2020年8月27日
我们描述了一种通过定量反转录聚合酶链式反应检测单侧输尿管梗阻(UUO)小鼠肾脏中microRNA表达水平的方法。该方案适用于研究UUO小鼠以及其他病理条件下小鼠肾脏microRNA的表达谱。
该方法可实现对患有多种病理状况(如肾纤维化)小鼠肾脏中microRNA表达的检测。该技术的主要优势在于,通过一个简单的过程即可实现高准确性和高灵敏度的microRNA表达谱分析,节省时间并避免技术误差。进行假手术时,使用手术剪和镊子在腹部皮肤做切口,并从膀胱至左侧肋骨下缘剪开肌肉和腹膜。
用 PBS 润湿两根棉签,小心地将肠道推向一侧。放置湿润的棉签以识别左侧肾脏和输尿管。用 4-0 尼龙线缝合腹膜膜,然后缝合切口。
为了进行单侧输尿管梗阻(UUO)操作,先在腹部皮肤上做一切口,并剪开肌肉和腹膜,操作方法与假手术所示相同。将一支2.5毫升的注射器置于小鼠下方。用PBS润湿两根棉签,然后用镊子小心地将肠道拨至一侧,并放置棉签以辨认左侧输尿管。
用镊子提起左侧肾脏。使用4-0丝线在相距约一厘米的两个位置结扎左侧输尿管。在两处结扎线的中间位置剪断输尿管,然后使用4-0尼龙缝线缝合腹膜和切口。
剪开腹膜后,如前所述,用镊子提起腹膜,使用手术剪在上缘做一横向切口,然后沿肋骨最低边缘继续切开。辨认左肾,并用 PBS 反复灌注,直至肾脏变为黄白色。用手术剪剪断左肾动脉和静脉,将肾脏取下并置于培养皿中,然后用 PBS 小心冲洗。
用手术剪和镊子将肾脏切成约10毫克的组织样本,每块样本放入一个1.5毫升的微量离心管中,并盖紧管盖。将一份肾脏样本放入硅胶匀浆器中,加入700微升基于苯酚/胍的裂解试剂。缓慢按压并旋转匀浆器的研杵,对肾脏样本进行匀浆处理。
重复按压和扭转,直至样品完全溶解于裂解试剂中。为进一步均质化样品,将均质后的裂解液转移至生物聚合物离心柱中,在14,000 ×g条件下离心3分钟,然后将沉淀的裂解液转移至一个新的1.5毫升微量离心管中。向管中的裂解液加入140 µL氯仿,并 tightly 封紧管盖。
为混合裂解液和氯仿,将离心管颠倒15次。样品在室温下孵育2至3分钟,然后在4°C下以12,000 × g离心15分钟。小心不要扰动沉淀物,将上清液转移至新的1.5毫升微量离心管中,并加入1.5倍体积的100%乙醇。
将混合物涡旋振荡5秒。取700 µL样品加入置于2 mL收集管中的膜固定式离心柱中。盖紧柱子的盖子,在15,000 ×g条件下离心15秒,然后弃去收集管中的沉淀裂解物。
向2毫升收集管中的膜固定式离心柱加入700微升洗涤缓冲液一,彻底清洗样本。然后重复离心,并弃去收集管。每次用500微升洗涤缓冲液二洗涤,重复洗涤两次。
最后一次洗涤后,将膜结合的离心柱放入2毫升收集管中,在15,000 × g条件下离心1分钟,弃去沉淀的裂解液。将膜结合的离心柱转移至新的1.5毫升离心管中。加入30 µL无RNase的水溶解总RNA,盖紧离心柱盖子,在室温下静置5分钟。
然后在4℃下以15,000 × g离心1分钟。将含有总RNA的样品转移至冰上预冷的新微量离心管中,并通过分光光度法测定总RNA的浓度。根据文章所述方法配制主混合液,每管八联管中加入8 µL。
调整总RNA浓度后,将12微升总RNA等分试样加入每个试管中并盖紧管盖。离心试管15秒。将试管放入热循环仪中,在37摄氏度下孵育60分钟。
完成后,立即在95摄氏度下孵育5分钟以合成cDNA。将cDNA转移至新的1.5毫升微量离心管中,并用蒸馏水稀释10倍。涡旋振荡并离心5秒,随后按照文本稿件中的描述进行定量实时PCR。
本方案用于通过结扎8周龄雄性小鼠(体重20至25克)的左侧输尿管,建立单侧尿道梗阻小鼠模型。使用4-0丝线进行双重结扎,完全阻塞输尿管。术后第8天采集肾脏组织。
microRNA 的 qRT-PCR 数据表明,与对照组相比,UUO 小鼠肾脏中 microRNA 3070-3p 的水平显著升高,而 microRNA 7218-5p 和 microRNA 7219-5p 的水平则降低。在实施本方案时,请务必反复旋转肾脏样本,直至其完全溶解于苯酚/胍类裂解试剂中,以获得良好的 RNA 提取效果。
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本文介绍了一种利用定量反转录聚合酶链式反应检测单侧输尿管梗阻(UUO)小鼠肾脏中microRNA表达水平的方法。该技术可在多种病理条件下实现对microRNA表达谱的高准确性和高灵敏度分析。
在肾纤维化模型中准确的microRNA表达谱分析有助于靶点验证和肾脏疾病药物研发中的机制去风险化。该qRT-PCR方法可对疾病相关miRNA进行可重复的定量,为通路解析和生物标志物的一致性提供预测信心。该方法填补了肾组织分析中的关键空白,有助于早期假设验证和研发项目优先级排序。
该方法适用于从靶点鉴定到先导化合物优化的整个发现流程,可提供分子表型数据,为早期决策提供依据。