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DOI: 10.3791/62020-v
Ivan V. Chicherin1,2, Sergei A. Levitskii1, Maria V. Baleva1, Igor A. Krasheninnikov1, Maxim V. Patrushev3, Piotr A. Kamenski1
1Department of Biology,M.V. Lomonosov Moscow State University, 2Institute of Functional Genomics,M.V. Lomonosov Moscow State University, 3National Research Centre "Kurchatov Institute"
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
贝克的酵母线粒体基因组编码了八种多肽。当前协议的目标是将所有这些都标记为单独的频段,然后将其可视化为单独的频段。
线粒体是能够有氧呼吸的真核细胞的基本细胞。他们的功能障碍是众所周知的人类疾病来源。贝克的酵母线粒体含有循环基因组编码八种蛋白质。
在这段视频中,我们描述了通过对转化产品进行放射性标记和随后通过凝胶电泳分离来检测酵母线粒体中蛋白质生物合成的协议。该程序包括几个主要步骤。新鲜盘子上冷冻库存培养物中的斯特雷克酵母, 具有适当的介质。
将盘子放在文化孵化器中30度,24至48小时。在 15 毫升管中的新鲜条纹中以两毫升的介质接种这些培养物,并在 30 度的 200 RPM 下一夜之间孵育它们。测量600纳米波长的培养物的光学密度。
在室温下,在 9,000 G 的无菌管调色板酵母细胞中,以相当于 0.2 吸附装置的体积为例,时间为 30 秒。丢弃此超自然。通过涡流5秒钟,用0.5毫升无菌水清洗细胞。
在室温下,9000 G的皮莱特酵母细胞可容纳30秒。丢弃超自然人。在两毫升的新鲜擦拭中稀释细胞。
孵化边缘在 200 RPM 和 30 度,直到光学密度达到 1.5 到 1.9 从 1.5 到 1.9 值。传输相当于微型离心机管中一个光学单元的培养体积。在 3000 G 下旋转管子一分钟。
丢弃超自然人。通过涡流5秒钟,用0.5毫升无菌水清洗细胞。在室温下,在9000G的帕莱特酵母细胞30秒内丢弃超母细胞。
在 0.5 毫升无菌转化缓冲中重新悬浮酵母细胞。将悬架置于 15 毫升管中。在细胞悬浮中加入环氧酰胺,最终浓度为每毫升0.2毫克孵化,在200 RPM和30度下进行5分钟边缘,以抑制细胞溶解。
从 25 到 30 添加 S35 甲氨酸 S35 甲氨酸的 25 到 30 微库到细胞悬浮和孵育 30 分钟边缘在 200 RPM 和 30 度。添加无标签的冷甲基氨酸和博里霉素,停止标签孵化10分钟边缘采取在200 RPM和30度。通过离心收集酵母细胞,在9000G下30秒。
通过涡流5秒钟,用0.5毫升无菌水清洗细胞。在室温下,9000 G的皮莱特酵母细胞可容纳30秒。丢弃超自然人。
在调色板和漩涡中加入 75 微升裂解缓冲器,时间为 5 到 10 秒。添加 500 微升 0.5 摩尔三轮缓冲区 0.5 摩尔三轮缓冲与 pH 6.8。pH 6.8.
漩涡短暂。在样品中加入600微升甲醇。漩涡五秒钟。
在样品中加入150微升氯仿。漩涡五秒钟。在 12,000 G.小心地用取样器丢弃 opaface 时,将样品离心两分钟。
在样品中加入600微升甲醇。通过多次倒置管子小心混合。离心机样品两分钟,在12,000 G.丢弃超自然。
空气在80度下将调色板干燥两分钟。溶解60微升莱姆利样品缓冲器中的沉淀蛋白。在 14 度下加热样品 10 分钟。
导致17.5%莱姆利SDS多丙烯酰胺凝胶。将每个样品的 15 微升装入口袋。在冷室中运行凝胶,直到蓝色染料达到凝胶淋巴的约 65%。
用 Kumasi 亮蓝色染色凝胶,并进行扫描或拍照,这需要作为负载控制。干燥凝胶干燥机中的凝胶。将其与存储磷屏幕一起保存在盒式磁带中三到五天。
在磷成像仪上扫描屏幕。按照上述协议,我们从两个糖精脑菌株中分配线粒体翻译产品。Aim23基因编码线粒体翻译启动因子三的野生类型和突变变种删除。
线粒体翻译产品已经在变性聚丙烯酰胺凝胶中积极标记和分离。样本在饱和前每两分半钟收集一次,以建立时间过程。凝胶在为期五天的展览后被染色、干燥和筛选。
在成功的实验中,图片演示了根据标准模式分配的八个波段。然而,根据应变和实验条件,单个频段的强变程度可能变化很大。每个波段对应于一个翻译产品。
数据表明,突变菌株能够线粒体蛋白合成,因为所有出现在野生类型的产品都可见于这种突变体中。然而,波段的特性不同于野生类型,这意味着Aim23的删除会影响线粒体基因表达。库马西酿造的蓝色污渍,并作为负载控制。
它们的数据结果可以量化,使用图像 G 或图像泉软件识别菌株或实验条件之间的差异。对于这些,与每个产品对应的信号比率与总信号进行计算。平均值和标准偏差至少在三个独立实验中计算。
在去年的实验中,对合成蛋白的动能进行了研究。样品在标签反应被冷甲氨酸和博里霉素停止后,在指示的时间点采集。这种控制对于估计产品的稳定性是必要的。
免疫染色与抗波林一个抗体是一个加载控制。我们描述了这种方法,它经常用于研究酵母线粒体中的蛋白质生物合成。此协议相对简单且操作速度较快。
同时,它允许获得关于四个酵母线粒体mRNA的转化率的宝贵信息,这是非常有利的。然而,它有几个限制,需要额外的实验,并在于这种州际水平的蛋白质和mRNA。它可以在线粒体翻译系统中提供有关这些功能的信息,但应使用更先进的技术来发现该机制。
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