2021年5月15日
Updegraff 法是用于纤维素测定的最广泛使用的方法。本演示的主要目的是提供一种详细的 Updegraff 方案,用于测定植物生物量样品中的纤维素含量。
本文展示了Updegraff法,这是目前全球最广泛使用的测定结晶纤维素含量的方法。纤维素主要由通过β-1,4-糖苷键连接的葡萄糖单体构成。我们将该实验方案分为五个阶段。
在第一阶段,我们准备植物生物质材料。在第二阶段,提取粗细胞壁。在第三阶段,我们采用Updegraff法处理,其中Updegraff试剂由乙酸和硝酸组成,有助于从样品中去除半纤维素和木质素。
在第四阶段,我们借助硫酸进行酸水解,从而产生葡萄糖单体。最后,在第五阶段,我们采用蒽酮法测定结晶纤维素的含量。从温室中采集植物材料,用清水彻底清洗,室温下晾干两天,分离组织后将组织转移至分别标记的容器中,并在49摄氏度的培养箱中孵育10天。
最后,使用剪刀或刀片将组织切成小块。将组织冷冻后放入研钵中,用研杵充分研磨成均匀的粉末;或者也可使用冷冻研磨仪(Freezer/Mill)。此处我们以冷冻研磨仪为例进行演示,因此将组织样品放入这些研磨管中,置于冷冻研磨仪内,以10 CP的速度运行三个循环。
将组织粉末收集到 Falcon 管中,如图所示。称取 20 mg 组织粉末,转移至已预称重的 2 mL 离心管中。加入 1 mL 蛋白质溶解缓冲液以去除蛋白质。涡旋振荡。
在15,000 RPM下离心五分钟。弃去上清液。重复此步骤两次。
向保留的沉淀中加入1 mL无菌水。充分涡旋。在15,000 RPM条件下离心5分钟。重复此步骤再两次。
向保留的沉淀物中加入1 mL 70%乙醇,涡旋振荡。转移至预热至70°C并同时振荡的金属浴中,孵育1小时。孵育结束后,在15,000 RPM条件下离心5分钟。
再重复此步骤一次。向保存的沉淀中加入 1 mL 100% 甲基乙二酮。涡旋混匀。在 15,000 RPM 条件下离心 5 分钟。
加入1 mL氯仿-甲醇。涡旋振荡。在15,000 RPM下离心5分钟。弃去上清液,加入1 mL丙酮。涡旋振荡。
室温孵育5分钟。在15,000 RPM下离心5分钟。弃去上清液,于37摄氏度下空气干燥过夜,或通过真空干燥继续处理。
将样品放入真空干燥器中,风干两到三小时,或直至沉淀完全干燥。称取上一步骤获得的细胞壁提取物 5 mg,转移至 2 mL 螺口管中。
此时还需加入阳性对照。为此目的,使用两毫克的沃特曼滤纸。转移至一个两毫升的螺旋盖管中。
向每份称重的细胞壁提取物中加入 1.5 mL Updegraff 试剂。涡旋混匀后,在预热的金属浴中 100 摄氏度孵育 30 分钟。孵育 30 分钟后,转移至试管架中。
室温静置冷却10分钟。以15,000 RPM离心10分钟。弃去上清液,注意不要扰动沉淀。
加入1 mL无菌水。涡旋振荡。在15,000 RPM下离心10分钟。弃去500微升上清液。
加入 1 mL 丙酮。涡旋振荡。在 15,000 RPM 条件下离心 5 分钟。弃去 1 mL 上清液。
加入1 mL丙酮。涡旋振荡。在15,000 RPM下离心5分钟。完全弃去上清液。
加入 1 mL 丙酮。涡旋振荡。在 15,000 RPM 条件下离心 5 分钟。弃去上清液。
在37摄氏度下干燥过夜。孵育一晚后,转移至试管架。加入1 mL 67%硫酸。涡旋振荡。
在25摄氏度下孵育一小时,同时振荡。孵育一小时后,确保沉淀物完全溶解。转移至试管架中。
这是纤维素提取的最后一步。现在样品已准备好进行样品稀释。进行样品稀释时,取上一步骤中每份样品的10 µL,加入490 µL无菌水。
对所有实验样品重复此步骤。用于制备葡萄糖标准曲线时,配制新鲜的1 mg/mL葡萄糖储备液,并通过以20 µL递增的方式加入1 mg/mL葡萄糖,配制0 µg至200 µg的不同浓度,再用无菌水定容至1 mL。取每种已配制的标准品500 µL至带螺旋盖的试管中,加入1 mL 0.2%蒽酮溶液。
现在样品已准备好进行蒽酮测定。加入1 mL新配制的蒽酮试剂,立即涡旋混匀,然后置于冰上。
以相同方法对所有标准品和样品进行重复操作。然后转移至预热至100摄氏度的金属浴中,孵育10分钟。10分钟孵育结束后,立即转移至冰上,于冰中继续孵育5分钟。
孵育后,取各样品200微升,设三个重复。对标准品和样品均以相同方式重复操作。将加样完毕的96孔板放入多功能酶标仪中。
使用 Smart Max Pro 程序,将滤光片设置为 620 纳米,选择 96 孔板类型,并选中全部读取区域。
单击“确定”。读取。读取酶标板。您将获得标准品和样品的吸光度读数,这些数据将被收集到 Excel 表格中,用于进一步分析和纤维素含量的估算。
葡萄糖标准曲线的制备方法是:以葡萄糖浓度(单位为微克/毫升)作为横坐标,以相应浓度在620纳米处的归一化吸光度值作为纵坐标。在绘制的散点图中,我们得到一条回归直线,并获得其斜率(m)和截距(c)值,用于估算样品中结晶纤维素的含量。第一步,我们计算了620纳米处的光密度(OD)值的平均值。
然后通过减去空白值对数据进行归一化。我们使用公式 x 等于(OD 减去 c)除以 m 来计算葡萄糖浓度,其中 c 和 m 的值来自标准曲线中回归直线前一步骤的结果。由于蒽酮测定所用的总体积为 500 微升,我们再除以稀释倍数 2。
由于所用样品体积仅为10微升,因此需进一步除以10,以获得每微升微克浓度的葡萄糖,该浓度等于每毫升毫克浓度。然后,我们使用了1.11的水分校正因子,该因子代表此过程中的水分增加量。最后,将结果除以细胞壁重量(约5毫克),再乘以100,即可计算出结晶纤维素含量的百分比。
然后,我们对三个生物学重复样本的结晶纤维素含量取平均值,以获得单个样本的数值,并将其与另一实验组三个生物学重复样本的平均值进行比较。可采用 t 检验来评估两者之间的显著性水平。在表 A 中,我们列出了浓度及其在 620 纳米处对应的吸光度(OD)值,这些数据进一步用于绘制散点图和回归线,并利用所得的斜率(m)和截距(c)值代入公式 C,以计算两个实验组之间的纤维素含量差异。
总之,两个样本均显示出纤维素的差异。感谢观看。
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本演示介绍了Updegraff法,这是目前用于测定植物生物量中结晶纤维素含量的最常用技术。该方案分为五个明确阶段,以确保对纤维素含量进行系统而全面的测定。
对植物生物质中结晶纤维素进行定量估算,对于专注于生物能源、原料优化和细胞壁生物学的生物制药研发团队至关重要。Updegraff 方法提供了一种稳健且可重复的流程,用于分离和测定纤维素含量,有助于提高生物质表征和比较研究的预测可靠性。该能力支撑了基于植物的生物产品研发管线中的早期发现、靶点验证和转化研究。
Updegraff 方法融入了植物源生物产品的发现到临床前研究的连续过程,能够在关键转折点实现可靠的纤维素定量。