计算的输入文件POSCAR,用于分析材料的电子性质。第二步。
计算包埋能。在Linux系统中输入命令 mkdir nanocomposite isolated-nanoribbon isolated-nanotube,以创建用于纳米复合材料、孤立纳米带和孤立纳米管的qsub文件夹。准备一个PBS脚本,job。
pbs 和四个输入文件 INCAR、POSCAR、POTCAR 以及 KPOINTS。用于在每个文件夹中进行能量计算。输入文件 POSCAR 以相同的方式弛豫结构并统计 CAR 形成情况。
进入每个文件夹,在内部 Linux 系统中输入 qsub job.pbs。这一系列关联作业将分别对纳米复合材料、独立的纳米带和独立的纳米管进行静态自洽能量计算。
接下来,针对每个体系,从 OUTCAR 文件中追踪总能量。完成静态自洽计算后,根据此公式计算包埋能。纳米复合材料的周期性相互作用允许沿 Z 轴方向,L 为晶胞沿 Z 轴的晶格常数。包埋能可用于评估纳米复合材料的能量稳定性。
第三步,从能带结构中提取电子性质。准备一个 PBS 脚本文件 job.pbs 和六个输入文件。
INCAR、POSCAR、POTCAR、KPOINTS、CHGCAR 和 CHG。对于能带计算,在 INCAR 中设置 ICHARG 等于 11。预转换的 CHGCAR 和 CHG 文件来自静态自洽计算。
KPOINTS 中的 KPOINT 采样采用线模式。在内部 Linux 系统中输入 qsub job.pbs 以提交作业。
使用 p4vasprun 生成投影能带。通过输入 p4v vasprun 加载 vasprun.xml。
在终端中打开xml。选择菜单,电子局域DOS能带。控制,然后选择能带。
在标签原子选择中指定纳米管的原子序数。通过使用 VMD 指向相应原子来获取原子序数。为投影能带结构指定符号的颜色、类型和大小。
这些菜单符号及其符号大小。按下菜单,添加新行。图形将显示来自纳米管贡献的能带结构。
然后重复相同的步骤,以收集来自纳米带的投影能带。选择菜单中的“图形导出”,将图形导出为 agr 格式的文件。
例如,保存为 11-4.agr。使用 XM 级别识别投影条带。输入命令 xmgrace11-4。
在终端中输入 agr 以启动 xmgrace 菜单系统。选择菜单中的“Plot”→“Axis Properties”以识别坐标轴的标签及其范围。选择“Manual Plot Set Appearance”,读取指定能带序号及关键点处的能量值。
通过分别投影纳米管或纳米带的能带贡献,可直接获得纳米管或纳米带的价带最大值和导带最小值。然后计算价带偏移、导带偏移以及带隙。选择菜单中的“文件”,指向以APS格式导出图像。
计算价带顶(VBM)和导带底(CBM)的能带分解电荷密度。准备一个 pbs 脚本作业文件、pbs 文件以及七个输入文件:INCAR、POSCAR、POTCAR、KPOINTS、WAVECAR、CHGCAR 和 CHG。
指定CBM和VBM的能带编号,然后在INCAR中输入IBAND。每个能带边缘使用对应的单个KPOINT。
该点收敛的CHGCAR、CHG以及WAVECAR文件均来自静态自洽计算。输入命令qsub job。
将pbs提交至内部Linux系统以运行任务。任务完成后,使用VMD在实空间中绘制价带最大值(VBM)和导带最小值(CBM)。启动VMD会话并加载POSCAR。
在 VMD 主窗口中选择菜单“文件”→“新建分子”。通过浏览窗口找到 PARCHG 文件。按类型加载 PARCHG,然后点击并评分 PARCHG。
选择菜单,绘制实心表面,并在图形表示窗口中显示实心表面。将 ISO 值更改为合适的数值,例如 0.02。通过菜单着色方法更改 ISO 表面的颜色。
第四步,通过外加场调控纳米复合材料的电子特性。向纳米复合材料施加一个横向电场。准备一个 PBS 脚本作业。
pbs 以及四个输入文件 INCAR、POSCAR、POTCAR 和 KPOINTS。通过 e-field 标签以 eV/Å 为单位定义电场强度。将 LDIPOL 设为 T,将 IDIPOL 设为 2。
电场将施加于Y轴方向。在不进行结构优化的情况下,按照步骤二和步骤三进行静态自洽计算和能带结构计算。对纳米复合材料施加纵向强度测试,沿周期性方向调整晶格参数,以考虑链状效应。
例如,若施加1%的应变以优化纳米复合材料沿轴方向的晶格参数,且沿Z轴的轴向抗拉强度通过作用发生变化,则将POSCAR文件中的晶格参数更改为2.529545 Å。按照步骤一弛豫修改后的结构,随后按照步骤二和步骤三进行静态自洽计算和能带结构计算。
代表性结果。包埋能可用于粗略估计纳米复合材料的能量稳定性。氮化硼纳米带 a2、a3 和 a4 被包埋在氮化硼纳米管 (11,11) 内时的包埋能分别为 0.033 eV Astrum、0.068 eV Astrum 和 0.131 eV Astrum。
尽管封装能随纳米带尺寸变化而改变一个数量级,但三种纳米复合材料均呈现第二类带阶排列。这是氮化硼与纳米带的能带结构,其中四号纳米带被封装在氮化硼纳米管(11,11)内。价带顶位于纳米管,导带底位于纳米带。
交错的能带排列有利于光生电流,其主要的电荷传输机制如下:在X点处,光在纳米带中产生电子-空穴对。随后,空穴从纳米带解离至纳米管。
计算得到的价带偏移为317 µeV,大于300 K时的热能(约13 µeV),这有效地降低了光生载流子的复合速率。
为了通过宽光谱增强光吸收,将电场和纵向拉伸应力施加于氮化硼纳米带,该纳米带为四重封装在氮化硼纳米管(11, 11)内部的结构。这是相对于真空能级的能带边缘演化情况,且在无外场时无响应。在此纳米复合材料中,两种外场均使其带隙显著减小,最大可降至接近 0.95 eV。
更重要的是,这种交错的能带排列在扩散作用下仍得以保持。水的氧化还原电位由蓝色虚线标出。能带边缘相对于氧化还原电位的位置表明,该纳米复合材料在水分解反应中具有良好的应用前景。结论。
采用计算筛选方法发现具有适用于单独水分解特性的低维材料,是一种快速且高效的方法。这类一维体系有望整合光催化产氢与安全胶囊式反应结构。光生电子可由纳米带收集,质子则穿过纳米管,通过静电吸引结合生成氢分子。
产生的氢气被完全隔离在纳米管内部,以避免发生不需要的逆反应或爆炸。使用PPE泛函的第一性原理计算会低估能隙状态,但能够捕捉到能带排列和能带偏移的基本趋势。
与实验工作相比,若要获得更准确的价带偏移、导带偏移及带隙数值,需采用杂化泛函,但这将比使用PPE泛函耗费更多计算时间。此外,为研究光生空穴和电子在静态纳米体系中的寿命,还需进行一些必要的计算。这对于设计具有长载流子寿命的光催化剂至关重要。
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本方案详细介绍了使用第一性原理计算对光催化剂进行计算筛选的方法。重点研究了封装在纳米管内的氮化硼纳米带中的第二类键对齐。
基于第一性原理的计算筛选方法可用于一维范德华异质结构,从而快速识别具有定制电子特性的光催化剂候选材料。该方法有助于在材料筛选早期降低风险,并提高面向能源应用(如水分解)的材料选择的预测可信度。将能带排列分析整合到材料发现工作流程中,可加速候选材料的筛选与分类,并为后续实验验证提供指导。
该计算方案可融入从早期假设验证到功能性纳米材料先导物识别的整个发现过程。